RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000467435.1

HDLBP-231, Transcript of high density lipoprotein binding protein, human

TSL 2

Gene HDLBP, Length 639 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
HDLBP-231	ENST00000467435	MRPL3	P09001	348 aa	Known RBP	11.1	□□□□□ -0.63
HDLBP-231	ENST00000467435	LIMS3	P0CW19	117 aa		11.1	□□□□□ -0.63
HDLBP-231	ENST00000467435	LIMS4	P0CW20	117 aa		11.1	□□□□□ -0.63
HDLBP-231	ENST00000467435	TFPI	P10646	304 aa		11.1	□□□□□ -0.63
HDLBP-231	ENST00000467435	LIF	P15018	202 aa		11.1	□□□□□ -0.63
HDLBP-231	ENST00000467435	IL11	P20809	199 aa		11.1	□□□□□ -0.63
HDLBP-231	ENST00000467435	PAX7	P23759	505 aa		11.1	□□□□□ -0.63
HDLBP-231	ENST00000467435	ITGA3	P26006	1051 aa		11.1	□□□□□ -0.63
HDLBP-231	ENST00000467435	EIF1	P41567	113 aa	Known RBP	11.1	□□□□□ -0.63
HDLBP-231	ENST00000467435	MAP2K6	P52564	334 aa		11.1	□□□□□ -0.63
HDLBP-231	ENST00000467435	WNT4	P56705	351 aa		11.1	□□□□□ -0.63
HDLBP-231	ENST00000467435	DBP	Q10586	325 aa	Predicted RBP	11.1	□□□□□ -0.63
HDLBP-231	ENST00000467435	MLLT11	Q13015	90 aa	Predicted RBP	11.1	□□□□□ -0.63
HDLBP-231	ENST00000467435	AIMP2	Q13155	320 aa	Known RBP	11.1	□□□□□ -0.63
HDLBP-231	ENST00000467435	MFSD13A	Q14CX5	517 aa		11.1	□□□□□ -0.63
HDLBP-231	ENST00000467435	SPHAR	Q15513	63 aa		11.1	□□□□□ -0.63
HDLBP-231	ENST00000467435	OR7A5	Q15622	319 aa		11.1	□□□□□ -0.63
HDLBP-231	ENST00000467435	CTF1	Q16619	201 aa		11.1	□□□□□ -0.63
HDLBP-231	ENST00000467435	ZNF800	Q2TB10	664 aa	Predicted RBP eCLIP	11.1	□□□□□ -0.63	2e-13	■■■□□ 15.8
HDLBP-231	ENST00000467435	EMC4	Q5J8M3	183 aa		11.1	□□□□□ -0.63
HDLBP-231	ENST00000467435	DCAF10	Q5QP82	559 aa		11.1	□□□□□ -0.63
HDLBP-231	ENST00000467435	ASCL5	Q7RTU5	278 aa		11.1	□□□□□ -0.63
HDLBP-231	ENST00000467435	GHDC	Q8N2G8	530 aa		11.1	□□□□□ -0.63
HDLBP-231	ENST00000467435	OR5M1	Q8NGP8	315 aa		11.1	□□□□□ -0.63
HDLBP-231	ENST00000467435	OR1J4	Q8NGS1	313 aa		11.1	□□□□□ -0.63
HDLBP-231	ENST00000467435	MFSD8	Q8NHS3	518 aa		11.1	□□□□□ -0.63
HDLBP-231	ENST00000467435	ZNF417	Q8TAU3	575 aa		11.1	□□□□□ -0.63
HDLBP-231	ENST00000467435	ZPLD1	Q8TCW7	415 aa		11.1	□□□□□ -0.63
HDLBP-231	ENST00000467435	PSMF1	Q92530	271 aa		11.1	□□□□□ -0.63
HDLBP-231	ENST00000467435	ZNF587	Q96SQ5	575 aa	Predicted RBP	11.1	□□□□□ -0.63
HDLBP-231	ENST00000467435	JAM3	Q9BX67	310 aa		11.1	□□□□□ -0.63
HDLBP-231	ENST00000467435	POTEKP	Q9BYX7	375 aa		11.1	□□□□□ -0.63
HDLBP-231	ENST00000467435	INIP	Q9NRY2	104 aa		11.1	□□□□□ -0.63
HDLBP-231	ENST00000467435	SACM1L	Q9NTJ5	587 aa		11.1	□□□□□ -0.63
HDLBP-231	ENST00000467435	ALKBH4	Q9NXW9	302 aa		11.1	□□□□□ -0.63
HDLBP-231	ENST00000467435	MRPL39	Q9NYK5	338 aa	Known RBP	11.1	□□□□□ -0.63
HDLBP-231	ENST00000467435	TAS2R5	Q9NYW4	299 aa		11.1	□□□□□ -0.63
HDLBP-231	ENST00000467435	ABI3	Q9P2A4	366 aa		11.1	□□□□□ -0.63
HDLBP-231	ENST00000467435	GRHPR	Q9UBQ7	328 aa		11.1	□□□□□ -0.63
HDLBP-231	ENST00000467435	TEKT2	Q9UIF3	430 aa		11.1	□□□□□ -0.63
HDLBP-231	ENST00000467435	CORIN	Q9Y5Q5	1042 aa		11.1	□□□□□ -0.63
HDLBP-231	ENST00000467435		A0A0G2JMM0	328 aa		11.09	□□□□□ -0.63
HDLBP-231	ENST00000467435		A0A1W2PPB8	328 aa		11.09	□□□□□ -0.63
HDLBP-231	ENST00000467435		A0A1W2PRS3	328 aa		11.09	□□□□□ -0.63
HDLBP-231	ENST00000467435	OR6C68	A6NDL8	312 aa		11.09	□□□□□ -0.63
HDLBP-231	ENST00000467435	VGLL3	A8MV65	326 aa		11.09	□□□□□ -0.63
HDLBP-231	ENST00000467435	KIR3DP1	A8MWS1	328 aa		11.09	□□□□□ -0.63
HDLBP-231	ENST00000467435		J3QRE1	110 aa		11.09	□□□□□ -0.63
HDLBP-231	ENST00000467435	CCRL2	O00421	344 aa		11.09	□□□□□ -0.63
HDLBP-231	ENST00000467435	PLPP3	O14495	311 aa		11.09	□□□□□ -0.63
HDLBP-231	ENST00000467435	TM4SF5	O14894	197 aa		11.09	□□□□□ -0.63
HDLBP-231	ENST00000467435	SLC22A1	O15245	554 aa		11.09	□□□□□ -0.63
HDLBP-231	ENST00000467435	PLG	P00747	810 aa	Predicted RBP	11.09	□□□□□ -0.63
HDLBP-231	ENST00000467435	IGHM	P01871	453 aa		11.09	□□□□□ -0.63
HDLBP-231	ENST00000467435	SCG5	P05408	212 aa		11.09	□□□□□ -0.63
HDLBP-231	ENST00000467435	LIPC	P11150	499 aa		11.09	□□□□□ -0.63
HDLBP-231	ENST00000467435	AHCY	P23526	432 aa		11.09	□□□□□ -0.63
HDLBP-231	ENST00000467435	GADD45A	P24522	165 aa		11.09	□□□□□ -0.63
HDLBP-231	ENST00000467435	DPP4	P27487	766 aa		11.09	□□□□□ -0.63
HDLBP-231	ENST00000467435	ADH6	P28332	368 aa		11.09	□□□□□ -0.63
HDLBP-231	ENST00000467435	CD79B	P40259	229 aa		11.09	□□□□□ -0.63
HDLBP-231	ENST00000467435	CASR	P41180	1078 aa		11.09	□□□□□ -0.63
HDLBP-231	ENST00000467435	DNASE1L1	P49184	302 aa		11.09	□□□□□ -0.63
HDLBP-231	ENST00000467435	CYB561	P49447	251 aa		11.09	□□□□□ -0.63
HDLBP-231	ENST00000467435	RGS6	P49758	472 aa		11.09	□□□□□ -0.63
HDLBP-231	ENST00000467435	LSM3	P62310	102 aa	Known RBP	11.09	□□□□□ -0.63
HDLBP-231	ENST00000467435	OC90	Q02509	493 aa	Predicted RBP	11.09	□□□□□ -0.63
HDLBP-231	ENST00000467435	LGALS3BP	Q08380	585 aa		11.09	□□□□□ -0.63
HDLBP-231	ENST00000467435	POU4F2	Q12837	409 aa		11.09	□□□□□ -0.63
HDLBP-231	ENST00000467435	NFATC3	Q12968	1075 aa		11.09	□□□□□ -0.63
HDLBP-231	ENST00000467435	LSAMP	Q13449	338 aa		11.09	□□□□□ -0.63
HDLBP-231	ENST00000467435	GGTLC2	Q14390	218 aa		11.09	□□□□□ -0.63
HDLBP-231	ENST00000467435	SPCS2	Q15005	226 aa		11.09	□□□□□ -0.63
HDLBP-231	ENST00000467435	TGIF1	Q15583	401 aa		11.09	□□□□□ -0.63
HDLBP-231	ENST00000467435	MEST	Q5EB52	335 aa		11.09	□□□□□ -0.63
HDLBP-231	ENST00000467435	SLC35D3	Q5M8T2	416 aa		11.09	□□□□□ -0.63
HDLBP-231	ENST00000467435	OR2G6	Q5TZ20	316 aa		11.09	□□□□□ -0.63
HDLBP-231	ENST00000467435	GPR139	Q6DWJ6	353 aa		11.09	□□□□□ -0.63
HDLBP-231	ENST00000467435	IGF2-AS	Q6U949	168 aa		11.09	□□□□□ -0.63
HDLBP-231	ENST00000467435	TMPRSS7	Q7RTY8	843 aa		11.09	□□□□□ -0.63
HDLBP-231	ENST00000467435	MDGA2	Q7Z553	956 aa		11.09	□□□□□ -0.63
HDLBP-231	ENST00000467435	KLHL36	Q8N4N3	616 aa		11.09	□□□□□ -0.63
HDLBP-231	ENST00000467435	TMEM99	Q8N816	258 aa		11.09	□□□□□ -0.63
HDLBP-231	ENST00000467435	SCAI	Q8N9R8	606 aa		11.09	□□□□□ -0.63
HDLBP-231	ENST00000467435	NPEPL1	Q8NDH3	523 aa		11.09	□□□□□ -0.63
HDLBP-231	ENST00000467435	SLC25A43	Q8WUT9	341 aa	Predicted RBP	11.09	□□□□□ -0.63
HDLBP-231	ENST00000467435	ARL5B	Q96KC2	179 aa		11.09	□□□□□ -0.63
HDLBP-231	ENST00000467435	FER1L6-AS2	Q96M78	137 aa		11.09	□□□□□ -0.63
HDLBP-231	ENST00000467435	MYCBP	Q99417	103 aa	Predicted RBP	11.09	□□□□□ -0.63
HDLBP-231	ENST00000467435	DDO	Q99489	341 aa		11.09	□□□□□ -0.63
HDLBP-231	ENST00000467435	TEAD3	Q99594	435 aa		11.09	□□□□□ -0.63
HDLBP-231	ENST00000467435	NMNAT2	Q9BZQ4	307 aa		11.09	□□□□□ -0.63
HDLBP-231	ENST00000467435	TMEM185B	Q9H7F4	350 aa		11.09	□□□□□ -0.63
HDLBP-231	ENST00000467435	ADGRL4	Q9HBW9	690 aa		11.09	□□□□□ -0.63
HDLBP-231	ENST00000467435	ERVK13-1	Q9NX77	482 aa		11.09	□□□□□ -0.63
HDLBP-231	ENST00000467435	HAO2	Q9NYQ3	351 aa		11.09	□□□□□ -0.63
HDLBP-231	ENST00000467435	LIPT2	A6NK58	231 aa		11.08	□□□□□ -0.64
HDLBP-231	ENST00000467435	C12orf71	A8MTZ7	269 aa		11.08	□□□□□ -0.64
HDLBP-231	ENST00000467435	AIRE	O43918	545 aa		11.08	□□□□□ -0.64
HDLBP-231	ENST00000467435	EFNA2	O43921	213 aa		11.08	□□□□□ -0.64

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