RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000534626.6

RECQL4-208, Transcript of RecQ like helicase 4, humanhuman

TSL 5

Gene RECQL4, Length 1,165 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RECQL4-208ENST00000534626 WDR31Q8NA23 367 aa14.65□□□□□ -0.06
RECQL4-208ENST00000534626 PNPT1Q8TCS8 783 aaKnown RBP14.65□□□□□ -0.06
RECQL4-208ENST00000534626 PROX1Q92786 737 aa14.65□□□□□ -0.06
RECQL4-208ENST00000534626 KCNK17Q96T54 332 aa14.65□□□□□ -0.06
RECQL4-208ENST00000534626 MOV10Q9HCE1 1003 aaKnown RBP14.65□□□□□ -0.06
RECQL4-208ENST00000534626 PNPOQ9NVS9 261 aa14.65□□□□□ -0.06
RECQL4-208ENST00000534626 MXRA5Q9NR99 2828 aa14.65□□□□□ -0.06
RECQL4-208ENST00000534626 A0A096LPI6 279 aa14.64□□□□□ -0.07
RECQL4-208ENST00000534626 ZC3H12DA2A288 527 aaKnown RBP14.64□□□□□ -0.07
RECQL4-208ENST00000534626 LIPT2A6NK58 231 aa14.64□□□□□ -0.07
RECQL4-208ENST00000534626 AQP7P3A6NL99 342 aa14.64□□□□□ -0.07
RECQL4-208ENST00000534626 A8MVM7 634 aa14.64□□□□□ -0.07
RECQL4-208ENST00000534626 ZNF587BE7ETH6 402 aa14.64□□□□□ -0.07
RECQL4-208ENST00000534626 ATP6V1G2-DDX39BF2Z307 99 aa14.64□□□□□ -0.07
RECQL4-208ENST00000534626 AKR7A3O95154 331 aa14.64□□□□□ -0.07
RECQL4-208ENST00000534626 VAMP5O95183 116 aa14.64□□□□□ -0.07
RECQL4-208ENST00000534626 ANP32DO95626 131 aa14.64□□□□□ -0.07
RECQL4-208ENST00000534626 IL6P05231 212 aa14.64□□□□□ -0.07
RECQL4-208ENST00000534626 GSNP06396 782 aa14.64□□□□□ -0.07
RECQL4-208ENST00000534626 ALDOCP09972 364 aaKnown RBP14.64□□□□□ -0.07
RECQL4-208ENST00000534626 FAM157CP0CG43 387 aa14.64□□□□□ -0.07
RECQL4-208ENST00000534626 CDH2P19022 906 aaPredicted RBP14.64□□□□□ -0.07
RECQL4-208ENST00000534626 NCF2P19878 526 aaPredicted RBP14.64□□□□□ -0.07
RECQL4-208ENST00000534626 CRISP3P54108 245 aa14.64□□□□□ -0.07
RECQL4-208ENST00000534626 FOXG1P55316 489 aaPredicted RBP14.64□□□□□ -0.07
RECQL4-208ENST00000534626 SNRPD2P62316 118 aaKnown RBP14.64□□□□□ -0.07
RECQL4-208ENST00000534626 BST1Q10588 318 aa14.64□□□□□ -0.07
RECQL4-208ENST00000534626 CEACAM7Q14002 265 aa14.64□□□□□ -0.07
RECQL4-208ENST00000534626 CYB5R2Q6BCY4 276 aa14.64□□□□□ -0.07
RECQL4-208ENST00000534626 WBP2NLQ6ICG8 309 aa14.64□□□□□ -0.07
RECQL4-208ENST00000534626 CADM2Q8N3J6 435 aa14.64□□□□□ -0.07
RECQL4-208ENST00000534626 TMEM99Q8N816 258 aa14.64□□□□□ -0.07
RECQL4-208ENST00000534626 OR52P1PQ8NH57 321 aa14.64□□□□□ -0.07
RECQL4-208ENST00000534626 TEX37Q96LM6 180 aa14.64□□□□□ -0.07
RECQL4-208ENST00000534626 ADAM19Q9H013 955 aa14.64□□□□□ -0.07
RECQL4-208ENST00000534626 RMND5AQ9H871 391 aa14.64□□□□□ -0.07
RECQL4-208ENST00000534626 MANSC1Q9H8J5 431 aa14.64□□□□□ -0.07
RECQL4-208ENST00000534626 TMEM45AQ9NWC5 275 aa14.64□□□□□ -0.07
RECQL4-208ENST00000534626 TMEM160Q9NX00 188 aa14.64□□□□□ -0.07
RECQL4-208ENST00000534626 THUMPD1Q9NXG2 353 aaKnown RBP14.64□□□□□ -0.07
RECQL4-208ENST00000534626 ZNF232Q9UNY5 417 aa14.64□□□□□ -0.07
RECQL4-208ENST00000534626 DNHD1Q96M86 4753 aa14.64□□□□□ -0.07
RECQL4-208ENST00000534626 CDHR4A6H8M9 788 aa14.63□□□□□ -0.07
RECQL4-208ENST00000534626 SLCO1B7G3V0H7 640 aa14.63□□□□□ -0.07
RECQL4-208ENST00000534626 SDHDO14521 159 aa14.63□□□□□ -0.07
RECQL4-208ENST00000534626 HDAC3O15379 428 aa14.63□□□□□ -0.07
RECQL4-208ENST00000534626 GPRIN2O60269 458 aa14.63□□□□□ -0.07
RECQL4-208ENST00000534626 IDO1P14902 403 aa14.63□□□□□ -0.07
RECQL4-208ENST00000534626 USF1P22415 310 aaPredicted RBP14.63□□□□□ -0.07
RECQL4-208ENST00000534626 CDKN2CP42773 168 aa14.63□□□□□ -0.07
RECQL4-208ENST00000534626 CRATP43155 626 aa14.63□□□□□ -0.07
RECQL4-208ENST00000534626 UBE2NP61088 152 aaKnown RBP14.63□□□□□ -0.07
RECQL4-208ENST00000534626 COX20Q5RI15 118 aa14.63□□□□□ -0.07
RECQL4-208ENST00000534626 CEP85LQ5SZL2 805 aa14.63□□□□□ -0.07
RECQL4-208ENST00000534626 NXNQ6DKJ4 435 aa14.63□□□□□ -0.07
RECQL4-208ENST00000534626 C10orf105Q8TEF2 133 aa14.63□□□□□ -0.07
RECQL4-208ENST00000534626 HTRA1Q92743 480 aa14.63□□□□□ -0.07
RECQL4-208ENST00000534626 BEX2Q9BXY8 128 aa14.63□□□□□ -0.07
RECQL4-208ENST00000534626 ADPRHL2Q9NX46 363 aa14.63□□□□□ -0.07
RECQL4-208ENST00000534626 GPR45Q9Y5Y3 372 aa14.63□□□□□ -0.07
RECQL4-208ENST00000534626 STAB1Q9NY15 2570 aa14.63□□□□□ -0.07
RECQL4-208ENST00000534626 A0A096LNT2 108 aa14.62□□□□□ -0.07
RECQL4-208ENST00000534626 SLC22A3O75751 556 aa14.62□□□□□ -0.07
RECQL4-208ENST00000534626 F12P00748 615 aaPredicted RBP14.62□□□□□ -0.07
RECQL4-208ENST00000534626 CRYAAP02489 173 aa14.62□□□□□ -0.07
RECQL4-208ENST00000534626 GTF2E2P29084 291 aaKnown RBP14.62□□□□□ -0.07
RECQL4-208ENST00000534626 GZMKP49863 264 aa14.62□□□□□ -0.07
RECQL4-208ENST00000534626 PDLIM4P50479 330 aa14.62□□□□□ -0.07
RECQL4-208ENST00000534626 DSTNP60981 165 aa14.62□□□□□ -0.07
RECQL4-208ENST00000534626 RNF220Q5VTB9 566 aa14.62□□□□□ -0.07
RECQL4-208ENST00000534626 PRAMEF8Q5VWM4 474 aa14.62□□□□□ -0.07
RECQL4-208ENST00000534626 PRAMEF7Q5VXH5 474 aa14.62□□□□□ -0.07
RECQL4-208ENST00000534626 ZNF836Q6ZNA1 936 aa14.62□□□□□ -0.07
RECQL4-208ENST00000534626 FBXO17Q96EF6 278 aa14.62□□□□□ -0.07
RECQL4-208ENST00000534626 AURKBQ96GD4 344 aaPredicted RBP14.62□□□□□ -0.07
RECQL4-208ENST00000534626 BOD1Q96IK1 185 aa14.62□□□□□ -0.07
RECQL4-208ENST00000534626 ZNF317Q96PQ6 595 aaPredicted RBP14.62□□□□□ -0.07
RECQL4-208ENST00000534626 PIMREGQ9BSJ6 248 aa14.62□□□□□ -0.07
RECQL4-208ENST00000534626 SHARPINQ9H0F6 387 aa14.62□□□□□ -0.07
RECQL4-208ENST00000534626 MYOZ1Q9NP98 299 aaPredicted RBP14.62□□□□□ -0.07
RECQL4-208ENST00000534626 THAP1Q9NVV9 213 aa14.62□□□□□ -0.07
RECQL4-208ENST00000534626 RLIMQ9NVW2 624 aa14.62□□□□□ -0.07
RECQL4-208ENST00000534626 FBXO9Q9UK97 447 aaPredicted RBP14.62□□□□□ -0.07
RECQL4-208ENST00000534626 MOKQ9UQ07 419 aa14.62□□□□□ -0.07
RECQL4-208ENST00000534626 RASD1Q9Y272 281 aa14.62□□□□□ -0.07
RECQL4-208ENST00000534626 ZNF443Q9Y2A4 671 aaPredicted RBP14.62□□□□□ -0.07
RECQL4-208ENST00000534626 NDUFS8O00217 210 aa14.61□□□□□ -0.07
RECQL4-208ENST00000534626 AHSA1O95433 338 aa14.61□□□□□ -0.07
RECQL4-208ENST00000534626 BCHEP06276 602 aa14.61□□□□□ -0.07
RECQL4-208ENST00000534626 GKN3PP0CG01 181 aa14.61□□□□□ -0.07
RECQL4-208ENST00000534626 EPHA3P29320 983 aa14.61□□□□□ -0.07
RECQL4-208ENST00000534626 IL12AP29459 219 aa14.61□□□□□ -0.07
RECQL4-208ENST00000534626 SH3BGRP55822 239 aaPredicted RBP14.61□□□□□ -0.07
RECQL4-208ENST00000534626 LSM11P83369 360 aaKnown RBP eCLIP14.61□□□□□ -0.073e-7■■■□□ 14.8
RECQL4-208ENST00000534626 SLC25A3Q00325 362 aa14.61□□□□□ -0.07
RECQL4-208ENST00000534626 PDCD4Q53EL6 469 aaKnown RBP14.61□□□□□ -0.07
RECQL4-208ENST00000534626 HIKESHIQ53FT3 197 aa14.61□□□□□ -0.07
RECQL4-208ENST00000534626 C1orf140Q5VVS0 124 aa14.61□□□□□ -0.07
RECQL4-208ENST00000534626 ATG16L1Q676U5 607 aa14.61□□□□□ -0.07
RECQL4-208ENST00000534626 MSANTD1Q6ZTZ1 278 aa14.61□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 42.7 ms