RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000608440.5

CTCFL-218, Transcript of CCCTC-binding factor like, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene CTCFL, Length 2,749 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTCFL-218ENST00000608440 PHOX2AO14813 284 aa11.6□□□□□ -0.55
CTCFL-218ENST00000608440 GBAP04062 536 aa11.6□□□□□ -0.55
CTCFL-218ENST00000608440 NPSP0C0P6 89 aa11.6□□□□□ -0.55
CTCFL-218ENST00000608440 SBK2P0C263 348 aa11.6□□□□□ -0.55
CTCFL-218ENST00000608440 GRK4P32298 578 aa11.6□□□□□ -0.55
CTCFL-218ENST00000608440 MNDAP41218 407 aa11.6□□□□□ -0.55
CTCFL-218ENST00000608440 MEF2DQ14814 521 aa11.6□□□□□ -0.55
CTCFL-218ENST00000608440 GFI1BQ5VTD9 330 aa11.6□□□□□ -0.55
CTCFL-218ENST00000608440 WSCD1Q658N2 575 aa11.6□□□□□ -0.55
CTCFL-218ENST00000608440 BHLHA9Q7RTU4 235 aa11.6□□□□□ -0.55
CTCFL-218ENST00000608440 TAF8Q7Z7C8 310 aa11.6□□□□□ -0.55
CTCFL-218ENST00000608440 ST7LQ8TDW4 575 aa11.6□□□□□ -0.55
CTCFL-218ENST00000608440 TCTN2Q96GX1 697 aa11.6□□□□□ -0.55
CTCFL-218ENST00000608440 ACBD6Q9BR61 282 aa11.6□□□□□ -0.55
CTCFL-218ENST00000608440 ZDHHC5Q9C0B5 715 aa11.6□□□□□ -0.55
CTCFL-218ENST00000608440 TMEM248Q9NWD8 314 aa11.6□□□□□ -0.55
CTCFL-218ENST00000608440 TNFSF18Q9UNG2 199 aa11.6□□□□□ -0.55
CTCFL-218ENST00000608440 SLC35A3Q9Y2D2 325 aa11.6□□□□□ -0.55
CTCFL-218ENST00000608440 ANKRD36A6QL64 1941 aa11.6□□□□□ -0.55
CTCFL-218ENST00000608440 ANKRD20A5PA0PJZ0 165 aa11.59□□□□□ -0.55
CTCFL-218ENST00000608440 CTDSPLO15194 276 aa11.59□□□□□ -0.55
CTCFL-218ENST00000608440 FGF16O43320 207 aa11.59□□□□□ -0.55
CTCFL-218ENST00000608440 HYAL3O43820 417 aaPredicted RBP11.59□□□□□ -0.55
CTCFL-218ENST00000608440 SLC2A10O95528 541 aa11.59□□□□□ -0.55
CTCFL-218ENST00000608440 F10P00742 488 aa11.59□□□□□ -0.55
CTCFL-218ENST00000608440 XPAP23025 273 aaPredicted RBP11.59□□□□□ -0.55
CTCFL-218ENST00000608440 GSK3AP49840 483 aa11.59□□□□□ -0.55
CTCFL-218ENST00000608440 ADPRHP54922 357 aa11.59□□□□□ -0.55
CTCFL-218ENST00000608440 CLDN12P56749 244 aa11.59□□□□□ -0.55
CTCFL-218ENST00000608440 NRG3P56975 720 aa11.59□□□□□ -0.55
CTCFL-218ENST00000608440 ACSM2AQ08AH3 577 aa11.59□□□□□ -0.55
CTCFL-218ENST00000608440 TDGQ13569 410 aa11.59□□□□□ -0.55
CTCFL-218ENST00000608440 NDUFA9Q16795 377 aa11.59□□□□□ -0.55
CTCFL-218ENST00000608440 ZNF385BQ569K4 471 aa11.59□□□□□ -0.55
CTCFL-218ENST00000608440 AWAT1Q58HT5 328 aa11.59□□□□□ -0.55
CTCFL-218ENST00000608440 ACSM2BQ68CK6 577 aa11.59□□□□□ -0.55
CTCFL-218ENST00000608440 GPR32P1Q8NGA4 272 aa11.59□□□□□ -0.55
CTCFL-218ENST00000608440 OR56A3Q8NH54 315 aa11.59□□□□□ -0.55
CTCFL-218ENST00000608440 GPR148Q8TDV2 347 aa11.59□□□□□ -0.55
CTCFL-218ENST00000608440 INSM2Q96T92 566 aaPredicted RBP11.59□□□□□ -0.55
CTCFL-218ENST00000608440 BOCQ9BWV1 1114 aa11.59□□□□□ -0.55
CTCFL-218ENST00000608440 OR51I1Q9H343 314 aa11.59□□□□□ -0.55
CTCFL-218ENST00000608440 CACNG4Q9UBN1 327 aa11.59□□□□□ -0.55
CTCFL-218ENST00000608440 MBD1Q9UIS9 605 aaPredicted RBP11.59□□□□□ -0.55
CTCFL-218ENST00000608440 ANGPT4Q9Y264 503 aa11.59□□□□□ -0.55
CTCFL-218ENST00000608440 HS3ST4Q9Y661 456 aa11.59□□□□□ -0.55
CTCFL-218ENST00000608440 MKI67P46013 3256 aaKnown RBP11.59□□□□□ -0.55
CTCFL-218ENST00000608440 CKAP5Q14008 2032 aa11.59□□□□□ -0.55
CTCFL-218ENST00000608440 MYBPHLA2RUH7 354 aa11.59□□□□□ -0.55
CTCFL-218ENST00000608440 C7orf77A4D0Y5 90 aa11.59□□□□□ -0.55
CTCFL-218ENST00000608440 TOX3O15405 576 aaPredicted RBP11.59□□□□□ -0.55
CTCFL-218ENST00000608440 REM1O75628 298 aa11.59□□□□□ -0.55
CTCFL-218ENST00000608440 OR2F2O95006 317 aa11.59□□□□□ -0.55
CTCFL-218ENST00000608440 IFNA17P01571 189 aa11.59□□□□□ -0.55
CTCFL-218ENST00000608440 CD79AP11912 226 aa11.59□□□□□ -0.55
CTCFL-218ENST00000608440 FOSL2P15408 326 aa11.59□□□□□ -0.55
CTCFL-218ENST00000608440 EPHB3P54753 998 aa11.59□□□□□ -0.55
CTCFL-218ENST00000608440 ACSM1Q08AH1 577 aa11.59□□□□□ -0.55
CTCFL-218ENST00000608440 OR2F1Q13607 317 aa11.59□□□□□ -0.55
CTCFL-218ENST00000608440 SLBPQ14493 270 aaKnown RBP eCLIP11.59□□□□□ -0.55
CTCFL-218ENST00000608440 ZNF235Q14590 738 aa11.59□□□□□ -0.55
CTCFL-218ENST00000608440 HYAL4Q2M3T9 481 aa11.59□□□□□ -0.55
CTCFL-218ENST00000608440 ZNF750Q32MQ0 723 aa11.59□□□□□ -0.55
CTCFL-218ENST00000608440 SLC35D3Q5M8T2 416 aa11.59□□□□□ -0.55
CTCFL-218ENST00000608440 ARHGAP40Q5TG30 622 aa11.59□□□□□ -0.55
CTCFL-218ENST00000608440 FRG2Q64ET8 278 aa11.59□□□□□ -0.55
CTCFL-218ENST00000608440 OR2A2Q6IF42 318 aa11.59□□□□□ -0.55
CTCFL-218ENST00000608440 PRSS55Q6UWB4 352 aaPredicted RBP11.59□□□□□ -0.55
CTCFL-218ENST00000608440 OR4E2Q8NGC2 313 aa11.59□□□□□ -0.55
CTCFL-218ENST00000608440 OR52N2Q8NGI0 321 aa11.59□□□□□ -0.55
CTCFL-218ENST00000608440 C1orf216Q8TAB5 229 aa11.59□□□□□ -0.55
CTCFL-218ENST00000608440 SMPDL3BQ92485 455 aa11.59□□□□□ -0.55
CTCFL-218ENST00000608440 FRG2BQ96QU4 278 aa11.59□□□□□ -0.55
CTCFL-218ENST00000608440 GAL3ST4Q96RP7 486 aa11.59□□□□□ -0.55
CTCFL-218ENST00000608440 GPR61Q9BZJ8 451 aa11.59□□□□□ -0.55
CTCFL-218ENST00000608440 ARL15Q9NXU5 204 aa11.59□□□□□ -0.55
CTCFL-218ENST00000608440 DOK5Q9P104 306 aa11.59□□□□□ -0.55
CTCFL-218ENST00000608440 LAMA2P24043 3122 aaKnown RBP11.59□□□□□ -0.55
CTCFL-218ENST00000608440 GNG14A0A1W2PPG7 69 aa11.59□□□□□ -0.55
CTCFL-218ENST00000608440 FOXE1O00358 373 aaPredicted RBP11.59□□□□□ -0.55
CTCFL-218ENST00000608440 VNN2O95498 520 aa11.59□□□□□ -0.55
CTCFL-218ENST00000608440 NTN1O95631 604 aa11.59□□□□□ -0.55
CTCFL-218ENST00000608440 BCHEP06276 602 aa11.59□□□□□ -0.55
CTCFL-218ENST00000608440 ANXA4P09525 319 aaPredicted RBP11.59□□□□□ -0.55
CTCFL-218ENST00000608440 THEGLP0DJG4 465 aa11.59□□□□□ -0.55
CTCFL-218ENST00000608440 C5AR1P21730 350 aa11.59□□□□□ -0.55
CTCFL-218ENST00000608440 CASRP41180 1078 aa11.59□□□□□ -0.55
CTCFL-218ENST00000608440 RBM34P42696 430 aaKnown RBP11.59□□□□□ -0.55
CTCFL-218ENST00000608440 RPS10P46783 165 aaKnown RBP11.59□□□□□ -0.55
CTCFL-218ENST00000608440 LY6G6FQ5SQ64 297 aa11.59□□□□□ -0.55
CTCFL-218ENST00000608440 ADGRF1Q5T601 910 aa11.59□□□□□ -0.55
CTCFL-218ENST00000608440 DHRS11Q6UWP2 260 aa11.59□□□□□ -0.55
CTCFL-218ENST00000608440 ABHD13Q7L211 337 aa11.59□□□□□ -0.55
CTCFL-218ENST00000608440 NDUFAF7Q7L592 441 aa11.59□□□□□ -0.55
CTCFL-218ENST00000608440 CDK20Q8IZL9 346 aa11.59□□□□□ -0.55
CTCFL-218ENST00000608440 SDR9C7Q8NEX9 313 aa11.59□□□□□ -0.55
CTCFL-218ENST00000608440 RNF141Q8WVD5 230 aa11.59□□□□□ -0.55
CTCFL-218ENST00000608440 SULT4A1Q9BR01 284 aa11.59□□□□□ -0.55
CTCFL-218ENST00000608440 TTTY10Q9BZA0 68 aa11.59□□□□□ -0.55
CTCFL-218ENST00000608440 LOC100509620A0A075B734 347 aa11.58□□□□□ -0.56
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 23.5 ms