RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000546160.5

PDE4D-226, Transcript of phosphodiesterase 4D, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene PDE4D, Length 7,690 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4D-226ENST00000546160 KHSRPQ92945 711 aaKnown RBP eCLIP5.93□□□□□ -1.46
PDE4D-226ENST00000546160 INTS12Q96CB8 462 aaKnown RBP5.93□□□□□ -1.46
PDE4D-226ENST00000546160 OR51E2Q9H255 320 aa5.93□□□□□ -1.46
PDE4D-226ENST00000546160 KCNIP2Q9NS61 270 aa5.93□□□□□ -1.46
PDE4D-226ENST00000546160 LCTP09848 1927 aa5.93□□□□□ -1.46
PDE4D-226ENST00000546160 DOCK4Q8N1I0 1966 aa5.93□□□□□ -1.46
PDE4D-226ENST00000546160 ZNF593O00488 134 aaPredicted RBP5.93□□□□□ -1.46
PDE4D-226ENST00000546160 DVL2O14641 736 aa5.93□□□□□ -1.46
PDE4D-226ENST00000546160 HCRTR1O43613 425 aa5.93□□□□□ -1.46
PDE4D-226ENST00000546160 PLRG1O43660 514 aaKnown RBP5.93□□□□□ -1.46
PDE4D-226ENST00000546160 VAMP5O95183 116 aa5.93□□□□□ -1.46
PDE4D-226ENST00000546160 IFNA17P01571 189 aa5.93□□□□□ -1.46
PDE4D-226ENST00000546160 SERPINA2P20848 420 aa5.93□□□□□ -1.46
PDE4D-226ENST00000546160 ILKQ13418 452 aa5.93□□□□□ -1.46
PDE4D-226ENST00000546160 FGFBP1Q14512 234 aa5.93□□□□□ -1.46
PDE4D-226ENST00000546160 SHHQ15465 462 aa5.93□□□□□ -1.46
PDE4D-226ENST00000546160 FCRLBQ6BAA4 426 aa5.93□□□□□ -1.46
PDE4D-226ENST00000546160 FAM57BQ71RH2 274 aa5.93□□□□□ -1.46
PDE4D-226ENST00000546160 DEFB123Q8N688 67 aa5.93□□□□□ -1.46
PDE4D-226ENST00000546160 ARRDC3Q96B67 414 aa5.93□□□□□ -1.46
PDE4D-226ENST00000546160 ANKRD9Q96BM1 317 aaPredicted RBP5.93□□□□□ -1.46
PDE4D-226ENST00000546160 BTF3L4Q96K17 158 aa5.93□□□□□ -1.46
PDE4D-226ENST00000546160 OR51B6Q9H340 312 aa5.93□□□□□ -1.46
PDE4D-226ENST00000546160 CDCP1Q9H5V8 836 aa5.93□□□□□ -1.46
PDE4D-226ENST00000546160 DDX31Q9H8H2 851 aaKnown RBP5.93□□□□□ -1.46
PDE4D-226ENST00000546160 HSBP1L1C9JCN9 74 aa5.93□□□□□ -1.46
PDE4D-226ENST00000546160 J3QRK9 145 aa5.93□□□□□ -1.46
PDE4D-226ENST00000546160 SULT1C2O00338 296 aa5.93□□□□□ -1.46
PDE4D-226ENST00000546160 BCAS1O75363 584 aaPredicted RBP5.93□□□□□ -1.46
PDE4D-226ENST00000546160 FCER2P06734 321 aa5.93□□□□□ -1.46
PDE4D-226ENST00000546160 HTR1FP30939 366 aa5.93□□□□□ -1.46
PDE4D-226ENST00000546160 TRHRP34981 398 aaPredicted RBP5.93□□□□□ -1.46
PDE4D-226ENST00000546160 HTR6P50406 440 aa5.93□□□□□ -1.46
PDE4D-226ENST00000546160 FOXA1P55317 472 aa5.93□□□□□ -1.46
PDE4D-226ENST00000546160 ATXN7L3Q14CW9 347 aaPredicted RBP5.93□□□□□ -1.46
PDE4D-226ENST00000546160 THEM4Q5T1C6 240 aa5.93□□□□□ -1.46
PDE4D-226ENST00000546160 NKAIN2Q5VXU1 208 aa5.93□□□□□ -1.46
PDE4D-226ENST00000546160 TMEM71Q6P5X7 295 aa5.93□□□□□ -1.46
PDE4D-226ENST00000546160 TSSK4Q6SA08 328 aa5.93□□□□□ -1.46
PDE4D-226ENST00000546160 TP53INP2Q8IXH6 220 aa5.93□□□□□ -1.46
PDE4D-226ENST00000546160 ZNF784Q8NCA9 323 aaPredicted RBP5.93□□□□□ -1.46
PDE4D-226ENST00000546160 SIMC1Q8NDZ2 872 aa5.93□□□□□ -1.46
PDE4D-226ENST00000546160 SGK3Q96BR1 496 aa5.93□□□□□ -1.46
PDE4D-226ENST00000546160 KCNJ15Q99712 375 aa5.93□□□□□ -1.46
PDE4D-226ENST00000546160 DUSP22Q9NRW4 184 aa5.93□□□□□ -1.46
PDE4D-226ENST00000546160 TMED7-TICAM2A0A0A6YYA0 188 aa5.93□□□□□ -1.46
PDE4D-226ENST00000546160 SMAD9O15198 467 aaKnown RBP5.93□□□□□ -1.46
PDE4D-226ENST00000546160 KNG1P01042 644 aa5.93□□□□□ -1.46
PDE4D-226ENST00000546160 CXCL10P02778 98 aa5.93□□□□□ -1.46
PDE4D-226ENST00000546160 TFP02787 698 aa5.93□□□□□ -1.46
PDE4D-226ENST00000546160 DCNP07585 359 aaKnown RBP5.93□□□□□ -1.46
PDE4D-226ENST00000546160 PVRP15151 417 aa5.93□□□□□ -1.46
PDE4D-226ENST00000546160 ETV4P43268 484 aa5.93□□□□□ -1.46
PDE4D-226ENST00000546160 NFATC3Q12968 1075 aa5.93□□□□□ -1.46
PDE4D-226ENST00000546160 RUNX2Q13950 521 aa5.93□□□□□ -1.46
PDE4D-226ENST00000546160 ZNF791Q3KP31 576 aaPredicted RBP5.93□□□□□ -1.46
PDE4D-226ENST00000546160 ZNF789Q5FWF6 425 aa5.93□□□□□ -1.46
PDE4D-226ENST00000546160 GPR157Q5UAW9 335 aa5.93□□□□□ -1.46
PDE4D-226ENST00000546160 NXNL2Q5VZ03 156 aa5.93□□□□□ -1.46
PDE4D-226ENST00000546160 MED25Q71SY5 747 aa5.93□□□□□ -1.46
PDE4D-226ENST00000546160 ASRGL1Q7L266 308 aa5.93□□□□□ -1.46
PDE4D-226ENST00000546160 SLC46A3Q7Z3Q1 461 aa5.93□□□□□ -1.46
PDE4D-226ENST00000546160 GLB1L2Q8IW92 636 aa5.93□□□□□ -1.46
PDE4D-226ENST00000546160 SLC37A2Q8TED4 501 aa5.93□□□□□ -1.46
PDE4D-226ENST00000546160 C7orf34Q96L11 122 aa5.93□□□□□ -1.46
PDE4D-226ENST00000546160 ZNF583Q96ND8 569 aa5.93□□□□□ -1.46
PDE4D-226ENST00000546160 KATNB1Q9BVA0 655 aa5.93□□□□□ -1.46
PDE4D-226ENST00000546160 NXF5Q9H1B4 397 aaKnown RBP5.93□□□□□ -1.46
PDE4D-226ENST00000546160 GPATCH2Q9NW75 528 aa5.93□□□□□ -1.46
PDE4D-226ENST00000546160 TRAPPC2LQ9UL33 140 aa5.93□□□□□ -1.46
PDE4D-226ENST00000546160 TMED7Q9Y3B3 224 aa5.93□□□□□ -1.46
PDE4D-226ENST00000546160 F5P12259 2224 aa5.93□□□□□ -1.46
PDE4D-226ENST00000546160 CABIN1Q9Y6J0 2220 aa5.93□□□□□ -1.46
PDE4D-226ENST00000546160 SOCS7O14512 581 aa5.93□□□□□ -1.46
PDE4D-226ENST00000546160 LILRB5O75023 590 aa5.93□□□□□ -1.46
PDE4D-226ENST00000546160 FZD7O75084 574 aa5.93□□□□□ -1.46
PDE4D-226ENST00000546160 CR2P20023 1033 aa5.93□□□□□ -1.46
PDE4D-226ENST00000546160 CSNK1G2P78368 415 aa5.93□□□□□ -1.46
PDE4D-226ENST00000546160 OR8B8Q15620 311 aa5.93□□□□□ -1.46
PDE4D-226ENST00000546160 YIF1BQ5BJH7 314 aa5.93□□□□□ -1.46
PDE4D-226ENST00000546160 FAM180BQ6P0A1 224 aa5.93□□□□□ -1.46
PDE4D-226ENST00000546160 ZFP41Q8N8Y5 198 aa5.93□□□□□ -1.46
PDE4D-226ENST00000546160 DOK4Q8TEW6 326 aa5.93□□□□□ -1.46
PDE4D-226ENST00000546160 TM4SF18Q96CE8 201 aa5.93□□□□□ -1.46
PDE4D-226ENST00000546160 ELP4Q96EB1 424 aa5.93□□□□□ -1.46
PDE4D-226ENST00000546160 LYSMD1Q96S90 227 aa5.93□□□□□ -1.46
PDE4D-226ENST00000546160 TP63Q9H3D4 680 aaPredicted RBP5.93□□□□□ -1.46
PDE4D-226ENST00000546160 OLAHQ9NV23 265 aa5.93□□□□□ -1.46
PDE4D-226ENST00000546160 RASD1Q9Y272 281 aa5.93□□□□□ -1.46
PDE4D-226ENST00000546160 KIF26BQ2KJY2 2108 aa5.93□□□□□ -1.46
PDE4D-226ENST00000546160 MDFIC2A0A1B0GVS7 189 aa5.93□□□□□ -1.46
PDE4D-226ENST00000546160 SLC1A3P43003 542 aa5.93□□□□□ -1.46
PDE4D-226ENST00000546160 FNTBP49356 437 aa5.93□□□□□ -1.46
PDE4D-226ENST00000546160 MAP2K6P52564 334 aa5.93□□□□□ -1.46
PDE4D-226ENST00000546160 LGALS4P56470 323 aa5.93□□□□□ -1.46
PDE4D-226ENST00000546160 TBCEQ15813 527 aaPredicted RBP5.93□□□□□ -1.46
PDE4D-226ENST00000546160 PYCR3Q53H96 274 aa5.93□□□□□ -1.46
PDE4D-226ENST00000546160 VHLLQ6RSH7 139 aa5.93□□□□□ -1.46
PDE4D-226ENST00000546160 ADGRG5Q8IZF4 528 aa5.93□□□□□ -1.46
PDE4D-226ENST00000546160 SLC22A24Q8N4F4 322 aa5.93□□□□□ -1.46
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