RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000585685.5

APOC4-APOC2-201, Transcript of APOC4-APOC2 readthrough (NMD candidate), humanhuman

TSL 5

Gene APOC4-APOC2, Length 1,829 nt, Biotype nonsense mediated decay.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 WDR70Q9NW82 654 aa15.04■□□□□ -0
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 NCDNQ9UBB6 729 aa15.04■□□□□ -0
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 ASXL3Q9C0F0 2248 aa15.04■□□□□ -0
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 BLOC1S5-TXNDC5H3BN57 136 aa15.03■□□□□ -0
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 TO15178 435 aa15.03■□□□□ -0
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 MAGEB4O15481 346 aaPredicted RBP15.03■□□□□ -0
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 SELENOFO60613 162 aa15.03■□□□□ -0
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 ARL6IP5O75915 188 aa15.03■□□□□ -0
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 TXNDC12O95881 172 aa15.03■□□□□ -0
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 EIF4EP06730 217 aaKnown RBP15.03■□□□□ -0
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 UQCRC1P31930 480 aa15.03■□□□□ -0
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 CDKN2AP42771 156 aaKnown RBP15.03■□□□□ -0
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 RPS11P62280 158 aaKnown RBP eCLIP15.03■□□□□ -0
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 EBPQ15125 230 aaKnown RBP15.03■□□□□ -0
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 ALG10Q5BKT4 473 aa15.03■□□□□ -0
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 LEG1Q6P5S2 330 aa15.03■□□□□ -0
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 PLET1Q6UQ28 207 aa15.03■□□□□ -0
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 EXD3Q8N9H8 876 aa15.03■□□□□ -0
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 DNASE2BQ8WZ79 361 aa15.03■□□□□ -0
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 ZNF486Q96H40 463 aaPredicted RBP15.03■□□□□ -0
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 SLC41A2Q96JW4 573 aa15.03■□□□□ -0
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 Q96M85 177 aa15.03■□□□□ -0
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 ADOQ96SZ5 270 aa15.03■□□□□ -0
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 ZNF304Q9HCX3 659 aa15.03■□□□□ -0
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 GNG8Q9UK08 70 aa15.03■□□□□ -0
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 ITGB1BP2Q9UKP3 347 aa15.03■□□□□ -0
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 TMEM265A0A087WTH1 108 aa15.03■□□□□ -0
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 A0A0B4J293 547 aa15.03■□□□□ -0
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 A0A0G2JMP0 313 aa15.03■□□□□ -0
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 A0A0X1KG70 313 aa15.03■□□□□ -0
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 A0A1W2PQD3 144 aa15.03■□□□□ -0
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 ICOSLGO75144 302 aa15.03■□□□□ -0
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 UCHL1P09936 223 aa15.03■□□□□ -0
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 ATXN8OSP0DMR3 200 aa15.03■□□□□ -0
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 GLB1P16278 677 aa15.03■□□□□ -0
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 FBLP22087 321 aaKnown RBP15.03■□□□□ -0
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 SDHAP31040 664 aa15.03■□□□□ -0
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 GPLD1P80108 840 aa15.03■□□□□ -0
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 LTBQ06643 244 aa15.03■□□□□ -0
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 SLC25A35Q3KQZ1 300 aa15.03■□□□□ -0
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 IL20RBQ6UXL0 311 aa15.03■□□□□ -0
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 JAZF1Q86VZ6 243 aa15.03■□□□□ -0
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 GPR135Q8IZ08 494 aa15.03■□□□□ -0
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 UBE2J2Q8N2K1 259 aa15.03■□□□□ -0
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 SPEM1Q8N4L4 309 aa15.03■□□□□ -0
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 SAMD12Q8N8I0 201 aa15.03■□□□□ -0
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 OR4M2Q8NGB6 313 aa15.03■□□□□ -0
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 OR4M1Q8NGD0 313 aa15.03■□□□□ -0
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 OR6K6Q8NGW6 343 aa15.03■□□□□ -0
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 PHYHIPQ92561 330 aa15.03■□□□□ -0
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 DAZLQ92904 295 aaKnown RBP15.03■□□□□ -0
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 ZNF524Q96C55 264 aa15.03■□□□□ -0
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 RNF31Q96EP0 1072 aa15.03■□□□□ -0
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 ACOXLQ9NUZ1 547 aa15.03■□□□□ -0
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 MOKQ9UQ07 419 aa15.03■□□□□ -0
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 TRBV2A0A0J9YWF9 115 aa15.02■□□□□ -0
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 NOTOA8MTQ0 251 aa15.02■□□□□ -0
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 GPRIN2O60269 458 aa15.02■□□□□ -0
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 TSPAN2O60636 221 aa15.02■□□□□ -0
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 FOLR1P15328 257 aa15.02■□□□□ -0
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 HLA-DMAP28067 261 aa15.02■□□□□ -0
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 TACR3P29371 465 aa15.02■□□□□ -0
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 CSF2RBP32927 897 aa15.02■□□□□ -0
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 NR4A2P43354 598 aa15.02■□□□□ -0
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 NKX2-5P52952 324 aaPredicted RBP15.02■□□□□ -0
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 CTXN1P60606 82 aa15.02■□□□□ -0
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 ZNF117Q03924 483 aa15.02■□□□□ -0
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 EMC4Q5J8M3 183 aa15.02■□□□□ -0
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 PRAMEF17Q5VTA0 474 aa15.02■□□□□ -0
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 YOD1Q5VVQ6 348 aaPredicted RBP15.02■□□□□ -0
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 UNQ9370/PRO34162Q6UXP9 181 aa15.02■□□□□ -0
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 PRSS42Q7Z5A4 293 aa15.02■□□□□ -0
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 KMT5CQ86Y97 462 aa15.02■□□□□ -0
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 C9orf40Q8IXQ3 194 aa15.02■□□□□ -0
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 GHDCQ8N2G8 530 aa15.02■□□□□ -0
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 C10orf53Q8N6V4 93 aa15.02■□□□□ -0
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 ZNF563Q8TA94 476 aa15.02■□□□□ -0
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 TRMT10AQ8TBZ6 339 aaKnown RBP15.02■□□□□ -0
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 SLC7A6Q92536 515 aa15.02■□□□□ -0
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 SHDQ96IW2 340 aa15.02■□□□□ -0
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 GAL3ST4Q96RP7 486 aa15.02■□□□□ -0
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 ALG12Q9BV10 488 aa15.02■□□□□ -0
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 RTN4RQ9BZR6 473 aa15.02■□□□□ -0
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 ABRACLQ9P1F3 81 aa15.02■□□□□ -0
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 WNT16Q9UBV4 365 aa15.02■□□□□ -0
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 N6AMT1Q9Y5N5 214 aa15.02■□□□□ -0
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 PCNX3Q9H6A9 2034 aa15.02□□□□□ -0.01
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 PRUNE2Q8WUY3 3088 aa15.01□□□□□ -0.01
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 MSANTD3-TMEFF1A0A0A6YYJ0 341 aa15.01□□□□□ -0.01
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 ANKRD61A6NGH8 418 aa15.01□□□□□ -0.01
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 A8MU76 341 aa15.01□□□□□ -0.01
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 BCKDHBP21953 392 aa15.01□□□□□ -0.01
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 EDNRAP25101 427 aa15.01□□□□□ -0.01
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 IL12BP29460 328 aa15.01□□□□□ -0.01
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 PITPNBP48739 271 aa15.01□□□□□ -0.01
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 INPP1P49441 399 aa15.01□□□□□ -0.01
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 ZP2Q05996 745 aa15.01□□□□□ -0.01
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 TBRG1Q3YBR2 411 aa15.01□□□□□ -0.01
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 VWA2Q5GFL6 755 aa15.01□□□□□ -0.01
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 CEP78Q5JTW2 689 aa15.01□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 53 ms