RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000261609.11

HERC2-201, Transcript of HECT and RLD domain containing E3 ubiquitin protein ligase 2, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene HERC2, Length 15,337 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC2-201ENST00000261609 PGCP20142 388 aa6.69□□□□□ -1.34
HERC2-201ENST00000261609 PLGLB1Q02325 96 aa6.69□□□□□ -1.34
HERC2-201ENST00000261609 ZNF836Q6ZNA1 936 aa6.69□□□□□ -1.34
HERC2-201ENST00000261609 NICN1Q9BSH3 213 aa6.69□□□□□ -1.34
HERC2-201ENST00000261609 ATXN7L1Q9ULK2 861 aaPredicted RBP6.69□□□□□ -1.34
HERC2-201ENST00000261609 FLVCR2Q9UPI3 526 aa6.69□□□□□ -1.34
HERC2-201ENST00000261609 MROH6A6NGR9 719 aa6.69□□□□□ -1.34
HERC2-201ENST00000261609 PPP5D1E7EU14 171 aa6.69□□□□□ -1.34
HERC2-201ENST00000261609 M0R143 59 aa6.69□□□□□ -1.34
HERC2-201ENST00000261609 SERPINA5P05154 406 aa6.69□□□□□ -1.34
HERC2-201ENST00000261609 HMGCLP35914 325 aa6.69□□□□□ -1.34
HERC2-201ENST00000261609 TAS2R30P59541 319 aa6.69□□□□□ -1.34
HERC2-201ENST00000261609 ERVK-16P61578 105 aa6.69□□□□□ -1.34
HERC2-201ENST00000261609 MFGE8Q08431 387 aaPredicted RBP6.69□□□□□ -1.34
HERC2-201ENST00000261609 ACSM1Q08AH1 577 aa6.69□□□□□ -1.34
HERC2-201ENST00000261609 CDONQ4KMG0 1287 aa6.69□□□□□ -1.34
HERC2-201ENST00000261609 PSAPL1Q6NUJ1 521 aa6.69□□□□□ -1.34
HERC2-201ENST00000261609 CA5BP1Q8WTZ4 195 aa6.69□□□□□ -1.34
HERC2-201ENST00000261609 ZCCHC4Q9H5U6 513 aa6.69□□□□□ -1.34
HERC2-201ENST00000261609 NOX4Q9NPH5 578 aa6.69□□□□□ -1.34
HERC2-201ENST00000261609 OSGIN2Q9Y236 505 aa6.69□□□□□ -1.34
HERC2-201ENST00000261609 LSMEM2Q8N112 164 aa6.69□□□□□ -1.34
HERC2-201ENST00000261609 TMEM156Q8N614 296 aa6.69□□□□□ -1.34
HERC2-201ENST00000261609 ANKLE1Q8NAG6 615 aa6.69□□□□□ -1.34
HERC2-201ENST00000261609 OR5D14Q8NGL3 314 aa6.69□□□□□ -1.34
HERC2-201ENST00000261609 ZNF586Q9NXT0 402 aa6.69□□□□□ -1.34
HERC2-201ENST00000261609 CLN5O75503 358 aa6.69□□□□□ -1.34
HERC2-201ENST00000261609 GPX5O75715 221 aa6.69□□□□□ -1.34
HERC2-201ENST00000261609 ZNF25P17030 456 aaPredicted RBP6.69□□□□□ -1.34
HERC2-201ENST00000261609 CD80P33681 288 aa6.69□□□□□ -1.34
HERC2-201ENST00000261609 KCTD11Q693B1 232 aa6.69□□□□□ -1.34
HERC2-201ENST00000261609 RDH10Q8IZV5 341 aa6.69□□□□□ -1.34
HERC2-201ENST00000261609 RCBTB1Q8NDN9 531 aa6.69□□□□□ -1.34
HERC2-201ENST00000261609 OR6T1Q8NGN1 323 aa6.69□□□□□ -1.34
HERC2-201ENST00000261609 TRAF4Q9BUZ4 470 aaPredicted RBP6.69□□□□□ -1.34
HERC2-201ENST00000261609 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa6.69□□□□□ -1.34
HERC2-201ENST00000261609 KIF26BQ2KJY2 2108 aa6.69□□□□□ -1.34
HERC2-201ENST00000261609 FER1L4A9Z1Z3 1794 aa6.69□□□□□ -1.34
HERC2-201ENST00000261609 CPEP16870 476 aa6.69□□□□□ -1.34
HERC2-201ENST00000261609 KIR2DL3P43628 341 aa6.69□□□□□ -1.34
HERC2-201ENST00000261609 PLCXD2Q0VAA5 305 aa6.69□□□□□ -1.34
HERC2-201ENST00000261609 HAGHQ16775 308 aa6.69□□□□□ -1.34
HERC2-201ENST00000261609 KIAA0319Q5VV43 1072 aa6.69□□□□□ -1.34
HERC2-201ENST00000261609 KLHDC8AQ8IYD2 350 aa6.69□□□□□ -1.34
HERC2-201ENST00000261609 DAZLQ92904 295 aaKnown RBP6.69□□□□□ -1.34
HERC2-201ENST00000261609 AMBRA1Q9C0C7 1298 aa6.69□□□□□ -1.34
HERC2-201ENST00000261609 SLCO5A1Q9H2Y9 848 aa6.69□□□□□ -1.34
HERC2-201ENST00000261609 KLHL42Q9P2K6 505 aa6.69□□□□□ -1.34
HERC2-201ENST00000261609 LOC100289279A0A1B0GTE1 492 aa6.69□□□□□ -1.34
HERC2-201ENST00000261609 SOCS7O14512 581 aa6.69□□□□□ -1.34
HERC2-201ENST00000261609 VEGFDO43915 354 aa6.69□□□□□ -1.34
HERC2-201ENST00000261609 METTL15P1P0C7V9 234 aa6.69□□□□□ -1.34
HERC2-201ENST00000261609 EVX1P49640 407 aa6.69□□□□□ -1.34
HERC2-201ENST00000261609 RPS21P63220 83 aaKnown RBP6.69□□□□□ -1.34
HERC2-201ENST00000261609 MPEG1Q2M385 716 aa6.69□□□□□ -1.34
HERC2-201ENST00000261609 CNKSR3Q6P9H4 555 aa6.69□□□□□ -1.34
HERC2-201ENST00000261609 SLC16A13Q7RTY0 426 aa6.69□□□□□ -1.34
HERC2-201ENST00000261609 DDIT4LQ96D03 193 aa6.69□□□□□ -1.34
HERC2-201ENST00000261609 LRIG1Q96JA1 1093 aa6.69□□□□□ -1.34
HERC2-201ENST00000261609 OR10A5Q9H207 317 aa6.69□□□□□ -1.34
HERC2-201ENST00000261609 OR10A2Q9H208 303 aa6.69□□□□□ -1.34
HERC2-201ENST00000261609 LIN7BQ9HAP6 207 aa6.69□□□□□ -1.34
HERC2-201ENST00000261609 EHFQ9NZC4 300 aa6.69□□□□□ -1.34
HERC2-201ENST00000261609 POLEQ07864 2286 aa6.69□□□□□ -1.34
HERC2-201ENST00000261609 RNH1P13489 461 aaKnown RBP6.69□□□□□ -1.34
HERC2-201ENST00000261609 MGMTP16455 207 aa6.69□□□□□ -1.34
HERC2-201ENST00000261609 SDC1P18827 310 aa6.69□□□□□ -1.34
HERC2-201ENST00000261609 CR2P20023 1033 aa6.69□□□□□ -1.34
HERC2-201ENST00000261609 BIDP55957 195 aa6.69□□□□□ -1.34
HERC2-201ENST00000261609 ETFDHQ16134 617 aa6.69□□□□□ -1.34
HERC2-201ENST00000261609 SBSNQ6UWP8 590 aa6.69□□□□□ -1.34
HERC2-201ENST00000261609 UHRF2Q96PU4 802 aa6.69□□□□□ -1.34
HERC2-201ENST00000261609 MRPS17Q9Y2R5 130 aaKnown RBP6.69□□□□□ -1.34
HERC2-201ENST00000261609 CD200R1Q8TD46 325 aa6.68□□□□□ -1.34
HERC2-201ENST00000261609 BSCL2Q96G97 398 aaPredicted RBP6.68□□□□□ -1.34
HERC2-201ENST00000261609 ARL2-SNX15V9GYD0 113 aa6.68□□□□□ -1.34
HERC2-201ENST00000261609 TMEM212A6NML5 194 aa6.68□□□□□ -1.34
HERC2-201ENST00000261609 OR2T1O43869 369 aa6.68□□□□□ -1.34
HERC2-201ENST00000261609 GPR37L1O60883 481 aa6.68□□□□□ -1.34
HERC2-201ENST00000261609 PDGFBP01127 241 aaPredicted RBP6.68□□□□□ -1.34
HERC2-201ENST00000261609 MRPS34P82930 218 aaKnown RBP6.68□□□□□ -1.34
HERC2-201ENST00000261609 OR51S1Q8NGJ8 323 aa6.68□□□□□ -1.34
HERC2-201ENST00000261609 SPTSSAQ969W0 71 aa6.68□□□□□ -1.34
HERC2-201ENST00000261609 DPH7Q9BTV6 452 aa6.68□□□□□ -1.34
HERC2-201ENST00000261609 AQP7O14520 342 aa6.68□□□□□ -1.34
HERC2-201ENST00000261609 COCHO43405 550 aa6.68□□□□□ -1.34
HERC2-201ENST00000261609 HAPLN1P10915 354 aaPredicted RBP6.68□□□□□ -1.34
HERC2-201ENST00000261609 CTRB1P17538 263 aa6.68□□□□□ -1.34
HERC2-201ENST00000261609 SIRPAP78324 504 aa6.68□□□□□ -1.34
HERC2-201ENST00000261609 IER5LQ5T953 404 aa6.68□□□□□ -1.34
HERC2-201ENST00000261609 CTRB2Q6GPI1 263 aa6.68□□□□□ -1.34
HERC2-201ENST00000261609 GKN2Q86XP6 184 aa6.68□□□□□ -1.34
HERC2-201ENST00000261609 BOCQ9BWV1 1114 aa6.68□□□□□ -1.34
HERC2-201ENST00000261609 ACOXLQ9NUZ1 547 aa6.68□□□□□ -1.34
HERC2-201ENST00000261609 HIDE1A8MVS5 230 aa6.68□□□□□ -1.34
HERC2-201ENST00000261609 SYT5O00445 386 aa6.68□□□□□ -1.34
HERC2-201ENST00000261609 DAP3P51398 398 aaKnown RBP6.68□□□□□ -1.34
HERC2-201ENST00000261609 CAMK2BQ13554 666 aa6.68□□□□□ -1.34
HERC2-201ENST00000261609 ADIRFQ15847 76 aa6.68□□□□□ -1.34
HERC2-201ENST00000261609 OR13C9Q8NGT0 318 aa6.68□□□□□ -1.34
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 24.7 ms