RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000318988.10

CTDNEP1-201, Transcript of CTD nuclear envelope phosphatase 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CTDNEP1, Length 1,549 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDNEP1-201ENST00000318988 ZHX1-C8orf76Q96EF9 292 aa24.65■■□□□ 1.54
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CTDNEP1-201ENST00000318988 PLA2G12AQ9BZM1 189 aa24.65■■□□□ 1.54
CTDNEP1-201ENST00000318988 TIGARQ9NQ88 270 aa24.65■■□□□ 1.54
CTDNEP1-201ENST00000318988 IL20RAQ9UHF4 553 aa24.65■■□□□ 1.54
CTDNEP1-201ENST00000318988 NPIPA1Q9UND3 350 aa24.65■■□□□ 1.54
CTDNEP1-201ENST00000318988 HIF3AQ9Y2N7 669 aa24.65■■□□□ 1.54
CTDNEP1-201ENST00000318988 A0A0J9YW62 118 aa24.64■■□□□ 1.53
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CTDNEP1-201ENST00000318988 BCL2A1Q16548 175 aa24.64■■□□□ 1.53
CTDNEP1-201ENST00000318988 GXYLT1Q4G148 440 aa24.64■■□□□ 1.53
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CTDNEP1-201ENST00000318988 H1FNTQ75WM6 255 aaPredicted RBP24.64■■□□□ 1.53
CTDNEP1-201ENST00000318988 OR2T33Q8NG76 320 aa24.64■■□□□ 1.53
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CTDNEP1-201ENST00000318988 APOL4Q9BPW4 351 aa24.64■■□□□ 1.53
CTDNEP1-201ENST00000318988 IFT27Q9BW83 186 aa24.64■■□□□ 1.53
CTDNEP1-201ENST00000318988 ZAR1LA6NP61 321 aa24.63■■□□□ 1.53
CTDNEP1-201ENST00000318988 EIF1BO60739 113 aaKnown RBP24.63■■□□□ 1.53
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CTDNEP1-201ENST00000318988 IL18R1Q13478 541 aa24.63■■□□□ 1.53
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CTDNEP1-201ENST00000318988 TMEM236Q5W0B7 351 aa24.63■■□□□ 1.53
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CTDNEP1-201ENST00000318988 OR8D4Q8NGM9 314 aa24.63■■□□□ 1.53
CTDNEP1-201ENST00000318988 NAA11Q9BSU3 229 aaPredicted RBP24.63■■□□□ 1.53
CTDNEP1-201ENST00000318988 PRRG3Q9BZD7 231 aa24.63■■□□□ 1.53
CTDNEP1-201ENST00000318988 CHST11Q9NPF2 352 aa24.63■■□□□ 1.53
CTDNEP1-201ENST00000318988 NDRG4Q9ULP0 352 aaKnown RBP24.63■■□□□ 1.53
CTDNEP1-201ENST00000318988 B3GALT5Q9Y2C3 310 aa24.63■■□□□ 1.53
CTDNEP1-201ENST00000318988 AKR7A3O95154 331 aa24.62■■□□□ 1.53
CTDNEP1-201ENST00000318988 AHCYP23526 432 aa24.62■■□□□ 1.53
CTDNEP1-201ENST00000318988 EIF1AXP47813 144 aaKnown RBP24.62■■□□□ 1.53
CTDNEP1-201ENST00000318988 CDC42P60953 191 aa24.62■■□□□ 1.53
CTDNEP1-201ENST00000318988 RPS3AP61247 264 aaKnown RBP24.62■■□□□ 1.53
CTDNEP1-201ENST00000318988 SRYQ05066 204 aa24.62■■□□□ 1.53
CTDNEP1-201ENST00000318988 RPL18Q07020 188 aaKnown RBP24.62■■□□□ 1.53
CTDNEP1-201ENST00000318988 VASNQ6EMK4 673 aa24.62■■□□□ 1.53
CTDNEP1-201ENST00000318988 CASP12Q6UXS9 341 aa24.62■■□□□ 1.53
CTDNEP1-201ENST00000318988 IQCF1Q8N6M8 205 aa24.62■■□□□ 1.53
CTDNEP1-201ENST00000318988 SETD9Q8NE22 299 aa24.62■■□□□ 1.53
CTDNEP1-201ENST00000318988 SLC25A18Q9H1K4 315 aa24.62■■□□□ 1.53
CTDNEP1-201ENST00000318988 SLC25A19Q9HC21 320 aa24.62■■□□□ 1.53
CTDNEP1-201ENST00000318988 IMPAD1Q9NX62 359 aa24.62■■□□□ 1.53
CTDNEP1-201ENST00000318988 PLPP3O14495 311 aa24.61■■□□□ 1.53
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CTDNEP1-201ENST00000318988 MED21Q13503 144 aa24.61■■□□□ 1.53
CTDNEP1-201ENST00000318988 FHL1Q13642 323 aa24.61■■□□□ 1.53
CTDNEP1-201ENST00000318988 SIAH3Q8IW03 269 aa24.61■■□□□ 1.53
CTDNEP1-201ENST00000318988 C8orf59Q8N0T1 100 aaPredicted RBP24.61■■□□□ 1.53
CTDNEP1-201ENST00000318988 EXD3Q8N9H8 876 aa24.61■■□□□ 1.53
CTDNEP1-201ENST00000318988 MOSPD2Q8NHP6 518 aa24.61■■□□□ 1.53
CTDNEP1-201ENST00000318988 CNBD2Q96M20 576 aa24.61■■□□□ 1.53
CTDNEP1-201ENST00000318988 PITX2Q99697 317 aa24.61■■□□□ 1.53
CTDNEP1-201ENST00000318988 ANKRD60Q9BZ19 345 aa24.61■■□□□ 1.53
CTDNEP1-201ENST00000318988 BAIAP2Q9UQB8 552 aa24.61■■□□□ 1.53
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CTDNEP1-201ENST00000318988 C11orf98E9PRG8 122 aa24.61■■□□□ 1.53
CTDNEP1-201ENST00000318988 H0YC42 278 aa24.61■■□□□ 1.53
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CTDNEP1-201ENST00000318988 ZNF708P17019 499 aa24.61■■□□□ 1.53
CTDNEP1-201ENST00000318988 SUCLG1P53597 346 aaKnown RBP24.61■■□□□ 1.53
CTDNEP1-201ENST00000318988 RAC3P60763 192 aa24.61■■□□□ 1.53
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CTDNEP1-201ENST00000318988 CHMP1BQ7LBR1 199 aa24.61■■□□□ 1.53
CTDNEP1-201ENST00000318988 DEPDC4Q8N2C3 294 aa24.61■■□□□ 1.53
CTDNEP1-201ENST00000318988 OR10D3Q8NH80 312 aa24.61■■□□□ 1.53
CTDNEP1-201ENST00000318988 FAM81AQ8TBF8 368 aa24.61■■□□□ 1.53
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CTDNEP1-201ENST00000318988 SEC14L4Q9UDX3 406 aa24.61■■□□□ 1.53
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CTDNEP1-201ENST00000318988 HMGN1P05114 100 aa24.6■■□□□ 1.53
CTDNEP1-201ENST00000318988 GNAO1P09471 354 aa24.6■■□□□ 1.53
CTDNEP1-201ENST00000318988 NOS3P29474 1203 aa24.6■■□□□ 1.53
CTDNEP1-201ENST00000318988 CLDN18P56856 261 aa24.6■■□□□ 1.53
CTDNEP1-201ENST00000318988 PUDPQ08623 228 aa24.6■■□□□ 1.53
CTDNEP1-201ENST00000318988 PGGHGQ32M88 737 aa24.6■■□□□ 1.53
CTDNEP1-201ENST00000318988 ADPRHL1Q8NDY3 354 aa24.6■■□□□ 1.53
CTDNEP1-201ENST00000318988 TIMP4Q99727 224 aa24.6■■□□□ 1.53
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