RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000489247.1

ATG4A-208, Transcript of autophagy related 4A cysteine peptidase, humanhuman

TSL 2

Gene ATG4A, Length 623 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG4A-208ENST00000489247 TMEM205Q6UW68 189 aa5.05□□□□□ -1.6
ATG4A-208ENST00000489247 ZNF517Q6ZMY9 492 aaPredicted RBP5.05□□□□□ -1.6
ATG4A-208ENST00000489247 USP43Q70EL4 1123 aa5.05□□□□□ -1.6
ATG4A-208ENST00000489247 BMP8AQ7Z5Y6 402 aa5.05□□□□□ -1.6
ATG4A-208ENST00000489247 GATAD2AQ86YP4 633 aa5.05□□□□□ -1.6
ATG4A-208ENST00000489247 EGFL6Q8IUX8 553 aa5.05□□□□□ -1.6
ATG4A-208ENST00000489247 LYSMD2Q8IV50 215 aa5.05□□□□□ -1.6
ATG4A-208ENST00000489247 MISPQ8IVT2 679 aa5.05□□□□□ -1.6
ATG4A-208ENST00000489247 GID4Q8IVV7 300 aa5.05□□□□□ -1.6
ATG4A-208ENST00000489247 CDK20Q8IZL9 346 aa5.05□□□□□ -1.6
ATG4A-208ENST00000489247 METTL27Q8N6F8 245 aaPredicted RBP5.05□□□□□ -1.6
ATG4A-208ENST00000489247 STPG3Q8N7X2 389 aa5.05□□□□□ -1.6
ATG4A-208ENST00000489247 BMPERQ8N8U9 685 aa5.05□□□□□ -1.6
ATG4A-208ENST00000489247 TMEM105Q8N8V8 129 aa5.05□□□□□ -1.6
ATG4A-208ENST00000489247 OR52L1Q8NGH7 329 aa5.05□□□□□ -1.6
ATG4A-208ENST00000489247 OR52I1Q8NGK6 324 aa5.05□□□□□ -1.6
ATG4A-208ENST00000489247 OR52N1Q8NH53 320 aa5.05□□□□□ -1.6
ATG4A-208ENST00000489247 PFN4Q8NHR9 129 aa5.05□□□□□ -1.6
ATG4A-208ENST00000489247 FANK1Q8TC84 345 aa5.05□□□□□ -1.6
ATG4A-208ENST00000489247 STT3BQ8TCJ2 826 aa5.05□□□□□ -1.6
ATG4A-208ENST00000489247 DOK4Q8TEW6 326 aa5.05□□□□□ -1.6
ATG4A-208ENST00000489247 ZCCHC14Q8WYQ9 949 aaKnown RBP5.05□□□□□ -1.6
ATG4A-208ENST00000489247 PIGKQ92643 395 aa5.05□□□□□ -1.6
ATG4A-208ENST00000489247 ARSGQ96EG1 525 aa5.05□□□□□ -1.6
ATG4A-208ENST00000489247 DTNBP1Q96EV8 351 aa5.05□□□□□ -1.6
ATG4A-208ENST00000489247 OPALINQ96PE5 141 aa5.05□□□□□ -1.6
ATG4A-208ENST00000489247 OR5M11Q96RB7 305 aa5.05□□□□□ -1.6
ATG4A-208ENST00000489247 DDOQ99489 341 aa5.05□□□□□ -1.6
ATG4A-208ENST00000489247 MGLLQ99685 303 aa5.05□□□□□ -1.6
ATG4A-208ENST00000489247 COQ7Q99807 217 aa5.05□□□□□ -1.6
ATG4A-208ENST00000489247 WDR77Q9BQA1 342 aaPredicted RBP5.05□□□□□ -1.6
ATG4A-208ENST00000489247 SLIRPQ9GZT3 109 aaKnown RBP5.05□□□□□ -1.6
ATG4A-208ENST00000489247 GAREM1Q9H706 876 aa5.05□□□□□ -1.6
ATG4A-208ENST00000489247 WDR54Q9H977 334 aa5.05□□□□□ -1.6
ATG4A-208ENST00000489247 PLGRKTQ9HBL7 147 aa5.05□□□□□ -1.6
ATG4A-208ENST00000489247 AMBNQ9NP70 447 aa5.05□□□□□ -1.6
ATG4A-208ENST00000489247 INPP5EQ9NRR6 644 aa5.05□□□□□ -1.6
ATG4A-208ENST00000489247 C20orf141Q9NUB4 165 aa5.05□□□□□ -1.6
ATG4A-208ENST00000489247 TBC1D23Q9NUY8 699 aa5.05□□□□□ -1.6
ATG4A-208ENST00000489247 NDUFB11Q9NX14 153 aa5.05□□□□□ -1.6
ATG4A-208ENST00000489247 CCDC59Q9P031 241 aaKnown RBP5.05□□□□□ -1.6
ATG4A-208ENST00000489247 COPS7AQ9UBW8 275 aa5.05□□□□□ -1.6
ATG4A-208ENST00000489247 SEC14L4Q9UDX3 406 aa5.05□□□□□ -1.6
ATG4A-208ENST00000489247 RARRES3Q9UL19 164 aa5.05□□□□□ -1.6
ATG4A-208ENST00000489247 ERGIC3Q9Y282 383 aa5.05□□□□□ -1.6
ATG4A-208ENST00000489247 B3GNT3Q9Y2A9 372 aa5.05□□□□□ -1.6
ATG4A-208ENST00000489247 EXOSC1Q9Y3B2 195 aaKnown RBP5.05□□□□□ -1.6
ATG4A-208ENST00000489247 OR10H1Q9Y4A9 318 aa5.05□□□□□ -1.6
ATG4A-208ENST00000489247 PCDHGA5Q9Y5G8 931 aa5.05□□□□□ -1.6
ATG4A-208ENST00000489247 CLCA3PQ9Y6N3 262 aa5.05□□□□□ -1.6
ATG4A-208ENST00000489247 MAU2Q9Y6X3 613 aa5.05□□□□□ -1.6
ATG4A-208ENST00000489247 PRUNE2Q8WUY3 3088 aa5.05□□□□□ -1.6
ATG4A-208ENST00000489247 DNAH14Q0VDD8 3507 aa5.04□□□□□ -1.6
ATG4A-208ENST00000489247 EML5Q05BV3 1969 aa5.04□□□□□ -1.6
ATG4A-208ENST00000489247 PCDH15Q96QU1 1955 aa5.04□□□□□ -1.6
ATG4A-208ENST00000489247 LOC102723996A0A087X1L8 192 aa5.04□□□□□ -1.6
ATG4A-208ENST00000489247 IGLV3-32A0A0A0MS00 114 aa5.04□□□□□ -1.6
ATG4A-208ENST00000489247 CCDC182A6NF36 153 aa5.04□□□□□ -1.6
ATG4A-208ENST00000489247 TMEM221A6NGB7 291 aa5.04□□□□□ -1.6
ATG4A-208ENST00000489247 METTL15A6NJ78 407 aa5.04□□□□□ -1.6
ATG4A-208ENST00000489247 SAGE2PA6NJ88 616 aa5.04□□□□□ -1.6
ATG4A-208ENST00000489247 B4E171 279 aa5.04□□□□□ -1.6
ATG4A-208ENST00000489247 M0R296 226 aa5.04□□□□□ -1.6
ATG4A-208ENST00000489247 ZNF264O43296 627 aa5.04□□□□□ -1.6
ATG4A-208ENST00000489247 AIREO43918 545 aa5.04□□□□□ -1.6
ATG4A-208ENST00000489247 CDC40O60508 579 aaKnown RBP eCLIP5.04□□□□□ -1.6
ATG4A-208ENST00000489247 NPIPB7O75200 414 aa5.04□□□□□ -1.6
ATG4A-208ENST00000489247 ALOX12BO75342 701 aa5.04□□□□□ -1.6
ATG4A-208ENST00000489247 CSO75390 466 aaKnown RBP5.04□□□□□ -1.6
ATG4A-208ENST00000489247 SCRG1O75711 98 aa5.04□□□□□ -1.6
ATG4A-208ENST00000489247 OR7A10O76100 309 aa5.04□□□□□ -1.6
ATG4A-208ENST00000489247 NDUFB2O95178 105 aa5.04□□□□□ -1.6
ATG4A-208ENST00000489247 UTS2O95399 124 aa5.04□□□□□ -1.6
ATG4A-208ENST00000489247 TXNDC12O95881 172 aa5.04□□□□□ -1.6
ATG4A-208ENST00000489247 LIMS3P0CW19 117 aa5.04□□□□□ -1.6
ATG4A-208ENST00000489247 LIMS4P0CW20 117 aa5.04□□□□□ -1.6
ATG4A-208ENST00000489247 MYF5P13349 255 aa5.04□□□□□ -1.6
ATG4A-208ENST00000489247 ZNF28P17035 718 aa5.04□□□□□ -1.6
ATG4A-208ENST00000489247 CD53P19397 219 aa5.04□□□□□ -1.6
ATG4A-208ENST00000489247 HOXA5P20719 270 aa5.04□□□□□ -1.6
ATG4A-208ENST00000489247 GALP22466 123 aa5.04□□□□□ -1.6
ATG4A-208ENST00000489247 GADD45AP24522 165 aa5.04□□□□□ -1.6
ATG4A-208ENST00000489247 ACP1P24666 158 aa5.04□□□□□ -1.6
ATG4A-208ENST00000489247 MST1P26927 711 aa5.04□□□□□ -1.6
ATG4A-208ENST00000489247 APEX1P27695 318 aaKnown RBP5.04□□□□□ -1.6
ATG4A-208ENST00000489247 SLC6A6P31641 620 aa5.04□□□□□ -1.6
ATG4A-208ENST00000489247 TSPAN7P41732 249 aa5.04□□□□□ -1.6
ATG4A-208ENST00000489247 SLC1A3P43003 542 aa5.04□□□□□ -1.6
ATG4A-208ENST00000489247 MTNR1BP49286 362 aa5.04□□□□□ -1.6
ATG4A-208ENST00000489247 MLLT10P55197 1068 aa5.04□□□□□ -1.6
ATG4A-208ENST00000489247 CDH11P55287 796 aa5.04□□□□□ -1.6
ATG4A-208ENST00000489247 SUMO3P55854 103 aaPredicted RBP5.04□□□□□ -1.6
ATG4A-208ENST00000489247 WNT4P56705 351 aa5.04□□□□□ -1.6
ATG4A-208ENST00000489247 DCDP81605 110 aaKnown RBP5.04□□□□□ -1.6
ATG4A-208ENST00000489247 CD83Q01151 205 aa5.04□□□□□ -1.6
ATG4A-208ENST00000489247 MC2RQ01718 297 aa5.04□□□□□ -1.6
ATG4A-208ENST00000489247 OCA2Q04671 838 aa5.04□□□□□ -1.6
ATG4A-208ENST00000489247 GPR50Q13585 617 aa5.04□□□□□ -1.6
ATG4A-208ENST00000489247 IL10RAQ13651 578 aa5.04□□□□□ -1.6
ATG4A-208ENST00000489247 EFR3AQ14156 821 aa5.04□□□□□ -1.6
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 50.6 ms