RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000488380.5

NISCH-212, Transcript of nischarin, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene NISCH, Length 3,168 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NISCH-212ENST00000488380 SPHK1Q9NYA1 384 aa12.4□□□□□ -0.42
NISCH-212ENST00000488380 WSB2Q9NYS7 404 aaPredicted RBP12.4□□□□□ -0.42
NISCH-212ENST00000488380 TRIOO75962 3097 aa12.4□□□□□ -0.42
NISCH-212ENST00000488380 TRBV2A0A0J9YWF9 115 aa12.4□□□□□ -0.42
NISCH-212ENST00000488380 J3QRE1 110 aa12.4□□□□□ -0.42
NISCH-212ENST00000488380 ERI3O43414 337 aaKnown RBP12.4□□□□□ -0.42
NISCH-212ENST00000488380 SC5DO75845 299 aa12.4□□□□□ -0.42
NISCH-212ENST00000488380 ASGR2P07307 311 aa12.4□□□□□ -0.42
NISCH-212ENST00000488380 GJA4P35212 333 aa12.4□□□□□ -0.42
NISCH-212ENST00000488380 TSSK4Q6SA08 328 aa12.4□□□□□ -0.42
NISCH-212ENST00000488380 ASPGQ86U10 573 aa12.4□□□□□ -0.42
NISCH-212ENST00000488380 SPAG16Q8N0X2 631 aa12.4□□□□□ -0.42
NISCH-212ENST00000488380 PUSL1Q8N0Z8 303 aaKnown RBP12.4□□□□□ -0.42
NISCH-212ENST00000488380 THAP6Q8TBB0 222 aa12.4□□□□□ -0.42
NISCH-212ENST00000488380 CNRIP1Q96F85 164 aaPredicted RBP12.4□□□□□ -0.42
NISCH-212ENST00000488380 CRB3Q9BUF7 120 aa12.4□□□□□ -0.42
NISCH-212ENST00000488380 ZNF471Q9BX82 626 aaPredicted RBP12.4□□□□□ -0.42
NISCH-212ENST00000488380 SLC22A11Q9NSA0 550 aa12.4□□□□□ -0.42
NISCH-212ENST00000488380 LOC105378220A0A1B0GUY1 285 aaPredicted RBP12.39□□□□□ -0.43
NISCH-212ENST00000488380 A0A1W2PR48 441 aa12.39□□□□□ -0.43
NISCH-212ENST00000488380 OR2W5A6NFC9 320 aa12.39□□□□□ -0.43
NISCH-212ENST00000488380 SNRPGP15A8MWD9 76 aa12.39□□□□□ -0.43
NISCH-212ENST00000488380 VSIG10L2P0DP72 767 aa12.39□□□□□ -0.43
NISCH-212ENST00000488380 LUMP51884 338 aaPredicted RBP12.39□□□□□ -0.43
NISCH-212ENST00000488380 PRDX1Q06830 199 aaKnown RBP12.39□□□□□ -0.43
NISCH-212ENST00000488380 GUCA2BQ16661 112 aa12.39□□□□□ -0.43
NISCH-212ENST00000488380 VITQ6UXI7 678 aa12.39□□□□□ -0.43
NISCH-212ENST00000488380 SSX6Q7RTT6 188 aa12.39□□□□□ -0.43
NISCH-212ENST00000488380 SLC16A13Q7RTY0 426 aa12.39□□□□□ -0.43
NISCH-212ENST00000488380 GDF7Q7Z4P5 450 aa12.39□□□□□ -0.43
NISCH-212ENST00000488380 SHISA5Q8N114 240 aa12.39□□□□□ -0.43
NISCH-212ENST00000488380 DNAAF1Q8NEP3 725 aa12.39□□□□□ -0.43
NISCH-212ENST00000488380 SYNPRQ8TBG9 265 aa12.39□□□□□ -0.43
NISCH-212ENST00000488380 SLC22A8Q8TCC7 542 aa12.39□□□□□ -0.43
NISCH-212ENST00000488380 PDCD10Q9BUL8 212 aa12.39□□□□□ -0.43
NISCH-212ENST00000488380 CACYBPQ9HB71 228 aaKnown RBP12.39□□□□□ -0.43
NISCH-212ENST00000488380 ZNF275Q9NSD4 429 aaPredicted RBP12.39□□□□□ -0.43
NISCH-212ENST00000488380 ACOD1A6NK06 481 aa12.39□□□□□ -0.43
NISCH-212ENST00000488380 SLC22A31A6NKX4 558 aa12.39□□□□□ -0.43
NISCH-212ENST00000488380 CTDSPLO15194 276 aa12.39□□□□□ -0.43
NISCH-212ENST00000488380 KAT7O95251 611 aa12.39□□□□□ -0.43
NISCH-212ENST00000488380 S100A9P06702 114 aaKnown RBP12.39□□□□□ -0.43
NISCH-212ENST00000488380 SBK2P0C263 348 aa12.39□□□□□ -0.43
NISCH-212ENST00000488380 SPP1P10451 314 aa12.39□□□□□ -0.43
NISCH-212ENST00000488380 CBR1P16152 277 aa12.39□□□□□ -0.43
NISCH-212ENST00000488380 FCARP24071 287 aa12.39□□□□□ -0.43
NISCH-212ENST00000488380 CERS1P27544 350 aa12.39□□□□□ -0.43
NISCH-212ENST00000488380 SEC13P55735 322 aa12.39□□□□□ -0.43
NISCH-212ENST00000488380 HFEQ30201 348 aa12.39□□□□□ -0.43
NISCH-212ENST00000488380 ELFN2Q5R3F8 820 aa12.39□□□□□ -0.43
NISCH-212ENST00000488380 PSRC1Q6PGN9 363 aaPredicted RBP12.39□□□□□ -0.43
NISCH-212ENST00000488380 GJD3Q8N144 294 aa12.39□□□□□ -0.43
NISCH-212ENST00000488380 ARL14Q8N4G2 192 aa12.39□□□□□ -0.43
NISCH-212ENST00000488380 OR2AK2Q8NG84 335 aa12.39□□□□□ -0.43
NISCH-212ENST00000488380 OR51A7Q8NH64 312 aa12.39□□□□□ -0.43
NISCH-212ENST00000488380 CD180Q99467 661 aa12.39□□□□□ -0.43
NISCH-212ENST00000488380 C6orf106Q9H6K1 298 aaPredicted RBP12.39□□□□□ -0.43
NISCH-212ENST00000488380 THAP10Q9P2Z0 257 aaPredicted RBP12.39□□□□□ -0.43
NISCH-212ENST00000488380 MAN2B1O00754 1011 aa12.38□□□□□ -0.43
NISCH-212ENST00000488380 FCMRO60667 390 aa12.38□□□□□ -0.43
NISCH-212ENST00000488380 NDUFB6O95139 128 aa12.38□□□□□ -0.43
NISCH-212ENST00000488380 F12P00748 615 aaPredicted RBP12.38□□□□□ -0.43
NISCH-212ENST00000488380 FABP1P07148 127 aa12.38□□□□□ -0.43
NISCH-212ENST00000488380 CNR1P21554 472 aa12.38□□□□□ -0.43
NISCH-212ENST00000488380 NTSP30990 170 aa12.38□□□□□ -0.43
NISCH-212ENST00000488380 PSMB10P40306 273 aa12.38□□□□□ -0.43
NISCH-212ENST00000488380 ANXA11P50995 505 aaKnown RBP12.38□□□□□ -0.43
NISCH-212ENST00000488380 CLDN2P57739 230 aa12.38□□□□□ -0.43
NISCH-212ENST00000488380 CBFBQ13951 182 aa12.38□□□□□ -0.43
NISCH-212ENST00000488380 CST6Q15828 149 aa12.38□□□□□ -0.43
NISCH-212ENST00000488380 LDLRAD3Q86YD5 345 aa12.38□□□□□ -0.43
NISCH-212ENST00000488380 CCDC36Q8IYA8 594 aa12.38□□□□□ -0.43
NISCH-212ENST00000488380 SVBPQ8N300 66 aa12.38□□□□□ -0.43
NISCH-212ENST00000488380 MUC20Q8N307 709 aaPredicted RBP12.38□□□□□ -0.43
NISCH-212ENST00000488380 RFLNBQ8N5W9 214 aa12.38□□□□□ -0.43
NISCH-212ENST00000488380 ZNF784Q8NCA9 323 aaPredicted RBP12.38□□□□□ -0.43
NISCH-212ENST00000488380 OR1M1Q8NGA1 313 aa12.38□□□□□ -0.43
NISCH-212ENST00000488380 SNX33Q8WV41 574 aa12.38□□□□□ -0.43
NISCH-212ENST00000488380 ARSGQ96EG1 525 aa12.38□□□□□ -0.43
NISCH-212ENST00000488380 TEX101Q9BY14 249 aa12.38□□□□□ -0.43
NISCH-212ENST00000488380 PBX4Q9BYU1 374 aa12.38□□□□□ -0.43
NISCH-212ENST00000488380 NOX4Q9NPH5 578 aa12.38□□□□□ -0.43
NISCH-212ENST00000488380 POT1Q9NUX5 634 aa12.38□□□□□ -0.43
NISCH-212ENST00000488380 GNG8Q9UK08 70 aa12.38□□□□□ -0.43
NISCH-212ENST00000488380 TRAV1-2A0A0B4J238 106 aa12.38□□□□□ -0.43
NISCH-212ENST00000488380 TBX19O60806 448 aa12.38□□□□□ -0.43
NISCH-212ENST00000488380 AQP8O94778 261 aa12.38□□□□□ -0.43
NISCH-212ENST00000488380 RPN2P04844 631 aa12.38□□□□□ -0.43
NISCH-212ENST00000488380 ZGLP1P0C6A0 271 aa12.38□□□□□ -0.43
NISCH-212ENST00000488380 EDNRAP25101 427 aa12.38□□□□□ -0.43
NISCH-212ENST00000488380 PEBP1P30086 187 aaKnown RBP12.38□□□□□ -0.43
NISCH-212ENST00000488380 NAA10P41227 235 aaPredicted RBP12.38□□□□□ -0.43
NISCH-212ENST00000488380 AGERQ15109 404 aa12.38□□□□□ -0.43
NISCH-212ENST00000488380 PDGFRLQ15198 375 aa12.38□□□□□ -0.43
NISCH-212ENST00000488380 PCGF3Q3KNV8 242 aa12.38□□□□□ -0.43
NISCH-212ENST00000488380 MANEAQ5SRI9 462 aa12.38□□□□□ -0.43
NISCH-212ENST00000488380 DMKNQ6E0U4 476 aaPredicted RBP12.38□□□□□ -0.43
NISCH-212ENST00000488380 MBOAT2Q6ZWT7 520 aa12.38□□□□□ -0.43
NISCH-212ENST00000488380 RTL10Q7L3V2 364 aa12.38□□□□□ -0.43
NISCH-212ENST00000488380 OR52E1Q8NGJ3 308 aa12.38□□□□□ -0.43
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 62 ms