RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000545308.5

SNHG1-222, Transcript of small nucleolar RNA host gene 1, human

TSL 2

Gene SNHG1, Length 646 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SNHG1-222	ENST00000545308	TRIM49	P0CI25	452 aa		3.21	□□□□□ -1.9
SNHG1-222	ENST00000545308	TRIM49C	P0CI26	452 aa		3.21	□□□□□ -1.9
SNHG1-222	ENST00000545308	SMIM10L2A	P0DMW4	78 aa		3.21	□□□□□ -1.9
SNHG1-222	ENST00000545308	SMIM10L2B	P0DMW5	78 aa		3.21	□□□□□ -1.9
SNHG1-222	ENST00000545308	ACADS	P16219	412 aa		3.21	□□□□□ -1.9
SNHG1-222	ENST00000545308	PTBP1	P26599	531 aa	Known RBP eCLIP	3.21	□□□□□ -1.9	3e-55	■■□□□ 13.5
SNHG1-222	ENST00000545308	UGT1A5	P35504	534 aa		3.21	□□□□□ -1.9
SNHG1-222	ENST00000545308	FNTA	P49354	379 aa		3.21	□□□□□ -1.9
SNHG1-222	ENST00000545308	ARHGDIB	P52566	201 aa		3.21	□□□□□ -1.9
SNHG1-222	ENST00000545308	EFNB2	P52799	333 aa		3.21	□□□□□ -1.9
SNHG1-222	ENST00000545308	ATP5I	P56385	69 aa	Predicted RBP	3.21	□□□□□ -1.9
SNHG1-222	ENST00000545308	ERVPABLB-1	P60509	514 aa		3.21	□□□□□ -1.9
SNHG1-222	ENST00000545308	RND3	P61587	244 aa		3.21	□□□□□ -1.9
SNHG1-222	ENST00000545308	PAX8	Q06710	450 aa		3.21	□□□□□ -1.9
SNHG1-222	ENST00000545308	PUDP	Q08623	228 aa		3.21	□□□□□ -1.9
SNHG1-222	ENST00000545308	CUL1	Q13616	776 aa		3.21	□□□□□ -1.9
SNHG1-222	ENST00000545308	CNPY1	Q3B7I2	92 aa		3.21	□□□□□ -1.9
SNHG1-222	ENST00000545308	TEX44	Q53QW1	395 aa		3.21	□□□□□ -1.9
SNHG1-222	ENST00000545308	LCE1F	Q5T754	118 aa		3.21	□□□□□ -1.9
SNHG1-222	ENST00000545308	UQCC3	Q6UW78	93 aa		3.21	□□□□□ -1.9
SNHG1-222	ENST00000545308	SERPINA9	Q86WD7	417 aa		3.21	□□□□□ -1.9
SNHG1-222	ENST00000545308	CDR2L	Q86X02	465 aa	Predicted RBP	3.21	□□□□□ -1.9
SNHG1-222	ENST00000545308	SLC22A18AS	Q8N1D0	253 aa		3.21	□□□□□ -1.9
SNHG1-222	ENST00000545308	KIR3DL3	Q8N743	410 aa		3.21	□□□□□ -1.9
SNHG1-222	ENST00000545308	CSNK1G2-AS1	Q8NCQ2	148 aa		3.21	□□□□□ -1.9
SNHG1-222	ENST00000545308	CATSPER1	Q8NEC5	780 aa		3.21	□□□□□ -1.9
SNHG1-222	ENST00000545308	OR4D9	Q8NGE8	314 aa		3.21	□□□□□ -1.9
SNHG1-222	ENST00000545308	OR6T1	Q8NGN1	323 aa		3.21	□□□□□ -1.9
SNHG1-222	ENST00000545308	OR1L4	Q8NGR5	311 aa		3.21	□□□□□ -1.9
SNHG1-222	ENST00000545308	TRUB1	Q8WWH5	349 aa	Known RBP	3.21	□□□□□ -1.9
SNHG1-222	ENST00000545308	TMEM80	Q96HE8	168 aa		3.21	□□□□□ -1.9
SNHG1-222	ENST00000545308	RPRD1A	Q96P16	312 aa	Predicted RBP	3.21	□□□□□ -1.9
SNHG1-222	ENST00000545308	AGAP3	Q96P47	875 aa		3.21	□□□□□ -1.9
SNHG1-222	ENST00000545308	OR5B2	Q96R09	309 aa		3.21	□□□□□ -1.9
SNHG1-222	ENST00000545308	CITED1	Q99966	193 aa		3.21	□□□□□ -1.9
SNHG1-222	ENST00000545308	SPATA16	Q9BXB7	569 aa		3.21	□□□□□ -1.9
SNHG1-222	ENST00000545308	PARD6B	Q9BYG5	372 aa		3.21	□□□□□ -1.9
SNHG1-222	ENST00000545308	POMK	Q9H5K3	350 aa		3.21	□□□□□ -1.9
SNHG1-222	ENST00000545308	HEXA-AS1	Q9H8Q6	139 aa		3.21	□□□□□ -1.9
SNHG1-222	ENST00000545308	POLE4	Q9NR33	117 aa		3.21	□□□□□ -1.9
SNHG1-222	ENST00000545308	ARMCX1	Q9P291	453 aa		3.21	□□□□□ -1.9
SNHG1-222	ENST00000545308	SEC14L3	Q9UDX4	400 aa		3.21	□□□□□ -1.9
SNHG1-222	ENST00000545308	SLC2A6	Q9UGQ3	507 aa		3.21	□□□□□ -1.9
SNHG1-222	ENST00000545308	ZNF639	Q9UID6	485 aa		3.21	□□□□□ -1.9
SNHG1-222	ENST00000545308	AK6	Q9Y3D8	172 aa	Known RBP	3.21	□□□□□ -1.9
SNHG1-222	ENST00000545308	L3MBTL1	Q9Y468	752 aa		3.21	□□□□□ -1.9
SNHG1-222	ENST00000545308	STYXL1	Q9Y6J8	313 aa		3.21	□□□□□ -1.9
SNHG1-222	ENST00000545308	SETX	Q7Z333	2677 aa	Known RBP	3.21	□□□□□ -1.9
SNHG1-222	ENST00000545308	GPR179	Q6PRD1	2367 aa		3.2	□□□□□ -1.9
SNHG1-222	ENST00000545308	ZBED9	Q6R2W3	1325 aa		3.2	□□□□□ -1.9
SNHG1-222	ENST00000545308	CCDC171	Q6TFL3	1326 aa		3.2	□□□□□ -1.9
SNHG1-222	ENST00000545308	PCNX2	A6NKB5	2137 aa		3.2	□□□□□ -1.9
SNHG1-222	ENST00000545308	FRY	Q5TBA9	3013 aa		3.2	□□□□□ -1.9
SNHG1-222	ENST00000545308	IGHV2-70D	A0A0C4DH43	119 aa		3.2	□□□□□ -1.9
SNHG1-222	ENST00000545308		A0A1W2PPR1	153 aa		3.2	□□□□□ -1.9
SNHG1-222	ENST00000545308	ZNF840P	A6NDX5	716 aa		3.2	□□□□□ -1.9
SNHG1-222	ENST00000545308	BTBD17	A6NE02	478 aa		3.2	□□□□□ -1.9
SNHG1-222	ENST00000545308	PCP4L1	A6NKN8	68 aa		3.2	□□□□□ -1.9
SNHG1-222	ENST00000545308	PP2D1	A8MPX8	630 aa		3.2	□□□□□ -1.9
SNHG1-222	ENST00000545308	SHISA9	B4DS77	424 aa		3.2	□□□□□ -1.9
SNHG1-222	ENST00000545308		H7C423	109 aa		3.2	□□□□□ -1.9
SNHG1-222	ENST00000545308	RS1	O15537	224 aa		3.2	□□□□□ -1.9
SNHG1-222	ENST00000545308	LAT	O43561	262 aa		3.2	□□□□□ -1.9
SNHG1-222	ENST00000545308	PRKAB2	O43741	272 aa		3.2	□□□□□ -1.9
SNHG1-222	ENST00000545308	SLC2A3	P11169	496 aa		3.2	□□□□□ -1.9
SNHG1-222	ENST00000545308	MX1	P20591	662 aa		3.2	□□□□□ -1.9
SNHG1-222	ENST00000545308	CD80	P33681	288 aa		3.2	□□□□□ -1.9
SNHG1-222	ENST00000545308	RPS9	P46781	194 aa	Known RBP	3.2	□□□□□ -1.9
SNHG1-222	ENST00000545308	HLCS	P50747	726 aa		3.2	□□□□□ -1.9
SNHG1-222	ENST00000545308	SUCLG1	P53597	346 aa	Known RBP	3.2	□□□□□ -1.9
SNHG1-222	ENST00000545308	VLDLR	P98155	873 aa		3.2	□□□□□ -1.9
SNHG1-222	ENST00000545308	FCHO2	Q0JRZ9	810 aa		3.2	□□□□□ -1.9
SNHG1-222	ENST00000545308	PPP1R3A	Q16821	1122 aa		3.2	□□□□□ -1.9
SNHG1-222	ENST00000545308	IMMT	Q16891	758 aa	Known RBP	3.2	□□□□□ -1.9
SNHG1-222	ENST00000545308	OR2A2	Q6IF42	318 aa		3.2	□□□□□ -1.9
SNHG1-222	ENST00000545308	ZNF343	Q6P1L6	599 aa		3.2	□□□□□ -1.9
SNHG1-222	ENST00000545308	FAM199X	Q6PEV8	388 aa	Predicted RBP	3.2	□□□□□ -1.9
SNHG1-222	ENST00000545308	PAQR6	Q6TCH4	344 aa		3.2	□□□□□ -1.9
SNHG1-222	ENST00000545308	TMUB2	Q71RG4	321 aa		3.2	□□□□□ -1.9
SNHG1-222	ENST00000545308	NANOGNB	Q7Z5D8	188 aa		3.2	□□□□□ -1.9
SNHG1-222	ENST00000545308	ERICH1	Q86X53	443 aa		3.2	□□□□□ -1.9
SNHG1-222	ENST00000545308	UBE2J2	Q8N2K1	259 aa		3.2	□□□□□ -1.9
SNHG1-222	ENST00000545308	FGFRL1	Q8N441	504 aa		3.2	□□□□□ -1.9
SNHG1-222	ENST00000545308	DHRSX	Q8N5I4	330 aa		3.2	□□□□□ -1.9
SNHG1-222	ENST00000545308	CSNK1A1L	Q8N752	337 aa		3.2	□□□□□ -1.9
SNHG1-222	ENST00000545308		Q8N9G6	341 aa	Predicted RBP	3.2	□□□□□ -1.9
SNHG1-222	ENST00000545308	OR9K2	Q8NGE7	335 aa		3.2	□□□□□ -1.9
SNHG1-222	ENST00000545308	OR52K2	Q8NGK3	314 aa		3.2	□□□□□ -1.9
SNHG1-222	ENST00000545308	ITLN1	Q8WWA0	313 aa		3.2	□□□□□ -1.9
SNHG1-222	ENST00000545308	C10orf35	Q96D05	121 aa		3.2	□□□□□ -1.9
SNHG1-222	ENST00000545308	CELF6	Q96J87	481 aa	Known RBP	3.2	□□□□□ -1.9
SNHG1-222	ENST00000545308	CNOT6L	Q96LI5	555 aa	Known RBP	3.2	□□□□□ -1.9
SNHG1-222	ENST00000545308	RBM14	Q96PK6	669 aa	Known RBP	3.2	□□□□□ -1.9
SNHG1-222	ENST00000545308	TAAR1	Q96RJ0	339 aa		3.2	□□□□□ -1.9
SNHG1-222	ENST00000545308	NIPSNAP3B	Q9BS92	247 aa		3.2	□□□□□ -1.9
SNHG1-222	ENST00000545308	TUBGCP2	Q9BSJ2	902 aa		3.2	□□□□□ -1.9
SNHG1-222	ENST00000545308	ZBP1	Q9H171	429 aa		3.2	□□□□□ -1.9
SNHG1-222	ENST00000545308	RHBG	Q9H310	441 aa		3.2	□□□□□ -1.9
SNHG1-222	ENST00000545308	GNB4	Q9HAV0	340 aa		3.2	□□□□□ -1.9
SNHG1-222	ENST00000545308	ZFP14	Q9HCL3	533 aa		3.2	□□□□□ -1.9

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