RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000560702.1

MEIS2-220, Transcript of Meis homeobox 2, humanhuman

TSL 5

Gene MEIS2, Length 3,230 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MEIS2-220ENST00000560702 ST8SIA4Q92187 359 aa6.3□□□□□ -1.4
MEIS2-220ENST00000560702 TSACCQ96A04 125 aaPredicted RBP6.3□□□□□ -1.4
MEIS2-220ENST00000560702 RASD2Q96D21 266 aa6.3□□□□□ -1.4
MEIS2-220ENST00000560702 SEC22AQ96IW7 307 aa6.3□□□□□ -1.4
MEIS2-220ENST00000560702 LRRC3BQ96PB8 259 aa6.3□□□□□ -1.4
MEIS2-220ENST00000560702 OR1F2PQ96R84 312 aa6.3□□□□□ -1.4
MEIS2-220ENST00000560702 GDF15Q99988 308 aa6.3□□□□□ -1.4
MEIS2-220ENST00000560702 CCDC3Q9BQI4 270 aa6.3□□□□□ -1.4
MEIS2-220ENST00000560702 IGFLR1Q9H665 355 aa6.3□□□□□ -1.4
MEIS2-220ENST00000560702 APOBEC3BQ9UH17 382 aaKnown RBP6.3□□□□□ -1.4
MEIS2-220ENST00000560702 IGKV1-8A0A0C4DH67 115 aa6.29□□□□□ -1.4
MEIS2-220ENST00000560702 GXYLT2A0PJZ3 443 aa6.29□□□□□ -1.4
MEIS2-220ENST00000560702 TRAPPC13A5PLN9 417 aa6.29□□□□□ -1.4
MEIS2-220ENST00000560702 DUXAA6NLW8 204 aa6.29□□□□□ -1.4
MEIS2-220ENST00000560702 C1QTNF3-AMACRE9PGA6 284 aa6.29□□□□□ -1.4
MEIS2-220ENST00000560702 SHOXO15266 292 aa6.29□□□□□ -1.4
MEIS2-220ENST00000560702 IFNGP01579 166 aa6.29□□□□□ -1.4
MEIS2-220ENST00000560702 TPOP07202 933 aa6.29□□□□□ -1.4
MEIS2-220ENST00000560702 TMIGD3P0DMS9 266 aaPredicted RBP6.29□□□□□ -1.4
MEIS2-220ENST00000560702 DRD2P14416 443 aa6.29□□□□□ -1.4
MEIS2-220ENST00000560702 HIST1H1CP16403 213 aaKnown RBP6.29□□□□□ -1.4
MEIS2-220ENST00000560702 TYRP1P17643 537 aa6.29□□□□□ -1.4
MEIS2-220ENST00000560702 PSMB1P20618 241 aaKnown RBP6.29□□□□□ -1.4
MEIS2-220ENST00000560702 FPR3P25089 353 aa6.29□□□□□ -1.4
MEIS2-220ENST00000560702 C19orf57Q0VDD7 668 aa6.29□□□□□ -1.4
MEIS2-220ENST00000560702 CAMK2DQ13557 499 aa6.29□□□□□ -1.4
MEIS2-220ENST00000560702 LINC00303Q3SY05 128 aa6.29□□□□□ -1.4
MEIS2-220ENST00000560702 ABHD17CQ6PCB6 329 aa6.29□□□□□ -1.4
MEIS2-220ENST00000560702 ENPP7Q6UWV6 458 aa6.29□□□□□ -1.4
MEIS2-220ENST00000560702 DBX2Q6ZNG2 339 aa6.29□□□□□ -1.4
MEIS2-220ENST00000560702 ZNF627Q7L945 461 aa6.29□□□□□ -1.4
MEIS2-220ENST00000560702 OR4K14Q8NGD5 310 aa6.29□□□□□ -1.4
MEIS2-220ENST00000560702 OR52N1Q8NH53 320 aa6.29□□□□□ -1.4
MEIS2-220ENST00000560702 CCL4L1Q8NHW4 92 aa6.29□□□□□ -1.4
MEIS2-220ENST00000560702 TSEN15Q8WW01 171 aaKnown RBP6.29□□□□□ -1.4
MEIS2-220ENST00000560702 CNOT9Q92600 299 aaKnown RBP6.29□□□□□ -1.4
MEIS2-220ENST00000560702 FBXW5Q969U6 566 aa6.29□□□□□ -1.4
MEIS2-220ENST00000560702 MARC2Q969Z3 335 aa6.29□□□□□ -1.4
MEIS2-220ENST00000560702 VOPP1Q96AW1 172 aa6.29□□□□□ -1.4
MEIS2-220ENST00000560702 S100A16Q96FQ6 103 aaKnown RBP6.29□□□□□ -1.4
MEIS2-220ENST00000560702 OR2M2Q96R28 347 aa6.29□□□□□ -1.4
MEIS2-220ENST00000560702 KCNJ15Q99712 375 aa6.29□□□□□ -1.4
MEIS2-220ENST00000560702 LMAN2LQ9H0V9 348 aa6.29□□□□□ -1.4
MEIS2-220ENST00000560702 IL21RQ9HBE5 538 aa6.29□□□□□ -1.4
MEIS2-220ENST00000560702 ASB6Q9NWX5 421 aa6.29□□□□□ -1.4
MEIS2-220ENST00000560702 CLDND1Q9NY35 253 aa6.29□□□□□ -1.4
MEIS2-220ENST00000560702 SLCO1C1Q9NYB5 712 aa6.29□□□□□ -1.4
MEIS2-220ENST00000560702 CALML5Q9NZT1 146 aa6.29□□□□□ -1.4
MEIS2-220ENST00000560702 SERGEFQ9UGK8 458 aa6.29□□□□□ -1.4
MEIS2-220ENST00000560702 PHF11Q9UIL8 331 aa6.29□□□□□ -1.4
MEIS2-220ENST00000560702 NUP50Q9UKX7 468 aa6.29□□□□□ -1.4
MEIS2-220ENST00000560702 WDFY3Q8IZQ1 3526 aa6.29□□□□□ -1.4
MEIS2-220ENST00000560702 NOTCH4Q99466 2003 aa6.29□□□□□ -1.4
MEIS2-220ENST00000560702 TMEM72A0PK05 275 aa6.29□□□□□ -1.4
MEIS2-220ENST00000560702 E9PQ18 207 aa6.29□□□□□ -1.4
MEIS2-220ENST00000560702 C11orf98E9PRG8 122 aa6.29□□□□□ -1.4
MEIS2-220ENST00000560702 H0Y8X5 98 aa6.29□□□□□ -1.4
MEIS2-220ENST00000560702 TRIM3O75382 744 aaPredicted RBP6.29□□□□□ -1.4
MEIS2-220ENST00000560702 RP2O75695 350 aa6.29□□□□□ -1.4
MEIS2-220ENST00000560702 KRT33AO76009 404 aa6.29□□□□□ -1.4
MEIS2-220ENST00000560702 ZIC2O95409 532 aaPredicted RBP6.29□□□□□ -1.4
MEIS2-220ENST00000560702 GPANK1O95872 356 aa6.29□□□□□ -1.4
MEIS2-220ENST00000560702 PLGP00747 810 aaPredicted RBP6.29□□□□□ -1.4
MEIS2-220ENST00000560702 IFNA16P05015 189 aa6.29□□□□□ -1.4
MEIS2-220ENST00000560702 EPXP11678 715 aa6.29□□□□□ -1.4
MEIS2-220ENST00000560702 ZNF35P13682 527 aa6.29□□□□□ -1.4
MEIS2-220ENST00000560702 GTF2F2P13984 249 aa6.29□□□□□ -1.4
MEIS2-220ENST00000560702 CMPK1P30085 196 aa6.29□□□□□ -1.4
MEIS2-220ENST00000560702 BTCP35070 178 aa6.29□□□□□ -1.4
MEIS2-220ENST00000560702 GAS1P54826 345 aa6.29□□□□□ -1.4
MEIS2-220ENST00000560702 SORDQ00796 357 aa6.29□□□□□ -1.4
MEIS2-220ENST00000560702 GAS6Q14393 721 aa6.29□□□□□ -1.4
MEIS2-220ENST00000560702 ELAVL3Q14576 367 aaKnown RBP6.29□□□□□ -1.4
MEIS2-220ENST00000560702 MLF2Q15773 248 aaPredicted RBP6.29□□□□□ -1.4
MEIS2-220ENST00000560702 NKPD1Q17RQ9 610 aa6.29□□□□□ -1.4
MEIS2-220ENST00000560702 COL28A1Q2UY09 1125 aa6.29□□□□□ -1.4
MEIS2-220ENST00000560702 SLC36A2Q495M3 483 aa6.29□□□□□ -1.4
MEIS2-220ENST00000560702 SLC48A1Q6P1K1 146 aa6.29□□□□□ -1.4
MEIS2-220ENST00000560702 LRRN1Q6UXK5 716 aa6.29□□□□□ -1.4
MEIS2-220ENST00000560702 TRILQ7L0X0 811 aa6.29□□□□□ -1.4
MEIS2-220ENST00000560702 FAM219AQ8IW50 185 aa6.29□□□□□ -1.4
MEIS2-220ENST00000560702 CDH26Q8IXH8 852 aa6.29□□□□□ -1.4
MEIS2-220ENST00000560702 LRRC56Q8IYG6 542 aaPredicted RBP6.29□□□□□ -1.4
MEIS2-220ENST00000560702 PRSS58Q8IYP2 241 aa6.29□□□□□ -1.4
MEIS2-220ENST00000560702 OR2L5Q8NG80 312 aa6.29□□□□□ -1.4
MEIS2-220ENST00000560702 OR4N2Q8NGD1 307 aa6.29□□□□□ -1.4
MEIS2-220ENST00000560702 OR6M1Q8NGM8 313 aa6.29□□□□□ -1.4
MEIS2-220ENST00000560702 OR56B4Q8NH76 319 aa6.29□□□□□ -1.4
MEIS2-220ENST00000560702 PATE1Q8WXA2 126 aa6.29□□□□□ -1.4
MEIS2-220ENST00000560702 ADAMTS14Q8WXS8 1223 aa6.29□□□□□ -1.4
MEIS2-220ENST00000560702 ADAD1Q96M93 576 aaKnown RBP6.29□□□□□ -1.4
MEIS2-220ENST00000560702 TMEM168Q9H0V1 697 aa6.29□□□□□ -1.4
MEIS2-220ENST00000560702 SRMSQ9H3Y6 488 aa6.29□□□□□ -1.4
MEIS2-220ENST00000560702 EXO5Q9H790 373 aa6.29□□□□□ -1.4
MEIS2-220ENST00000560702 TMEM185BQ9H7F4 350 aa6.29□□□□□ -1.4
MEIS2-220ENST00000560702 MTHFD2LQ9H903 347 aaPredicted RBP6.29□□□□□ -1.4
MEIS2-220ENST00000560702 PPP1R14DQ9NXH3 145 aa6.29□□□□□ -1.4
MEIS2-220ENST00000560702 TAS2R3Q9NYW6 316 aa6.29□□□□□ -1.4
MEIS2-220ENST00000560702 SCP2D1Q9UJQ7 156 aa6.29□□□□□ -1.4
MEIS2-220ENST00000560702 PLEKHA6Q9Y2H5 1048 aa6.29□□□□□ -1.4
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 36.9 ms