RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000557464.5

RBM23-230, Transcript of RNA binding motif protein 23, human

TSL 5

Gene RBM23, Length 457 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RBM23-230	ENST00000557464	CNOT4	O95628	575 aa	Known RBP	10.79	□□□□□ -0.68
RBM23-230	ENST00000557464	VIM	P08670	466 aa	Known RBP	10.79	□□□□□ -0.68
RBM23-230	ENST00000557464	GGT1	P19440	569 aa		10.79	□□□□□ -0.68
RBM23-230	ENST00000557464	P2RY4	P51582	365 aa		10.79	□□□□□ -0.68
RBM23-230	ENST00000557464	ARFIP2	P53365	341 aa		10.79	□□□□□ -0.68
RBM23-230	ENST00000557464	NR1H2	P55055	460 aa		10.79	□□□□□ -0.68
RBM23-230	ENST00000557464	NKX6-1	P78426	367 aa	Predicted RBP	10.79	□□□□□ -0.68
RBM23-230	ENST00000557464	CASP12	Q6UXS9	341 aa		10.79	□□□□□ -0.68
RBM23-230	ENST00000557464	P3H2	Q8IVL5	708 aa		10.79	□□□□□ -0.68
RBM23-230	ENST00000557464	LSMEM1	Q8N8F7	131 aa		10.79	□□□□□ -0.68
RBM23-230	ENST00000557464	SMYD1	Q8NB12	490 aa		10.79	□□□□□ -0.68
RBM23-230	ENST00000557464	HIPK4	Q8NE63	616 aa		10.79	□□□□□ -0.68
RBM23-230	ENST00000557464	OR9K2	Q8NGE7	335 aa		10.79	□□□□□ -0.68
RBM23-230	ENST00000557464	STK35	Q8TDR2	534 aa		10.79	□□□□□ -0.68
RBM23-230	ENST00000557464	NEUROG1	Q92886	237 aa		10.79	□□□□□ -0.68
RBM23-230	ENST00000557464	ZDHHC16	Q969W1	377 aa		10.79	□□□□□ -0.68
RBM23-230	ENST00000557464	SLC25A36	Q96CQ1	311 aa		10.79	□□□□□ -0.68
RBM23-230	ENST00000557464	KTI12	Q96EK9	354 aa	Predicted RBP	10.79	□□□□□ -0.68
RBM23-230	ENST00000557464	ZNF385A	Q96PM9	386 aa	Known RBP	10.79	□□□□□ -0.68
RBM23-230	ENST00000557464	ZNF607	Q96SK3	696 aa		10.79	□□□□□ -0.68
RBM23-230	ENST00000557464	CCL19	Q99731	98 aa		10.79	□□□□□ -0.68
RBM23-230	ENST00000557464	PTDSS2	Q9BVG9	487 aa		10.79	□□□□□ -0.68
RBM23-230	ENST00000557464	TAPBPL	Q9BX59	468 aa		10.79	□□□□□ -0.68
RBM23-230	ENST00000557464	PIF1	Q9H611	641 aa		10.79	□□□□□ -0.68
RBM23-230	ENST00000557464	SLC7A10	Q9NS82	523 aa		10.79	□□□□□ -0.68
RBM23-230	ENST00000557464	RPS6KB2	Q9UBS0	482 aa		10.79	□□□□□ -0.68
RBM23-230	ENST00000557464	MTOR	P42345	2549 aa		10.79	□□□□□ -0.68
RBM23-230	ENST00000557464		A0A1W2PR80	420 aa		10.78	□□□□□ -0.68
RBM23-230	ENST00000557464	CIB4	A0PJX0	185 aa		10.78	□□□□□ -0.68
RBM23-230	ENST00000557464	OR5H1	A6NKK0	313 aa		10.78	□□□□□ -0.68
RBM23-230	ENST00000557464	ELOA3D	A6NLF2	546 aa	Predicted RBP	10.78	□□□□□ -0.68
RBM23-230	ENST00000557464	CCT8L1P	A6NM43	557 aa		10.78	□□□□□ -0.68
RBM23-230	ENST00000557464	FTCDNL1	E5RQL4	147 aa		10.78	□□□□□ -0.68
RBM23-230	ENST00000557464		M0QX08	132 aa		10.78	□□□□□ -0.68
RBM23-230	ENST00000557464	CLOCK	O15516	846 aa		10.78	□□□□□ -0.68
RBM23-230	ENST00000557464	SERPINB7	O75635	380 aa		10.78	□□□□□ -0.68
RBM23-230	ENST00000557464	AHSA1	O95433	338 aa		10.78	□□□□□ -0.68
RBM23-230	ENST00000557464	OPN1SW	P03999	348 aa		10.78	□□□□□ -0.68
RBM23-230	ENST00000557464	ITGA5	P08648	1049 aa		10.78	□□□□□ -0.68
RBM23-230	ENST00000557464	TROVE2	P10155	538 aa	Known RBP eCLIP	10.78	□□□□□ -0.68
RBM23-230	ENST00000557464	RPS5	P46782	204 aa	Known RBP	10.78	□□□□□ -0.68
RBM23-230	ENST00000557464	PCBP3	P57721	371 aa	Known RBP	10.78	□□□□□ -0.68
RBM23-230	ENST00000557464	KLF10	Q13118	480 aa		10.78	□□□□□ -0.68
RBM23-230	ENST00000557464	PPA1	Q15181	289 aa		10.78	□□□□□ -0.68
RBM23-230	ENST00000557464	GABRA6	Q16445	453 aa		10.78	□□□□□ -0.68
RBM23-230	ENST00000557464	DUSP7	Q16829	419 aa		10.78	□□□□□ -0.68
RBM23-230	ENST00000557464	CYP51A1	Q16850	503 aa		10.78	□□□□□ -0.68
RBM23-230	ENST00000557464	ELOA3B	Q3SY89	546 aa		10.78	□□□□□ -0.68
RBM23-230	ENST00000557464	TIMM23B	Q5SRD1	257 aa		10.78	□□□□□ -0.68
RBM23-230	ENST00000557464	TSPO2	Q5TGU0	170 aa		10.78	□□□□□ -0.68
RBM23-230	ENST00000557464	C9orf135	Q5VTT2	229 aa		10.78	□□□□□ -0.68
RBM23-230	ENST00000557464	TMEM225	Q6GV28	225 aa		10.78	□□□□□ -0.68
RBM23-230	ENST00000557464	C20orf204	Q6ZNR8	217 aa		10.78	□□□□□ -0.68
RBM23-230	ENST00000557464	GPAT4	Q86UL3	456 aa		10.78	□□□□□ -0.68
RBM23-230	ENST00000557464	ARMC8	Q8IUR7	673 aa		10.78	□□□□□ -0.68
RBM23-230	ENST00000557464	KDM8	Q8N371	416 aa		10.78	□□□□□ -0.68
RBM23-230	ENST00000557464	C11orf65	Q8NCR3	313 aa		10.78	□□□□□ -0.68
RBM23-230	ENST00000557464	ELOA3	Q8NG57	546 aa		10.78	□□□□□ -0.68
RBM23-230	ENST00000557464	OR10A6	Q8NH74	314 aa		10.78	□□□□□ -0.68
RBM23-230	ENST00000557464	MFSD8	Q8NHS3	518 aa		10.78	□□□□□ -0.68
RBM23-230	ENST00000557464	IGFBPL1	Q8WX77	278 aa		10.78	□□□□□ -0.68
RBM23-230	ENST00000557464	AKAP1	Q92667	903 aa	Known RBP eCLIP	10.78	□□□□□ -0.68
RBM23-230	ENST00000557464	PIGT	Q969N2	578 aa		10.78	□□□□□ -0.68
RBM23-230	ENST00000557464	TAAR8	Q969N4	342 aa		10.78	□□□□□ -0.68
RBM23-230	ENST00000557464	MUCL1	Q96DR8	90 aa		10.78	□□□□□ -0.68
RBM23-230	ENST00000557464	PIP5K1A	Q99755	562 aa		10.78	□□□□□ -0.68
RBM23-230	ENST00000557464	USB1	Q9BQ65	265 aa	Known RBP	10.78	□□□□□ -0.68
RBM23-230	ENST00000557464	SF3B5	Q9BWJ5	86 aa	Known RBP	10.78	□□□□□ -0.68
RBM23-230	ENST00000557464	TRIM2	Q9C040	744 aa		10.78	□□□□□ -0.68
RBM23-230	ENST00000557464	ESRP2	Q9H6T0	727 aa	Known RBP	10.78	□□□□□ -0.68
RBM23-230	ENST00000557464	KAT8	Q9H7Z6	458 aa	Known RBP	10.78	□□□□□ -0.68
RBM23-230	ENST00000557464	NGB	Q9NPG2	151 aa		10.78	□□□□□ -0.68
RBM23-230	ENST00000557464	SAR1A	Q9NR31	198 aa		10.78	□□□□□ -0.68
RBM23-230	ENST00000557464	PARPBP	Q9NWS1	579 aa		10.78	□□□□□ -0.68
RBM23-230	ENST00000557464	ASB6	Q9NWX5	421 aa		10.78	□□□□□ -0.68
RBM23-230	ENST00000557464	NPAP1	Q9NZP6	1156 aa		10.78	□□□□□ -0.68
RBM23-230	ENST00000557464	SEC14L4	Q9UDX3	406 aa		10.78	□□□□□ -0.68
RBM23-230	ENST00000557464	MALT1	Q9UDY8	824 aa		10.78	□□□□□ -0.68
RBM23-230	ENST00000557464	ANGPT4	Q9Y264	503 aa		10.78	□□□□□ -0.68
RBM23-230	ENST00000557464	SLC9A8	Q9Y2E8	581 aa		10.78	□□□□□ -0.68
RBM23-230	ENST00000557464	RNF115	Q9Y4L5	304 aa		10.78	□□□□□ -0.68
RBM23-230	ENST00000557464	USF3	Q68DE3	2245 aa		10.78	□□□□□ -0.68
RBM23-230	ENST00000557464	FLNA	P21333	2647 aa	Known RBP	10.78	□□□□□ -0.68
RBM23-230	ENST00000557464	IGKV1D-42	A0A075B6H8	117 aa		10.77	□□□□□ -0.69
RBM23-230	ENST00000557464	PRORSD1P	A6NEY8	169 aa		10.77	□□□□□ -0.69
RBM23-230	ENST00000557464	PDLIM1	O00151	329 aa		10.77	□□□□□ -0.69
RBM23-230	ENST00000557464	HS3ST1	O14792	307 aa		10.77	□□□□□ -0.69
RBM23-230	ENST00000557464	SMPD2	O60906	423 aa		10.77	□□□□□ -0.69
RBM23-230	ENST00000557464	CD3E	P07766	207 aa		10.77	□□□□□ -0.69
RBM23-230	ENST00000557464	PNMT	P11086	282 aa		10.77	□□□□□ -0.69
RBM23-230	ENST00000557464	GZMM	P51124	257 aa		10.77	□□□□□ -0.69
RBM23-230	ENST00000557464	RGS8	P57771	180 aa	Predicted RBP	10.77	□□□□□ -0.69
RBM23-230	ENST00000557464	BSPH1	Q075Z2	132 aa		10.77	□□□□□ -0.69
RBM23-230	ENST00000557464	RBBP4	Q09028	425 aa		10.77	□□□□□ -0.69
RBM23-230	ENST00000557464	OR1Q1	Q15612	314 aa		10.77	□□□□□ -0.69
RBM23-230	ENST00000557464	RABL3	Q5HYI8	236 aa		10.77	□□□□□ -0.69
RBM23-230	ENST00000557464	ALG10B	Q5I7T1	473 aa		10.77	□□□□□ -0.69
RBM23-230	ENST00000557464	NANOGP8	Q6NSW7	305 aa		10.77	□□□□□ -0.69
RBM23-230	ENST00000557464	C6orf89	Q6UWU4	347 aa		10.77	□□□□□ -0.69
RBM23-230	ENST00000557464	CREB3L2	Q70SY1	520 aa		10.77	□□□□□ -0.69

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