RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000298838.10

PACSIN3-201, Transcript of protein kinase C and casein kinase substrate in neurons 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PACSIN3, Length 1,843 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PACSIN3-201ENST00000298838 TMEM99Q8N816 258 aa18.58■□□□□ 0.57
PACSIN3-201ENST00000298838 RFKQ969G6 155 aa18.58■□□□□ 0.57
PACSIN3-201ENST00000298838 OTULINQ96BN8 352 aa18.58■□□□□ 0.57
PACSIN3-201ENST00000298838 RASD2Q96D21 266 aa18.58■□□□□ 0.57
PACSIN3-201ENST00000298838 Q96M85 177 aa18.58■□□□□ 0.57
PACSIN3-201ENST00000298838 ZNF582Q96NG8 517 aaPredicted RBP18.58■□□□□ 0.57
PACSIN3-201ENST00000298838 TSPAN32Q96QS1 320 aa18.58■□□□□ 0.57
PACSIN3-201ENST00000298838 FANCFQ9NPI8 374 aa18.58■□□□□ 0.57
PACSIN3-201ENST00000298838 HINT3Q9NQE9 182 aaKnown RBP18.58■□□□□ 0.57
PACSIN3-201ENST00000298838 KIAA1549Q9HCM3 1950 aa18.58■□□□□ 0.57
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PACSIN3-201ENST00000298838 AQP7P3A6NL99 342 aa18.58■□□□□ 0.56
PACSIN3-201ENST00000298838 KDM4EB2RXH2 506 aaPredicted RBP18.58■□□□□ 0.56
PACSIN3-201ENST00000298838 PRR23D1E9PI22 279 aaPredicted RBP18.58■□□□□ 0.56
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PACSIN3-201ENST00000298838 TAF4O00268 1085 aa18.58■□□□□ 0.56
PACSIN3-201ENST00000298838 PRODHO43272 600 aa18.58■□□□□ 0.56
PACSIN3-201ENST00000298838 PRR23D2P0DMB1 279 aaPredicted RBP18.58■□□□□ 0.56
PACSIN3-201ENST00000298838 CDH15P55291 814 aa18.58■□□□□ 0.56
PACSIN3-201ENST00000298838 KHDRBS1Q07666 443 aaKnown RBP eCLIP18.58■□□□□ 0.56
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PACSIN3-201ENST00000298838 MS4A18Q3C1V0 323 aa18.58■□□□□ 0.56
PACSIN3-201ENST00000298838 PLBD1Q6P4A8 553 aa18.58■□□□□ 0.56
PACSIN3-201ENST00000298838 TMEM154Q6P9G4 183 aa18.58■□□□□ 0.56
PACSIN3-201ENST00000298838 TRILQ7L0X0 811 aa18.58■□□□□ 0.56
PACSIN3-201ENST00000298838 KDM8Q8N371 416 aa18.58■□□□□ 0.56
PACSIN3-201ENST00000298838 SDR9C7Q8NEX9 313 aa18.58■□□□□ 0.56
PACSIN3-201ENST00000298838 ZHX1-C8orf76Q96EF9 292 aa18.58■□□□□ 0.56
PACSIN3-201ENST00000298838 DEFB127Q9H1M4 99 aa18.58■□□□□ 0.56
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PACSIN3-201ENST00000298838 CCNB1IP1Q9NPC3 277 aa18.58■□□□□ 0.56
PACSIN3-201ENST00000298838 AKAP8LQ9ULX6 646 aaKnown RBP eCLIP18.58■□□□□ 0.56
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PACSIN3-201ENST00000298838 CLCA1A8K7I4 914 aa18.57■□□□□ 0.56
PACSIN3-201ENST00000298838 K7EM74 188 aa18.57■□□□□ 0.56
PACSIN3-201ENST00000298838 M0R3G1 203 aa18.57■□□□□ 0.56
PACSIN3-201ENST00000298838 ACVR2AP27037 513 aa18.57■□□□□ 0.56
PACSIN3-201ENST00000298838 RAC3P60763 192 aa18.57■□□□□ 0.56
PACSIN3-201ENST00000298838 SLC35A2P78381 396 aa18.57■□□□□ 0.56
PACSIN3-201ENST00000298838 POU3F1Q03052 451 aaPredicted RBP18.57■□□□□ 0.56
PACSIN3-201ENST00000298838 ITGADQ13349 1161 aa18.57■□□□□ 0.56
PACSIN3-201ENST00000298838 ACKR1Q16570 336 aa18.57■□□□□ 0.56
PACSIN3-201ENST00000298838 ZNF239Q16600 458 aaKnown RBP18.57■□□□□ 0.56
PACSIN3-201ENST00000298838 AADACL4Q5VUY2 407 aa18.57■□□□□ 0.56
PACSIN3-201ENST00000298838 HBMQ6B0K9 141 aa18.57■□□□□ 0.56
PACSIN3-201ENST00000298838 TMEM225Q6GV28 225 aa18.57■□□□□ 0.56
PACSIN3-201ENST00000298838 PXKQ7Z7A4 578 aa18.57■□□□□ 0.56
PACSIN3-201ENST00000298838 JAZF1Q86VZ6 243 aa18.57■□□□□ 0.56
PACSIN3-201ENST00000298838 OR2V1Q8NHB1 315 aa18.57■□□□□ 0.56
PACSIN3-201ENST00000298838 IPCEF1Q8WWN9 437 aaPredicted RBP18.57■□□□□ 0.56
PACSIN3-201ENST00000298838 RHNO1Q9BSD3 238 aa18.57■□□□□ 0.56
PACSIN3-201ENST00000298838 TXNIPQ9H3M7 391 aa18.57■□□□□ 0.56
PACSIN3-201ENST00000298838 DUSP21Q9H596 190 aa18.57■□□□□ 0.56
PACSIN3-201ENST00000298838 H2AFY2Q9P0M6 372 aaPredicted RBP18.57■□□□□ 0.56
PACSIN3-201ENST00000298838 PSORS1C1Q9UIG5 152 aa18.57■□□□□ 0.56
PACSIN3-201ENST00000298838 ZNF346Q9UL40 294 aaKnown RBP18.57■□□□□ 0.56
PACSIN3-201ENST00000298838 RPL36Q9Y3U8 105 aaKnown RBP18.57■□□□□ 0.56
PACSIN3-201ENST00000298838 CHD8Q9HCK8 2581 aa18.57■□□□□ 0.56
PACSIN3-201ENST00000298838 MED19A0JLT2 244 aaPredicted RBP18.56■□□□□ 0.56
PACSIN3-201ENST00000298838 H0YC42 278 aa18.56■□□□□ 0.56
PACSIN3-201ENST00000298838 ACTL6AO96019 429 aa18.56■□□□□ 0.56
PACSIN3-201ENST00000298838 IGHMP01871 453 aa18.56■□□□□ 0.56
PACSIN3-201ENST00000298838 SMIM18P0DKX4 95 aa18.56■□□□□ 0.56
PACSIN3-201ENST00000298838 LHX2P50458 406 aa18.56■□□□□ 0.56
PACSIN3-201ENST00000298838 DAP3P51398 398 aaKnown RBP18.56■□□□□ 0.56
PACSIN3-201ENST00000298838 P2RY4P51582 365 aa18.56■□□□□ 0.56
PACSIN3-201ENST00000298838 SUCLG1P53597 346 aaKnown RBP18.56■□□□□ 0.56
PACSIN3-201ENST00000298838 RPL27P61353 136 aaKnown RBP18.56■□□□□ 0.56
PACSIN3-201ENST00000298838 H3F3AP84243 136 aa18.56■□□□□ 0.56
PACSIN3-201ENST00000298838 KRR1Q13601 381 aaKnown RBP18.56■□□□□ 0.56
PACSIN3-201ENST00000298838 PDSS1Q5T2R2 415 aa18.56■□□□□ 0.56
PACSIN3-201ENST00000298838 AHSA2Q719I0 299 aa18.56■□□□□ 0.56
PACSIN3-201ENST00000298838 GID4Q8IVV7 300 aa18.56■□□□□ 0.56
PACSIN3-201ENST00000298838 RBMXL3Q8N7X1 1067 aaKnown RBP18.56■□□□□ 0.56
PACSIN3-201ENST00000298838 CYB561A3Q8NBI2 242 aa18.56■□□□□ 0.56
PACSIN3-201ENST00000298838 SLC37A3Q8NCC5 494 aa18.56■□□□□ 0.56
PACSIN3-201ENST00000298838 NEIL3Q8TAT5 605 aa18.56■□□□□ 0.56
PACSIN3-201ENST00000298838 ADGRG7Q96K78 797 aa18.56■□□□□ 0.56
PACSIN3-201ENST00000298838 MRPS26Q9BYN8 205 aaKnown RBP18.56■□□□□ 0.56
PACSIN3-201ENST00000298838 EXO5Q9H790 373 aa18.56■□□□□ 0.56
PACSIN3-201ENST00000298838 PAK1IP1Q9NWT1 392 aaPredicted RBP18.56■□□□□ 0.56
PACSIN3-201ENST00000298838 B3GNT3Q9Y2A9 372 aa18.56■□□□□ 0.56
PACSIN3-201ENST00000298838 ZNF407Q9C0G0 2248 aa18.56■□□□□ 0.56
PACSIN3-201ENST00000298838 A0A087WXM4 84 aa18.56■□□□□ 0.56
PACSIN3-201ENST00000298838 TRGV5A0A0B4J1U4 118 aa18.56■□□□□ 0.56
PACSIN3-201ENST00000298838 NPIPB13A6NJU9 1138 aa18.56■□□□□ 0.56
PACSIN3-201ENST00000298838 NPIPB4C9JG80 1138 aa18.56■□□□□ 0.56
PACSIN3-201ENST00000298838 XKRYO14609 159 aa18.56■□□□□ 0.56
PACSIN3-201ENST00000298838 ATP6V1B1P15313 513 aa18.56■□□□□ 0.56
PACSIN3-201ENST00000298838 ZNF708P17019 499 aa18.56■□□□□ 0.56
PACSIN3-201ENST00000298838 EIF1AXP47813 144 aaKnown RBP18.56■□□□□ 0.56
PACSIN3-201ENST00000298838 CDH11P55287 796 aa18.56■□□□□ 0.56
PACSIN3-201ENST00000298838 CARD18P57730 90 aa18.56■□□□□ 0.56
PACSIN3-201ENST00000298838 HSF1Q00613 529 aa18.56■□□□□ 0.56
PACSIN3-201ENST00000298838 ZNF91Q05481 1191 aa18.56■□□□□ 0.56
PACSIN3-201ENST00000298838 APOFQ13790 326 aa18.56■□□□□ 0.56
PACSIN3-201ENST00000298838 ASB18Q6ZVZ8 466 aa18.56■□□□□ 0.56
PACSIN3-201ENST00000298838 ARIH2OSQ8N7S6 290 aa18.56■□□□□ 0.56
PACSIN3-201ENST00000298838 OR10D3Q8NH80 312 aa18.56■□□□□ 0.56
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