RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000587718.5

CAPNS1-204, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene CAPNS1, Length 1,558 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-204ENST00000587718 LALBAP00709 142 aa23.14■■□□□ 1.29
CAPNS1-204ENST00000587718 PGDP52209 483 aa23.14■■□□□ 1.29
CAPNS1-204ENST00000587718 IL10RAQ13651 578 aa23.14■■□□□ 1.29
CAPNS1-204ENST00000587718 SLC35D3Q5M8T2 416 aa23.14■■□□□ 1.29
CAPNS1-204ENST00000587718 PTPMT1Q8WUK0 201 aaPredicted RBP23.14■■□□□ 1.29
CAPNS1-204ENST00000587718 NDC1Q9BTX1 674 aa23.14■■□□□ 1.29
CAPNS1-204ENST00000587718 SLC6A5Q9Y345 797 aa23.14■■□□□ 1.29
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CAPNS1-204ENST00000587718 FAM183AA6NL82 134 aa23.13■■□□□ 1.29
CAPNS1-204ENST00000587718 MKRN2OSH3BPM6 223 aa23.13■■□□□ 1.29
CAPNS1-204ENST00000587718 GABRPO00591 440 aa23.13■■□□□ 1.29
CAPNS1-204ENST00000587718 CDC123O75794 336 aaPredicted RBP23.13■■□□□ 1.29
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CAPNS1-204ENST00000587718 TCRBV16S1A1N1A0A5B0 115 aa23.1■■□□□ 1.29
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CAPNS1-204ENST00000587718 TMEM99Q8N816 258 aa23.1■■□□□ 1.29
CAPNS1-204ENST00000587718 TEX19Q8NA77 164 aa23.1■■□□□ 1.29
CAPNS1-204ENST00000587718 NACC2Q96BF6 587 aa23.1■■□□□ 1.29
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CAPNS1-204ENST00000587718 ERMAPQ96PL5 475 aaPredicted RBP23.1■■□□□ 1.29
CAPNS1-204ENST00000587718 HCAR1Q9BXC0 346 aa23.1■■□□□ 1.29
CAPNS1-204ENST00000587718 LAT2Q9GZY6 243 aa23.1■■□□□ 1.29
CAPNS1-204ENST00000587718 NPAP1Q9NZP6 1156 aa23.1■■□□□ 1.29
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