RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000476423.5

SZRD1-208, Transcript of SUZ RNA binding domain containing 1, humanhuman

TSL 4

Gene SZRD1, Length 567 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SZRD1-208ENST00000476423 TTC23Q5W5X9 447 aa6.93□□□□□ -1.3
SZRD1-208ENST00000476423 ALKBH2Q6NS38 261 aa6.93□□□□□ -1.3
SZRD1-208ENST00000476423 STAC2Q6ZMT1 411 aa6.93□□□□□ -1.3
SZRD1-208ENST00000476423 Q6ZPA2 131 aa6.93□□□□□ -1.3
SZRD1-208ENST00000476423 GALNT10Q86SR1 603 aa6.93□□□□□ -1.3
SZRD1-208ENST00000476423 SNX32Q86XE0 403 aa6.93□□□□□ -1.3
SZRD1-208ENST00000476423 FBXL14Q8N1E6 418 aa6.93□□□□□ -1.3
SZRD1-208ENST00000476423 CLEC4FQ8N1N0 589 aa6.93□□□□□ -1.3
SZRD1-208ENST00000476423 ZNF619Q8N2I2 560 aa6.93□□□□□ -1.3
SZRD1-208ENST00000476423 ZNF781Q8N8C0 355 aa6.93□□□□□ -1.3
SZRD1-208ENST00000476423 SYT14Q8NB59 555 aa6.93□□□□□ -1.3
SZRD1-208ENST00000476423 PAPD5Q8NDF8 572 aaKnown RBP6.93□□□□□ -1.3
SZRD1-208ENST00000476423 KBTBD8Q8NFY9 601 aa6.93□□□□□ -1.3
SZRD1-208ENST00000476423 OR7A2PQ8NGA2 310 aa6.93□□□□□ -1.3
SZRD1-208ENST00000476423 OR4K17Q8NGC6 315 aa6.93□□□□□ -1.3
SZRD1-208ENST00000476423 OR6F1Q8NGZ6 308 aa6.93□□□□□ -1.3
SZRD1-208ENST00000476423 RHEBL1Q8TAI7 183 aa6.93□□□□□ -1.3
SZRD1-208ENST00000476423 MUL1Q969V5 352 aa6.93□□□□□ -1.3
SZRD1-208ENST00000476423 EXOSC8Q96B26 276 aaKnown RBP6.93□□□□□ -1.3
SZRD1-208ENST00000476423 PHF21BQ96EK2 531 aa6.93□□□□□ -1.3
SZRD1-208ENST00000476423 AURKBQ96GD4 344 aaPredicted RBP6.93□□□□□ -1.3
SZRD1-208ENST00000476423 WWC2-AS2Q96NR7 200 aa6.93□□□□□ -1.3
SZRD1-208ENST00000476423 HOPXQ9BPY8 73 aaPredicted RBP6.93□□□□□ -1.3
SZRD1-208ENST00000476423 CCDC32Q9BV29 185 aa6.93□□□□□ -1.3
SZRD1-208ENST00000476423 RSPO3Q9BXY4 272 aaPredicted RBP6.93□□□□□ -1.3
SZRD1-208ENST00000476423 EBPLQ9BY08 206 aa6.93□□□□□ -1.3
SZRD1-208ENST00000476423 ACTR6Q9GZN1 396 aa6.93□□□□□ -1.3
SZRD1-208ENST00000476423 PLSCR4Q9NRQ2 329 aa6.93□□□□□ -1.3
SZRD1-208ENST00000476423 B3GNT2Q9NY97 397 aa6.93□□□□□ -1.3
SZRD1-208ENST00000476423 MED11Q9P086 117 aa6.93□□□□□ -1.3
SZRD1-208ENST00000476423 PPP4R1LQ9P1A2 415 aa6.93□□□□□ -1.3
SZRD1-208ENST00000476423 MARCOQ9UEW3 520 aaPredicted RBP6.93□□□□□ -1.3
SZRD1-208ENST00000476423 CD300AQ9UGN4 299 aa6.93□□□□□ -1.3
SZRD1-208ENST00000476423 UTS2RQ9UKP6 389 aa6.93□□□□□ -1.3
SZRD1-208ENST00000476423 CFL2Q9Y281 166 aa6.93□□□□□ -1.3
SZRD1-208ENST00000476423 ACOT9Q9Y305 439 aa6.93□□□□□ -1.3
SZRD1-208ENST00000476423 RBMX2Q9Y388 322 aaKnown RBP6.93□□□□□ -1.3
SZRD1-208ENST00000476423 RAP2CQ9Y3L5 183 aa6.93□□□□□ -1.3
SZRD1-208ENST00000476423 FKBP7Q9Y680 259 aa6.93□□□□□ -1.3
SZRD1-208ENST00000476423 GIMAP1-GIMAP5A0A087WTJ2 511 aa6.92□□□□□ -1.3
SZRD1-208ENST00000476423 C1orf226A1L170 272 aa6.92□□□□□ -1.3
SZRD1-208ENST00000476423 LOC110117498-PIK3R3F6TDL0 507 aa6.92□□□□□ -1.3
SZRD1-208ENST00000476423 SULT1B1O43704 296 aa6.92□□□□□ -1.3
SZRD1-208ENST00000476423 FADS1O60427 444 aa6.92□□□□□ -1.3
SZRD1-208ENST00000476423 RGS9O75916 674 aaPredicted RBP6.92□□□□□ -1.3
SZRD1-208ENST00000476423 SBK3P0C264 359 aa6.92□□□□□ -1.3
SZRD1-208ENST00000476423 NAT2P11245 290 aa6.92□□□□□ -1.3
SZRD1-208ENST00000476423 IL11P20809 199 aa6.92□□□□□ -1.3
SZRD1-208ENST00000476423 PTNP21246 168 aa6.92□□□□□ -1.3
SZRD1-208ENST00000476423 SHC1P29353 583 aa6.92□□□□□ -1.3
SZRD1-208ENST00000476423 IL12BP29460 328 aa6.92□□□□□ -1.3
SZRD1-208ENST00000476423 TALDO1P37837 337 aa6.92□□□□□ -1.3
SZRD1-208ENST00000476423 ETV6P41212 452 aa6.92□□□□□ -1.3
SZRD1-208ENST00000476423 CBX5P45973 191 aa6.92□□□□□ -1.3
SZRD1-208ENST00000476423 SLC9A3P48764 834 aa6.92□□□□□ -1.3
SZRD1-208ENST00000476423 RNF144AP50876 292 aaPredicted RBP6.92□□□□□ -1.3
SZRD1-208ENST00000476423 CDH13P55290 713 aa6.92□□□□□ -1.3
SZRD1-208ENST00000476423 EEFSECP57772 596 aaKnown RBP6.92□□□□□ -1.3
SZRD1-208ENST00000476423 PSME3P61289 254 aa6.92□□□□□ -1.3
SZRD1-208ENST00000476423 ADARB1P78563 741 aaKnown RBP6.92□□□□□ -1.3
SZRD1-208ENST00000476423 MS4A2Q01362 244 aa6.92□□□□□ -1.3
SZRD1-208ENST00000476423 COX10Q12887 443 aa6.92□□□□□ -1.3
SZRD1-208ENST00000476423 TMEM44Q2T9K0 475 aa6.92□□□□□ -1.3
SZRD1-208ENST00000476423 SMU1Q2TAY7 513 aa6.92□□□□□ -1.3
SZRD1-208ENST00000476423 CTU2Q2VPK5 515 aaKnown RBP6.92□□□□□ -1.3
SZRD1-208ENST00000476423 MTX3Q5HYI7 312 aa6.92□□□□□ -1.3
SZRD1-208ENST00000476423 COQ5Q5HYK3 327 aa6.92□□□□□ -1.3
SZRD1-208ENST00000476423 DDX59Q5T1V6 619 aaKnown RBP eCLIP6.92□□□□□ -1.3
SZRD1-208ENST00000476423 GRTP1Q5TC63 336 aa6.92□□□□□ -1.3
SZRD1-208ENST00000476423 APOOLQ6UXV4 268 aa6.92□□□□□ -1.3
SZRD1-208ENST00000476423 CREB3L2Q70SY1 520 aa6.92□□□□□ -1.3
SZRD1-208ENST00000476423 SSX8Q7RTT4 187 aa6.92□□□□□ -1.3
SZRD1-208ENST00000476423 ADCK1Q86TW2 530 aa6.92□□□□□ -1.3
SZRD1-208ENST00000476423 STK32CQ86UX6 486 aa6.92□□□□□ -1.3
SZRD1-208ENST00000476423 GLCCI1Q86VQ1 547 aa6.92□□□□□ -1.3
SZRD1-208ENST00000476423 DHFR2Q86XF0 187 aa6.92□□□□□ -1.3
SZRD1-208ENST00000476423 LYSMD2Q8IV50 215 aa6.92□□□□□ -1.3
SZRD1-208ENST00000476423 SLC44A2Q8IWA5 706 aaPredicted RBP6.92□□□□□ -1.3
SZRD1-208ENST00000476423 CCDC116Q8IYX3 515 aa6.92□□□□□ -1.3
SZRD1-208ENST00000476423 FBXO30Q8TB52 745 aa6.92□□□□□ -1.3
SZRD1-208ENST00000476423 ZNF675Q8TD23 568 aa6.92□□□□□ -1.3
SZRD1-208ENST00000476423 LRTOMTQ8WZ04 291 aa6.92□□□□□ -1.3
SZRD1-208ENST00000476423 HSD17B8Q92506 261 aa6.92□□□□□ -1.3
SZRD1-208ENST00000476423 PIK3R3Q92569 461 aa6.92□□□□□ -1.3
SZRD1-208ENST00000476423 ZNF566Q969W8 418 aa6.92□□□□□ -1.3
SZRD1-208ENST00000476423 C1GALT1C1Q96EU7 318 aa6.92□□□□□ -1.3
SZRD1-208ENST00000476423 GIMAP5Q96F15 307 aa6.92□□□□□ -1.3
SZRD1-208ENST00000476423 SLC29A1Q99808 456 aa6.92□□□□□ -1.3
SZRD1-208ENST00000476423 TMEM185BQ9H7F4 350 aa6.92□□□□□ -1.3
SZRD1-208ENST00000476423 NIPAL2Q9H841 368 aa6.92□□□□□ -1.3
SZRD1-208ENST00000476423 ZMAT3Q9HA38 289 aaKnown RBP6.92□□□□□ -1.3
SZRD1-208ENST00000476423 RPRD1BQ9NQG5 326 aaKnown RBP6.92□□□□□ -1.3
SZRD1-208ENST00000476423 GIMAP4Q9NUV9 329 aa6.92□□□□□ -1.3
SZRD1-208ENST00000476423 TMEM45AQ9NWC5 275 aa6.92□□□□□ -1.3
SZRD1-208ENST00000476423 MRPL39Q9NYK5 338 aaKnown RBP6.92□□□□□ -1.3
SZRD1-208ENST00000476423 ADAM29Q9UKF5 820 aa6.92□□□□□ -1.3
SZRD1-208ENST00000476423 ZNF175Q9Y473 711 aa6.92□□□□□ -1.3
SZRD1-208ENST00000476423 SNX5Q9Y5X3 404 aa6.92□□□□□ -1.3
SZRD1-208ENST00000476423 ARPC4-TTLL3A0A0A6YYG9 625 aa6.91□□□□□ -1.3
SZRD1-208ENST00000476423 IGHV4-61A0A0C4DH41 118 aa6.91□□□□□ -1.3
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 22.3 ms