RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000564582.2

CHD9-210, Transcript of chromodomain helicase DNA binding protein 9, humanhuman

TSL 3

Gene CHD9, Length 968 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHD9-210ENST00000564582 SLC25A27O95847 323 aa5.12□□□□□ -1.59
CHD9-210ENST00000564582 TRBC1P01850 177 aa5.12□□□□□ -1.59
CHD9-210ENST00000564582 ALDOBP05062 364 aa5.12□□□□□ -1.59
CHD9-210ENST00000564582 EDN1P05305 212 aa5.12□□□□□ -1.59
CHD9-210ENST00000564582 MPC1LP0DKB6 136 aa5.12□□□□□ -1.59
CHD9-210ENST00000564582 PRG2P13727 222 aa5.12□□□□□ -1.59
CHD9-210ENST00000564582 ARF4P18085 180 aaPredicted RBP5.12□□□□□ -1.59
CHD9-210ENST00000564582 SDC1P18827 310 aa5.12□□□□□ -1.59
CHD9-210ENST00000564582 ELK1P19419 428 aa5.12□□□□□ -1.59
CHD9-210ENST00000564582 PRDX3P30048 256 aaKnown RBP5.12□□□□□ -1.59
CHD9-210ENST00000564582 PPP2R1BP30154 601 aa5.12□□□□□ -1.59
CHD9-210ENST00000564582 ATP6V1E1P36543 226 aa5.12□□□□□ -1.59
CHD9-210ENST00000564582 SLC1A3P43003 542 aa5.12□□□□□ -1.59
CHD9-210ENST00000564582 RABIFP47224 123 aa5.12□□□□□ -1.59
CHD9-210ENST00000564582 ZNF140P52738 457 aaPredicted RBP5.12□□□□□ -1.59
CHD9-210ENST00000564582 ART1P52961 327 aa5.12□□□□□ -1.59
CHD9-210ENST00000564582 BACE1P56817 501 aa5.12□□□□□ -1.59
CHD9-210ENST00000564582 ERVK-25P63136 954 aa5.12□□□□□ -1.59
CHD9-210ENST00000564582 EFNB1P98172 346 aa5.12□□□□□ -1.59
CHD9-210ENST00000564582 CDK5Q00535 292 aa5.12□□□□□ -1.59
CHD9-210ENST00000564582 SEMG2Q02383 582 aa5.12□□□□□ -1.59
CHD9-210ENST00000564582 SRSF4Q08170 494 aaKnown RBP5.12□□□□□ -1.59
CHD9-210ENST00000564582 CRYZQ08257 329 aaKnown RBP5.12□□□□□ -1.59
CHD9-210ENST00000564582 PPP1R8Q12972 351 aaKnown RBP5.12□□□□□ -1.59
CHD9-210ENST00000564582 OLIG2Q13516 323 aa5.12□□□□□ -1.59
CHD9-210ENST00000564582 DDX39BQ13838 428 aaKnown RBP5.12□□□□□ -1.59
CHD9-210ENST00000564582 KLF9Q13886 244 aaPredicted RBP5.12□□□□□ -1.59
CHD9-210ENST00000564582 PTPRCAPQ14761 206 aa5.12□□□□□ -1.59
CHD9-210ENST00000564582 P2RY14Q15391 338 aa5.12□□□□□ -1.59
CHD9-210ENST00000564582 RBMS2Q15434 407 aaKnown RBP5.12□□□□□ -1.59
CHD9-210ENST00000564582 GPR68Q15743 365 aa5.12□□□□□ -1.59
CHD9-210ENST00000564582 GPR162Q16538 588 aa5.12□□□□□ -1.59
CHD9-210ENST00000564582 ST3GAL2Q16842 350 aa5.12□□□□□ -1.59
CHD9-210ENST00000564582 LY6KQ17RY6 165 aa5.12□□□□□ -1.59
CHD9-210ENST00000564582 ZSWIM7Q19AV6 140 aa5.12□□□□□ -1.59
CHD9-210ENST00000564582 ZNF750Q32MQ0 723 aa5.12□□□□□ -1.59
CHD9-210ENST00000564582 SLC36A2Q495M3 483 aa5.12□□□□□ -1.59
CHD9-210ENST00000564582 SYT14P1Q58G82 188 aa5.12□□□□□ -1.59
CHD9-210ENST00000564582 UBE2NLQ5JXB2 153 aa5.12□□□□□ -1.59
CHD9-210ENST00000564582 SYPL2Q5VXT5 272 aa5.12□□□□□ -1.59
CHD9-210ENST00000564582 PTRHD1Q6GMV3 140 aaKnown RBP5.12□□□□□ -1.59
CHD9-210ENST00000564582 SLC30A6Q6NXT4 461 aa5.12□□□□□ -1.59
CHD9-210ENST00000564582 HIST2H3AQ71DI3 136 aa5.12□□□□□ -1.59
CHD9-210ENST00000564582 LINGO2Q7L985 606 aa5.12□□□□□ -1.59
CHD9-210ENST00000564582 GLT6D1Q7Z4J2 308 aa5.12□□□□□ -1.59
CHD9-210ENST00000564582 VTCN1Q7Z7D3 282 aa5.12□□□□□ -1.59
CHD9-210ENST00000564582 PIM3Q86V86 326 aa5.12□□□□□ -1.59
CHD9-210ENST00000564582 PGBD5Q8N414 524 aa5.12□□□□□ -1.59
CHD9-210ENST00000564582 SIRT6Q8N6T7 355 aa5.12□□□□□ -1.59
CHD9-210ENST00000564582 TCEANCQ8N8B7 351 aa5.12□□□□□ -1.59
CHD9-210ENST00000564582 SAMD12Q8N8I0 201 aa5.12□□□□□ -1.59
CHD9-210ENST00000564582 RASGEF1AQ8N9B8 481 aa5.12□□□□□ -1.59
CHD9-210ENST00000564582 DNAAF1Q8NEP3 725 aa5.12□□□□□ -1.59
CHD9-210ENST00000564582 WDR20Q8TBZ3 569 aa5.12□□□□□ -1.59
CHD9-210ENST00000564582 CLEC4CQ8WTT0 213 aa5.12□□□□□ -1.59
CHD9-210ENST00000564582 EEF1AKMT1Q8WVE0 214 aa5.12□□□□□ -1.59
CHD9-210ENST00000564582 GTF3AQ92664 365 aaKnown RBP5.12□□□□□ -1.59
CHD9-210ENST00000564582 UBE2E3Q969T4 207 aa5.12□□□□□ -1.59
CHD9-210ENST00000564582 RAB3CQ96E17 227 aa5.12□□□□□ -1.59
CHD9-210ENST00000564582 MALSU1Q96EH3 234 aa5.12□□□□□ -1.59
CHD9-210ENST00000564582 S100A16Q96FQ6 103 aaKnown RBP5.12□□□□□ -1.59
CHD9-210ENST00000564582 LRR1Q96L50 414 aa5.12□□□□□ -1.59
CHD9-210ENST00000564582 ZNF582Q96NG8 517 aaPredicted RBP5.12□□□□□ -1.59
CHD9-210ENST00000564582 PFDN5Q99471 154 aa5.12□□□□□ -1.59
CHD9-210ENST00000564582 BARD1Q99728 777 aaKnown RBP5.12□□□□□ -1.59
CHD9-210ENST00000564582 NIPSNAP1Q9BPW8 284 aa5.12□□□□□ -1.59
CHD9-210ENST00000564582 SLC25A21Q9BQT8 299 aaPredicted RBP5.12□□□□□ -1.59
CHD9-210ENST00000564582 WRAP53Q9BUR4 548 aaKnown RBP5.12□□□□□ -1.59
CHD9-210ENST00000564582 VN1R3Q9BXE9 311 aa5.12□□□□□ -1.59
CHD9-210ENST00000564582 MAGEH1Q9H213 219 aa5.12□□□□□ -1.59
CHD9-210ENST00000564582 SLCO5A1Q9H2Y9 848 aa5.12□□□□□ -1.59
CHD9-210ENST00000564582 FBXO44Q9H4M3 255 aa5.12□□□□□ -1.59
CHD9-210ENST00000564582 NOX3Q9HBY0 568 aa5.12□□□□□ -1.59
CHD9-210ENST00000564582 MRPS30Q9NP92 439 aaKnown RBP5.12□□□□□ -1.59
CHD9-210ENST00000564582 NT5MQ9NPB1 228 aa5.12□□□□□ -1.59
CHD9-210ENST00000564582 B3GAT2Q9NPZ5 323 aa5.12□□□□□ -1.59
CHD9-210ENST00000564582 C19orf12Q9NSK7 152 aa5.12□□□□□ -1.59
CHD9-210ENST00000564582 MAN2C1Q9NTJ4 1040 aa5.12□□□□□ -1.59
CHD9-210ENST00000564582 SAGE1Q9NXZ1 904 aa5.12□□□□□ -1.59
CHD9-210ENST00000564582 AHSPQ9NZD4 102 aa5.12□□□□□ -1.59
CHD9-210ENST00000564582 MARCH4Q9P2E8 410 aaPredicted RBP5.12□□□□□ -1.59
CHD9-210ENST00000564582 NFKBIL1Q9UBC1 381 aaPredicted RBP5.12□□□□□ -1.59
CHD9-210ENST00000564582 FBXL2Q9UKC9 423 aa5.12□□□□□ -1.59
CHD9-210ENST00000564582 UTS2RQ9UKP6 389 aa5.12□□□□□ -1.59
CHD9-210ENST00000564582 EXO1Q9UQ84 846 aaKnown RBP5.12□□□□□ -1.59
CHD9-210ENST00000564582 KCNIP3Q9Y2W7 256 aa5.12□□□□□ -1.59
CHD9-210ENST00000564582 PCYT1BQ9Y5K3 369 aaPredicted RBP5.12□□□□□ -1.59
CHD9-210ENST00000564582 ETV7Q9Y603 341 aa5.12□□□□□ -1.59
CHD9-210ENST00000564582 ANKRD12Q6UB98 2062 aa5.12□□□□□ -1.59
CHD9-210ENST00000564582 NRXN2Q9P2S2 1712 aa5.11□□□□□ -1.59
CHD9-210ENST00000564582 IGLV3-10A0A075B6K4 115 aa5.11□□□□□ -1.59
CHD9-210ENST00000564582 SYNJ2BP-COX16A0A087WUM0 186 aa5.11□□□□□ -1.59
CHD9-210ENST00000564582 A0A0U1RQF3 1178 aa5.11□□□□□ -1.59
CHD9-210ENST00000564582 TRBC2A0A5B9 178 aa5.11□□□□□ -1.59
CHD9-210ENST00000564582 C1orf226A1L170 272 aa5.11□□□□□ -1.59
CHD9-210ENST00000564582 GGT3PA6NGU5 568 aa5.11□□□□□ -1.59
CHD9-210ENST00000564582 NCF1BA6NI72 391 aaPredicted RBP5.11□□□□□ -1.59
CHD9-210ENST00000564582 YJEFN3A6XGL0 299 aa5.11□□□□□ -1.59
CHD9-210ENST00000564582 NCF1CA8MVU1 366 aaPredicted RBP5.11□□□□□ -1.59
CHD9-210ENST00000564582 LINC00587B1AMM8 73 aa5.11□□□□□ -1.59
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