RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000639599.1

TARDBP-231, Transcript of TAR DNA binding protein, human

TSL 5

Gene TARDBP, Length 1,283 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TARDBP-231	ENST00000639599	OGFOD2	Q6N063	350 aa		12.87	□□□□□ -0.35
TARDBP-231	ENST00000639599	CROCCP2	Q86T23	111 aa		12.87	□□□□□ -0.35
TARDBP-231	ENST00000639599	GLB1L3	Q8NCI6	653 aa	Predicted RBP	12.87	□□□□□ -0.35
TARDBP-231	ENST00000639599	OR52P1P	Q8NH57	321 aa		12.87	□□□□□ -0.35
TARDBP-231	ENST00000639599	PROX1	Q92786	737 aa		12.87	□□□□□ -0.35
TARDBP-231	ENST00000639599	AURKB	Q96GD4	344 aa	Predicted RBP	12.87	□□□□□ -0.35
TARDBP-231	ENST00000639599	SORT1	Q99523	831 aa		12.87	□□□□□ -0.35
TARDBP-231	ENST00000639599	MOV10	Q9HCE1	1003 aa	Known RBP	12.87	□□□□□ -0.35
TARDBP-231	ENST00000639599	PNPO	Q9NVS9	261 aa		12.87	□□□□□ -0.35
TARDBP-231	ENST00000639599	AIG1	Q9NVV5	245 aa		12.87	□□□□□ -0.35
TARDBP-231	ENST00000639599	KCNS2	Q9ULS6	477 aa		12.87	□□□□□ -0.35
TARDBP-231	ENST00000639599	MOK	Q9UQ07	419 aa		12.87	□□□□□ -0.35
TARDBP-231	ENST00000639599	JMJD1C	Q15652	2540 aa		12.87	□□□□□ -0.35
TARDBP-231	ENST00000639599		A0A096LPI6	279 aa		12.86	□□□□□ -0.35
TARDBP-231	ENST00000639599	ZC3H12D	A2A288	527 aa	Known RBP	12.86	□□□□□ -0.35
TARDBP-231	ENST00000639599	AQP7P3	A6NL99	342 aa		12.86	□□□□□ -0.35
TARDBP-231	ENST00000639599	ELOA3D	A6NLF2	546 aa	Predicted RBP	12.86	□□□□□ -0.35
TARDBP-231	ENST00000639599		A8MVM7	634 aa		12.86	□□□□□ -0.35
TARDBP-231	ENST00000639599	VSTM5	A8MXK1	200 aa		12.86	□□□□□ -0.35
TARDBP-231	ENST00000639599	KLF11	O14901	512 aa		12.86	□□□□□ -0.35
TARDBP-231	ENST00000639599	VAMP5	O95183	116 aa		12.86	□□□□□ -0.35
TARDBP-231	ENST00000639599	AHSA1	O95433	338 aa		12.86	□□□□□ -0.35
TARDBP-231	ENST00000639599	CRYAA	P02489	173 aa		12.86	□□□□□ -0.35
TARDBP-231	ENST00000639599	IL6	P05231	212 aa		12.86	□□□□□ -0.35
TARDBP-231	ENST00000639599	BCHE	P06276	602 aa		12.86	□□□□□ -0.35
TARDBP-231	ENST00000639599	GZMK	P49863	264 aa		12.86	□□□□□ -0.35
TARDBP-231	ENST00000639599	IL1RL1	Q01638	556 aa		12.86	□□□□□ -0.35
TARDBP-231	ENST00000639599	GGTLC2	Q14390	218 aa		12.86	□□□□□ -0.35
TARDBP-231	ENST00000639599	ELOA3B	Q3SY89	546 aa		12.86	□□□□□ -0.35
TARDBP-231	ENST00000639599	IQCC	Q4KMZ1	466 aa		12.86	□□□□□ -0.35
TARDBP-231	ENST00000639599	WDR93	Q6P2C0	686 aa		12.86	□□□□□ -0.35
TARDBP-231	ENST00000639599	NIPAL3	Q6P499	406 aa		12.86	□□□□□ -0.35
TARDBP-231	ENST00000639599	TMEM99	Q8N816	258 aa		12.86	□□□□□ -0.35
TARDBP-231	ENST00000639599	WDR31	Q8NA23	367 aa		12.86	□□□□□ -0.35
TARDBP-231	ENST00000639599	ELOA3	Q8NG57	546 aa		12.86	□□□□□ -0.35
TARDBP-231	ENST00000639599	VRK1	Q99986	396 aa	Predicted RBP	12.86	□□□□□ -0.35
TARDBP-231	ENST00000639599	PIF1	Q9H611	641 aa		12.86	□□□□□ -0.35
TARDBP-231	ENST00000639599	THUMPD1	Q9NXG2	353 aa	Known RBP	12.86	□□□□□ -0.35
TARDBP-231	ENST00000639599	RPS6KB2	Q9UBS0	482 aa		12.86	□□□□□ -0.35
TARDBP-231	ENST00000639599	PRDM4	Q9UKN5	801 aa		12.86	□□□□□ -0.35
TARDBP-231	ENST00000639599	HEATR5A	Q86XA9	2040 aa		12.86	□□□□□ -0.35
TARDBP-231	ENST00000639599	PRAMEF27	A3QJZ7	478 aa		12.85	□□□□□ -0.35
TARDBP-231	ENST00000639599	LIPT2	A6NK58	231 aa		12.85	□□□□□ -0.35
TARDBP-231	ENST00000639599	SLCO1B7	G3V0H7	640 aa		12.85	□□□□□ -0.35
TARDBP-231	ENST00000639599	PDLIM1	O00151	329 aa		12.85	□□□□□ -0.35
TARDBP-231	ENST00000639599	GKN3P	P0CG01	181 aa		12.85	□□□□□ -0.35
TARDBP-231	ENST00000639599	KIT	P10721	976 aa		12.85	□□□□□ -0.35
TARDBP-231	ENST00000639599	IDO1	P14902	403 aa		12.85	□□□□□ -0.35
TARDBP-231	ENST00000639599	NTF4	P34130	210 aa		12.85	□□□□□ -0.35
TARDBP-231	ENST00000639599	CDKN2C	P42773	168 aa		12.85	□□□□□ -0.35
TARDBP-231	ENST00000639599	DSTN	P60981	165 aa		12.85	□□□□□ -0.35
TARDBP-231	ENST00000639599	LSM11	P83369	360 aa	Known RBP eCLIP	12.85	□□□□□ -0.35	3e-9	■■□□□ 11.9
TARDBP-231	ENST00000639599	BST1	Q10588	318 aa		12.85	□□□□□ -0.35
TARDBP-231	ENST00000639599	HIKESHI	Q53FT3	197 aa		12.85	□□□□□ -0.35
TARDBP-231	ENST00000639599	C6orf10	Q5SRN2	563 aa		12.85	□□□□□ -0.35
TARDBP-231	ENST00000639599	ATG16L1	Q676U5	607 aa		12.85	□□□□□ -0.35
TARDBP-231	ENST00000639599	VHLL	Q6RSH7	139 aa		12.85	□□□□□ -0.35
TARDBP-231	ENST00000639599	VRK2	Q86Y07	508 aa		12.85	□□□□□ -0.35
TARDBP-231	ENST00000639599	MREG	Q8N565	214 aa		12.85	□□□□□ -0.35
TARDBP-231	ENST00000639599	C10orf105	Q8TEF2	133 aa		12.85	□□□□□ -0.35
TARDBP-231	ENST00000639599	C3orf49	Q96BT1	292 aa		12.85	□□□□□ -0.35
TARDBP-231	ENST00000639599	ZNF385A	Q96PM9	386 aa	Known RBP	12.85	□□□□□ -0.35
TARDBP-231	ENST00000639599	ALKBH3	Q96Q83	286 aa	Predicted RBP	12.85	□□□□□ -0.35
TARDBP-231	ENST00000639599	SLC38A2	Q96QD8	506 aa		12.85	□□□□□ -0.35
TARDBP-231	ENST00000639599	C20orf27	Q9GZN8	174 aa		12.85	□□□□□ -0.35
TARDBP-231	ENST00000639599	CHODL	Q9H9P2	273 aa		12.85	□□□□□ -0.35
TARDBP-231	ENST00000639599	MYOZ1	Q9NP98	299 aa	Predicted RBP	12.85	□□□□□ -0.35
TARDBP-231	ENST00000639599	NOL12	Q9UGY1	213 aa	Known RBP eCLIP	12.85	□□□□□ -0.35
TARDBP-231	ENST00000639599	HAO1	Q9UJM8	370 aa		12.85	□□□□□ -0.35
TARDBP-231	ENST00000639599	RASD1	Q9Y272	281 aa		12.85	□□□□□ -0.35
TARDBP-231	ENST00000639599	ZNF443	Q9Y2A4	671 aa	Predicted RBP	12.85	□□□□□ -0.35
TARDBP-231	ENST00000639599		V9GYY5	206 aa	Predicted RBP	12.85	□□□□□ -0.35
TARDBP-231	ENST00000639599	DNHD1	Q96M86	4753 aa		12.85	□□□□□ -0.35
TARDBP-231	ENST00000639599	CDHR4	A6H8M9	788 aa		12.84	□□□□□ -0.35
TARDBP-231	ENST00000639599	C5orf58	C9J3I9	102 aa		12.84	□□□□□ -0.35
TARDBP-231	ENST00000639599	NDUFS8	O00217	210 aa		12.84	□□□□□ -0.35
TARDBP-231	ENST00000639599	SDHD	O14521	159 aa		12.84	□□□□□ -0.35
TARDBP-231	ENST00000639599	HDAC3	O15379	428 aa		12.84	□□□□□ -0.35
TARDBP-231	ENST00000639599	PHF1	O43189	567 aa	Predicted RBP	12.84	□□□□□ -0.35
TARDBP-231	ENST00000639599	LMX1B	O60663	402 aa		12.84	□□□□□ -0.35
TARDBP-231	ENST00000639599	SLC22A3	O75751	556 aa		12.84	□□□□□ -0.35
TARDBP-231	ENST00000639599	LGI1	O95970	557 aa		12.84	□□□□□ -0.35
TARDBP-231	ENST00000639599	F12	P00748	615 aa	Predicted RBP	12.84	□□□□□ -0.35
TARDBP-231	ENST00000639599	ALDOC	P09972	364 aa	Known RBP	12.84	□□□□□ -0.35
TARDBP-231	ENST00000639599	APEH	P13798	732 aa	Known RBP	12.84	□□□□□ -0.35
TARDBP-231	ENST00000639599	RPS4Y1	P22090	263 aa	Known RBP	12.84	□□□□□ -0.35
TARDBP-231	ENST00000639599	EPHA3	P29320	983 aa		12.84	□□□□□ -0.35
TARDBP-231	ENST00000639599	BNIP2	Q12982	314 aa		12.84	□□□□□ -0.35
TARDBP-231	ENST00000639599	TBRG1	Q3YBR2	411 aa		12.84	□□□□□ -0.35
TARDBP-231	ENST00000639599	COX20	Q5RI15	118 aa		12.84	□□□□□ -0.35
TARDBP-231	ENST00000639599	C1orf140	Q5VVS0	124 aa		12.84	□□□□□ -0.35
TARDBP-231	ENST00000639599	AP1AR	Q63HQ0	302 aa		12.84	□□□□□ -0.35
TARDBP-231	ENST00000639599	FAM166A	Q6J272	317 aa		12.84	□□□□□ -0.35
TARDBP-231	ENST00000639599	ZNF836	Q6ZNA1	936 aa		12.84	□□□□□ -0.35
TARDBP-231	ENST00000639599	OR1K1	Q8NGR3	316 aa		12.84	□□□□□ -0.35
TARDBP-231	ENST00000639599	MGARP	Q8TDB4	240 aa		12.84	□□□□□ -0.35
TARDBP-231	ENST00000639599	SLC25A36	Q96CQ1	311 aa		12.84	□□□□□ -0.35
TARDBP-231	ENST00000639599	ITCH	Q96J02	903 aa		12.84	□□□□□ -0.35
TARDBP-231	ENST00000639599	TEX37	Q96LM6	180 aa		12.84	□□□□□ -0.35
TARDBP-231	ENST00000639599	KATNB1	Q9BVA0	655 aa		12.84	□□□□□ -0.35

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