RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000490677.1

HOXB3-211, Transcript of homeobox B3, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene HOXB3, Length 1,109 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB3-211ENST00000490677 NFKBIDQ8NI38 313 aa24.35■■□□□ 1.49
HOXB3-211ENST00000490677 RNF223E7ERA6 249 aa24.34■■□□□ 1.49
HOXB3-211ENST00000490677 M0R1B8 84 aa24.34■■□□□ 1.49
HOXB3-211ENST00000490677 TPST1O60507 370 aa24.34■■□□□ 1.49
HOXB3-211ENST00000490677 PRKAR1BP31321 381 aa24.34■■□□□ 1.49
HOXB3-211ENST00000490677 SELENOPP49908 381 aa24.34■■□□□ 1.49
HOXB3-211ENST00000490677 ATP4BP51164 291 aa24.34■■□□□ 1.49
HOXB3-211ENST00000490677 IRX1P78414 480 aaPredicted RBP24.34■■□□□ 1.49
HOXB3-211ENST00000490677 ADRM1Q16186 407 aa24.34■■□□□ 1.49
HOXB3-211ENST00000490677 GLIPR1L2Q4G1C9 344 aa24.34■■□□□ 1.49
HOXB3-211ENST00000490677 PRIMA1Q86XR5 153 aa24.34■■□□□ 1.49
HOXB3-211ENST00000490677 POMGNT2Q8NAT1 580 aa24.34■■□□□ 1.49
HOXB3-211ENST00000490677 MFSD8Q8NHS3 518 aa24.34■■□□□ 1.49
HOXB3-211ENST00000490677 DHRS9Q9BPW9 319 aa24.34■■□□□ 1.49
HOXB3-211ENST00000490677 TAPBPLQ9BX59 468 aa24.34■■□□□ 1.49
HOXB3-211ENST00000490677 ARMC7Q9H6L4 198 aa24.34■■□□□ 1.49
HOXB3-211ENST00000490677 FAIMQ9NVQ4 179 aa24.34■■□□□ 1.49
HOXB3-211ENST00000490677 TMEM45AQ9NWC5 275 aa24.34■■□□□ 1.49
HOXB3-211ENST00000490677 SEC14L4Q9UDX3 406 aa24.34■■□□□ 1.49
HOXB3-211ENST00000490677 AMDHD2Q9Y303 409 aa24.34■■□□□ 1.49
HOXB3-211ENST00000490677 INAFM1C9JVW0 142 aa24.33■■□□□ 1.49
HOXB3-211ENST00000490677 VAMP5O95183 116 aa24.33■■□□□ 1.49
HOXB3-211ENST00000490677 GPX2P18283 190 aa24.33■■□□□ 1.49
HOXB3-211ENST00000490677 PCSK6P29122 969 aa24.33■■□□□ 1.49
HOXB3-211ENST00000490677 GCNT6Q5T4J0 391 aa24.33■■□□□ 1.49
HOXB3-211ENST00000490677 TMEM225Q6GV28 225 aa24.33■■□□□ 1.49
HOXB3-211ENST00000490677 SLC22A25Q6T423 547 aa24.33■■□□□ 1.49
HOXB3-211ENST00000490677 DLEU7Q6UYE1 221 aa24.33■■□□□ 1.49
HOXB3-211ENST00000490677 LSMEM1Q8N8F7 131 aa24.33■■□□□ 1.49
HOXB3-211ENST00000490677 KTI12Q96EK9 354 aaPredicted RBP24.33■■□□□ 1.49
HOXB3-211ENST00000490677 ALG2Q9H553 416 aa24.33■■□□□ 1.49
HOXB3-211ENST00000490677 IGKV1D-42A0A075B6H8 117 aa24.32■■□□□ 1.48
HOXB3-211ENST00000490677 PNMTP11086 282 aa24.32■■□□□ 1.48
HOXB3-211ENST00000490677 CDK6Q00534 326 aa24.32■■□□□ 1.48
HOXB3-211ENST00000490677 TGFBR3Q03167 851 aa24.32■■□□□ 1.48
HOXB3-211ENST00000490677 C1QTNF12Q5T7M4 302 aa24.32■■□□□ 1.48
HOXB3-211ENST00000490677 AGAP6Q5VW22 663 aa24.32■■□□□ 1.48
HOXB3-211ENST00000490677 DHRS4L2Q6PKH6 230 aa24.32■■□□□ 1.48
HOXB3-211ENST00000490677 WFDC6Q9BQY6 131 aa24.32■■□□□ 1.48
HOXB3-211ENST00000490677 PRR14Q9BWN1 585 aa24.32■■□□□ 1.48
HOXB3-211ENST00000490677 REG4Q9BYZ8 158 aa24.32■■□□□ 1.48
HOXB3-211ENST00000490677 ZNF385DQ9H6B1 395 aa24.32■■□□□ 1.48
HOXB3-211ENST00000490677 TMEM38AQ9H6F2 299 aa24.32■■□□□ 1.48
HOXB3-211ENST00000490677 C12orf10Q9HB07 376 aa24.32■■□□□ 1.48
HOXB3-211ENST00000490677 CBLN4Q9NTU7 201 aa24.32■■□□□ 1.48
HOXB3-211ENST00000490677 B3GAT1Q9P2W7 334 aa24.32■■□□□ 1.48
HOXB3-211ENST00000490677 RASD1Q9Y272 281 aa24.32■■□□□ 1.48
HOXB3-211ENST00000490677 RPS5P46782 204 aaKnown RBP24.31■■□□□ 1.48
HOXB3-211ENST00000490677 HIKESHIQ53FT3 197 aa24.31■■□□□ 1.48
HOXB3-211ENST00000490677 AGKQ53H12 422 aa24.31■■□□□ 1.48
HOXB3-211ENST00000490677 REEP3Q6NUK4 255 aa24.31■■□□□ 1.48
HOXB3-211ENST00000490677 KDM8Q8N371 416 aa24.31■■□□□ 1.48
HOXB3-211ENST00000490677 STON2Q8WXE9 905 aa24.31■■□□□ 1.48
HOXB3-211ENST00000490677 CPPED1Q9BRF8 314 aaPredicted RBP24.31■■□□□ 1.48
HOXB3-211ENST00000490677 CACNG6Q9BXT2 260 aa24.31■■□□□ 1.48
HOXB3-211ENST00000490677 NELFAQ9H3P2 528 aa24.31■■□□□ 1.48
HOXB3-211ENST00000490677 CUBNO60494 3623 aa24.3■■□□□ 1.48
HOXB3-211ENST00000490677 A0A1B0GWA3 101 aa24.3■■□□□ 1.48
HOXB3-211ENST00000490677 C5orf58C9J3I9 102 aa24.3■■□□□ 1.48
HOXB3-211ENST00000490677 ZNF432O94892 652 aa24.3■■□□□ 1.48
HOXB3-211ENST00000490677 AHSA1O95433 338 aa24.3■■□□□ 1.48
HOXB3-211ENST00000490677 PPIBP23284 216 aaKnown RBP24.3■■□□□ 1.48
HOXB3-211ENST00000490677 SQLEQ14534 574 aa24.3■■□□□ 1.48
HOXB3-211ENST00000490677 TAAR8Q969N4 342 aa24.3■■□□□ 1.48
HOXB3-211ENST00000490677 ALKBH3Q96Q83 286 aaPredicted RBP24.3■■□□□ 1.48
HOXB3-211ENST00000490677 CACYBPQ9HB71 228 aaKnown RBP24.3■■□□□ 1.48
HOXB3-211ENST00000490677 A0A096LNT2 108 aa24.29■■□□□ 1.48
HOXB3-211ENST00000490677 TPST2O60704 377 aa24.29■■□□□ 1.48
HOXB3-211ENST00000490677 UPK3AO75631 287 aa24.29■■□□□ 1.48
HOXB3-211ENST00000490677 PRPS1P60891 318 aa24.29■■□□□ 1.48
HOXB3-211ENST00000490677 MUC15Q8N387 334 aa24.29■■□□□ 1.48
HOXB3-211ENST00000490677 OR1K1Q8NGR3 316 aa24.29■■□□□ 1.48
HOXB3-211ENST00000490677 SLC25A36Q96CQ1 311 aa24.29■■□□□ 1.48
HOXB3-211ENST00000490677 ELOA3DA6NLF2 546 aaPredicted RBP24.28■■□□□ 1.48
HOXB3-211ENST00000490677 LGI1O95970 557 aa24.28■■□□□ 1.48
HOXB3-211ENST00000490677 CDH2P19022 906 aaPredicted RBP24.28■■□□□ 1.48
HOXB3-211ENST00000490677 ELOA3BQ3SY89 546 aa24.28■■□□□ 1.48
HOXB3-211ENST00000490677 TBRG1Q3YBR2 411 aa24.28■■□□□ 1.48
HOXB3-211ENST00000490677 ZNF544Q6NX49 715 aa24.28■■□□□ 1.48
HOXB3-211ENST00000490677 NIPAL3Q6P499 406 aa24.28■■□□□ 1.48
HOXB3-211ENST00000490677 ELOA3Q8NG57 546 aa24.28■■□□□ 1.48
HOXB3-211ENST00000490677 CKAP2Q8WWK9 683 aa24.28■■□□□ 1.48
HOXB3-211ENST00000490677 BCL2L2Q92843 193 aaPredicted RBP24.28■■□□□ 1.48
HOXB3-211ENST00000490677 HS6ST2Q96MM7 605 aa24.28■■□□□ 1.48
HOXB3-211ENST00000490677 LINC00470Q9BZP3 86 aa24.28■■□□□ 1.48
HOXB3-211ENST00000490677 BARX1Q9HBU1 254 aaPredicted RBP24.28■■□□□ 1.48
HOXB3-211ENST00000490677 POU2F3Q9UKI9 436 aa24.28■■□□□ 1.48
HOXB3-211ENST00000490677 ADAM21Q9UKJ8 722 aa24.28■■□□□ 1.48
HOXB3-211ENST00000490677 SCARB2Q14108 478 aa24.27■■□□□ 1.48
HOXB3-211ENST00000490677 NRF1Q16656 503 aa24.27■■□□□ 1.48
HOXB3-211ENST00000490677 RUNDC3AQ59EK9 446 aa24.27■■□□□ 1.48
HOXB3-211ENST00000490677 RETREG3Q86VR2 466 aa24.27■■□□□ 1.48
HOXB3-211ENST00000490677 PTOV1Q86YD1 416 aa24.27■■□□□ 1.48
HOXB3-211ENST00000490677 INTS9Q9NV88 658 aaKnown RBP24.27■■□□□ 1.48
HOXB3-211ENST00000490677 IGHV1-18A0A0C4DH31 117 aa24.26■■□□□ 1.47
HOXB3-211ENST00000490677 ZNF587BE7ETH6 402 aa24.26■■□□□ 1.47
HOXB3-211ENST00000490677 ATP6V1G2-DDX39BF2Z307 99 aa24.26■■□□□ 1.47
HOXB3-211ENST00000490677 FABP6P51161 128 aa24.26■■□□□ 1.47
HOXB3-211ENST00000490677 PCBP3P57721 371 aaKnown RBP24.26■■□□□ 1.47
HOXB3-211ENST00000490677 DMTNQ08495 405 aa24.26■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 407.1 ms