RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000437078.6

RABGEF1-210, Transcript of RAB guanine nucleotide exchange factor 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 5 BASIC

Gene RABGEF1, Length 4,319 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGEF1-210ENST00000437078 ABCG5Q9H222 651 aa12.44□□□□□ -0.42
RABGEF1-210ENST00000437078 FBXO8Q9NRD0 319 aa12.44□□□□□ -0.42
RABGEF1-210ENST00000437078 SIRT4Q9Y6E7 314 aaPredicted RBP12.44□□□□□ -0.42
RABGEF1-210ENST00000437078 IGHV1OR15-9A0A0B4J2B8 117 aa12.44□□□□□ -0.42
RABGEF1-210ENST00000437078 BCAT2O15382 392 aaPredicted RBP12.44□□□□□ -0.42
RABGEF1-210ENST00000437078 DUX1O43812 170 aa12.44□□□□□ -0.42
RABGEF1-210ENST00000437078 ALX3O95076 343 aa12.44□□□□□ -0.42
RABGEF1-210ENST00000437078 RAB3BP20337 219 aa12.44□□□□□ -0.42
RABGEF1-210ENST00000437078 SFTPDP35247 375 aa12.44□□□□□ -0.42
RABGEF1-210ENST00000437078 ZNF136P52737 540 aa12.44□□□□□ -0.42
RABGEF1-210ENST00000437078 CCINQ13939 588 aa12.44□□□□□ -0.42
RABGEF1-210ENST00000437078 C3orf38Q5JPI3 329 aa12.44□□□□□ -0.42
RABGEF1-210ENST00000437078 DPY19L4Q7Z388 723 aa12.44□□□□□ -0.42
RABGEF1-210ENST00000437078 ASB15Q8WXK1 588 aa12.44□□□□□ -0.42
RABGEF1-210ENST00000437078 ZNF350Q9GZX5 532 aa12.44□□□□□ -0.42
RABGEF1-210ENST00000437078 SLC25A19Q9HC21 320 aa12.44□□□□□ -0.42
RABGEF1-210ENST00000437078 DUSP22Q9NRW4 184 aa12.44□□□□□ -0.42
RABGEF1-210ENST00000437078 ANKRD10Q9NXR5 420 aa12.44□□□□□ -0.42
RABGEF1-210ENST00000437078 EIF3KQ9UBQ5 218 aaKnown RBP12.44□□□□□ -0.42
RABGEF1-210ENST00000437078 BRINP1O60477 761 aa12.44□□□□□ -0.42
RABGEF1-210ENST00000437078 ZNF217O75362 1048 aa12.44□□□□□ -0.42
RABGEF1-210ENST00000437078 RGS9O75916 674 aaPredicted RBP12.44□□□□□ -0.42
RABGEF1-210ENST00000437078 HEXBP07686 556 aa12.44□□□□□ -0.42
RABGEF1-210ENST00000437078 FOLR1P15328 257 aa12.44□□□□□ -0.42
RABGEF1-210ENST00000437078 HAGHLQ6PII5 290 aaPredicted RBP12.44□□□□□ -0.42
RABGEF1-210ENST00000437078 LRRC69Q6ZNQ3 347 aa12.44□□□□□ -0.42
RABGEF1-210ENST00000437078 ZPLD1Q8TCW7 415 aa12.44□□□□□ -0.42
RABGEF1-210ENST00000437078 CNN2Q99439 309 aaKnown RBP12.44□□□□□ -0.42
RABGEF1-210ENST00000437078 TCF7L1Q9HCS4 588 aa12.44□□□□□ -0.42
RABGEF1-210ENST00000437078 NDUFB11Q9NX14 153 aa12.44□□□□□ -0.42
RABGEF1-210ENST00000437078 RNF215Q9Y6U7 377 aa12.44□□□□□ -0.42
RABGEF1-210ENST00000437078 ICOSLGO75144 302 aa12.43□□□□□ -0.42
RABGEF1-210ENST00000437078 UTS2O95399 124 aa12.43□□□□□ -0.42
RABGEF1-210ENST00000437078 HTR1FP30939 366 aa12.43□□□□□ -0.42
RABGEF1-210ENST00000437078 RORAP35398 523 aa12.43□□□□□ -0.42
RABGEF1-210ENST00000437078 CAPZBP47756 277 aa12.43□□□□□ -0.42
RABGEF1-210ENST00000437078 GMFBP60983 142 aa12.43□□□□□ -0.42
RABGEF1-210ENST00000437078 CD226Q15762 336 aa12.43□□□□□ -0.42
RABGEF1-210ENST00000437078 TOMM34Q15785 309 aaPredicted RBP12.43□□□□□ -0.42
RABGEF1-210ENST00000437078 PRAMEF20Q5VT98 475 aa12.43□□□□□ -0.42
RABGEF1-210ENST00000437078 NIPAL3Q6P499 406 aa12.43□□□□□ -0.42
RABGEF1-210ENST00000437078 SLC35F2Q8IXU6 374 aa12.43□□□□□ -0.42
RABGEF1-210ENST00000437078 THAP4Q8WY91 577 aa12.43□□□□□ -0.42
RABGEF1-210ENST00000437078 TCTN2Q96GX1 697 aa12.43□□□□□ -0.42
RABGEF1-210ENST00000437078 FYTTD1Q96QD9 318 aaKnown RBP12.43□□□□□ -0.42
RABGEF1-210ENST00000437078 SLC35A3Q9Y2D2 325 aa12.43□□□□□ -0.42
RABGEF1-210ENST00000437078 ALOX12BO75342 701 aa12.43□□□□□ -0.42
RABGEF1-210ENST00000437078 RLN1P04808 185 aa12.43□□□□□ -0.42
RABGEF1-210ENST00000437078 ZGLP1P0C6A0 271 aa12.43□□□□□ -0.42
RABGEF1-210ENST00000437078 POU4F3Q15319 338 aa12.43□□□□□ -0.42
RABGEF1-210ENST00000437078 SLC25A35Q3KQZ1 300 aa12.43□□□□□ -0.42
RABGEF1-210ENST00000437078 KLHL26Q53HC5 615 aa12.43□□□□□ -0.42
RABGEF1-210ENST00000437078 FIP1L1Q6UN15 594 aaKnown RBP12.43□□□□□ -0.42
RABGEF1-210ENST00000437078 C1orf216Q8TAB5 229 aa12.43□□□□□ -0.42
RABGEF1-210ENST00000437078 TSPAN10Q9H1Z9 355 aaPredicted RBP12.43□□□□□ -0.42
RABGEF1-210ENST00000437078 LYRM4Q9HD34 91 aa12.43□□□□□ -0.42
RABGEF1-210ENST00000437078 RANGRFQ9HD47 186 aaPredicted RBP12.43□□□□□ -0.42
RABGEF1-210ENST00000437078 PRODH2Q9UF12 536 aa12.43□□□□□ -0.42
RABGEF1-210ENST00000437078 TGFBR3LH3BV60 316 aa12.43□□□□□ -0.42
RABGEF1-210ENST00000437078 YKT6O15498 198 aa12.43□□□□□ -0.42
RABGEF1-210ENST00000437078 GP1BBP13224 206 aa12.43□□□□□ -0.42
RABGEF1-210ENST00000437078 GNALP38405 381 aa12.43□□□□□ -0.42
RABGEF1-210ENST00000437078 FRKP42685 505 aaPredicted RBP12.43□□□□□ -0.42
RABGEF1-210ENST00000437078 MLC1Q15049 377 aa12.43□□□□□ -0.42
RABGEF1-210ENST00000437078 EID2Q8N6I1 236 aa12.43□□□□□ -0.42
RABGEF1-210ENST00000437078 OR6C4Q8NGE1 309 aa12.43□□□□□ -0.42
RABGEF1-210ENST00000437078 OR8S1Q8NH09 359 aa12.43□□□□□ -0.42
RABGEF1-210ENST00000437078 NT5CQ8TCD5 201 aa12.43□□□□□ -0.42
RABGEF1-210ENST00000437078 APOBEC4Q8WW27 367 aaKnown RBP12.43□□□□□ -0.42
RABGEF1-210ENST00000437078 DEDD2Q8WXF8 326 aa12.43□□□□□ -0.42
RABGEF1-210ENST00000437078 PHF7Q9BWX1 381 aaPredicted RBP12.43□□□□□ -0.42
RABGEF1-210ENST00000437078 PPIL3Q9H2H8 161 aaKnown RBP12.43□□□□□ -0.42
RABGEF1-210ENST00000437078 TEX46H3BTG2 121 aa12.43□□□□□ -0.42
RABGEF1-210ENST00000437078 CD27P26842 260 aa12.43□□□□□ -0.42
RABGEF1-210ENST00000437078 UGT2B10P36537 528 aa12.43□□□□□ -0.42
RABGEF1-210ENST00000437078 NUP62P37198 522 aaPredicted RBP12.43□□□□□ -0.42
RABGEF1-210ENST00000437078 PSPHP78330 225 aa12.43□□□□□ -0.42
RABGEF1-210ENST00000437078 FAM209BQ5JX69 171 aa12.43□□□□□ -0.42
RABGEF1-210ENST00000437078 BCL2L15Q5TBC7 163 aa12.43□□□□□ -0.42
RABGEF1-210ENST00000437078 BICRALQ6AI39 1079 aa12.43□□□□□ -0.42
RABGEF1-210ENST00000437078 LRFN4Q6PJG9 635 aa12.43□□□□□ -0.42
RABGEF1-210ENST00000437078 TIPARPQ7Z3E1 657 aaKnown RBP12.43□□□□□ -0.42
RABGEF1-210ENST00000437078 TMPRSS12Q86WS5 348 aa12.43□□□□□ -0.42
RABGEF1-210ENST00000437078 ZNF248Q8NDW4 579 aa12.43□□□□□ -0.42
RABGEF1-210ENST00000437078 PTP4A1Q93096 173 aa12.43□□□□□ -0.42
RABGEF1-210ENST00000437078 FRMD6Q96NE9 622 aa12.43□□□□□ -0.42
RABGEF1-210ENST00000437078 OR6C1Q96RD1 312 aa12.43□□□□□ -0.42
RABGEF1-210ENST00000437078 ORAI3Q9BRQ5 295 aa12.43□□□□□ -0.42
RABGEF1-210ENST00000437078 FAM221BA6H8Z2 402 aa12.42□□□□□ -0.42
RABGEF1-210ENST00000437078 ANXA2P2A6NMY6 339 aa12.42□□□□□ -0.42
RABGEF1-210ENST00000437078 POLR1CO15160 346 aaPredicted RBP12.42□□□□□ -0.42
RABGEF1-210ENST00000437078 ANXA2P07355 339 aaKnown RBP12.42□□□□□ -0.42
RABGEF1-210ENST00000437078 NR2C1P13056 603 aa12.42□□□□□ -0.42
RABGEF1-210ENST00000437078 TGM1P22735 817 aa12.42□□□□□ -0.42
RABGEF1-210ENST00000437078 CXCL12P48061 93 aa12.42□□□□□ -0.42
RABGEF1-210ENST00000437078 COMMD7Q86VX2 200 aa12.42□□□□□ -0.42
RABGEF1-210ENST00000437078 NR4A3Q92570 626 aa12.42□□□□□ -0.42
RABGEF1-210ENST00000437078 MICU1Q9BPX6 476 aa12.42□□□□□ -0.42
RABGEF1-210ENST00000437078 IL20Q9NYY1 176 aa12.42□□□□□ -0.42
RABGEF1-210ENST00000437078 FLRT2O43155 660 aa12.42□□□□□ -0.42
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 39.9 ms