RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000533677.1

PAFAH1B2-208, Transcript of platelet activating factor acetylhydrolase 1b catalytic subunit 2, humanhuman

TSL 3

Gene PAFAH1B2, Length 756 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PAFAH1B2-208ENST00000533677 SRPX2O60687 465 aaPredicted RBP6.46□□□□□ -1.38
PAFAH1B2-208ENST00000533677 MT-ND3P03897 115 aa6.46□□□□□ -1.38
PAFAH1B2-208ENST00000533677 OTX2P32243 289 aa6.46□□□□□ -1.38
PAFAH1B2-208ENST00000533677 CDH11P55287 796 aa6.46□□□□□ -1.38
PAFAH1B2-208ENST00000533677 TPD52P55327 224 aaPredicted RBP6.46□□□□□ -1.38
PAFAH1B2-208ENST00000533677 CX3CL1P78423 397 aa6.46□□□□□ -1.38
PAFAH1B2-208ENST00000533677 DCDP81605 110 aaKnown RBP6.46□□□□□ -1.38
PAFAH1B2-208ENST00000533677 IRF8Q02556 426 aa6.46□□□□□ -1.38
PAFAH1B2-208ENST00000533677 KLC1Q07866 573 aa6.46□□□□□ -1.38
PAFAH1B2-208ENST00000533677 IFFO1Q0D2I5 559 aa6.46□□□□□ -1.38
PAFAH1B2-208ENST00000533677 LY6DQ14210 128 aa6.46□□□□□ -1.38
PAFAH1B2-208ENST00000533677 RASA2Q15283 850 aa6.46□□□□□ -1.38
PAFAH1B2-208ENST00000533677 DEFB109BQ30KR1 87 aa6.46□□□□□ -1.38
PAFAH1B2-208ENST00000533677 TCTE1Q5JU00 501 aa6.46□□□□□ -1.38
PAFAH1B2-208ENST00000533677 CEP85LQ5SZL2 805 aa6.46□□□□□ -1.38
PAFAH1B2-208ENST00000533677 TMIGD1Q6UXZ0 262 aa6.46□□□□□ -1.38
PAFAH1B2-208ENST00000533677 ZYG11AQ6WRX3 759 aa6.46□□□□□ -1.38
PAFAH1B2-208ENST00000533677 SYVN1Q86TM6 617 aa6.46□□□□□ -1.38
PAFAH1B2-208ENST00000533677 C10orf107Q8IVU9 208 aa6.46□□□□□ -1.38
PAFAH1B2-208ENST00000533677 POMGNT2Q8NAT1 580 aa6.46□□□□□ -1.38
PAFAH1B2-208ENST00000533677 POGLUT1Q8NBL1 392 aa6.46□□□□□ -1.38
PAFAH1B2-208ENST00000533677 OR7G3Q8NG95 312 aa6.46□□□□□ -1.38
PAFAH1B2-208ENST00000533677 NT5CQ8TCD5 201 aa6.46□□□□□ -1.38
PAFAH1B2-208ENST00000533677 SNRNP27Q8WVK2 155 aaKnown RBP6.46□□□□□ -1.38
PAFAH1B2-208ENST00000533677 TSLPQ969D9 159 aa6.46□□□□□ -1.38
PAFAH1B2-208ENST00000533677 RERGQ96A58 199 aaPredicted RBP6.46□□□□□ -1.38
PAFAH1B2-208ENST00000533677 MS4A6EQ96DS6 147 aa6.46□□□□□ -1.38
PAFAH1B2-208ENST00000533677 FAM111AQ96PZ2 611 aa6.46□□□□□ -1.38
PAFAH1B2-208ENST00000533677 F2RL3Q96RI0 385 aa6.46□□□□□ -1.38
PAFAH1B2-208ENST00000533677 C17orf62Q9BQA9 187 aa6.46□□□□□ -1.38
PAFAH1B2-208ENST00000533677 MRPL57Q9BQC6 102 aaKnown RBP6.46□□□□□ -1.38
PAFAH1B2-208ENST00000533677 AIF1LQ9BQI0 150 aa6.46□□□□□ -1.38
PAFAH1B2-208ENST00000533677 BTBD10Q9BSF8 475 aa6.46□□□□□ -1.38
PAFAH1B2-208ENST00000533677 NLNQ9BYT8 704 aa6.46□□□□□ -1.38
PAFAH1B2-208ENST00000533677 DRC3Q9H069 523 aa6.46□□□□□ -1.38
PAFAH1B2-208ENST00000533677 OR51B5Q9H339 312 aa6.46□□□□□ -1.38
PAFAH1B2-208ENST00000533677 ADPRHL2Q9NX46 363 aa6.46□□□□□ -1.38
PAFAH1B2-208ENST00000533677 OSGIN1Q9UJX0 560 aa6.46□□□□□ -1.38
PAFAH1B2-208ENST00000533677 ANAPC2Q9UJX6 822 aa6.46□□□□□ -1.38
PAFAH1B2-208ENST00000533677 FARSAQ9Y285 508 aaKnown RBP6.46□□□□□ -1.38
PAFAH1B2-208ENST00000533677 IGLV3-12A0A075B6K2 115 aa6.45□□□□□ -1.38
PAFAH1B2-208ENST00000533677 LRIT2A6NDA9 550 aa6.45□□□□□ -1.38
PAFAH1B2-208ENST00000533677 ARGFXA6NJG6 315 aa6.45□□□□□ -1.38
PAFAH1B2-208ENST00000533677 C21orf140B9A014 251 aa6.45□□□□□ -1.38
PAFAH1B2-208ENST00000533677 E9PI62 339 aa6.45□□□□□ -1.38
PAFAH1B2-208ENST00000533677 PLPP1O14494 284 aa6.45□□□□□ -1.38
PAFAH1B2-208ENST00000533677 COPEO14579 308 aa6.45□□□□□ -1.38
PAFAH1B2-208ENST00000533677 ERI3O43414 337 aaKnown RBP6.45□□□□□ -1.38
PAFAH1B2-208ENST00000533677 GALR3O60755 368 aaPredicted RBP6.45□□□□□ -1.38
PAFAH1B2-208ENST00000533677 SMIM24O75264 130 aa6.45□□□□□ -1.38
PAFAH1B2-208ENST00000533677 NSA2O95478 260 aaKnown RBP6.45□□□□□ -1.38
PAFAH1B2-208ENST00000533677 PLGP00747 810 aaPredicted RBP6.45□□□□□ -1.38
PAFAH1B2-208ENST00000533677 GBAP04062 536 aa6.45□□□□□ -1.38
PAFAH1B2-208ENST00000533677 CHRNGP07510 517 aa6.45□□□□□ -1.38
PAFAH1B2-208ENST00000533677 RBP1P09455 135 aa6.45□□□□□ -1.38
PAFAH1B2-208ENST00000533677 SLC35G6P0C7Q6 338 aa6.45□□□□□ -1.38
PAFAH1B2-208ENST00000533677 OR2T7P0C7T2 308 aa6.45□□□□□ -1.38
PAFAH1B2-208ENST00000533677 H2AFXP16104 143 aaPredicted RBP6.45□□□□□ -1.38
PAFAH1B2-208ENST00000533677 TCEA1P23193 301 aaKnown RBP6.45□□□□□ -1.38
PAFAH1B2-208ENST00000533677 PPP2R1BP30154 601 aa6.45□□□□□ -1.38
PAFAH1B2-208ENST00000533677 ALDH3A1P30838 453 aa6.45□□□□□ -1.38
PAFAH1B2-208ENST00000533677 PLA2G16P53816 162 aa6.45□□□□□ -1.38
PAFAH1B2-208ENST00000533677 HERVK_113P63132 956 aa6.45□□□□□ -1.38
PAFAH1B2-208ENST00000533677 RELAQ04206 551 aa6.45□□□□□ -1.38
PAFAH1B2-208ENST00000533677 ILF2Q12905 390 aaKnown RBP6.45□□□□□ -1.38
PAFAH1B2-208ENST00000533677 RAPSNQ13702 412 aa6.45□□□□□ -1.38
PAFAH1B2-208ENST00000533677 CASP8Q14790 479 aa6.45□□□□□ -1.38
PAFAH1B2-208ENST00000533677 RBBP7Q16576 425 aa6.45□□□□□ -1.38
PAFAH1B2-208ENST00000533677 ADPRMQ3LIE5 342 aa6.45□□□□□ -1.38
PAFAH1B2-208ENST00000533677 ZNF628Q5EBL2 1059 aa6.45□□□□□ -1.38
PAFAH1B2-208ENST00000533677 CDKL4Q5MAI5 379 aa6.45□□□□□ -1.38
PAFAH1B2-208ENST00000533677 GFI1BQ5VTD9 330 aa6.45□□□□□ -1.38
PAFAH1B2-208ENST00000533677 CYB5D1Q6P9G0 228 aa6.45□□□□□ -1.38
PAFAH1B2-208ENST00000533677 SCIMPQ6UWF3 145 aa6.45□□□□□ -1.38
PAFAH1B2-208ENST00000533677 CCDC91Q7Z6B0 441 aa6.45□□□□□ -1.38
PAFAH1B2-208ENST00000533677 CA13Q8N1Q1 262 aa6.45□□□□□ -1.38
PAFAH1B2-208ENST00000533677 RIBC1Q8N443 379 aaPredicted RBP6.45□□□□□ -1.38
PAFAH1B2-208ENST00000533677 CAMKVQ8NCB2 501 aa6.45□□□□□ -1.38
PAFAH1B2-208ENST00000533677 TSPAN14Q8NG11 270 aa6.45□□□□□ -1.38
PAFAH1B2-208ENST00000533677 OR2Y1Q8NGV0 311 aa6.45□□□□□ -1.38
PAFAH1B2-208ENST00000533677 TCP10LQ8TDR4 215 aa6.45□□□□□ -1.38
PAFAH1B2-208ENST00000533677 ACMSDQ8TDX5 336 aa6.45□□□□□ -1.38
PAFAH1B2-208ENST00000533677 AGAP11Q8TF27 550 aa6.45□□□□□ -1.38
PAFAH1B2-208ENST00000533677 FBXO17Q96EF6 278 aa6.45□□□□□ -1.38
PAFAH1B2-208ENST00000533677 SENP5Q96HI0 755 aaPredicted RBP6.45□□□□□ -1.38
PAFAH1B2-208ENST00000533677 TMEM109Q9BVC6 243 aa6.45□□□□□ -1.38
PAFAH1B2-208ENST00000533677 ERVK-6Q9BXR3 956 aa6.45□□□□□ -1.38
PAFAH1B2-208ENST00000533677 RHBGQ9H310 441 aa6.45□□□□□ -1.38
PAFAH1B2-208ENST00000533677 CNOT10Q9H9A5 744 aaKnown RBP6.45□□□□□ -1.38
PAFAH1B2-208ENST00000533677 TRPC4Q9UBN4 977 aa6.45□□□□□ -1.38
PAFAH1B2-208ENST00000533677 SHANK1Q9Y566 2161 aa6.45□□□□□ -1.38
PAFAH1B2-208ENST00000533677 COL12A1Q99715 3063 aa6.45□□□□□ -1.38
PAFAH1B2-208ENST00000533677 TENM4Q6N022 2769 aa6.45□□□□□ -1.38
PAFAH1B2-208ENST00000533677 SYNDIG1LA6NDD5 238 aa6.44□□□□□ -1.38
PAFAH1B2-208ENST00000533677 WASHC1A8K0Z3 465 aa6.44□□□□□ -1.38
PAFAH1B2-208ENST00000533677 BLOC1S5-TXNDC5H3BN57 136 aa6.44□□□□□ -1.38
PAFAH1B2-208ENST00000533677 EEDO75530 441 aaKnown RBP6.44□□□□□ -1.38
PAFAH1B2-208ENST00000533677 LYPLA1O75608 230 aaPredicted RBP6.44□□□□□ -1.38
PAFAH1B2-208ENST00000533677 SUPT7LO94864 414 aa6.44□□□□□ -1.38
PAFAH1B2-208ENST00000533677 PDYNP01213 254 aa6.44□□□□□ -1.38
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 51.7 ms