RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000218364.4

HTATSF1-201, Transcript of HIV-1 Tat specific factor 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene HTATSF1, Length 2,775 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HTATSF1-201ENST00000218364 ZFYVE21Q9BQ24 234 aa20.29■□□□□ 0.84
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HTATSF1-201ENST00000218364 MGAT4CQ9UBM8 478 aa20.29■□□□□ 0.84
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HTATSF1-201ENST00000218364 OR6C65A6NJZ3 312 aa20.26■□□□□ 0.83
HTATSF1-201ENST00000218364 IDSB3KWA1 339 aa20.26■□□□□ 0.83
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HTATSF1-201ENST00000218364 LDOC1O95751 146 aaPredicted RBP20.26■□□□□ 0.83
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HTATSF1-201ENST00000218364 DNM1P46Q6ZS02 220 aa20.26■□□□□ 0.83
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HTATSF1-201ENST00000218364 C15orf40Q8WUR7 153 aa20.26■□□□□ 0.83
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HTATSF1-201ENST00000218364 SFXN2Q96NB2 322 aa20.26■□□□□ 0.83
HTATSF1-201ENST00000218364 HCN3Q9P1Z3 774 aa20.26■□□□□ 0.83
HTATSF1-201ENST00000218364 LINC01553A4QN01 128 aa20.25■□□□□ 0.83
HTATSF1-201ENST00000218364 A6NCN8 305 aa20.25■□□□□ 0.83
HTATSF1-201ENST00000218364 POM121BA6NF01 834 aa20.25■□□□□ 0.83
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HTATSF1-201ENST00000218364 RPL4P36578 427 aaKnown RBP20.25■□□□□ 0.83
HTATSF1-201ENST00000218364 TCEA2Q15560 299 aa20.25■□□□□ 0.83
HTATSF1-201ENST00000218364 ZNF141Q15928 474 aa20.25■□□□□ 0.83
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