RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000295718.6

PTPRN-201, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type N, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRN, Length 3,784 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRN-201ENST00000295718 OR2T27Q8NH04 317 aa13.3□□□□□ -0.28
PTPRN-201ENST00000295718 CCL4L1Q8NHW4 92 aa13.3□□□□□ -0.28
PTPRN-201ENST00000295718 FAM174AQ8TBP5 190 aa13.3□□□□□ -0.28
PTPRN-201ENST00000295718 SFXN5Q8TD22 340 aa13.3□□□□□ -0.28
PTPRN-201ENST00000295718 HAVCR2Q8TDQ0 301 aa13.3□□□□□ -0.28
PTPRN-201ENST00000295718 SMIM19Q96E16 107 aa13.3□□□□□ -0.28
PTPRN-201ENST00000295718 SHPKQ9UHJ6 478 aa13.3□□□□□ -0.28
PTPRN-201ENST00000295718 DHDHQ9UQ10 334 aa13.3□□□□□ -0.28
PTPRN-201ENST00000295718 SCN4AP35499 1836 aa13.29□□□□□ -0.28
PTPRN-201ENST00000295718 CDC40O60508 579 aaKnown RBP eCLIP13.29□□□□□ -0.28
PTPRN-201ENST00000295718 ZNF823P16415 610 aa13.29□□□□□ -0.28
PTPRN-201ENST00000295718 MAOBP27338 520 aa13.29□□□□□ -0.28
PTPRN-201ENST00000295718 CST5P28325 142 aaPredicted RBP13.29□□□□□ -0.28
PTPRN-201ENST00000295718 POU3F4P49335 361 aa13.29□□□□□ -0.28
PTPRN-201ENST00000295718 MAT1AQ00266 395 aaKnown RBP13.29□□□□□ -0.28
PTPRN-201ENST00000295718 ALG10Q5BKT4 473 aa13.29□□□□□ -0.28
PTPRN-201ENST00000295718 GLRX5Q86SX6 157 aa13.29□□□□□ -0.28
PTPRN-201ENST00000295718 OR9A4Q8NGU2 314 aa13.29□□□□□ -0.28
PTPRN-201ENST00000295718 OR10R2Q8NGX6 335 aa13.29□□□□□ -0.28
PTPRN-201ENST00000295718 ZC3H10Q96K80 434 aaKnown RBP13.29□□□□□ -0.28
PTPRN-201ENST00000295718 DGAT2Q96PD7 388 aa13.29□□□□□ -0.28
PTPRN-201ENST00000295718 VRK1Q99986 396 aaPredicted RBP13.29□□□□□ -0.28
PTPRN-201ENST00000295718 MCOLN1Q9GZU1 580 aa13.29□□□□□ -0.28
PTPRN-201ENST00000295718 PPIL1Q9Y3C6 166 aa13.29□□□□□ -0.28
PTPRN-201ENST00000295718 BRCA1P38398 1863 aaKnown RBP13.29□□□□□ -0.28
PTPRN-201ENST00000295718 SHOXO15266 292 aa13.29□□□□□ -0.28
PTPRN-201ENST00000295718 AKAIN1P0CW23 69 aa13.29□□□□□ -0.28
PTPRN-201ENST00000295718 RD3LP0DJH9 198 aa13.29□□□□□ -0.28
PTPRN-201ENST00000295718 CXCL2P19875 107 aa13.29□□□□□ -0.28
PTPRN-201ENST00000295718 P2RX1P51575 399 aa13.29□□□□□ -0.28
PTPRN-201ENST00000295718 PRSS41Q7RTY9 318 aa13.29□□□□□ -0.28
PTPRN-201ENST00000295718 KDM8Q8N371 416 aa13.29□□□□□ -0.28
PTPRN-201ENST00000295718 BPIFB2Q8N4F0 458 aa13.29□□□□□ -0.28
PTPRN-201ENST00000295718 ZNF248Q8NDW4 579 aa13.29□□□□□ -0.28
PTPRN-201ENST00000295718 OR4C16Q8NGL9 310 aa13.29□□□□□ -0.28
PTPRN-201ENST00000295718 DCUN1D4Q92564 292 aa13.29□□□□□ -0.28
PTPRN-201ENST00000295718 ADAT1Q9BUB4 502 aaKnown RBP13.29□□□□□ -0.28
PTPRN-201ENST00000295718 SEC61A2Q9H9S3 476 aa13.29□□□□□ -0.28
PTPRN-201ENST00000295718 ST6GALNAC1Q9NSC7 600 aaPredicted RBP13.29□□□□□ -0.28
PTPRN-201ENST00000295718 A0A0A6YYD5 115 aa13.29□□□□□ -0.28
PTPRN-201ENST00000295718 TMEM82A0PJX8 343 aa13.29□□□□□ -0.28
PTPRN-201ENST00000295718 H0Y8X5 98 aa13.29□□□□□ -0.28
PTPRN-201ENST00000295718 CLDN4O14493 209 aa13.29□□□□□ -0.28
PTPRN-201ENST00000295718 KCNAB3O43448 404 aa13.29□□□□□ -0.28
PTPRN-201ENST00000295718 KAT7O95251 611 aa13.29□□□□□ -0.28
PTPRN-201ENST00000295718 APODP05090 189 aa13.29□□□□□ -0.28
PTPRN-201ENST00000295718 NOGQ13253 232 aa13.29□□□□□ -0.28
PTPRN-201ENST00000295718 CSNK1A1LQ8N752 337 aa13.29□□□□□ -0.28
PTPRN-201ENST00000295718 ARIH2OSQ8N7S6 290 aa13.29□□□□□ -0.28
PTPRN-201ENST00000295718 SLAIN1Q8ND83 568 aa13.29□□□□□ -0.28
PTPRN-201ENST00000295718 DPYSL5Q9BPU6 564 aa13.29□□□□□ -0.28
PTPRN-201ENST00000295718 B4DGG1 531 aa13.28□□□□□ -0.28
PTPRN-201ENST00000295718 FGF17O60258 216 aa13.28□□□□□ -0.28
PTPRN-201ENST00000295718 GREM1O60565 184 aa13.28□□□□□ -0.28
PTPRN-201ENST00000295718 ZFPL1O95159 310 aa13.28□□□□□ -0.28
PTPRN-201ENST00000295718 PRH1P02810 166 aa13.28□□□□□ -0.28
PTPRN-201ENST00000295718 SULT1A3P0DMM9 295 aa13.28□□□□□ -0.28
PTPRN-201ENST00000295718 SULT1A4P0DMN0 295 aa13.28□□□□□ -0.28
PTPRN-201ENST00000295718 GDI1P31150 447 aa13.28□□□□□ -0.28
PTPRN-201ENST00000295718 ZNF85Q03923 595 aa13.28□□□□□ -0.28
PTPRN-201ENST00000295718 KRBOX4Q5JUW0 171 aa13.28□□□□□ -0.28
PTPRN-201ENST00000295718 GPR148Q8TDV2 347 aa13.28□□□□□ -0.28
PTPRN-201ENST00000295718 THAP3Q8WTV1 239 aaPredicted RBP13.28□□□□□ -0.28
PTPRN-201ENST00000295718 HERVK_113Q902F9 699 aa13.28□□□□□ -0.28
PTPRN-201ENST00000295718 SLC38A3Q99624 504 aa13.28□□□□□ -0.28
PTPRN-201ENST00000295718 PRDM7Q9NQW5 492 aa13.28□□□□□ -0.28
PTPRN-201ENST00000295718 ZNF736B4DX44 427 aaPredicted RBP13.28□□□□□ -0.28
PTPRN-201ENST00000295718 D6RAR5 112 aa13.28□□□□□ -0.28
PTPRN-201ENST00000295718 EPPINO95925 133 aa13.28□□□□□ -0.28
PTPRN-201ENST00000295718 NID1P14543 1247 aa13.28□□□□□ -0.28
PTPRN-201ENST00000295718 UBE2IP63279 158 aaKnown RBP13.28□□□□□ -0.28
PTPRN-201ENST00000295718 FGL1Q08830 312 aa13.28□□□□□ -0.28
PTPRN-201ENST00000295718 GLT8D1Q68CQ7 371 aa13.28□□□□□ -0.28
PTPRN-201ENST00000295718 LCN10Q6JVE6 187 aa13.28□□□□□ -0.28
PTPRN-201ENST00000295718 TEX19Q8NA77 164 aa13.28□□□□□ -0.28
PTPRN-201ENST00000295718 OR10H5Q8NGA6 315 aa13.28□□□□□ -0.28
PTPRN-201ENST00000295718 STOML3Q8TAV4 291 aa13.28□□□□□ -0.28
PTPRN-201ENST00000295718 OR2M4Q96R27 311 aa13.28□□□□□ -0.28
PTPRN-201ENST00000295718 SLC17A9Q9BYT1 436 aa13.28□□□□□ -0.28
PTPRN-201ENST00000295718 ADGRL4Q9HBW9 690 aa13.28□□□□□ -0.28
PTPRN-201ENST00000295718 GPR160Q9UJ42 338 aa13.28□□□□□ -0.28
PTPRN-201ENST00000295718 ADAM29Q9UKF5 820 aa13.28□□□□□ -0.28
PTPRN-201ENST00000295718 PLXNB2O15031 1838 aa13.28□□□□□ -0.28
PTPRN-201ENST00000295718 MCRIP1C9JLW8 97 aa13.28□□□□□ -0.28
PTPRN-201ENST00000295718 DNAJB6O75190 326 aa13.28□□□□□ -0.28
PTPRN-201ENST00000295718 FBXO24O75426 580 aa13.28□□□□□ -0.28
PTPRN-201ENST00000295718 OPN1LWP04000 364 aa13.28□□□□□ -0.28
PTPRN-201ENST00000295718 ZGLP1P0C6A0 271 aa13.28□□□□□ -0.28
PTPRN-201ENST00000295718 NDUFS1P28331 727 aa13.28□□□□□ -0.28
PTPRN-201ENST00000295718 AKR1C3P42330 323 aa13.28□□□□□ -0.28
PTPRN-201ENST00000295718 TRA2BP62995 288 aaKnown RBP13.28□□□□□ -0.28
PTPRN-201ENST00000295718 IL13RA1P78552 427 aa13.28□□□□□ -0.28
PTPRN-201ENST00000295718 SLC36A2Q495M3 483 aa13.28□□□□□ -0.28
PTPRN-201ENST00000295718 STEAP1BQ6NZ63 245 aa13.28□□□□□ -0.28
PTPRN-201ENST00000295718 WDR88Q6ZMY6 472 aa13.28□□□□□ -0.28
PTPRN-201ENST00000295718 STPG2Q8N412 459 aa13.28□□□□□ -0.28
PTPRN-201ENST00000295718 OR2AK2Q8NG84 335 aa13.28□□□□□ -0.28
PTPRN-201ENST00000295718 ZBTB8AQ96BR9 441 aa13.28□□□□□ -0.28
PTPRN-201ENST00000295718 MMABQ96EY8 250 aaPredicted RBP13.28□□□□□ -0.28
PTPRN-201ENST00000295718 CAPNS2Q96L46 248 aa13.28□□□□□ -0.28
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 24.5 ms