RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000394202.8

CNN3-202, Transcript of calponin 3, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene CNN3, Length 1,974 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNN3-202ENST00000394202 IMPAD1Q9NX62 359 aa20.88■□□□□ 0.93
CNN3-202ENST00000394202 QPCTLQ9NXS2 382 aa20.88■□□□□ 0.93
CNN3-202ENST00000394202 LHX6Q9UPM6 363 aa20.88■□□□□ 0.93
CNN3-202ENST00000394202 B3GNT3Q9Y2A9 372 aa20.88■□□□□ 0.93
CNN3-202ENST00000394202 PCDHGB7Q9Y5F8 929 aa20.88■□□□□ 0.93
CNN3-202ENST00000394202 ACACBO00763 2458 aa20.88■□□□□ 0.93
CNN3-202ENST00000394202 MS4A18H0YCH9 400 aa20.88■□□□□ 0.93
CNN3-202ENST00000394202 ADORA3P0DMS8 318 aa20.88■□□□□ 0.93
CNN3-202ENST00000394202 ZNF24P17028 368 aa20.88■□□□□ 0.93
CNN3-202ENST00000394202 POU3F2P20265 443 aaPredicted RBP20.88■□□□□ 0.93
CNN3-202ENST00000394202 SLC6A6P31641 620 aa20.88■□□□□ 0.93
CNN3-202ENST00000394202 ERVK-25P63136 954 aa20.88■□□□□ 0.93
CNN3-202ENST00000394202 SNAPC1Q16533 368 aa20.88■□□□□ 0.93
CNN3-202ENST00000394202 MS4A18Q3C1V0 323 aa20.88■□□□□ 0.93
CNN3-202ENST00000394202 PTCHD4Q6ZW05 846 aa20.88■□□□□ 0.93
CNN3-202ENST00000394202 KATNB1Q9BVA0 655 aa20.88■□□□□ 0.93
CNN3-202ENST00000394202 ASPNQ9BXN1 380 aa20.88■□□□□ 0.93
CNN3-202ENST00000394202 NRIP3Q9NQ35 241 aa20.88■□□□□ 0.93
CNN3-202ENST00000394202 IER3IP1Q9Y5U9 82 aa20.88■□□□□ 0.93
CNN3-202ENST00000394202 NBEAQ8NFP9 2946 aa20.87■□□□□ 0.93
CNN3-202ENST00000394202 EIF4E1BA6NMX2 242 aaKnown RBP20.87■□□□□ 0.93
CNN3-202ENST00000394202 SURF4O15260 269 aa20.87■□□□□ 0.93
CNN3-202ENST00000394202 RAMP1O60894 148 aa20.87■□□□□ 0.93
CNN3-202ENST00000394202 FZD7O75084 574 aa20.87■□□□□ 0.93
CNN3-202ENST00000394202 AHCYP23526 432 aa20.87■□□□□ 0.93
CNN3-202ENST00000394202 PAX7P23759 505 aa20.87■□□□□ 0.93
CNN3-202ENST00000394202 LHX2P50458 406 aa20.87■□□□□ 0.93
CNN3-202ENST00000394202 FOXK2Q01167 660 aa20.87■□□□□ 0.93
CNN3-202ENST00000394202 ZNF362Q5T0B9 420 aaPredicted RBP20.87■□□□□ 0.93
CNN3-202ENST00000394202 H1FNTQ75WM6 255 aaPredicted RBP20.87■□□□□ 0.93
CNN3-202ENST00000394202 FAM98AQ8NCA5 519 aaKnown RBP20.87■□□□□ 0.93
CNN3-202ENST00000394202 ERMAPQ96PL5 475 aaPredicted RBP20.87■□□□□ 0.93
CNN3-202ENST00000394202 ALKBH4Q9NXW9 302 aa20.87■□□□□ 0.93
CNN3-202ENST00000394202 TRAPPC4Q9Y296 219 aa20.87■□□□□ 0.93
CNN3-202ENST00000394202 HSPE1-MOB4S4R3N1 261 aa20.87■□□□□ 0.93
CNN3-202ENST00000394202 TLN1Q9Y490 2541 aaKnown RBP20.87■□□□□ 0.93
CNN3-202ENST00000394202 EIF1AYO14602 144 aaKnown RBP20.86■□□□□ 0.93
CNN3-202ENST00000394202 TFECO14948 347 aaPredicted RBP20.86■□□□□ 0.93
CNN3-202ENST00000394202 TLX2O43763 284 aaPredicted RBP20.86■□□□□ 0.93
CNN3-202ENST00000394202 HLA-DOBP13765 273 aa20.86■□□□□ 0.93
CNN3-202ENST00000394202 FMO3P31513 532 aa20.86■□□□□ 0.93
CNN3-202ENST00000394202 PCYT1AP49585 367 aa20.86■□□□□ 0.93
CNN3-202ENST00000394202 P2RY4P51582 365 aa20.86■□□□□ 0.93
CNN3-202ENST00000394202 RPS6KA3P51812 740 aa20.86■□□□□ 0.93
CNN3-202ENST00000394202 NADK2Q4G0N4 442 aa20.86■□□□□ 0.93
CNN3-202ENST00000394202 DPY19L2P2Q6ZN68 376 aa20.86■□□□□ 0.93
CNN3-202ENST00000394202 ZNF786Q8N393 782 aa20.86■□□□□ 0.93
CNN3-202ENST00000394202 DTNBP1Q96EV8 351 aa20.86■□□□□ 0.93
CNN3-202ENST00000394202 ADGRG7Q96K78 797 aa20.86■□□□□ 0.93
CNN3-202ENST00000394202 SRXN1Q9BYN0 137 aa20.86■□□□□ 0.93
CNN3-202ENST00000394202 CHST11Q9NPF2 352 aa20.86■□□□□ 0.93
CNN3-202ENST00000394202 PNPLA3Q9NST1 481 aa20.86■□□□□ 0.93
CNN3-202ENST00000394202 CORINQ9Y5Q5 1042 aa20.86■□□□□ 0.93
CNN3-202ENST00000394202 SERPINI2O75830 405 aa20.86■□□□□ 0.93
CNN3-202ENST00000394202 CHN2P52757 468 aa20.86■□□□□ 0.93
CNN3-202ENST00000394202 CTXN1P60606 82 aa20.86■□□□□ 0.93
CNN3-202ENST00000394202 MFSD13AQ14CX5 517 aa20.86■□□□□ 0.93
CNN3-202ENST00000394202 DEPDC4Q8N2C3 294 aa20.86■□□□□ 0.93
CNN3-202ENST00000394202 KDF1Q8NAX2 398 aaPredicted RBP20.86■□□□□ 0.93
CNN3-202ENST00000394202 GPX7Q96SL4 187 aaPredicted RBP20.86■□□□□ 0.93
CNN3-202ENST00000394202 RNF13O43567 381 aa20.85■□□□□ 0.93
CNN3-202ENST00000394202 PMS2P2O95744 297 aa20.85■□□□□ 0.93
CNN3-202ENST00000394202 PLGP00747 810 aaPredicted RBP20.85■□□□□ 0.93
CNN3-202ENST00000394202 GTF2E2P29084 291 aaKnown RBP20.85■□□□□ 0.93
CNN3-202ENST00000394202 ANKDD1AQ495B1 522 aa20.85■□□□□ 0.93
CNN3-202ENST00000394202 C6orf141Q5SZD1 244 aa20.85■□□□□ 0.93
CNN3-202ENST00000394202 SCAIQ8N9R8 606 aa20.85■□□□□ 0.93
CNN3-202ENST00000394202 NEIL3Q8TAT5 605 aa20.85■□□□□ 0.93
CNN3-202ENST00000394202 POLDIP3Q9BY77 421 aaKnown RBP20.85■□□□□ 0.93
CNN3-202ENST00000394202 SPRR3Q9UBC9 169 aa20.85■□□□□ 0.93
CNN3-202ENST00000394202 IGHV3-15A0A0B4J1V0 119 aa20.85■□□□□ 0.93
CNN3-202ENST00000394202 ZNHIT1O43257 154 aa20.85■□□□□ 0.93
CNN3-202ENST00000394202 CD14P08571 375 aa20.85■□□□□ 0.93
CNN3-202ENST00000394202 CLDN18P56856 261 aa20.85■□□□□ 0.93
CNN3-202ENST00000394202 SRYQ05066 204 aa20.85■□□□□ 0.93
CNN3-202ENST00000394202 FAM122BQ7Z309 247 aa20.85■□□□□ 0.93
CNN3-202ENST00000394202 RASD2Q96D21 266 aa20.85■□□□□ 0.93
CNN3-202ENST00000394202 Q96M85 177 aa20.85■□□□□ 0.93
CNN3-202ENST00000394202 UCN2Q96RP3 112 aa20.85■□□□□ 0.93
CNN3-202ENST00000394202 LDAHQ9H6V9 325 aa20.85■□□□□ 0.93
CNN3-202ENST00000394202 TRGV5A0A0B4J1U4 118 aa20.84■□□□□ 0.93
CNN3-202ENST00000394202 GJE1A6NN92 205 aa20.84■□□□□ 0.93
CNN3-202ENST00000394202 IMPA2O14732 288 aa20.84■□□□□ 0.93
CNN3-202ENST00000394202 HIST1H1CP16403 213 aaKnown RBP20.84■□□□□ 0.93
CNN3-202ENST00000394202 NOS3P29474 1203 aa20.84■□□□□ 0.93
CNN3-202ENST00000394202 GRK5P34947 590 aa20.84■□□□□ 0.93
CNN3-202ENST00000394202 H3F3AP84243 136 aa20.84■□□□□ 0.93
CNN3-202ENST00000394202 PUDPQ08623 228 aa20.84■□□□□ 0.93
CNN3-202ENST00000394202 C3AR1Q16581 482 aa20.84■□□□□ 0.93
CNN3-202ENST00000394202 OR8J1Q8NGP2 316 aa20.84■□□□□ 0.93
CNN3-202ENST00000394202 ABTB1Q969K4 478 aaPredicted RBP20.84■□□□□ 0.93
CNN3-202ENST00000394202 SLC38A2Q96QD8 506 aa20.84■□□□□ 0.93
CNN3-202ENST00000394202 AMBNQ9NP70 447 aa20.84■□□□□ 0.93
CNN3-202ENST00000394202 B3GAT1Q9P2W7 334 aa20.84■□□□□ 0.93
CNN3-202ENST00000394202 B3GALT5Q9Y2C3 310 aa20.84■□□□□ 0.93
CNN3-202ENST00000394202 PKD1L2Q7Z442 2459 aa20.84■□□□□ 0.93
CNN3-202ENST00000394202 FAM183AA6NL82 134 aa20.83■□□□□ 0.93
CNN3-202ENST00000394202 LINC01387J3KSC0 135 aa20.83■□□□□ 0.93
CNN3-202ENST00000394202 XPNPEP2O43895 674 aa20.83■□□□□ 0.93
CNN3-202ENST00000394202 OR6A2O95222 327 aa20.83■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 28.7 ms