RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000606426.1

CUX2P1-201, Transcript of cut like homeobox 2 pseudogene 1, humanhuman

BASIC

Gene CUX2P1, Length 298 nt, Biotype processed pseudogene.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUX2P1-201ENST00000606426 RPS5P46782 204 aaKnown RBP6.7□□□□□ -1.34
CUX2P1-201ENST00000606426 YAP1P46937 504 aaKnown RBP6.7□□□□□ -1.34
CUX2P1-201ENST00000606426 CTBP2P56545 445 aa6.7□□□□□ -1.34
CUX2P1-201ENST00000606426 H3F3AP84243 136 aa6.7□□□□□ -1.34
CUX2P1-201ENST00000606426 VLDLRP98155 873 aa6.7□□□□□ -1.34
CUX2P1-201ENST00000606426 SPIBQ01892 262 aa6.7□□□□□ -1.34
CUX2P1-201ENST00000606426 EGR4Q05215 589 aa6.7□□□□□ -1.34
CUX2P1-201ENST00000606426 RASGEF1BQ0VAM2 473 aa6.7□□□□□ -1.34
CUX2P1-201ENST00000606426 ANKDD1AQ495B1 522 aa6.7□□□□□ -1.34
CUX2P1-201ENST00000606426 TMEM201Q5SNT2 666 aa6.7□□□□□ -1.34
CUX2P1-201ENST00000606426 TMEM225Q6GV28 225 aa6.7□□□□□ -1.34
CUX2P1-201ENST00000606426 SEM1Q6ZVN7 128 aa6.7□□□□□ -1.34
CUX2P1-201ENST00000606426 FAM214BQ7L5A3 538 aa6.7□□□□□ -1.34
CUX2P1-201ENST00000606426 HIST3H2AQ7L7L0 130 aa6.7□□□□□ -1.34
CUX2P1-201ENST00000606426 MAMDC2Q7Z304 686 aaPredicted RBP6.7□□□□□ -1.34
CUX2P1-201ENST00000606426 MRGPRGQ86SM5 289 aa6.7□□□□□ -1.34
CUX2P1-201ENST00000606426 MARVELD2Q8N4S9 558 aa6.7□□□□□ -1.34
CUX2P1-201ENST00000606426 C10orf53Q8N6V4 93 aa6.7□□□□□ -1.34
CUX2P1-201ENST00000606426 FAM86B1Q8N7N1 296 aa6.7□□□□□ -1.34
CUX2P1-201ENST00000606426 C9orf106Q8NAJ2 232 aa6.7□□□□□ -1.34
CUX2P1-201ENST00000606426 ADPRHL1Q8NDY3 354 aa6.7□□□□□ -1.34
CUX2P1-201ENST00000606426 OR6K3Q8NGY3 331 aa6.7□□□□□ -1.34
CUX2P1-201ENST00000606426 CA5BP1Q8WTZ4 195 aa6.7□□□□□ -1.34
CUX2P1-201ENST00000606426 HIST1H2ACQ93077 130 aa6.7□□□□□ -1.34
CUX2P1-201ENST00000606426 KTI12Q96EK9 354 aaPredicted RBP6.7□□□□□ -1.34
CUX2P1-201ENST00000606426 SEPHS2Q99611 448 aa6.7□□□□□ -1.34
CUX2P1-201ENST00000606426 SRXN1Q9BYN0 137 aa6.7□□□□□ -1.34
CUX2P1-201ENST00000606426 NDEL1Q9GZM8 345 aa6.7□□□□□ -1.34
CUX2P1-201ENST00000606426 NMNAT1Q9HAN9 279 aaPredicted RBP6.7□□□□□ -1.34
CUX2P1-201ENST00000606426 BCO1Q9HAY6 547 aa6.7□□□□□ -1.34
CUX2P1-201ENST00000606426 NANSQ9NR45 359 aa6.7□□□□□ -1.34
CUX2P1-201ENST00000606426 Q9UFV3 132 aa6.7□□□□□ -1.34
CUX2P1-201ENST00000606426 ZNF229Q9UJW7 825 aa6.7□□□□□ -1.34
CUX2P1-201ENST00000606426 TMCC3Q9ULS5 477 aa6.7□□□□□ -1.34
CUX2P1-201ENST00000606426 AURKCQ9UQB9 309 aa6.7□□□□□ -1.34
CUX2P1-201ENST00000606426 RNF6Q9Y252 685 aa6.7□□□□□ -1.34
CUX2P1-201ENST00000606426 RASD1Q9Y272 281 aa6.7□□□□□ -1.34
CUX2P1-201ENST00000606426 TMEM5Q9Y2B1 443 aa6.7□□□□□ -1.34
CUX2P1-201ENST00000606426 V9GYQ6 96 aa6.7□□□□□ -1.34
CUX2P1-201ENST00000606426 DNAJC13O75165 2243 aa6.7□□□□□ -1.34
CUX2P1-201ENST00000606426 PRRC2CQ9Y520 2896 aaKnown RBP6.7□□□□□ -1.34
CUX2P1-201ENST00000606426 ZGRF1Q86YA3 2104 aa6.7□□□□□ -1.34
CUX2P1-201ENST00000606426 HEATR5AQ86XA9 2040 aa6.69□□□□□ -1.34
CUX2P1-201ENST00000606426 IGKV3D-15A0A087WSY6 115 aa6.69□□□□□ -1.34
CUX2P1-201ENST00000606426 A0A1W2PNV4 684 aa6.69□□□□□ -1.34
CUX2P1-201ENST00000606426 TCRBV3S1A0A5B6 114 aa6.69□□□□□ -1.34
CUX2P1-201ENST00000606426 CLEC18AA5D8T8 446 aa6.69□□□□□ -1.34
CUX2P1-201ENST00000606426 FTCDNL1E5RQL4 147 aa6.69□□□□□ -1.34
CUX2P1-201ENST00000606426 J3KTA2 159 aa6.69□□□□□ -1.34
CUX2P1-201ENST00000606426 FFAR1O14842 300 aa6.69□□□□□ -1.34
CUX2P1-201ENST00000606426 SMAD9O15198 467 aaKnown RBP6.69□□□□□ -1.34
CUX2P1-201ENST00000606426 AKAP8O43823 692 aaKnown RBP6.69□□□□□ -1.34
CUX2P1-201ENST00000606426 SEMA7AO75326 666 aa6.69□□□□□ -1.34
CUX2P1-201ENST00000606426 AQP8O94778 261 aa6.69□□□□□ -1.34
CUX2P1-201ENST00000606426 PRSS23O95084 383 aa6.69□□□□□ -1.34
CUX2P1-201ENST00000606426 OR6A2O95222 327 aa6.69□□□□□ -1.34
CUX2P1-201ENST00000606426 LYPD3O95274 346 aa6.69□□□□□ -1.34
CUX2P1-201ENST00000606426 CLDN14O95500 239 aa6.69□□□□□ -1.34
CUX2P1-201ENST00000606426 THY1P04216 161 aa6.69□□□□□ -1.34
CUX2P1-201ENST00000606426 YES1P07947 543 aa6.69□□□□□ -1.34
CUX2P1-201ENST00000606426 NQO1P15559 274 aaKnown RBP6.69□□□□□ -1.34
CUX2P1-201ENST00000606426 RRM2P31350 389 aa6.69□□□□□ -1.34
CUX2P1-201ENST00000606426 PEX19P40855 299 aa6.69□□□□□ -1.34
CUX2P1-201ENST00000606426 ARHGDIAP52565 204 aa6.69□□□□□ -1.34
CUX2P1-201ENST00000606426 SLC16A1P53985 500 aa6.69□□□□□ -1.34
CUX2P1-201ENST00000606426 ADORA2A-AS1P86434 159 aa6.69□□□□□ -1.34
CUX2P1-201ENST00000606426 POU4F3Q15319 338 aa6.69□□□□□ -1.34
CUX2P1-201ENST00000606426 ZNF74Q16587 644 aa6.69□□□□□ -1.34
CUX2P1-201ENST00000606426 ZSCAN26Q16670 478 aa6.69□□□□□ -1.34
CUX2P1-201ENST00000606426 OTUD3Q5T2D3 398 aaPredicted RBP6.69□□□□□ -1.34
CUX2P1-201ENST00000606426 ABLIM2Q6H8Q1 611 aa6.69□□□□□ -1.34
CUX2P1-201ENST00000606426 CLEC18BQ6UXF7 455 aa6.69□□□□□ -1.34
CUX2P1-201ENST00000606426 ZNF730Q6ZMV8 503 aa6.69□□□□□ -1.34
CUX2P1-201ENST00000606426 WDR88Q6ZMY6 472 aa6.69□□□□□ -1.34
CUX2P1-201ENST00000606426 MBOAT2Q6ZWT7 520 aa6.69□□□□□ -1.34
CUX2P1-201ENST00000606426 H1FNTQ75WM6 255 aaPredicted RBP6.69□□□□□ -1.34
CUX2P1-201ENST00000606426 STK32CQ86UX6 486 aa6.69□□□□□ -1.34
CUX2P1-201ENST00000606426 NKAIN4Q8IVV8 208 aa6.69□□□□□ -1.34
CUX2P1-201ENST00000606426 ADGRG5Q8IZF4 528 aa6.69□□□□□ -1.34
CUX2P1-201ENST00000606426 RPRMLQ8N4K4 120 aa6.69□□□□□ -1.34
CUX2P1-201ENST00000606426 CLEC18CQ8NCF0 446 aa6.69□□□□□ -1.34
CUX2P1-201ENST00000606426 LILRB4Q8NHJ6 448 aa6.69□□□□□ -1.34
CUX2P1-201ENST00000606426 TMEM255BQ8WV15 326 aa6.69□□□□□ -1.34
CUX2P1-201ENST00000606426 ITLN2Q8WWU7 325 aaPredicted RBP6.69□□□□□ -1.34
CUX2P1-201ENST00000606426 LIPHQ8WWY8 451 aa6.69□□□□□ -1.34
CUX2P1-201ENST00000606426 ROBO4Q8WZ75 1007 aa6.69□□□□□ -1.34
CUX2P1-201ENST00000606426 TAAR8Q969N4 342 aa6.69□□□□□ -1.34
CUX2P1-201ENST00000606426 SDCCAG3Q96C92 435 aa6.69□□□□□ -1.34
CUX2P1-201ENST00000606426 INTS12Q96CB8 462 aaKnown RBP6.69□□□□□ -1.34
CUX2P1-201ENST00000606426 SLC25A36Q96CQ1 311 aa6.69□□□□□ -1.34
CUX2P1-201ENST00000606426 SGTBQ96EQ0 304 aa6.69□□□□□ -1.34
CUX2P1-201ENST00000606426 DHRS1Q96LJ7 313 aa6.69□□□□□ -1.34
CUX2P1-201ENST00000606426 PSD2Q9BQI7 771 aa6.69□□□□□ -1.34
CUX2P1-201ENST00000606426 PRSS27Q9BQR3 290 aa6.69□□□□□ -1.34
CUX2P1-201ENST00000606426 PTDSS2Q9BVG9 487 aa6.69□□□□□ -1.34
CUX2P1-201ENST00000606426 CHID1Q9BWS9 393 aa6.69□□□□□ -1.34
CUX2P1-201ENST00000606426 REEP1Q9H902 201 aa6.69□□□□□ -1.34
CUX2P1-201ENST00000606426 CHST11Q9NPF2 352 aa6.69□□□□□ -1.34
CUX2P1-201ENST00000606426 CCM2LQ9NUG4 571 aaPredicted RBP6.69□□□□□ -1.34
CUX2P1-201ENST00000606426 PARPBPQ9NWS1 579 aa6.69□□□□□ -1.34
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 33.9 ms