RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000462494.5

ACTB-207, Transcript of actin beta, humanhuman

TSL 5

Gene ACTB, Length 2,245 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cell leading edge, Cytoplasm, Cytosol, Exosome, Lamellipodium, Mitochondria, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTB-207ENST00000462494 TSC22D2O75157 780 aa15.48■□□□□ 0.07
ACTB-207ENST00000462494 RPP14O95059 124 aaKnown RBP15.48■□□□□ 0.07
ACTB-207ENST00000462494 PRKCAP17252 672 aa15.48■□□□□ 0.07
ACTB-207ENST00000462494 STOMP27105 288 aa15.48■□□□□ 0.07
ACTB-207ENST00000462494 LAMTOR1Q6IAA8 161 aa15.48■□□□□ 0.07
ACTB-207ENST00000462494 MED25Q71SY5 747 aa15.48■□□□□ 0.07
ACTB-207ENST00000462494 JAZF1Q86VZ6 243 aa15.48■□□□□ 0.07
ACTB-207ENST00000462494 ZNF511Q8NB15 262 aa15.48■□□□□ 0.07
ACTB-207ENST00000462494 PHOSPHO1Q8TCT1 267 aa15.48■□□□□ 0.07
ACTB-207ENST00000462494 SNAPC3Q92966 411 aa15.48■□□□□ 0.07
ACTB-207ENST00000462494 MRPL48Q96GC5 212 aaKnown RBP15.48■□□□□ 0.07
ACTB-207ENST00000462494 STMN3Q9NZ72 180 aa15.48■□□□□ 0.07
ACTB-207ENST00000462494 IGKV1D-42A0A075B6H8 117 aa15.47■□□□□ 0.07
ACTB-207ENST00000462494 GMFGO60234 142 aa15.47■□□□□ 0.07
ACTB-207ENST00000462494 ALX3O95076 343 aa15.47■□□□□ 0.07
ACTB-207ENST00000462494 CDKN2AP42771 156 aaKnown RBP15.47■□□□□ 0.07
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ACTB-207ENST00000462494 IGLV3-21P80748 117 aaPredicted RBP15.47■□□□□ 0.07
ACTB-207ENST00000462494 FUT7Q11130 342 aa15.47■□□□□ 0.07
ACTB-207ENST00000462494 CD226Q15762 336 aa15.47■□□□□ 0.07
ACTB-207ENST00000462494 CCDC58Q4VC31 144 aa15.47■□□□□ 0.07
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ACTB-207ENST00000462494 Q6ZS52 159 aa15.47■□□□□ 0.07
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ACTB-207ENST00000462494 OR6C4Q8NGE1 309 aa15.47■□□□□ 0.07
ACTB-207ENST00000462494 OR51Q1Q8NH59 317 aa15.47■□□□□ 0.07
ACTB-207ENST00000462494 KLHDC7BQ96G42 594 aa15.47■□□□□ 0.07
ACTB-207ENST00000462494 DDOQ99489 341 aa15.47■□□□□ 0.07
ACTB-207ENST00000462494 ALG12Q9BV10 488 aa15.47■□□□□ 0.07
ACTB-207ENST00000462494 AUNIPQ9H7T9 357 aa15.47■□□□□ 0.07
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ACTB-207ENST00000462494 MRPL15Q9P015 296 aaKnown RBP15.47■□□□□ 0.07
ACTB-207ENST00000462494 CAMK2AQ9UQM7 478 aa15.47■□□□□ 0.07
ACTB-207ENST00000462494 TMEM184BQ9Y519 407 aaPredicted RBP15.47■□□□□ 0.07
ACTB-207ENST00000462494 ARPC3O15145 178 aa15.47■□□□□ 0.07
ACTB-207ENST00000462494 NSA2O95478 260 aaKnown RBP15.47■□□□□ 0.07
ACTB-207ENST00000462494 ADRB1P08588 477 aa15.47■□□□□ 0.07
ACTB-207ENST00000462494 ANKRD34CP0C6C1 535 aa15.47■□□□□ 0.07
ACTB-207ENST00000462494 BLKP51451 505 aa15.47■□□□□ 0.07
ACTB-207ENST00000462494 NANOS3P60323 173 aaKnown RBP15.47■□□□□ 0.07
ACTB-207ENST00000462494 KLHL26Q53HC5 615 aa15.47■□□□□ 0.07
ACTB-207ENST00000462494 UBE2NLQ5JXB2 153 aa15.47■□□□□ 0.07
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ACTB-207ENST00000462494 CMTM4Q8IZR5 234 aa15.47■□□□□ 0.07
ACTB-207ENST00000462494 OR11H7Q8NGC8 314 aa15.47■□□□□ 0.07
ACTB-207ENST00000462494 SCMH1Q96GD3 660 aa15.47■□□□□ 0.07
ACTB-207ENST00000462494 TCTN2Q96GX1 697 aa15.47■□□□□ 0.07
ACTB-207ENST00000462494 HYLS1Q96M11 299 aa15.47■□□□□ 0.07
ACTB-207ENST00000462494 MOGAT1Q96PD6 335 aa15.47■□□□□ 0.07
ACTB-207ENST00000462494 NMNAT2Q9BZQ4 307 aa15.47■□□□□ 0.07
ACTB-207ENST00000462494 GHITMQ9H3K2 345 aa15.47■□□□□ 0.07
ACTB-207ENST00000462494 ZCCHC4Q9H5U6 513 aa15.47■□□□□ 0.07
ACTB-207ENST00000462494 NANSQ9NR45 359 aa15.47■□□□□ 0.07
ACTB-207ENST00000462494 RXFP3Q9NSD7 469 aa15.47■□□□□ 0.07
ACTB-207ENST00000462494 A0A087WV48 116 aa15.46■□□□□ 0.07
ACTB-207ENST00000462494 HSFX4A0A1B0GTS1 333 aaPredicted RBP15.46■□□□□ 0.07
ACTB-207ENST00000462494 HSFX3A0A1B0GWH4 333 aaPredicted RBP15.46■□□□□ 0.07
ACTB-207ENST00000462494 A8MUA0 341 aa15.46■□□□□ 0.07
ACTB-207ENST00000462494 PRR32B1ATL7 298 aa15.46■□□□□ 0.07
ACTB-207ENST00000462494 C17orf105B2RV13 164 aa15.46■□□□□ 0.07
ACTB-207ENST00000462494 PIN1P1O15428 100 aa15.46■□□□□ 0.07
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ACTB-207ENST00000462494 GLCEO94923 617 aa15.46■□□□□ 0.07
ACTB-207ENST00000462494 F13BP05160 661 aa15.46■□□□□ 0.07
ACTB-207ENST00000462494 SYPP08247 313 aa15.46■□□□□ 0.07
ACTB-207ENST00000462494 MAOBP27338 520 aa15.46■□□□□ 0.07
ACTB-207ENST00000462494 CCR5P51681 352 aa15.46■□□□□ 0.07
ACTB-207ENST00000462494 GPLD1P80108 840 aa15.46■□□□□ 0.07
ACTB-207ENST00000462494 CBLN3Q6UW01 205 aa15.46■□□□□ 0.07
ACTB-207ENST00000462494 FAM160A2Q8N612 972 aaPredicted RBP15.46■□□□□ 0.07
ACTB-207ENST00000462494 HAVCR2Q8TDQ0 301 aa15.46■□□□□ 0.07
ACTB-207ENST00000462494 RLN3Q8WXF3 142 aa15.46■□□□□ 0.07
ACTB-207ENST00000462494 GCDHQ92947 438 aaPredicted RBP15.46■□□□□ 0.07
ACTB-207ENST00000462494 OR51J1Q9H342 316 aa15.46■□□□□ 0.07
ACTB-207ENST00000462494 BEX1Q9HBH7 125 aa15.46■□□□□ 0.07
ACTB-207ENST00000462494 PNO1Q9NRX1 252 aaKnown RBP15.46■□□□□ 0.07
ACTB-207ENST00000462494 ZNF281Q9Y2X9 895 aa15.46■□□□□ 0.07
ACTB-207ENST00000462494 TRABD2BA6NFA1 517 aa15.45■□□□□ 0.06
ACTB-207ENST00000462494 CLDN12P56749 244 aa15.45■□□□□ 0.06
ACTB-207ENST00000462494 CTXN1P60606 82 aa15.45■□□□□ 0.06
ACTB-207ENST00000462494 RPS4XP62701 263 aaKnown RBP15.45■□□□□ 0.06
ACTB-207ENST00000462494 SNTB2Q13425 540 aaKnown RBP15.45■□□□□ 0.06
ACTB-207ENST00000462494 CCINQ13939 588 aa15.45■□□□□ 0.06
ACTB-207ENST00000462494 CPEB4Q17RY0 729 aaKnown RBP eCLIP15.45■□□□□ 0.061e-17■■□□□ 12.5
ACTB-207ENST00000462494 C1QTNF12Q5T7M4 302 aa15.45■□□□□ 0.06
ACTB-207ENST00000462494 WBP2NLQ6ICG8 309 aa15.45■□□□□ 0.06
ACTB-207ENST00000462494 NANOGNBQ7Z5D8 188 aa15.45■□□□□ 0.06
ACTB-207ENST00000462494 SERPINA12Q8IW75 414 aa15.45■□□□□ 0.06
ACTB-207ENST00000462494 TIGD4Q8IY51 512 aa15.45■□□□□ 0.06
ACTB-207ENST00000462494 DEFB119Q8N690 84 aa15.45■□□□□ 0.06
ACTB-207ENST00000462494 ZNF321PQ8N8H1 164 aa15.45■□□□□ 0.06
ACTB-207ENST00000462494 BEST4Q8NFU0 473 aa15.45■□□□□ 0.06
ACTB-207ENST00000462494 DNAJA3Q96EY1 480 aa15.45■□□□□ 0.06
ACTB-207ENST00000462494 SRA1Q9HD15 236 aaKnown RBP15.45■□□□□ 0.06
ACTB-207ENST00000462494 ING4Q9UNL4 249 aa15.45■□□□□ 0.06
ACTB-207ENST00000462494 PCDHGA9Q9Y5G4 932 aaKnown RBP15.45■□□□□ 0.06
ACTB-207ENST00000462494 MPDZO75970 2070 aa15.45■□□□□ 0.06
ACTB-207ENST00000462494 C7orf66A4D0T2 115 aa15.45■□□□□ 0.06
ACTB-207ENST00000462494 ERVH48-1M5A8F1 160 aa15.45■□□□□ 0.06
ACTB-207ENST00000462494 ZNF749O43361 778 aa15.45■□□□□ 0.06
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