RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000409251.7

PTPRN-202, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type N, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRN, Length 3,622 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRN-202ENST00000409251 PXT1Q8NFP0 134 aa11.94□□□□□ -0.5
PTPRN-202ENST00000409251 OSTF1Q92882 214 aa11.94□□□□□ -0.5
PTPRN-202ENST00000409251 FOXN4Q96NZ1 517 aa11.94□□□□□ -0.5
PTPRN-202ENST00000409251 MAN2C1Q9NTJ4 1040 aa11.94□□□□□ -0.5
PTPRN-202ENST00000409251 ENTPD4Q9Y227 616 aa11.94□□□□□ -0.5
PTPRN-202ENST00000409251 ASB4Q9Y574 426 aa11.94□□□□□ -0.5
PTPRN-202ENST00000409251 F5H5P2 479 aa11.94□□□□□ -0.5
PTPRN-202ENST00000409251 TMIGD3P0DMS9 266 aaPredicted RBP11.94□□□□□ -0.5
PTPRN-202ENST00000409251 TYRP1P17643 537 aa11.94□□□□□ -0.5
PTPRN-202ENST00000409251 TEAD1P28347 426 aa11.94□□□□□ -0.5
PTPRN-202ENST00000409251 IGFALSP35858 605 aa11.94□□□□□ -0.5
PTPRN-202ENST00000409251 MTNR1BP49286 362 aa11.94□□□□□ -0.5
PTPRN-202ENST00000409251 ADPRHP54922 357 aa11.94□□□□□ -0.5
PTPRN-202ENST00000409251 PRR5P85299 388 aa11.94□□□□□ -0.5
PTPRN-202ENST00000409251 GUCA2AQ02747 115 aa11.94□□□□□ -0.5
PTPRN-202ENST00000409251 SQSTM1Q13501 440 aa11.94□□□□□ -0.5
PTPRN-202ENST00000409251 RAB30Q15771 203 aa11.94□□□□□ -0.5
PTPRN-202ENST00000409251 RGS7BPQ6MZT1 257 aaPredicted RBP11.94□□□□□ -0.5
PTPRN-202ENST00000409251 SSX6Q7RTT6 188 aa11.94□□□□□ -0.5
PTPRN-202ENST00000409251 ZSCAN1Q8NBB4 408 aa11.94□□□□□ -0.5
PTPRN-202ENST00000409251 PRRC1Q96M27 445 aa11.94□□□□□ -0.5
PTPRN-202ENST00000409251 HHIPQ96QV1 700 aa11.94□□□□□ -0.5
PTPRN-202ENST00000409251 NOX4Q9NPH5 578 aa11.94□□□□□ -0.5
PTPRN-202ENST00000409251 CBLCQ9ULV8 474 aa11.94□□□□□ -0.5
PTPRN-202ENST00000409251 NOP16Q9Y3C1 178 aaKnown RBP11.94□□□□□ -0.5
PTPRN-202ENST00000409251 A0A1W2PRQ8 180 aa11.93□□□□□ -0.5
PTPRN-202ENST00000409251 CASC3O15234 703 aaKnown RBP11.93□□□□□ -0.5
PTPRN-202ENST00000409251 PVRP15151 417 aa11.93□□□□□ -0.5
PTPRN-202ENST00000409251 VAMP1P23763 118 aa11.93□□□□□ -0.5
PTPRN-202ENST00000409251 KIR2DL1P43626 348 aaPredicted RBP11.93□□□□□ -0.5
PTPRN-202ENST00000409251 OMPP47874 163 aa11.93□□□□□ -0.5
PTPRN-202ENST00000409251 B2MP61769 119 aa11.93□□□□□ -0.5
PTPRN-202ENST00000409251 NDUFA9Q16795 377 aa11.93□□□□□ -0.5
PTPRN-202ENST00000409251 LINC01555Q8NAE3 123 aa11.93□□□□□ -0.5
PTPRN-202ENST00000409251 OR5P2Q8WZ92 322 aa11.93□□□□□ -0.5
PTPRN-202ENST00000409251 TSPAN10Q9H1Z9 355 aaPredicted RBP11.93□□□□□ -0.5
PTPRN-202ENST00000409251 OR52A5Q9H2C5 316 aa11.93□□□□□ -0.5
PTPRN-202ENST00000409251 BRF2Q9HAW0 419 aa11.93□□□□□ -0.5
PTPRN-202ENST00000409251 COMMD9Q9P000 198 aa11.93□□□□□ -0.5
PTPRN-202ENST00000409251 ZNF346Q9UL40 294 aaKnown RBP11.93□□□□□ -0.5
PTPRN-202ENST00000409251 CACNA1EQ15878 2313 aa11.93□□□□□ -0.5
PTPRN-202ENST00000409251 A0A087WV48 116 aa11.93□□□□□ -0.5
PTPRN-202ENST00000409251 GXYLT2A0PJZ3 443 aa11.93□□□□□ -0.5
PTPRN-202ENST00000409251 RIIAD1A6NNX1 92 aa11.93□□□□□ -0.5
PTPRN-202ENST00000409251 SNRPEP62304 92 aaKnown RBP11.93□□□□□ -0.5
PTPRN-202ENST00000409251 NXPE4Q6UWF7 544 aa11.93□□□□□ -0.5
PTPRN-202ENST00000409251 BEST3Q8N1M1 668 aa11.93□□□□□ -0.5
PTPRN-202ENST00000409251 CD180Q99467 661 aa11.93□□□□□ -0.5
PTPRN-202ENST00000409251 PARP12Q9H0J9 701 aaKnown RBP11.93□□□□□ -0.5
PTPRN-202ENST00000409251 SLITRK2Q9H156 845 aa11.93□□□□□ -0.5
PTPRN-202ENST00000409251 GLIPR2Q9H4G4 154 aa11.93□□□□□ -0.5
PTPRN-202ENST00000409251 ZCCHC4Q9H5U6 513 aa11.93□□□□□ -0.5
PTPRN-202ENST00000409251 DZANK1Q9NVP4 752 aa11.93□□□□□ -0.5
PTPRN-202ENST00000409251 KCND3Q9UK17 655 aa11.93□□□□□ -0.5
PTPRN-202ENST00000409251 FBXO4Q9UKT5 387 aa11.93□□□□□ -0.5
PTPRN-202ENST00000409251 A0A1B0GW55 424 aa11.93□□□□□ -0.5
PTPRN-202ENST00000409251 KANTRA0A1W2PQU2 76 aa11.93□□□□□ -0.5
PTPRN-202ENST00000409251 EEF1E1-BLOC1S5C9J1V9 151 aa11.93□□□□□ -0.5
PTPRN-202ENST00000409251 AIPO00170 330 aa11.93□□□□□ -0.5
PTPRN-202ENST00000409251 SURF4O15260 269 aa11.93□□□□□ -0.5
PTPRN-202ENST00000409251 PRAMEF2O60811 474 aa11.93□□□□□ -0.5
PTPRN-202ENST00000409251 DUX4L2P0CJ85 424 aa11.93□□□□□ -0.5
PTPRN-202ENST00000409251 DUX4L3P0CJ86 424 aa11.93□□□□□ -0.5
PTPRN-202ENST00000409251 DUX4L4P0CJ87 422 aa11.93□□□□□ -0.5
PTPRN-202ENST00000409251 DUX4L5P0CJ88 424 aa11.93□□□□□ -0.5
PTPRN-202ENST00000409251 DUX4L6P0CJ89 424 aa11.93□□□□□ -0.5
PTPRN-202ENST00000409251 DUX4L7P0CJ90 424 aa11.93□□□□□ -0.5
PTPRN-202ENST00000409251 SLC9A5Q14940 896 aa11.93□□□□□ -0.5
PTPRN-202ENST00000409251 MLF2Q15773 248 aaPredicted RBP11.93□□□□□ -0.5
PTPRN-202ENST00000409251 B3GNTL1Q67FW5 361 aaPredicted RBP11.93□□□□□ -0.5
PTPRN-202ENST00000409251 GLT8D1Q68CQ7 371 aa11.93□□□□□ -0.5
PTPRN-202ENST00000409251 Q7L0L9 218 aa11.93□□□□□ -0.5
PTPRN-202ENST00000409251 SLC9B2Q86UD5 537 aa11.93□□□□□ -0.5
PTPRN-202ENST00000409251 OR52E2Q8NGJ4 325 aa11.93□□□□□ -0.5
PTPRN-202ENST00000409251 OR9A2Q8NGT5 310 aa11.93□□□□□ -0.5
PTPRN-202ENST00000409251 SLC41A3Q96GZ6 507 aa11.93□□□□□ -0.5
PTPRN-202ENST00000409251 LMF1Q96S06 567 aa11.93□□□□□ -0.5
PTPRN-202ENST00000409251 SPATA5L1Q9BVQ7 753 aa11.93□□□□□ -0.5
PTPRN-202ENST00000409251 DPEP2Q9H4A9 486 aa11.93□□□□□ -0.5
PTPRN-202ENST00000409251 KLHL31Q9H511 634 aa11.93□□□□□ -0.5
PTPRN-202ENST00000409251 PRMT8Q9NR22 394 aaPredicted RBP11.93□□□□□ -0.5
PTPRN-202ENST00000409251 STARD5Q9NSY2 213 aa11.93□□□□□ -0.5
PTPRN-202ENST00000409251 KLHL9Q9P2J3 617 aa11.93□□□□□ -0.5
PTPRN-202ENST00000409251 DUX4Q9UBX2 424 aa11.93□□□□□ -0.5
PTPRN-202ENST00000409251 TBC1D29Q9UFV1 150 aa11.93□□□□□ -0.5
PTPRN-202ENST00000409251 CACNB4O00305 520 aaPredicted RBP11.92□□□□□ -0.5
PTPRN-202ENST00000409251 BET1O15155 118 aa11.92□□□□□ -0.5
PTPRN-202ENST00000409251 DPM1O60762 260 aa11.92□□□□□ -0.5
PTPRN-202ENST00000409251 CELA2BP08218 269 aaPredicted RBP11.92□□□□□ -0.5
PTPRN-202ENST00000409251 ART1P52961 327 aa11.92□□□□□ -0.5
PTPRN-202ENST00000409251 TSPAN31Q12999 210 aa11.92□□□□□ -0.5
PTPRN-202ENST00000409251 SP140Q13342 867 aa11.92□□□□□ -0.5
PTPRN-202ENST00000409251 NRSN1Q8IZ57 195 aa11.92□□□□□ -0.5
PTPRN-202ENST00000409251 CDK20Q8IZL9 346 aa11.92□□□□□ -0.5
PTPRN-202ENST00000409251 SPAG16Q8N0X2 631 aa11.92□□□□□ -0.5
PTPRN-202ENST00000409251 C12orf45Q8N5I9 185 aaPredicted RBP11.92□□□□□ -0.5
PTPRN-202ENST00000409251 STK35Q8TDR2 534 aa11.92□□□□□ -0.5
PTPRN-202ENST00000409251 NEURL3Q96EH8 262 aa11.92□□□□□ -0.5
PTPRN-202ENST00000409251 MRGPRX1Q96LB2 322 aa11.92□□□□□ -0.5
PTPRN-202ENST00000409251 FGF20Q9NP95 211 aaPredicted RBP11.92□□□□□ -0.5
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 45.1 ms