RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000428732.1

DEPDC1-AS1-201, DEPDC1 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene DEPDC1-AS1, Length 1,247 nt, Biotype antisense RNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DEPDC1-AS1-201ENST00000428732 ANKRD27Q96NW4 1050 aa11.33□□□□□ -0.6
DEPDC1-AS1-201ENST00000428732 ZBTB18Q99592 522 aa11.33□□□□□ -0.6
DEPDC1-AS1-201ENST00000428732 PTDSS2Q9BVG9 487 aa11.33□□□□□ -0.6
DEPDC1-AS1-201ENST00000428732 WDR55Q9H6Y2 383 aaPredicted RBP11.33□□□□□ -0.6
DEPDC1-AS1-201ENST00000428732 GPR35Q9HC97 309 aa11.33□□□□□ -0.6
DEPDC1-AS1-201ENST00000428732 DYNLRB1Q9NP97 96 aa11.33□□□□□ -0.6
DEPDC1-AS1-201ENST00000428732 CALML5Q9NZT1 146 aa11.33□□□□□ -0.6
DEPDC1-AS1-201ENST00000428732 RCE1Q9Y256 329 aa11.33□□□□□ -0.6
DEPDC1-AS1-201ENST00000428732 LYNX1G3V0Z9 82 aa11.32□□□□□ -0.6
DEPDC1-AS1-201ENST00000428732 TM9SF1O15321 606 aa11.32□□□□□ -0.6
DEPDC1-AS1-201ENST00000428732 SLC43A1O75387 559 aa11.32□□□□□ -0.6
DEPDC1-AS1-201ENST00000428732 SEC14L2O76054 403 aa11.32□□□□□ -0.6
DEPDC1-AS1-201ENST00000428732 LYNX1P0DP58 116 aa11.32□□□□□ -0.6
DEPDC1-AS1-201ENST00000428732 IFNGR1P15260 489 aa11.32□□□□□ -0.6
DEPDC1-AS1-201ENST00000428732 ZNF43P17038 809 aa11.32□□□□□ -0.6
DEPDC1-AS1-201ENST00000428732 GTF2E2P29084 291 aaKnown RBP11.32□□□□□ -0.6
DEPDC1-AS1-201ENST00000428732 ARR3P36575 388 aa11.32□□□□□ -0.6
DEPDC1-AS1-201ENST00000428732 DSTNP60981 165 aa11.32□□□□□ -0.6
DEPDC1-AS1-201ENST00000428732 HOXC5Q00444 222 aa11.32□□□□□ -0.6
DEPDC1-AS1-201ENST00000428732 BST1Q10588 318 aa11.32□□□□□ -0.6
DEPDC1-AS1-201ENST00000428732 NPRL3Q12980 569 aa11.32□□□□□ -0.6
DEPDC1-AS1-201ENST00000428732 SNTB2Q13425 540 aaKnown RBP11.32□□□□□ -0.6
DEPDC1-AS1-201ENST00000428732 RIN1Q13671 783 aa11.32□□□□□ -0.6
DEPDC1-AS1-201ENST00000428732 MPP2Q14168 576 aa11.32□□□□□ -0.6
DEPDC1-AS1-201ENST00000428732 ADRM1Q16186 407 aa11.32□□□□□ -0.6
DEPDC1-AS1-201ENST00000428732 CEACAM16Q2WEN9 425 aa11.32□□□□□ -0.6
DEPDC1-AS1-201ENST00000428732 MDP1Q86V88 176 aa11.32□□□□□ -0.6
DEPDC1-AS1-201ENST00000428732 GPR137CQ8N3F9 429 aa11.32□□□□□ -0.6
DEPDC1-AS1-201ENST00000428732 UBASH3BQ8TF42 649 aa11.32□□□□□ -0.6
DEPDC1-AS1-201ENST00000428732 CKAP2Q8WWK9 683 aa11.32□□□□□ -0.6
DEPDC1-AS1-201ENST00000428732 KTI12Q96EK9 354 aaPredicted RBP11.32□□□□□ -0.6
DEPDC1-AS1-201ENST00000428732 TMEM19Q96HH6 336 aa11.32□□□□□ -0.6
DEPDC1-AS1-201ENST00000428732 SPATA9Q9BWV2 254 aa11.32□□□□□ -0.6
DEPDC1-AS1-201ENST00000428732 TPK1Q9H3S4 243 aa11.32□□□□□ -0.6
DEPDC1-AS1-201ENST00000428732 CRLF2Q9HC73 371 aa11.32□□□□□ -0.6
DEPDC1-AS1-201ENST00000428732 SSU72Q9NP77 194 aaKnown RBP11.32□□□□□ -0.6
DEPDC1-AS1-201ENST00000428732 B3GAT1Q9P2W7 334 aa11.32□□□□□ -0.6
DEPDC1-AS1-201ENST00000428732 ZNF232Q9UNY5 417 aa11.32□□□□□ -0.6
DEPDC1-AS1-201ENST00000428732 PCDHB14Q9Y5E9 798 aa11.32□□□□□ -0.6
DEPDC1-AS1-201ENST00000428732 A0A0G2JPF8 293 aa11.31□□□□□ -0.6
DEPDC1-AS1-201ENST00000428732 HNRNPCL2B2RXH8 293 aa11.31□□□□□ -0.6
DEPDC1-AS1-201ENST00000428732 HNRNPCL3B7ZW38 293 aa11.31□□□□□ -0.6
DEPDC1-AS1-201ENST00000428732 RGS16O15492 202 aaPredicted RBP11.31□□□□□ -0.6
DEPDC1-AS1-201ENST00000428732 HNRNPCL1O60812 293 aaKnown RBP11.31□□□□□ -0.6
DEPDC1-AS1-201ENST00000428732 ADRA2AP08913 450 aa11.31□□□□□ -0.6
DEPDC1-AS1-201ENST00000428732 HNRNPCL4P0DMR1 293 aa11.31□□□□□ -0.6
DEPDC1-AS1-201ENST00000428732 EPHA3P29320 983 aa11.31□□□□□ -0.6
DEPDC1-AS1-201ENST00000428732 CAPZA2P47755 286 aa11.31□□□□□ -0.6
DEPDC1-AS1-201ENST00000428732 C1DQ13901 141 aaKnown RBP11.31□□□□□ -0.6
DEPDC1-AS1-201ENST00000428732 CCNIQ14094 377 aa11.31□□□□□ -0.6
DEPDC1-AS1-201ENST00000428732 DAG1Q14118 895 aa11.31□□□□□ -0.6
DEPDC1-AS1-201ENST00000428732 GTDC1Q4AE62 458 aa11.31□□□□□ -0.6
DEPDC1-AS1-201ENST00000428732 ZNF311Q5JNZ3 666 aa11.31□□□□□ -0.6
DEPDC1-AS1-201ENST00000428732 KRT80Q6KB66 452 aa11.31□□□□□ -0.6
DEPDC1-AS1-201ENST00000428732 RINLQ6ZS11 566 aa11.31□□□□□ -0.6
DEPDC1-AS1-201ENST00000428732 MEX3DQ86XN8 651 aaKnown RBP11.31□□□□□ -0.6
DEPDC1-AS1-201ENST00000428732 KIRREL3-AS3Q8N7Y1 241 aaPredicted RBP11.31□□□□□ -0.6
DEPDC1-AS1-201ENST00000428732 GLB1L3Q8NCI6 653 aaPredicted RBP11.31□□□□□ -0.6
DEPDC1-AS1-201ENST00000428732 OXGR1Q96P68 337 aa11.31□□□□□ -0.6
DEPDC1-AS1-201ENST00000428732 OR2M2Q96R28 347 aa11.31□□□□□ -0.6
DEPDC1-AS1-201ENST00000428732 TPT1P8Q9HAU6 139 aa11.31□□□□□ -0.6
DEPDC1-AS1-201ENST00000428732 CACYBPQ9HB71 228 aaKnown RBP11.31□□□□□ -0.6
DEPDC1-AS1-201ENST00000428732 NOX3Q9HBY0 568 aa11.31□□□□□ -0.6
DEPDC1-AS1-201ENST00000428732 USP22Q9UPT9 525 aa11.31□□□□□ -0.6
DEPDC1-AS1-201ENST00000428732 M0R082 166 aa11.3□□□□□ -0.6
DEPDC1-AS1-201ENST00000428732 TRAF3IP2O43734 574 aaPredicted RBP11.3□□□□□ -0.6
DEPDC1-AS1-201ENST00000428732 FZD7O75084 574 aa11.3□□□□□ -0.6
DEPDC1-AS1-201ENST00000428732 ANP32DO95626 131 aa11.3□□□□□ -0.6
DEPDC1-AS1-201ENST00000428732 IL6P05231 212 aa11.3□□□□□ -0.6
DEPDC1-AS1-201ENST00000428732 DVL1P1P54792 670 aaPredicted RBP11.3□□□□□ -0.6
DEPDC1-AS1-201ENST00000428732 IL1RL1Q01638 556 aa11.3□□□□□ -0.6
DEPDC1-AS1-201ENST00000428732 MSMPQ1L6U9 139 aa11.3□□□□□ -0.6
DEPDC1-AS1-201ENST00000428732 PHYHD1Q5SRE7 291 aa11.3□□□□□ -0.6
DEPDC1-AS1-201ENST00000428732 TMEM123Q8N131 208 aa11.3□□□□□ -0.6
DEPDC1-AS1-201ENST00000428732 PIK3C3Q8NEB9 887 aa11.3□□□□□ -0.6
DEPDC1-AS1-201ENST00000428732 IL17RDQ8NFM7 739 aa11.3□□□□□ -0.6
DEPDC1-AS1-201ENST00000428732 ZNF417Q8TAU3 575 aa11.3□□□□□ -0.6
DEPDC1-AS1-201ENST00000428732 TAAR8Q969N4 342 aa11.3□□□□□ -0.6
DEPDC1-AS1-201ENST00000428732 VPS33AQ96AX1 596 aa11.3□□□□□ -0.6
DEPDC1-AS1-201ENST00000428732 ZNF587Q96SQ5 575 aaPredicted RBP11.3□□□□□ -0.6
DEPDC1-AS1-201ENST00000428732 ARMC7Q9H6L4 198 aa11.3□□□□□ -0.6
DEPDC1-AS1-201ENST00000428732 IFT52Q9Y366 437 aa11.3□□□□□ -0.6
DEPDC1-AS1-201ENST00000428732 CMAHPQ9Y471 501 aa11.3□□□□□ -0.6
DEPDC1-AS1-201ENST00000428732 ZNF99A8MXY4 864 aaPredicted RBP11.29□□□□□ -0.6
DEPDC1-AS1-201ENST00000428732 M0R3G1 203 aa11.29□□□□□ -0.6
DEPDC1-AS1-201ENST00000428732 AIM2O14862 343 aa11.29□□□□□ -0.6
DEPDC1-AS1-201ENST00000428732 HDAC3O15379 428 aa11.29□□□□□ -0.6
DEPDC1-AS1-201ENST00000428732 SLC22A3O75751 556 aa11.29□□□□□ -0.6
DEPDC1-AS1-201ENST00000428732 HLA-HP01893 362 aa11.29□□□□□ -0.6
DEPDC1-AS1-201ENST00000428732 ZCCHC18P0CG32 403 aa11.29□□□□□ -0.6
DEPDC1-AS1-201ENST00000428732 IDO1P14902 403 aa11.29□□□□□ -0.6
DEPDC1-AS1-201ENST00000428732 NR4A1P22736 598 aa11.29□□□□□ -0.6
DEPDC1-AS1-201ENST00000428732 GRPRP30550 384 aa11.29□□□□□ -0.6
DEPDC1-AS1-201ENST00000428732 PDCD4Q53EL6 469 aaKnown RBP11.29□□□□□ -0.6
DEPDC1-AS1-201ENST00000428732 UGT2A3Q6UWM9 527 aa11.29□□□□□ -0.6
DEPDC1-AS1-201ENST00000428732 C6orf89Q6UWU4 347 aa11.29□□□□□ -0.6
DEPDC1-AS1-201ENST00000428732 CCDC36Q8IYA8 594 aa11.29□□□□□ -0.6
DEPDC1-AS1-201ENST00000428732 SLC35B4Q969S0 331 aa11.29□□□□□ -0.6
DEPDC1-AS1-201ENST00000428732 MRPL24Q96A35 216 aaKnown RBP11.29□□□□□ -0.6
DEPDC1-AS1-201ENST00000428732 ZBTB9Q96C00 473 aa11.29□□□□□ -0.6
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 44.4 ms