RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000409435.5

SCN9A-202, Transcript of sodium voltage-gated channel alpha subunit 9, humanhuman

APPRIS ALT1 TSL 5 BASIC

Gene SCN9A, Length 5,967 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCN9A-202ENST00000409435 C1orf87Q8N0U7 546 aa6.75□□□□□ -1.33
SCN9A-202ENST00000409435 B3GNT7Q8NFL0 401 aa6.75□□□□□ -1.33
SCN9A-202ENST00000409435 TMBIM1Q969X1 311 aa6.75□□□□□ -1.33
SCN9A-202ENST00000409435 CNTNAP3Q9BZ76 1288 aa6.75□□□□□ -1.33
SCN9A-202ENST00000409435 OR10A5Q9H207 317 aa6.75□□□□□ -1.33
SCN9A-202ENST00000409435 TMPRSS5Q9H3S3 457 aa6.75□□□□□ -1.33
SCN9A-202ENST00000409435 RLIMQ9NVW2 624 aa6.75□□□□□ -1.33
SCN9A-202ENST00000409435 SLC17A4Q9Y2C5 497 aa6.75□□□□□ -1.33
SCN9A-202ENST00000409435 CACNA1GO43497 2377 aa6.75□□□□□ -1.33
SCN9A-202ENST00000409435 PPM1DO15297 605 aa6.75□□□□□ -1.33
SCN9A-202ENST00000409435 B4GALT3O60512 393 aa6.75□□□□□ -1.33
SCN9A-202ENST00000409435 CEACAM5P06731 702 aa6.75□□□□□ -1.33
SCN9A-202ENST00000409435 HOXC4P09017 264 aaPredicted RBP6.75□□□□□ -1.33
SCN9A-202ENST00000409435 PTGER4P35408 488 aa6.75□□□□□ -1.33
SCN9A-202ENST00000409435 BCL6P41182 706 aa6.75□□□□□ -1.33
SCN9A-202ENST00000409435 RRAS2P62070 204 aaPredicted RBP6.75□□□□□ -1.33
SCN9A-202ENST00000409435 ACER2Q5QJU3 275 aa6.75□□□□□ -1.33
SCN9A-202ENST00000409435 TMEM69Q5SWH9 247 aa6.75□□□□□ -1.33
SCN9A-202ENST00000409435 OR4F3Q6IEY1 312 aa6.75□□□□□ -1.33
SCN9A-202ENST00000409435 HIST2H3AQ71DI3 136 aa6.75□□□□□ -1.33
SCN9A-202ENST00000409435 CMTM4Q8IZR5 234 aa6.75□□□□□ -1.33
SCN9A-202ENST00000409435 KLHDC1Q8N7A1 406 aa6.75□□□□□ -1.33
SCN9A-202ENST00000409435 OR9A2Q8NGT5 310 aa6.75□□□□□ -1.33
SCN9A-202ENST00000409435 PAQR8Q8TEZ7 354 aa6.75□□□□□ -1.33
SCN9A-202ENST00000409435 DUSP19Q8WTR2 217 aa6.75□□□□□ -1.33
SCN9A-202ENST00000409435 DCUN1D4Q92564 292 aa6.75□□□□□ -1.33
SCN9A-202ENST00000409435 AIG1Q9NVV5 245 aa6.75□□□□□ -1.33
SCN9A-202ENST00000409435 FAM120CQ9NX05 1096 aaKnown RBP6.75□□□□□ -1.33
SCN9A-202ENST00000409435 POMT2Q9UKY4 750 aa6.75□□□□□ -1.33
SCN9A-202ENST00000409435 ASB4Q9Y574 426 aa6.75□□□□□ -1.33
SCN9A-202ENST00000409435 NUBP2Q9Y5Y2 271 aa6.75□□□□□ -1.33
SCN9A-202ENST00000409435 C9JVG2 144 aa6.75□□□□□ -1.33
SCN9A-202ENST00000409435 ZNF670-ZNF695F2Z2N8 137 aa6.75□□□□□ -1.33
SCN9A-202ENST00000409435 LRRTM2O43300 516 aa6.75□□□□□ -1.33
SCN9A-202ENST00000409435 NPHS1O60500 1241 aa6.75□□□□□ -1.33
SCN9A-202ENST00000409435 ADAM23O75077 832 aa6.75□□□□□ -1.33
SCN9A-202ENST00000409435 NSA2O95478 260 aaKnown RBP6.75□□□□□ -1.33
SCN9A-202ENST00000409435 AHSGP02765 367 aa6.75□□□□□ -1.33
SCN9A-202ENST00000409435 G6PDP11413 515 aa6.75□□□□□ -1.33
SCN9A-202ENST00000409435 CPMP14384 443 aa6.75□□□□□ -1.33
SCN9A-202ENST00000409435 GMPRP36959 345 aa6.75□□□□□ -1.33
SCN9A-202ENST00000409435 PRPS1P60891 318 aa6.75□□□□□ -1.33
SCN9A-202ENST00000409435 BTNL3Q6UXE8 466 aa6.75□□□□□ -1.33
SCN9A-202ENST00000409435 BPIFB2Q8N4F0 458 aa6.75□□□□□ -1.33
SCN9A-202ENST00000409435 NANPQ8TBE9 248 aa6.75□□□□□ -1.33
SCN9A-202ENST00000409435 ZNF675Q8TD23 568 aa6.75□□□□□ -1.33
SCN9A-202ENST00000409435 ZNF775Q96BV0 537 aaPredicted RBP6.75□□□□□ -1.33
SCN9A-202ENST00000409435 RASD2Q96D21 266 aa6.75□□□□□ -1.33
SCN9A-202ENST00000409435 RDH12Q96NR8 316 aa6.75□□□□□ -1.33
SCN9A-202ENST00000409435 DCLRE1CQ96SD1 692 aaKnown RBP6.75□□□□□ -1.33
SCN9A-202ENST00000409435 TBX5Q99593 518 aa6.75□□□□□ -1.33
SCN9A-202ENST00000409435 SAP130Q9H0E3 1048 aa6.75□□□□□ -1.33
SCN9A-202ENST00000409435 OR51I1Q9H343 314 aa6.75□□□□□ -1.33
SCN9A-202ENST00000409435 PPIHO43447 177 aaKnown RBP6.75□□□□□ -1.33
SCN9A-202ENST00000409435 ALDOBP05062 364 aa6.75□□□□□ -1.33
SCN9A-202ENST00000409435 NAT2P11245 290 aa6.75□□□□□ -1.33
SCN9A-202ENST00000409435 FPR2P25090 351 aa6.75□□□□□ -1.33
SCN9A-202ENST00000409435 ELAVL4P26378 380 aaKnown RBP6.75□□□□□ -1.33
SCN9A-202ENST00000409435 AQP2P41181 271 aa6.75□□□□□ -1.33
SCN9A-202ENST00000409435 GINS1Q14691 196 aa6.75□□□□□ -1.33
SCN9A-202ENST00000409435 TMEM205Q6UW68 189 aa6.75□□□□□ -1.33
SCN9A-202ENST00000409435 CLEC9AQ6UXN8 241 aa6.75□□□□□ -1.33
SCN9A-202ENST00000409435 SPATC1Q76KD6 591 aa6.75□□□□□ -1.33
SCN9A-202ENST00000409435 GALNT10Q86SR1 603 aa6.75□□□□□ -1.33
SCN9A-202ENST00000409435 SLC15A3Q8IY34 581 aa6.75□□□□□ -1.33
SCN9A-202ENST00000409435 FAM185AQ8N0U4 392 aa6.75□□□□□ -1.33
SCN9A-202ENST00000409435 STEAP2Q8NFT2 490 aa6.75□□□□□ -1.33
SCN9A-202ENST00000409435 BAHD1Q8TBE0 780 aaPredicted RBP6.75□□□□□ -1.33
SCN9A-202ENST00000409435 OR4K3Q96R72 315 aa6.75□□□□□ -1.33
SCN9A-202ENST00000409435 MCHR1Q99705 422 aa6.75□□□□□ -1.33
SCN9A-202ENST00000409435 CCL19Q99731 98 aa6.75□□□□□ -1.33
SCN9A-202ENST00000409435 MICU1Q9BPX6 476 aa6.75□□□□□ -1.33
SCN9A-202ENST00000409435 TAF1LQ8IZX4 1826 aa6.75□□□□□ -1.33
SCN9A-202ENST00000409435 A0A1W2PPM1 405 aa6.75□□□□□ -1.33
SCN9A-202ENST00000409435 CLIC1O00299 241 aa6.75□□□□□ -1.33
SCN9A-202ENST00000409435 EFSO43281 561 aa6.75□□□□□ -1.33
SCN9A-202ENST00000409435 SLC35E2BP0CK96 405 aa6.75□□□□□ -1.33
SCN9A-202ENST00000409435 STAG3L2P0CL84 134 aa6.75□□□□□ -1.33
SCN9A-202ENST00000409435 MGST1P10620 155 aaKnown RBP6.75□□□□□ -1.33
SCN9A-202ENST00000409435 PNMTP11086 282 aa6.75□□□□□ -1.33
SCN9A-202ENST00000409435 HNRNPH3P31942 346 aaKnown RBP6.75□□□□□ -1.33
SCN9A-202ENST00000409435 RGRP47804 291 aa6.75□□□□□ -1.33
SCN9A-202ENST00000409435 GSK3BP49841 420 aa6.75□□□□□ -1.33
SCN9A-202ENST00000409435 TAS2R31P59538 309 aa6.75□□□□□ -1.33
SCN9A-202ENST00000409435 METTL2BQ6P1Q9 378 aaKnown RBP6.75□□□□□ -1.33
SCN9A-202ENST00000409435 LILRB2Q8N423 598 aa6.75□□□□□ -1.33
SCN9A-202ENST00000409435 OR52P1PQ8NH57 321 aa6.75□□□□□ -1.33
SCN9A-202ENST00000409435 METTL2AQ96IZ6 378 aaKnown RBP6.75□□□□□ -1.33
SCN9A-202ENST00000409435 UBXN10Q96LJ8 280 aa6.75□□□□□ -1.33
SCN9A-202ENST00000409435 GNRHR2Q96P88 292 aa6.75□□□□□ -1.33
SCN9A-202ENST00000409435 AMBNQ9NP70 447 aa6.75□□□□□ -1.33
SCN9A-202ENST00000409435 FBXO8Q9NRD0 319 aa6.75□□□□□ -1.33
SCN9A-202ENST00000409435 NLKQ9UBE8 527 aa6.75□□□□□ -1.33
SCN9A-202ENST00000409435 NKX1-2Q9UD57 310 aaPredicted RBP6.75□□□□□ -1.33
SCN9A-202ENST00000409435 A6NIZ1 184 aa6.74□□□□□ -1.33
SCN9A-202ENST00000409435 SEC14L6B5MCN3 397 aa6.74□□□□□ -1.33
SCN9A-202ENST00000409435 ZNF814B7Z6K7 855 aa6.74□□□□□ -1.33
SCN9A-202ENST00000409435 UPK1BO75841 260 aa6.74□□□□□ -1.33
SCN9A-202ENST00000409435 SNCGO76070 127 aa6.74□□□□□ -1.33
SCN9A-202ENST00000409435 RAP1BP61224 184 aa6.74□□□□□ -1.33
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