RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000358813.4

CCL20-201, Transcript of C-C motif chemokine ligand 20, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene CCL20, Length 800 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCL20-201ENST00000358813 WASHC1A8K0Z3 465 aa4.73□□□□□ -1.65
CCL20-201ENST00000358813 INSIG1O15503 277 aa4.73□□□□□ -1.65
CCL20-201ENST00000358813 OR1F1O43749 312 aa4.73□□□□□ -1.65
CCL20-201ENST00000358813 TSPAN2O60636 221 aa4.73□□□□□ -1.65
CCL20-201ENST00000358813 ANXA9O76027 345 aa4.73□□□□□ -1.65
CCL20-201ENST00000358813 LSM8O95777 96 aaKnown RBP4.73□□□□□ -1.65
CCL20-201ENST00000358813 ACAA1P09110 424 aaPredicted RBP4.73□□□□□ -1.65
CCL20-201ENST00000358813 PPIAL4GP0DN37 164 aa4.73□□□□□ -1.65
CCL20-201ENST00000358813 DBTP11182 482 aaKnown RBP4.73□□□□□ -1.65
CCL20-201ENST00000358813 GZMAP12544 262 aa4.73□□□□□ -1.65
CCL20-201ENST00000358813 CD1EP15812 388 aa4.73□□□□□ -1.65
CCL20-201ENST00000358813 F8A1P23610 371 aa4.73□□□□□ -1.65
CCL20-201ENST00000358813 GIFP27352 417 aa4.73□□□□□ -1.65
CCL20-201ENST00000358813 HSPA9P38646 679 aaKnown RBP4.73□□□□□ -1.65
CCL20-201ENST00000358813 GRIA1P42261 906 aa4.73□□□□□ -1.65
CCL20-201ENST00000358813 CAPZBP47756 277 aa4.73□□□□□ -1.65
CCL20-201ENST00000358813 OR3A2P47893 321 aa4.73□□□□□ -1.65
CCL20-201ENST00000358813 GFERP55789 205 aa4.73□□□□□ -1.65
CCL20-201ENST00000358813 EIF4EBP2Q13542 120 aaPredicted RBP4.73□□□□□ -1.65
CCL20-201ENST00000358813 SSX2Q16385 188 aa4.73□□□□□ -1.65
CCL20-201ENST00000358813 HKDC1Q2TB90 917 aa4.73□□□□□ -1.65
CCL20-201ENST00000358813 RFTN2Q52LD8 501 aaPredicted RBP4.73□□□□□ -1.65
CCL20-201ENST00000358813 SPANXN4Q5MJ08 99 aa4.73□□□□□ -1.65
CCL20-201ENST00000358813 ARMC12Q5T9G4 340 aa4.73□□□□□ -1.65
CCL20-201ENST00000358813 DCUN1D2Q6PH85 259 aa4.73□□□□□ -1.65
CCL20-201ENST00000358813 STRADAQ7RTN6 431 aa4.73□□□□□ -1.65
CCL20-201ENST00000358813 PYROXD2Q8N2H3 581 aa4.73□□□□□ -1.65
CCL20-201ENST00000358813 UBE2J2Q8N2K1 259 aa4.73□□□□□ -1.65
CCL20-201ENST00000358813 CENPSQ8N2Z9 138 aa4.73□□□□□ -1.65
CCL20-201ENST00000358813 SYT14Q8NB59 555 aa4.73□□□□□ -1.65
CCL20-201ENST00000358813 ST6GALNAC3Q8NDV1 305 aa4.73□□□□□ -1.65
CCL20-201ENST00000358813 FDCSPQ8NFU4 85 aa4.73□□□□□ -1.65
CCL20-201ENST00000358813 OR52J3Q8NH60 311 aa4.73□□□□□ -1.65
CCL20-201ENST00000358813 SECTM1Q8WVN6 248 aa4.73□□□□□ -1.65
CCL20-201ENST00000358813 NELFBQ8WX92 580 aa4.73□□□□□ -1.65
CCL20-201ENST00000358813 MRPL24Q96A35 216 aaKnown RBP4.73□□□□□ -1.65
CCL20-201ENST00000358813 RASD2Q96D21 266 aa4.73□□□□□ -1.65
CCL20-201ENST00000358813 GIMAP5Q96F15 307 aa4.73□□□□□ -1.65
CCL20-201ENST00000358813 CELF6Q96J87 481 aaKnown RBP4.73□□□□□ -1.65
CCL20-201ENST00000358813 TMEM43Q9BTV4 400 aa4.73□□□□□ -1.65
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CCL20-201ENST00000358813 CXXC4Q9H2H0 198 aa4.73□□□□□ -1.65
CCL20-201ENST00000358813 YY1AP1Q9H869 796 aa4.73□□□□□ -1.65
CCL20-201ENST00000358813 METTL7AQ9H8H3 244 aa4.73□□□□□ -1.65
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CCL20-201ENST00000358813 INTS9Q9NV88 658 aaKnown RBP4.73□□□□□ -1.65
CCL20-201ENST00000358813 SLC17A4Q9Y2C5 497 aa4.73□□□□□ -1.65
CCL20-201ENST00000358813 RNF115Q9Y4L5 304 aa4.73□□□□□ -1.65
CCL20-201ENST00000358813 NBASA2RRP1 2371 aa4.73□□□□□ -1.65
CCL20-201ENST00000358813 USP9YO00507 2555 aaPredicted RBP4.73□□□□□ -1.65
CCL20-201ENST00000358813 CHD5Q8TDI0 1954 aa4.73□□□□□ -1.65
CCL20-201ENST00000358813 SDK2Q58EX2 2172 aa4.72□□□□□ -1.65
CCL20-201ENST00000358813 MN1Q10571 1320 aaPredicted RBP4.72□□□□□ -1.65
CCL20-201ENST00000358813 DOPEY1Q5JWR5 2465 aa4.72□□□□□ -1.65
CCL20-201ENST00000358813 ABCA12Q86UK0 2595 aa4.72□□□□□ -1.65
CCL20-201ENST00000358813 COL12A1Q99715 3063 aa4.72□□□□□ -1.65
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CCL20-201ENST00000358813 TRGV8A0A0C4DH27 118 aa4.72□□□□□ -1.65
CCL20-201ENST00000358813 TSPAN11A1L157 253 aa4.72□□□□□ -1.65
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CCL20-201ENST00000358813 H0YIV9 168 aa4.72□□□□□ -1.65
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CCL20-201ENST00000358813 ZSCAN12O43309 604 aa4.72□□□□□ -1.65
CCL20-201ENST00000358813 ZG16O60844 167 aa4.72□□□□□ -1.65
CCL20-201ENST00000358813 WBP4O75554 376 aaKnown RBP4.72□□□□□ -1.65
CCL20-201ENST00000358813 ATP1A1P05023 1023 aaKnown RBP4.72□□□□□ -1.65
CCL20-201ENST00000358813 CALB1P05937 261 aa4.72□□□□□ -1.65
CCL20-201ENST00000358813 UMODP07911 640 aa4.72□□□□□ -1.65
CCL20-201ENST00000358813 HBQ1P09105 142 aa4.72□□□□□ -1.65
CCL20-201ENST00000358813 FAM157CP0CG43 387 aa4.72□□□□□ -1.65
CCL20-201ENST00000358813 RNF224P0DH78 156 aa4.72□□□□□ -1.65
CCL20-201ENST00000358813 ZNF30P17039 623 aa4.72□□□□□ -1.65
CCL20-201ENST00000358813 IDSP22304 550 aa4.72□□□□□ -1.65
CCL20-201ENST00000358813 NR4A2P43354 598 aa4.72□□□□□ -1.65
CCL20-201ENST00000358813 HTR5AP47898 357 aa4.72□□□□□ -1.65
CCL20-201ENST00000358813 CSNK1DP48730 415 aa4.72□□□□□ -1.65
CCL20-201ENST00000358813 NDST2P52849 883 aa4.72□□□□□ -1.65
CCL20-201ENST00000358813 SUCLG1P53597 346 aaKnown RBP4.72□□□□□ -1.65
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CCL20-201ENST00000358813 BTG1P62324 171 aa4.72□□□□□ -1.65
CCL20-201ENST00000358813 TMED1Q13445 227 aa4.72□□□□□ -1.65
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CCL20-201ENST00000358813 KRTAP21-3Q3LHN1 58 aa4.72□□□□□ -1.65
CCL20-201ENST00000358813 LINC01620Q4KN68 170 aa4.72□□□□□ -1.65
CCL20-201ENST00000358813 PYCR3Q53H96 274 aa4.72□□□□□ -1.65
CCL20-201ENST00000358813 TECRLQ5HYJ1 363 aa4.72□□□□□ -1.65
CCL20-201ENST00000358813 DMKNQ6E0U4 476 aaPredicted RBP4.72□□□□□ -1.65
CCL20-201ENST00000358813 PYHIN1Q6K0P9 492 aa4.72□□□□□ -1.65
CCL20-201ENST00000358813 STEAP1BQ6NZ63 245 aa4.72□□□□□ -1.65
CCL20-201ENST00000358813 DNAJC24Q6P3W2 148 aa4.72□□□□□ -1.65
CCL20-201ENST00000358813 ANGPTL8Q6UXH0 198 aa4.72□□□□□ -1.65
CCL20-201ENST00000358813 ZNF730Q6ZMV8 503 aa4.72□□□□□ -1.65
CCL20-201ENST00000358813 Q6ZPB1 254 aaPredicted RBP4.72□□□□□ -1.65
CCL20-201ENST00000358813 NET1Q7Z628 596 aaPredicted RBP4.72□□□□□ -1.65
CCL20-201ENST00000358813 OOSP2Q86WS3 158 aa4.72□□□□□ -1.65
CCL20-201ENST00000358813 C17orf82Q86X59 251 aaPredicted RBP4.72□□□□□ -1.65
CCL20-201ENST00000358813 ATPAF2Q8N5M1 289 aa4.72□□□□□ -1.65
CCL20-201ENST00000358813 IQCF1Q8N6M8 205 aa4.72□□□□□ -1.65
CCL20-201ENST00000358813 GVQW1Q8N7I0 195 aa4.72□□□□□ -1.65
CCL20-201ENST00000358813 CHDHQ8NE62 594 aaPredicted RBP4.72□□□□□ -1.65
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