RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000533054.5

ROBO4-208, Transcript of roundabout guidance receptor 4, human

TSL 2 BASIC

Gene ROBO4, Length 3,071 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
ROBO4-208	ENST00000533054	ZNF350	Q9GZX5	532 aa		11.18	□□□□□ -0.62
ROBO4-208	ENST00000533054	GPN3	Q9UHW5	284 aa	Predicted RBP	11.18	□□□□□ -0.62
ROBO4-208	ENST00000533054	GLS2	Q9UI32	602 aa		11.18	□□□□□ -0.62
ROBO4-208	ENST00000533054	ELF5	Q9UKW6	265 aa	Predicted RBP	11.18	□□□□□ -0.62
ROBO4-208	ENST00000533054	MGAT4A	Q9UM21	535 aa		11.18	□□□□□ -0.62
ROBO4-208	ENST00000533054	SRPK3	Q9UPE1	567 aa		11.18	□□□□□ -0.62
ROBO4-208	ENST00000533054	ANGPTL1	O95841	491 aa		11.17	□□□□□ -0.62
ROBO4-208	ENST00000533054	HRG	P04196	525 aa		11.17	□□□□□ -0.62
ROBO4-208	ENST00000533054	FBP1	P09467	338 aa		11.17	□□□□□ -0.62
ROBO4-208	ENST00000533054	SMIM6	P0DI80	62 aa		11.17	□□□□□ -0.62
ROBO4-208	ENST00000533054	PNLIP	P16233	465 aa		11.17	□□□□□ -0.62
ROBO4-208	ENST00000533054	ZNF28	P17035	718 aa		11.17	□□□□□ -0.62
ROBO4-208	ENST00000533054	DEFA5	Q01523	94 aa		11.17	□□□□□ -0.62
ROBO4-208	ENST00000533054	CLEC12A	Q5QGZ9	265 aa		11.17	□□□□□ -0.62
ROBO4-208	ENST00000533054	FAHD1	Q6P587	224 aa		11.17	□□□□□ -0.62
ROBO4-208	ENST00000533054	ZNF782	Q6ZMW2	699 aa	Predicted RBP	11.17	□□□□□ -0.62
ROBO4-208	ENST00000533054	TIPARP	Q7Z3E1	657 aa	Known RBP	11.17	□□□□□ -0.62
ROBO4-208	ENST00000533054	IQCF1	Q8N6M8	205 aa		11.17	□□□□□ -0.62
ROBO4-208	ENST00000533054	AGBL5	Q8NDL9	886 aa		11.17	□□□□□ -0.62
ROBO4-208	ENST00000533054	MR1	Q95460	341 aa		11.17	□□□□□ -0.62
ROBO4-208	ENST00000533054	NEU1	Q99519	415 aa		11.17	□□□□□ -0.62
ROBO4-208	ENST00000533054	APOL4	Q9BPW4	351 aa		11.17	□□□□□ -0.62
ROBO4-208	ENST00000533054	NUDT9	Q9BW91	350 aa		11.17	□□□□□ -0.62
ROBO4-208	ENST00000533054	CHRNA10	Q9GZZ6	450 aa		11.17	□□□□□ -0.62
ROBO4-208	ENST00000533054	PAK1IP1	Q9NWT1	392 aa	Predicted RBP	11.17	□□□□□ -0.62
ROBO4-208	ENST00000533054	CBLC	Q9ULV8	474 aa		11.17	□□□□□ -0.62
ROBO4-208	ENST00000533054	SLC7A7	Q9UM01	511 aa		11.17	□□□□□ -0.62
ROBO4-208	ENST00000533054	KCNMB2	Q9Y691	235 aa		11.17	□□□□□ -0.62
ROBO4-208	ENST00000533054	SESN1	Q9Y6P5	492 aa		11.17	□□□□□ -0.62
ROBO4-208	ENST00000533054	NKX2-2	O95096	273 aa		11.17	□□□□□ -0.62
ROBO4-208	ENST00000533054	DBI	P07108	87 aa	Known RBP	11.17	□□□□□ -0.62
ROBO4-208	ENST00000533054	C6orf141	Q5SZD1	244 aa		11.17	□□□□□ -0.62
ROBO4-208	ENST00000533054	RHBDD2	Q6NTF9	364 aa		11.17	□□□□□ -0.62
ROBO4-208	ENST00000533054	MED25	Q71SY5	747 aa		11.17	□□□□□ -0.62
ROBO4-208	ENST00000533054	RNASE11	Q8TAA1	199 aa	Known RBP	11.17	□□□□□ -0.62
ROBO4-208	ENST00000533054	METTL21A	Q8WXB1	218 aa		11.17	□□□□□ -0.62
ROBO4-208	ENST00000533054	SLC38A4	Q969I6	547 aa		11.17	□□□□□ -0.62
ROBO4-208	ENST00000533054	RDH12	Q96NR8	316 aa		11.17	□□□□□ -0.62
ROBO4-208	ENST00000533054	OR1F2P	Q96R84	312 aa		11.17	□□□□□ -0.62
ROBO4-208	ENST00000533054	STAC	Q99469	402 aa		11.17	□□□□□ -0.62
ROBO4-208	ENST00000533054	ZBTB20	Q9HC78	741 aa	Predicted RBP	11.17	□□□□□ -0.62
ROBO4-208	ENST00000533054		A0A087WUU8	490 aa		11.17	□□□□□ -0.62
ROBO4-208	ENST00000533054	C1QB	P02746	253 aa		11.17	□□□□□ -0.62
ROBO4-208	ENST00000533054	GPR4	P46093	362 aa		11.17	□□□□□ -0.62
ROBO4-208	ENST00000533054	ISL1	P61371	349 aa		11.17	□□□□□ -0.62
ROBO4-208	ENST00000533054	DCD	P81605	110 aa	Known RBP	11.17	□□□□□ -0.62
ROBO4-208	ENST00000533054	FOXK1	P85037	733 aa		11.17	□□□□□ -0.62
ROBO4-208	ENST00000533054	POU4F2	Q12837	409 aa		11.17	□□□□□ -0.62
ROBO4-208	ENST00000533054	ZNF404	Q494X3	552 aa		11.17	□□□□□ -0.62
ROBO4-208	ENST00000533054	FAM46A	Q96IP4	442 aa	Known RBP	11.17	□□□□□ -0.62
ROBO4-208	ENST00000533054	PRRC1	Q96M27	445 aa		11.17	□□□□□ -0.62
ROBO4-208	ENST00000533054	FLRT3	Q9NZU0	649 aa		11.17	□□□□□ -0.62
ROBO4-208	ENST00000533054	COPS7A	Q9UBW8	275 aa		11.17	□□□□□ -0.62
ROBO4-208	ENST00000533054	WASF3	Q9UPY6	502 aa		11.17	□□□□□ -0.62
ROBO4-208	ENST00000533054	POFUT2	Q9Y2G5	429 aa		11.17	□□□□□ -0.62
ROBO4-208	ENST00000533054	C2orf92	A0A1B0GVN3	265 aa		11.16	□□□□□ -0.62
ROBO4-208	ENST00000533054	ADRB1	P08588	477 aa		11.16	□□□□□ -0.62
ROBO4-208	ENST00000533054	NID1	P14543	1247 aa		11.16	□□□□□ -0.62
ROBO4-208	ENST00000533054	SMIM11A	P58511	58 aa		11.16	□□□□□ -0.62
ROBO4-208	ENST00000533054	EXOSC2	Q13868	293 aa	Known RBP	11.16	□□□□□ -0.62
ROBO4-208	ENST00000533054	PTGES3	Q15185	160 aa	Known RBP	11.16	□□□□□ -0.62
ROBO4-208	ENST00000533054	KRBOX4	Q5JUW0	171 aa		11.16	□□□□□ -0.62
ROBO4-208	ENST00000533054	ZNF691	Q5VV52	312 aa		11.16	□□□□□ -0.62
ROBO4-208	ENST00000533054	PEAR1	Q5VY43	1037 aa	Predicted RBP	11.16	□□□□□ -0.62
ROBO4-208	ENST00000533054	LINC00299	Q6ZSB3	139 aa		11.16	□□□□□ -0.62
ROBO4-208	ENST00000533054	ZNF605	Q86T29	641 aa		11.16	□□□□□ -0.62
ROBO4-208	ENST00000533054	ZNF227	Q86WZ6	799 aa		11.16	□□□□□ -0.62
ROBO4-208	ENST00000533054	CCDC71	Q8IV32	467 aa	Predicted RBP	11.16	□□□□□ -0.62
ROBO4-208	ENST00000533054	C12orf45	Q8N5I9	185 aa	Predicted RBP	11.16	□□□□□ -0.62
ROBO4-208	ENST00000533054	BCORP1	Q8N888	145 aa		11.16	□□□□□ -0.62
ROBO4-208	ENST00000533054	TMEM255B	Q8WV15	326 aa		11.16	□□□□□ -0.62
ROBO4-208	ENST00000533054	OTULIN	Q96BN8	352 aa		11.16	□□□□□ -0.62
ROBO4-208	ENST00000533054	PDCD10	Q9BUL8	212 aa		11.16	□□□□□ -0.62
ROBO4-208	ENST00000533054	GPR61	Q9BZJ8	451 aa		11.16	□□□□□ -0.62
ROBO4-208	ENST00000533054	ULBP3	Q9BZM4	244 aa		11.16	□□□□□ -0.62
ROBO4-208	ENST00000533054	MKKS	Q9NPJ1	570 aa	Predicted RBP	11.16	□□□□□ -0.62
ROBO4-208	ENST00000533054	SDHAF2	Q9NX18	166 aa		11.16	□□□□□ -0.62
ROBO4-208	ENST00000533054	MAP1B	P46821	2468 aa	Known RBP	11.16	□□□□□ -0.62
ROBO4-208	ENST00000533054	TCRBV16S1A1N1	A0A5B0	115 aa		11.16	□□□□□ -0.62
ROBO4-208	ENST00000533054	C17orf51	A8MQB3	221 aa		11.16	□□□□□ -0.62
ROBO4-208	ENST00000533054	ABCD4	O14678	606 aa		11.16	□□□□□ -0.62
ROBO4-208	ENST00000533054	MMP11	P24347	488 aa		11.16	□□□□□ -0.62
ROBO4-208	ENST00000533054	MYL9	P24844	172 aa		11.16	□□□□□ -0.62
ROBO4-208	ENST00000533054	AZGP1	P25311	298 aa	Known RBP	11.16	□□□□□ -0.62
ROBO4-208	ENST00000533054	RORA	P35398	523 aa		11.16	□□□□□ -0.62
ROBO4-208	ENST00000533054	EMP2	P54851	167 aa		11.16	□□□□□ -0.62
ROBO4-208	ENST00000533054	GP2	P55259	537 aa	Known RBP	11.16	□□□□□ -0.62
ROBO4-208	ENST00000533054	FUT7	Q11130	342 aa		11.16	□□□□□ -0.62
ROBO4-208	ENST00000533054	CDK5R2	Q13319	367 aa		11.16	□□□□□ -0.62
ROBO4-208	ENST00000533054	NRM	Q8IXM6	262 aa		11.16	□□□□□ -0.62
ROBO4-208	ENST00000533054	ZNF615	Q8N8J6	731 aa		11.16	□□□□□ -0.62
ROBO4-208	ENST00000533054	ZNF511	Q8NB15	262 aa		11.16	□□□□□ -0.62
ROBO4-208	ENST00000533054	DAZL	Q92904	295 aa	Known RBP	11.16	□□□□□ -0.62
ROBO4-208	ENST00000533054	SLC41A3	Q96GZ6	507 aa		11.16	□□□□□ -0.62
ROBO4-208	ENST00000533054	GPA33	Q99795	319 aa		11.16	□□□□□ -0.62
ROBO4-208	ENST00000533054	GABARAPL1	Q9H0R8	117 aa		11.16	□□□□□ -0.62
ROBO4-208	ENST00000533054	ALX4	Q9H161	411 aa	Predicted RBP	11.16	□□□□□ -0.62
ROBO4-208	ENST00000533054	MAN2C1	Q9NTJ4	1040 aa		11.16	□□□□□ -0.62
ROBO4-208	ENST00000533054	EXTL2	Q9UBQ6	330 aa		11.16	□□□□□ -0.62
ROBO4-208	ENST00000533054	GHRL	Q9UBU3	117 aa		11.16	□□□□□ -0.62

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