RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000369547.5

SYT6-201, Transcript of synaptotagmin 6, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene SYT6, Length 4,369 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Exosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYT6-201ENST00000369547 HHLA2Q9UM44 414 aa14.94□□□□□ -0.02
SYT6-201ENST00000369547 P04436 131 aa14.93□□□□□ -0.02
SYT6-201ENST00000369547 RAE1P78406 368 aaKnown RBP14.93□□□□□ -0.02
SYT6-201ENST00000369547 HBMQ6B0K9 141 aa14.93□□□□□ -0.02
SYT6-201ENST00000369547 RPL22L1Q6P5R6 122 aaKnown RBP14.93□□□□□ -0.02
SYT6-201ENST00000369547 MARCH3Q86UD3 253 aa14.93□□□□□ -0.02
SYT6-201ENST00000369547 OR5D18Q8NGL1 313 aa14.93□□□□□ -0.02
SYT6-201ENST00000369547 ZFPM2Q8WW38 1151 aa14.93□□□□□ -0.02
SYT6-201ENST00000369547 ADAMTS14Q8WXS8 1223 aa14.93□□□□□ -0.02
SYT6-201ENST00000369547 SLC6A5Q9Y345 797 aa14.93□□□□□ -0.02
SYT6-201ENST00000369547 CHST2Q9Y4C5 530 aa14.93□□□□□ -0.02
SYT6-201ENST00000369547 HRO43593 1189 aa14.93□□□□□ -0.02
SYT6-201ENST00000369547 HTR3BO95264 441 aa14.93□□□□□ -0.02
SYT6-201ENST00000369547 C1QCP02747 245 aa14.93□□□□□ -0.02
SYT6-201ENST00000369547 ERCC1P07992 297 aaPredicted RBP14.93□□□□□ -0.02
SYT6-201ENST00000369547 OR2T7P0C7T2 308 aa14.93□□□□□ -0.02
SYT6-201ENST00000369547 EVI2BP34910 448 aa14.93□□□□□ -0.02
SYT6-201ENST00000369547 DBPQ10586 325 aaPredicted RBP14.93□□□□□ -0.02
SYT6-201ENST00000369547 CAMK2DQ13557 499 aa14.93□□□□□ -0.02
SYT6-201ENST00000369547 AGERQ15109 404 aa14.93□□□□□ -0.02
SYT6-201ENST00000369547 TMEM176BQ3YBM2 270 aaPredicted RBP14.93□□□□□ -0.02
SYT6-201ENST00000369547 NDUFAF7Q7L592 441 aa14.93□□□□□ -0.02
SYT6-201ENST00000369547 GPR137CQ8N3F9 429 aa14.93□□□□□ -0.02
SYT6-201ENST00000369547 OR2T27Q8NH04 317 aa14.93□□□□□ -0.02
SYT6-201ENST00000369547 GABARAPL3Q9BY60 117 aa14.93□□□□□ -0.02
SYT6-201ENST00000369547 OR51B6Q9H340 312 aa14.93□□□□□ -0.02
SYT6-201ENST00000369547 KCNIP3Q9Y2W7 256 aa14.93□□□□□ -0.02
SYT6-201ENST00000369547 NUBP2Q9Y5Y2 271 aa14.93□□□□□ -0.02
SYT6-201ENST00000369547 PHYHO14832 338 aa14.93□□□□□ -0.02
SYT6-201ENST00000369547 FABP7O15540 132 aa14.93□□□□□ -0.02
SYT6-201ENST00000369547 CSNK2A1P68400 391 aaPredicted RBP14.93□□□□□ -0.02
SYT6-201ENST00000369547 RUNX2Q13950 521 aa14.93□□□□□ -0.02
SYT6-201ENST00000369547 VWA2Q5GFL6 755 aa14.93□□□□□ -0.02
SYT6-201ENST00000369547 C9orf135Q5VTT2 229 aa14.93□□□□□ -0.02
SYT6-201ENST00000369547 METTL11BQ5VVY1 283 aa14.93□□□□□ -0.02
SYT6-201ENST00000369547 USP51Q70EK9 711 aa14.93□□□□□ -0.02
SYT6-201ENST00000369547 KCTD20Q7Z5Y7 419 aa14.93□□□□□ -0.02
SYT6-201ENST00000369547 SPRED2Q7Z698 418 aa14.93□□□□□ -0.02
SYT6-201ENST00000369547 CSNK2A3Q8NEV1 391 aa14.93□□□□□ -0.02
SYT6-201ENST00000369547 OR4C15Q8NGM1 316 aa14.93□□□□□ -0.02
SYT6-201ENST00000369547 PLA2G12AQ9BZM1 189 aa14.93□□□□□ -0.02
SYT6-201ENST00000369547 ZNF576Q9H609 170 aa14.93□□□□□ -0.02
SYT6-201ENST00000369547 MEGF11A6BM72 1044 aa14.92□□□□□ -0.02
SYT6-201ENST00000369547 CTNSO60931 367 aa14.92□□□□□ -0.02
SYT6-201ENST00000369547 UTS2O95399 124 aa14.92□□□□□ -0.02
SYT6-201ENST00000369547 SBK2P0C263 348 aa14.92□□□□□ -0.02
SYT6-201ENST00000369547 EEF1A2Q05639 463 aaKnown RBP14.92□□□□□ -0.02
SYT6-201ENST00000369547 FCN2Q15485 313 aa14.92□□□□□ -0.02
SYT6-201ENST00000369547 AGBL4Q5VU57 503 aa14.92□□□□□ -0.02
SYT6-201ENST00000369547 SLC35F3Q8IY50 421 aa14.92□□□□□ -0.02
SYT6-201ENST00000369547 OR51D1Q8NGF3 324 aa14.92□□□□□ -0.02
SYT6-201ENST00000369547 GIMAP1Q8WWP7 306 aa14.92□□□□□ -0.02
SYT6-201ENST00000369547 CTRCQ99895 268 aa14.92□□□□□ -0.02
SYT6-201ENST00000369547 ZNF160Q9HCG1 818 aa14.92□□□□□ -0.02
SYT6-201ENST00000369547 MED17Q9NVC6 651 aa14.92□□□□□ -0.02
SYT6-201ENST00000369547 A0A0B4J203 849 aa14.92□□□□□ -0.02
SYT6-201ENST00000369547 OR1D5P58170 312 aa14.92□□□□□ -0.02
SYT6-201ENST00000369547 MEP1BQ16820 701 aa14.92□□□□□ -0.02
SYT6-201ENST00000369547 TCTN1Q2MV58 587 aa14.92□□□□□ -0.02
SYT6-201ENST00000369547 RDH10Q8IZV5 341 aa14.92□□□□□ -0.02
SYT6-201ENST00000369547 OR13C9Q8NGT0 318 aa14.92□□□□□ -0.02
SYT6-201ENST00000369547 BMFQ96LC9 184 aa14.92□□□□□ -0.02
SYT6-201ENST00000369547 OPALINQ96PE5 141 aa14.92□□□□□ -0.02
SYT6-201ENST00000369547 CLCC1Q96S66 551 aa14.92□□□□□ -0.02
SYT6-201ENST00000369547 IGLV3-16A0A075B6K0 115 aa14.92□□□□□ -0.02
SYT6-201ENST00000369547 CCINQ13939 588 aa14.92□□□□□ -0.02
SYT6-201ENST00000369547 TBC1D25Q3MII6 688 aa14.92□□□□□ -0.02
SYT6-201ENST00000369547 PDSS1Q5T2R2 415 aa14.92□□□□□ -0.02
SYT6-201ENST00000369547 FAM109BQ6ICB4 259 aaPredicted RBP14.92□□□□□ -0.02
SYT6-201ENST00000369547 BEND4Q6ZU67 534 aa14.92□□□□□ -0.02
SYT6-201ENST00000369547 SSX6Q7RTT6 188 aa14.92□□□□□ -0.02
SYT6-201ENST00000369547 ZNF547Q8IVP9 402 aa14.92□□□□□ -0.02
SYT6-201ENST00000369547 SIAH3Q8IW03 269 aa14.92□□□□□ -0.02
SYT6-201ENST00000369547 C17orf50Q8WW18 174 aa14.92□□□□□ -0.02
SYT6-201ENST00000369547 MFFQ9GZY8 342 aa14.92□□□□□ -0.02
SYT6-201ENST00000369547 SLC7A11Q9UPY5 501 aa14.92□□□□□ -0.02
SYT6-201ENST00000369547 PRAMEF4O60810 478 aa14.92□□□□□ -0.02
SYT6-201ENST00000369547 RFPL3O75679 317 aa14.92□□□□□ -0.02
SYT6-201ENST00000369547 RAD51DO75771 328 aa14.92□□□□□ -0.02
SYT6-201ENST00000369547 HNRNPFP52597 415 aaKnown RBP14.92□□□□□ -0.02
SYT6-201ENST00000369547 PRAMEF9Q5VWM5 478 aa14.92□□□□□ -0.02
SYT6-201ENST00000369547 ZNF620Q6ZNG0 422 aa14.92□□□□□ -0.02
SYT6-201ENST00000369547 SUSD2Q9UGT4 822 aa14.92□□□□□ -0.02
SYT6-201ENST00000369547 C19orf53Q9UNZ5 99 aaPredicted RBP14.92□□□□□ -0.02
SYT6-201ENST00000369547 ASB4Q9Y574 426 aa14.92□□□□□ -0.02
SYT6-201ENST00000369547 TRDV1A0A1B0GX56 115 aa14.91□□□□□ -0.02
SYT6-201ENST00000369547 SLC33A1O00400 549 aaPredicted RBP14.91□□□□□ -0.02
SYT6-201ENST00000369547 NUDT21O43809 227 aaKnown RBP14.91□□□□□ -0.02
SYT6-201ENST00000369547 SC5DO75845 299 aa14.91□□□□□ -0.02
SYT6-201ENST00000369547 YOD1Q5VVQ6 348 aaPredicted RBP14.91□□□□□ -0.02
SYT6-201ENST00000369547 RCBTB1Q8NDN9 531 aa14.91□□□□□ -0.02
SYT6-201ENST00000369547 DNAAF1Q8NEP3 725 aa14.91□□□□□ -0.02
SYT6-201ENST00000369547 OR51T1Q8NGJ9 327 aa14.91□□□□□ -0.02
SYT6-201ENST00000369547 DVL3Q92997 716 aaPredicted RBP14.91□□□□□ -0.02
SYT6-201ENST00000369547 CDCA4Q9BXL8 241 aa14.91□□□□□ -0.02
SYT6-201ENST00000369547 SEMA6CQ9H3T2 930 aa14.91□□□□□ -0.02
SYT6-201ENST00000369547 PLCXD1Q9NUJ7 323 aa14.91□□□□□ -0.02
SYT6-201ENST00000369547 TMPRSS11EQ9UL52 423 aa14.91□□□□□ -0.02
SYT6-201ENST00000369547 OR5K3A6NET4 321 aa14.91□□□□□ -0.02
SYT6-201ENST00000369547 BCAT2O15382 392 aaPredicted RBP14.91□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 26.4 ms