RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000446285.5

ODC1-204, Transcript of ornithine decarboxylase 1, humanhuman

TSL 5

Gene ODC1, Length 665 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ODC1-204ENST00000446285 H7C417 338 aa23.3■■□□□ 1.32
ODC1-204ENST00000446285 NUDT6P53370 316 aa23.3■■□□□ 1.32
ODC1-204ENST00000446285 ROR2Q01974 943 aaKnown RBP23.3■■□□□ 1.32
ODC1-204ENST00000446285 ZNF613Q6PF04 617 aa23.3■■□□□ 1.32
ODC1-204ENST00000446285 PATL1Q86TB9 770 aaKnown RBP23.3■■□□□ 1.32
ODC1-204ENST00000446285 GPR137CQ8N3F9 429 aa23.3■■□□□ 1.32
ODC1-204ENST00000446285 PIK3C3Q8NEB9 887 aa23.3■■□□□ 1.32
ODC1-204ENST00000446285 SLC38A2Q96QD8 506 aa23.3■■□□□ 1.32
ODC1-204ENST00000446285 ARHGDIGQ99819 225 aa23.3■■□□□ 1.32
ODC1-204ENST00000446285 KATNB1Q9BVA0 655 aa23.3■■□□□ 1.32
ODC1-204ENST00000446285 ASPNQ9BXN1 380 aa23.3■■□□□ 1.32
ODC1-204ENST00000446285 KAT8Q9H7Z6 458 aaKnown RBP23.3■■□□□ 1.32
ODC1-204ENST00000446285 CRNNQ9UBG3 495 aaPredicted RBP23.3■■□□□ 1.32
ODC1-204ENST00000446285 SEC14L4Q9UDX3 406 aa23.3■■□□□ 1.32
ODC1-204ENST00000446285 ALPK2Q86TB3 2170 aa23.3■■□□□ 1.32
ODC1-204ENST00000446285 ATP6V1G2-DDX39BF2Z307 99 aa23.29■■□□□ 1.32
ODC1-204ENST00000446285 NDUFS7O75251 213 aa23.29■■□□□ 1.32
ODC1-204ENST00000446285 NQO1P15559 274 aaKnown RBP23.29■■□□□ 1.32
ODC1-204ENST00000446285 MTPNP58546 118 aa23.29■■□□□ 1.32
ODC1-204ENST00000446285 LGALS3BPQ08380 585 aa23.29■■□□□ 1.32
ODC1-204ENST00000446285 RAB35Q15286 201 aa23.29■■□□□ 1.32
ODC1-204ENST00000446285 INTS11Q5TA45 600 aaKnown RBP23.29■■□□□ 1.32
ODC1-204ENST00000446285 LINGO2Q7L985 606 aa23.29■■□□□ 1.32
ODC1-204ENST00000446285 UEVLDQ8IX04 471 aa23.29■■□□□ 1.32
ODC1-204ENST00000446285 RHNO1Q9BSD3 238 aa23.29■■□□□ 1.32
ODC1-204ENST00000446285 PRR14Q9BWN1 585 aa23.29■■□□□ 1.32
ODC1-204ENST00000446285 PMF1-BGLAPU3KQ54 211 aa23.29■■□□□ 1.32
ODC1-204ENST00000446285 ABCA1O95477 2261 aa23.29■■□□□ 1.32
ODC1-204ENST00000446285 CR1P17927 2039 aa23.28■■□□□ 1.32
ODC1-204ENST00000446285 M0QX08 132 aa23.28■■□□□ 1.32
ODC1-204ENST00000446285 TRAF3IP2O43734 574 aaPredicted RBP23.28■■□□□ 1.32
ODC1-204ENST00000446285 TPST2O60704 377 aa23.28■■□□□ 1.32
ODC1-204ENST00000446285 VIMP08670 466 aaKnown RBP23.28■■□□□ 1.32
ODC1-204ENST00000446285 PTNP21246 168 aa23.28■■□□□ 1.32
ODC1-204ENST00000446285 PCSK6P29122 969 aa23.28■■□□□ 1.32
ODC1-204ENST00000446285 PCGF2P35227 344 aa23.28■■□□□ 1.32
ODC1-204ENST00000446285 IL1RL1Q01638 556 aa23.28■■□□□ 1.32
ODC1-204ENST00000446285 CCDC36Q8IYA8 594 aa23.28■■□□□ 1.32
ODC1-204ENST00000446285 SMYD1Q8NB12 490 aa23.28■■□□□ 1.32
ODC1-204ENST00000446285 MCHR1Q99705 422 aa23.28■■□□□ 1.32
ODC1-204ENST00000446285 MRPL39Q9NYK5 338 aaKnown RBP23.28■■□□□ 1.32
ODC1-204ENST00000446285 IGHV1-18A0A0C4DH31 117 aa23.27■■□□□ 1.32
ODC1-204ENST00000446285 SSX4O60224 188 aa23.27■■□□□ 1.32
ODC1-204ENST00000446285 MT-ATP6P00846 226 aa23.27■■□□□ 1.32
ODC1-204ENST00000446285 CRYAAP02489 173 aa23.27■■□□□ 1.32
ODC1-204ENST00000446285 BGLAPP02818 100 aa23.27■■□□□ 1.32
ODC1-204ENST00000446285 CDH12P55289 794 aa23.27■■□□□ 1.32
ODC1-204ENST00000446285 SELPLGQ14242 412 aa23.27■■□□□ 1.32
ODC1-204ENST00000446285 CLEC2AQ6UVW9 174 aa23.27■■□□□ 1.32
ODC1-204ENST00000446285 RASSF5Q8WWW0 418 aa23.27■■□□□ 1.32
ODC1-204ENST00000446285 OR2M2Q96R28 347 aa23.27■■□□□ 1.32
ODC1-204ENST00000446285 SH3GL1Q99961 368 aa23.27■■□□□ 1.32
ODC1-204ENST00000446285 GPR35Q9HC97 309 aa23.27■■□□□ 1.32
ODC1-204ENST00000446285 MOKQ9UQ07 419 aa23.27■■□□□ 1.32
ODC1-204ENST00000446285 NOX1Q9Y5S8 564 aa23.27■■□□□ 1.32
ODC1-204ENST00000446285 CHP2O43745 196 aa23.26■■□□□ 1.31
ODC1-204ENST00000446285 SASH3O75995 380 aa23.26■■□□□ 1.31
ODC1-204ENST00000446285 TP53P04637 393 aaPredicted RBP23.26■■□□□ 1.31
ODC1-204ENST00000446285 TROVE2P10155 538 aaKnown RBP eCLIP23.26■■□□□ 1.31
ODC1-204ENST00000446285 CYLC2Q14093 348 aaPredicted RBP23.26■■□□□ 1.31
ODC1-204ENST00000446285 DUSP7Q16829 419 aa23.26■■□□□ 1.31
ODC1-204ENST00000446285 TRMT5Q32P41 509 aaKnown RBP23.26■■□□□ 1.31
ODC1-204ENST00000446285 COQ5Q5HYK3 327 aa23.26■■□□□ 1.31
ODC1-204ENST00000446285 TMEM123Q8N131 208 aa23.26■■□□□ 1.31
ODC1-204ENST00000446285 LRR1Q96L50 414 aa23.26■■□□□ 1.31
ODC1-204ENST00000446285 NELFAQ9H3P2 528 aa23.26■■□□□ 1.31
ODC1-204ENST00000446285 A0A096LPE4 126 aa23.25■■□□□ 1.31
ODC1-204ENST00000446285 A0A1W2PPZ6 126 aa23.25■■□□□ 1.31
ODC1-204ENST00000446285 INAFM1C9JVW0 142 aa23.25■■□□□ 1.31
ODC1-204ENST00000446285 MS4A18H0YCH9 400 aa23.25■■□□□ 1.31
ODC1-204ENST00000446285 M0R3H8 397 aa23.25■■□□□ 1.31
ODC1-204ENST00000446285 IGKV3-15P01624 115 aa23.25■■□□□ 1.31
ODC1-204ENST00000446285 IGLV1-44P01699 117 aa23.25■■□□□ 1.31
ODC1-204ENST00000446285 CSF3P09919 207 aa23.25■■□□□ 1.31
ODC1-204ENST00000446285 CBLP22681 906 aa23.25■■□□□ 1.31
ODC1-204ENST00000446285 ARF1P84077 181 aaKnown RBP23.25■■□□□ 1.31
ODC1-204ENST00000446285 PUDPQ08623 228 aa23.25■■□□□ 1.31
ODC1-204ENST00000446285 PMS2P3Q13401 168 aa23.25■■□□□ 1.31
ODC1-204ENST00000446285 MS4A18Q3C1V0 323 aa23.25■■□□□ 1.31
ODC1-204ENST00000446285 LINC00114Q6XXX2 140 aa23.25■■□□□ 1.31
ODC1-204ENST00000446285 OR10A6Q8NH74 314 aa23.25■■□□□ 1.31
ODC1-204ENST00000446285 WFDC6Q9BQY6 131 aa23.25■■□□□ 1.31
ODC1-204ENST00000446285 TMEM120AQ9BXJ8 343 aa23.25■■□□□ 1.31
ODC1-204ENST00000446285 CRLF2Q9HC73 371 aa23.25■■□□□ 1.31
ODC1-204ENST00000446285 B3GAT2Q9NPZ5 323 aa23.25■■□□□ 1.31
ODC1-204ENST00000446285 ARFGEF3Q5TH69 2177 aa23.25■■□□□ 1.31
ODC1-204ENST00000446285 SONP18583 2426 aaKnown RBP23.24■■□□□ 1.31
ODC1-204ENST00000446285 PDE5AO76074 875 aa23.24■■□□□ 1.31
ODC1-204ENST00000446285 NPPAP01160 153 aa23.24■■□□□ 1.31
ODC1-204ENST00000446285 OPN1SWP03999 348 aa23.24■■□□□ 1.31
ODC1-204ENST00000446285 KRTAP1-1Q07627 177 aa23.24■■□□□ 1.31
ODC1-204ENST00000446285 CEACAM16Q2WEN9 425 aa23.24■■□□□ 1.31
ODC1-204ENST00000446285 PXKQ7Z7A4 578 aa23.24■■□□□ 1.31
ODC1-204ENST00000446285 SNX32Q86XE0 403 aa23.24■■□□□ 1.31
ODC1-204ENST00000446285 C10orf53Q8N6V4 93 aa23.24■■□□□ 1.31
ODC1-204ENST00000446285 GPR32P1Q8NGA4 272 aa23.24■■□□□ 1.31
ODC1-204ENST00000446285 OR10H5Q8NGA6 315 aa23.24■■□□□ 1.31
ODC1-204ENST00000446285 OR4F15Q8NGB8 312 aa23.24■■□□□ 1.31
ODC1-204ENST00000446285 OR6T1Q8NGN1 323 aa23.24■■□□□ 1.31
ODC1-204ENST00000446285 SLC26A7Q8TE54 656 aa23.24■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 35.4 ms