RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000372616.1

CTPS1-201, Transcript of CTP synthase 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 2 BASIC

Gene CTPS1, Length 2,037 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTPS1-201ENST00000372616 H2AFB1P0C5Y9 115 aa6.62□□□□□ -1.35
CTPS1-201ENST00000372616 TFPIP10646 304 aa6.62□□□□□ -1.35
CTPS1-201ENST00000372616 PRG2P13727 222 aa6.62□□□□□ -1.35
CTPS1-201ENST00000372616 SRP9P49458 86 aaKnown RBP6.62□□□□□ -1.35
CTPS1-201ENST00000372616 TGM3Q08188 693 aa6.62□□□□□ -1.35
CTPS1-201ENST00000372616 LGALS3BPQ08380 585 aa6.62□□□□□ -1.35
CTPS1-201ENST00000372616 ELAVL3Q14576 367 aaKnown RBP6.62□□□□□ -1.35
CTPS1-201ENST00000372616 HLXQ14774 488 aaPredicted RBP6.62□□□□□ -1.35
CTPS1-201ENST00000372616 NKPD1Q17RQ9 610 aa6.62□□□□□ -1.35
CTPS1-201ENST00000372616 NDUFAF6Q330K2 333 aa6.62□□□□□ -1.35
CTPS1-201ENST00000372616 ACSM3Q53FZ2 586 aa6.62□□□□□ -1.35
CTPS1-201ENST00000372616 ZNF805Q5CZA5 627 aa6.62□□□□□ -1.35
CTPS1-201ENST00000372616 PABPC1L2AQ5JQF8 200 aa6.62□□□□□ -1.35
CTPS1-201ENST00000372616 OGFOD3Q6PK18 319 aa6.62□□□□□ -1.35
CTPS1-201ENST00000372616 ARL9Q6T311 187 aa6.62□□□□□ -1.35
CTPS1-201ENST00000372616 TMUB2Q71RG4 321 aa6.62□□□□□ -1.35
CTPS1-201ENST00000372616 SHFQ7M4L6 423 aa6.62□□□□□ -1.35
CTPS1-201ENST00000372616 TRMT11Q7Z4G4 463 aaKnown RBP6.62□□□□□ -1.35
CTPS1-201ENST00000372616 SYS1Q8N2H4 156 aa6.62□□□□□ -1.35
CTPS1-201ENST00000372616 RAB42Q8N4Z0 105 aa6.62□□□□□ -1.35
CTPS1-201ENST00000372616 OR11G2Q8NGC1 345 aa6.62□□□□□ -1.35
CTPS1-201ENST00000372616 RAD51AP1Q96B01 352 aa6.62□□□□□ -1.35
CTPS1-201ENST00000372616 TM4SF18Q96CE8 201 aa6.62□□□□□ -1.35
CTPS1-201ENST00000372616 SLC38A3Q99624 504 aa6.62□□□□□ -1.35
CTPS1-201ENST00000372616 PHF7Q9BWX1 381 aaPredicted RBP6.62□□□□□ -1.35
CTPS1-201ENST00000372616 SLC19A3Q9BZV2 496 aa6.62□□□□□ -1.35
CTPS1-201ENST00000372616 NOX3Q9HBY0 568 aa6.62□□□□□ -1.35
CTPS1-201ENST00000372616 ZNF304Q9HCX3 659 aa6.62□□□□□ -1.35
CTPS1-201ENST00000372616 HRASLSQ9HDD0 168 aa6.62□□□□□ -1.35
CTPS1-201ENST00000372616 WASH6PQ9NQA3 447 aa6.62□□□□□ -1.35
CTPS1-201ENST00000372616 SIRT3Q9NTG7 399 aaPredicted RBP6.62□□□□□ -1.35
CTPS1-201ENST00000372616 SEMA4GQ9NTN9 838 aa6.62□□□□□ -1.35
CTPS1-201ENST00000372616 ZCCHC3Q9NUD5 404 aaKnown RBP6.62□□□□□ -1.35
CTPS1-201ENST00000372616 TAS2R10Q9NYW0 307 aa6.62□□□□□ -1.35
CTPS1-201ENST00000372616 THAP10Q9P2Z0 257 aaPredicted RBP6.62□□□□□ -1.35
CTPS1-201ENST00000372616 UPB1Q9UBR1 384 aa6.62□□□□□ -1.35
CTPS1-201ENST00000372616 ZNF69Q9UC07 566 aa6.62□□□□□ -1.35
CTPS1-201ENST00000372616 PLCL2Q9UPR0 1127 aa6.62□□□□□ -1.35
CTPS1-201ENST00000372616 MUC22E2RYF6 1773 aaPredicted RBP6.62□□□□□ -1.35
CTPS1-201ENST00000372616 TICRRQ7Z2Z1 1910 aa6.61□□□□□ -1.35
CTPS1-201ENST00000372616 OR2M5A3KFT3 312 aa6.61□□□□□ -1.35
CTPS1-201ENST00000372616 OTOL1A6NHN0 477 aaPredicted RBP6.61□□□□□ -1.35
CTPS1-201ENST00000372616 OR2AG2A6NM03 316 aa6.61□□□□□ -1.35
CTPS1-201ENST00000372616 RIIAD1A6NNX1 92 aa6.61□□□□□ -1.35
CTPS1-201ENST00000372616 A8MX80 341 aa6.61□□□□□ -1.35
CTPS1-201ENST00000372616 PRRT4C9JH25 899 aa6.61□□□□□ -1.35
CTPS1-201ENST00000372616 PRSS44E7EML9 344 aa6.61□□□□□ -1.35
CTPS1-201ENST00000372616 C1QTNF3-AMACRE9PGA6 284 aa6.61□□□□□ -1.35
CTPS1-201ENST00000372616 G3V3Q6 166 aa6.61□□□□□ -1.35
CTPS1-201ENST00000372616 PLPP1O14494 284 aa6.61□□□□□ -1.35
CTPS1-201ENST00000372616 TOXO94900 526 aa6.61□□□□□ -1.35
CTPS1-201ENST00000372616 NDUFB6O95139 128 aa6.61□□□□□ -1.35
CTPS1-201ENST00000372616 MT-ND4P03905 459 aa6.61□□□□□ -1.35
CTPS1-201ENST00000372616 GBAP04062 536 aa6.61□□□□□ -1.35
CTPS1-201ENST00000372616 IFNA4P05014 189 aa6.61□□□□□ -1.35
CTPS1-201ENST00000372616 CALCBP10092 127 aa6.61□□□□□ -1.35
CTPS1-201ENST00000372616 GNSP15586 552 aa6.61□□□□□ -1.35
CTPS1-201ENST00000372616 MGMTP16455 207 aa6.61□□□□□ -1.35
CTPS1-201ENST00000372616 ZNF3P17036 446 aa6.61□□□□□ -1.35
CTPS1-201ENST00000372616 SELENOPP49908 381 aa6.61□□□□□ -1.35
CTPS1-201ENST00000372616 RGS8P57771 180 aaPredicted RBP6.61□□□□□ -1.35
CTPS1-201ENST00000372616 TAS2R38P59533 333 aa6.61□□□□□ -1.35
CTPS1-201ENST00000372616 DGCR2P98153 550 aa6.61□□□□□ -1.35
CTPS1-201ENST00000372616 SSBP1Q04837 148 aaKnown RBP6.61□□□□□ -1.35
CTPS1-201ENST00000372616 ZNF234Q14588 700 aa6.61□□□□□ -1.35
CTPS1-201ENST00000372616 RBMS2Q15434 407 aaKnown RBP6.61□□□□□ -1.35
CTPS1-201ENST00000372616 STK11Q15831 433 aa6.61□□□□□ -1.35
CTPS1-201ENST00000372616 SYPL1Q16563 259 aa6.61□□□□□ -1.35
CTPS1-201ENST00000372616 TMEM35AQ53FP2 167 aa6.61□□□□□ -1.35
CTPS1-201ENST00000372616 PRRT3Q5FWE3 981 aa6.61□□□□□ -1.35
CTPS1-201ENST00000372616 CLEC12AQ5QGZ9 265 aa6.61□□□□□ -1.35
CTPS1-201ENST00000372616 PDSS1Q5T2R2 415 aa6.61□□□□□ -1.35
CTPS1-201ENST00000372616 FAM46CQ5VWP2 391 aa6.61□□□□□ -1.35
CTPS1-201ENST00000372616 ZNF385CQ66K41 422 aaPredicted RBP6.61□□□□□ -1.35
CTPS1-201ENST00000372616 DMKNQ6E0U4 476 aaPredicted RBP6.61□□□□□ -1.35
CTPS1-201ENST00000372616 SLC25A25Q6KCM7 469 aa6.61□□□□□ -1.35
CTPS1-201ENST00000372616 LPCAT3Q6P1A2 487 aa6.61□□□□□ -1.35
CTPS1-201ENST00000372616 Q6ZS46 218 aa6.61□□□□□ -1.35
CTPS1-201ENST00000372616 RAB11FIP2Q7L804 512 aa6.61□□□□□ -1.35
CTPS1-201ENST00000372616 LINGO2Q7L985 606 aa6.61□□□□□ -1.35
CTPS1-201ENST00000372616 KRT77Q7Z794 578 aa6.61□□□□□ -1.35
CTPS1-201ENST00000372616 RANBP3LQ86VV4 465 aaPredicted RBP6.61□□□□□ -1.35
CTPS1-201ENST00000372616 C17orf64Q86WR6 236 aa6.61□□□□□ -1.35
CTPS1-201ENST00000372616 CPOQ8IVL8 374 aa6.61□□□□□ -1.35
CTPS1-201ENST00000372616 SPAG16Q8N0X2 631 aa6.61□□□□□ -1.35
CTPS1-201ENST00000372616 SVBPQ8N300 66 aa6.61□□□□□ -1.35
CTPS1-201ENST00000372616 SIRT6Q8N6T7 355 aa6.61□□□□□ -1.35
CTPS1-201ENST00000372616 PXT1Q8NFP0 134 aa6.61□□□□□ -1.35
CTPS1-201ENST00000372616 OR4Q3Q8NH05 313 aa6.61□□□□□ -1.35
CTPS1-201ENST00000372616 COQ8AQ8NI60 647 aa6.61□□□□□ -1.35
CTPS1-201ENST00000372616 CNOT9Q92600 299 aaKnown RBP6.61□□□□□ -1.35
CTPS1-201ENST00000372616 THRSPQ92748 146 aa6.61□□□□□ -1.35
CTPS1-201ENST00000372616 EDAQ92838 391 aa6.61□□□□□ -1.35
CTPS1-201ENST00000372616 SIPA1Q96FS4 1042 aa6.61□□□□□ -1.35
CTPS1-201ENST00000372616 C10orf90Q96M02 699 aa6.61□□□□□ -1.35
CTPS1-201ENST00000372616 BBS4Q96RK4 519 aa6.61□□□□□ -1.35
CTPS1-201ENST00000372616 CD180Q99467 661 aa6.61□□□□□ -1.35
CTPS1-201ENST00000372616 NPAS1Q99742 590 aa6.61□□□□□ -1.35
CTPS1-201ENST00000372616 GPA33Q99795 319 aa6.61□□□□□ -1.35
CTPS1-201ENST00000372616 PDCD10Q9BUL8 212 aa6.61□□□□□ -1.35
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