RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000384299.1

RNU6-472P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 472, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-472P, Length 107 nt, Biotype snRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-472P-201ENST00000384299 ATXN3P54252 364 aaPredicted RBP0.06□□□□□ -2.4
RNU6-472P-201ENST00000384299 SSTP61278 116 aa0.06□□□□□ -2.4
RNU6-472P-201ENST00000384299 ACVR1Q04771 509 aa0.06□□□□□ -2.4
RNU6-472P-201ENST00000384299 ZSWIM7Q19AV6 140 aa0.06□□□□□ -2.4
RNU6-472P-201ENST00000384299 HFEQ30201 348 aa0.06□□□□□ -2.4
RNU6-472P-201ENST00000384299 SMUG1Q53HV7 270 aa0.06□□□□□ -2.4
RNU6-472P-201ENST00000384299 AP1ARQ63HQ0 302 aa0.06□□□□□ -2.4
RNU6-472P-201ENST00000384299 FAHD2BQ6P2I3 314 aaPredicted RBP0.06□□□□□ -2.4
RNU6-472P-201ENST00000384299 CBLN3Q6UW01 205 aa0.06□□□□□ -2.4
RNU6-472P-201ENST00000384299 C16orf62Q7Z3J2 963 aa0.06□□□□□ -2.4
RNU6-472P-201ENST00000384299 LRRC43Q8N309 656 aa0.06□□□□□ -2.4
RNU6-472P-201ENST00000384299 TMEM105Q8N8V8 129 aa0.06□□□□□ -2.4
RNU6-472P-201ENST00000384299 RPL3LQ92901 407 aaKnown RBP0.06□□□□□ -2.4
RNU6-472P-201ENST00000384299 FGF11Q92914 225 aa0.06□□□□□ -2.4
RNU6-472P-201ENST00000384299 SLC25A36Q96CQ1 311 aa0.06□□□□□ -2.4
RNU6-472P-201ENST00000384299 FAHD2AQ96GK7 314 aa0.06□□□□□ -2.4
RNU6-472P-201ENST00000384299 PKMYT1Q99640 499 aa0.06□□□□□ -2.4
RNU6-472P-201ENST00000384299 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP0.06□□□□□ -2.4
RNU6-472P-201ENST00000384299 ATP10DQ9P241 1426 aa0.05□□□□□ -2.4
RNU6-472P-201ENST00000384299 A0A0U1RQG5 324 aaPredicted RBP0.05□□□□□ -2.4
RNU6-472P-201ENST00000384299 C12orf71A8MTZ7 269 aa0.05□□□□□ -2.4
RNU6-472P-201ENST00000384299 GABARAPO95166 117 aa0.05□□□□□ -2.4
RNU6-472P-201ENST00000384299 ALDOBP05062 364 aa0.05□□□□□ -2.4
RNU6-472P-201ENST00000384299 GNAO1P09471 354 aa0.05□□□□□ -2.4
RNU6-472P-201ENST00000384299 UROSP10746 265 aa0.05□□□□□ -2.4
RNU6-472P-201ENST00000384299 KRTAP10-4P60372 401 aaPredicted RBP0.05□□□□□ -2.4
RNU6-472P-201ENST00000384299 PPP1R8Q12972 351 aaKnown RBP0.05□□□□□ -2.4
RNU6-472P-201ENST00000384299 RIPK1Q13546 671 aa0.05□□□□□ -2.4
RNU6-472P-201ENST00000384299 CHI3L2Q15782 390 aa0.05□□□□□ -2.4
RNU6-472P-201ENST00000384299 FUT11Q495W5 492 aa0.05□□□□□ -2.4
RNU6-472P-201ENST00000384299 FAM47EQ6ZV65 393 aa0.05□□□□□ -2.4
RNU6-472P-201ENST00000384299 VPS36Q86VN1 386 aa0.05□□□□□ -2.4
RNU6-472P-201ENST00000384299 IQCA1Q86XH1 822 aa0.05□□□□□ -2.4
RNU6-472P-201ENST00000384299 SYCP3Q8IZU3 236 aa0.05□□□□□ -2.4
RNU6-472P-201ENST00000384299 LSMEM1Q8N8F7 131 aa0.05□□□□□ -2.4
RNU6-472P-201ENST00000384299 KLF14Q8TD94 323 aaPredicted RBP0.05□□□□□ -2.4
RNU6-472P-201ENST00000384299 AURKBQ96GD4 344 aaPredicted RBP0.05□□□□□ -2.4
RNU6-472P-201ENST00000384299 ZNF607Q96SK3 696 aa0.05□□□□□ -2.4
RNU6-472P-201ENST00000384299 AP1M1Q9BXS5 423 aa0.05□□□□□ -2.4
RNU6-472P-201ENST00000384299 DUSP16Q9BY84 665 aa0.05□□□□□ -2.4
RNU6-472P-201ENST00000384299 SUDS3Q9H7L9 328 aaPredicted RBP0.05□□□□□ -2.4
RNU6-472P-201ENST00000384299 MRPL39Q9NYK5 338 aaKnown RBP0.05□□□□□ -2.4
RNU6-472P-201ENST00000384299 FBXW2Q9UKT8 454 aa0.05□□□□□ -2.4
RNU6-472P-201ENST00000384299 STX8Q9UNK0 236 aa0.05□□□□□ -2.4
RNU6-472P-201ENST00000384299 F11RQ9Y624 299 aaKnown RBP0.05□□□□□ -2.4
RNU6-472P-201ENST00000384299 VWDEQ8N2E2 1590 aa0.04□□□□□ -2.4
RNU6-472P-201ENST00000384299 SDHAF1A6NFY7 115 aa0.04□□□□□ -2.4
RNU6-472P-201ENST00000384299 TAPBPO15533 448 aa0.04□□□□□ -2.4
RNU6-472P-201ENST00000384299 ANXA4P09525 319 aaPredicted RBP0.04□□□□□ -2.4
RNU6-472P-201ENST00000384299 CSF3P09919 207 aa0.04□□□□□ -2.4
RNU6-472P-201ENST00000384299 BDKRB1P46663 353 aa0.04□□□□□ -2.4
RNU6-472P-201ENST00000384299 MYBPC1Q00872 1141 aa0.04□□□□□ -2.4
RNU6-472P-201ENST00000384299 RIPPLY1Q0D2K3 151 aa0.04□□□□□ -2.4
RNU6-472P-201ENST00000384299 FUT5Q11128 374 aa0.04□□□□□ -2.4
RNU6-472P-201ENST00000384299 RAB40BQ12829 278 aa0.04□□□□□ -2.4
RNU6-472P-201ENST00000384299 MEP1BQ16820 701 aa0.04□□□□□ -2.4
RNU6-472P-201ENST00000384299 HECTD3Q5T447 861 aa0.04□□□□□ -2.4
RNU6-472P-201ENST00000384299 PRMT9Q6P2P2 845 aa0.04□□□□□ -2.4
RNU6-472P-201ENST00000384299 CES3Q6UWW8 571 aa0.04□□□□□ -2.4
RNU6-472P-201ENST00000384299 TMEM184AQ6ZMB5 413 aa0.04□□□□□ -2.4
RNU6-472P-201ENST00000384299 H2AFVQ71UI9 128 aa0.04□□□□□ -2.4
RNU6-472P-201ENST00000384299 GET4Q7L5D6 327 aaPredicted RBP0.04□□□□□ -2.4
RNU6-472P-201ENST00000384299 GLRX5Q86SX6 157 aa0.04□□□□□ -2.4
RNU6-472P-201ENST00000384299 SLC26A11Q86WA9 606 aa0.04□□□□□ -2.4
RNU6-472P-201ENST00000384299 UNC45BQ8IWX7 931 aa0.04□□□□□ -2.4
RNU6-472P-201ENST00000384299 OR51G2Q8NGK0 314 aa0.04□□□□□ -2.4
RNU6-472P-201ENST00000384299 RNASE8Q8TDE3 154 aaKnown RBP0.04□□□□□ -2.4
RNU6-472P-201ENST00000384299 BAG1Q99933 345 aaPredicted RBP0.04□□□□□ -2.4
RNU6-472P-201ENST00000384299 RPAP3Q9H6T3 665 aaPredicted RBP0.04□□□□□ -2.4
RNU6-472P-201ENST00000384299 COPS7BQ9H9Q2 264 aaPredicted RBP0.04□□□□□ -2.4
RNU6-472P-201ENST00000384299 POLD4Q9HCU8 107 aa0.04□□□□□ -2.4
RNU6-472P-201ENST00000384299 GLRX2Q9NS18 164 aa0.04□□□□□ -2.4
RNU6-472P-201ENST00000384299 HOMER3Q9NSC5 361 aa0.04□□□□□ -2.4
RNU6-472P-201ENST00000384299 SLC2A8Q9NY64 477 aa0.04□□□□□ -2.4
RNU6-472P-201ENST00000384299 NFKBIL1Q9UBC1 381 aaPredicted RBP0.04□□□□□ -2.4
RNU6-472P-201ENST00000384299 DNAJB9Q9UBS3 223 aa0.04□□□□□ -2.4
RNU6-472P-201ENST00000384299 TICRRQ7Z2Z1 1910 aa0.04□□□□□ -2.4
RNU6-472P-201ENST00000384299 MALRD1Q5VYJ5 2156 aa0.04□□□□□ -2.4
RNU6-472P-201ENST00000384299 SMIM30A4D0T7 59 aa0.03□□□□□ -2.4
RNU6-472P-201ENST00000384299 A8MUI8 341 aa0.03□□□□□ -2.4
RNU6-472P-201ENST00000384299 CCDC22O60826 627 aa0.03□□□□□ -2.4
RNU6-472P-201ENST00000384299 TBCAO75347 108 aaKnown RBP0.03□□□□□ -2.4
RNU6-472P-201ENST00000384299 KLK3P07288 261 aaPredicted RBP0.03□□□□□ -2.4
RNU6-472P-201ENST00000384299 HRES1P13985 223 aa0.03□□□□□ -2.4
RNU6-472P-201ENST00000384299 PAICSP22234 425 aaKnown RBP0.03□□□□□ -2.4
RNU6-472P-201ENST00000384299 PTPN6P29350 595 aa0.03□□□□□ -2.4
RNU6-472P-201ENST00000384299 FUSP35637 526 aaKnown RBP eCLIP0.03□□□□□ -2.4
RNU6-472P-201ENST00000384299 CXCL12P48061 93 aa0.03□□□□□ -2.4
RNU6-472P-201ENST00000384299 GPM6AP51674 278 aa0.03□□□□□ -2.4
RNU6-472P-201ENST00000384299 CNN1P51911 297 aaKnown RBP0.03□□□□□ -2.4
RNU6-472P-201ENST00000384299 FGF8P55075 233 aaPredicted RBP0.03□□□□□ -2.4
RNU6-472P-201ENST00000384299 SLC7A9P82251 487 aa0.03□□□□□ -2.4
RNU6-472P-201ENST00000384299 GINS1Q14691 196 aa0.03□□□□□ -2.4
RNU6-472P-201ENST00000384299 BCL7AQ4VC05 210 aa0.03□□□□□ -2.4
RNU6-472P-201ENST00000384299 GPRC6AQ5T6X5 926 aa0.03□□□□□ -2.4
RNU6-472P-201ENST00000384299 ACSM5Q6NUN0 579 aa0.03□□□□□ -2.4
RNU6-472P-201ENST00000384299 LPCAT2Q7L5N7 544 aa0.03□□□□□ -2.4
RNU6-472P-201ENST00000384299 NLRP9Q7RTR0 991 aa0.03□□□□□ -2.4
RNU6-472P-201ENST00000384299 THOC6Q86W42 341 aaKnown RBP0.03□□□□□ -2.4
RNU6-472P-201ENST00000384299 CALHM1Q8IU99 346 aa0.03□□□□□ -2.4
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 30.6 ms