RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000528787.1

SSBP3-211, Transcript of single stranded DNA binding protein 3, humanhuman

TSL 4

Gene SSBP3, Length 577 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSBP3-211ENST00000528787 ATMQ13315 3056 aa7.13□□□□□ -1.27
SSBP3-211ENST00000528787 PHF3Q92576 2039 aaKnown RBP7.13□□□□□ -1.27
SSBP3-211ENST00000528787 ARHGAP21Q5T5U3 1957 aa7.13□□□□□ -1.27
SSBP3-211ENST00000528787 ZZEF1O43149 2961 aa7.12□□□□□ -1.27
SSBP3-211ENST00000528787 NPIPB13A6NJU9 1138 aa7.12□□□□□ -1.27
SSBP3-211ENST00000528787 LIPT2A6NK58 231 aa7.12□□□□□ -1.27
SSBP3-211ENST00000528787 AQP7P3A6NL99 342 aa7.12□□□□□ -1.27
SSBP3-211ENST00000528787 ZNF724A8MTY0 619 aa7.12□□□□□ -1.27
SSBP3-211ENST00000528787 CENPBD1B2RD01 187 aa7.12□□□□□ -1.27
SSBP3-211ENST00000528787 NPIPB4C9JG80 1138 aa7.12□□□□□ -1.27
SSBP3-211ENST00000528787 DVL2O14641 736 aa7.12□□□□□ -1.27
SSBP3-211ENST00000528787 TNFSF11O14788 317 aa7.12□□□□□ -1.27
SSBP3-211ENST00000528787 IDH3BO43837 385 aa7.12□□□□□ -1.27
SSBP3-211ENST00000528787 MGRN1O60291 552 aa7.12□□□□□ -1.27
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SSBP3-211ENST00000528787 ADAM11O75078 769 aa7.12□□□□□ -1.27
SSBP3-211ENST00000528787 FZD7O75084 574 aa7.12□□□□□ -1.27
SSBP3-211ENST00000528787 OR7A10O76100 309 aa7.12□□□□□ -1.27
SSBP3-211ENST00000528787 PRSS23O95084 383 aa7.12□□□□□ -1.27
SSBP3-211ENST00000528787 CNOT4O95628 575 aaKnown RBP7.12□□□□□ -1.27
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SSBP3-211ENST00000528787 CELA3AP09093 270 aa7.12□□□□□ -1.27
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SSBP3-211ENST00000528787 FUT1P19526 365 aa7.12□□□□□ -1.27
SSBP3-211ENST00000528787 CCNA2P20248 432 aa7.12□□□□□ -1.27
SSBP3-211ENST00000528787 TNFRSF1BP20333 461 aa7.12□□□□□ -1.27
SSBP3-211ENST00000528787 FPR3P25089 353 aa7.12□□□□□ -1.27
SSBP3-211ENST00000528787 OPRM1P35372 400 aa7.12□□□□□ -1.27
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SSBP3-211ENST00000528787 RAD23AP54725 363 aa7.12□□□□□ -1.27
SSBP3-211ENST00000528787 MLLT10P55197 1068 aa7.12□□□□□ -1.27
SSBP3-211ENST00000528787 IL1RL1Q01638 556 aa7.12□□□□□ -1.27
SSBP3-211ENST00000528787 PLAURQ03405 335 aa7.12□□□□□ -1.27
SSBP3-211ENST00000528787 TLE1Q04724 770 aa7.12□□□□□ -1.27
SSBP3-211ENST00000528787 ZP4Q12836 540 aa7.12□□□□□ -1.27
SSBP3-211ENST00000528787 TSPAN31Q12999 210 aa7.12□□□□□ -1.27
SSBP3-211ENST00000528787 C1DQ13901 141 aaKnown RBP7.12□□□□□ -1.27
SSBP3-211ENST00000528787 POU4F3Q15319 338 aa7.12□□□□□ -1.27
SSBP3-211ENST00000528787 OR7A5Q15622 319 aa7.12□□□□□ -1.27
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SSBP3-211ENST00000528787 PPP4R4Q6NUP7 873 aa7.12□□□□□ -1.27
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SSBP3-211ENST00000528787 CD300LDQ6UXZ3 194 aa7.12□□□□□ -1.27
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SSBP3-211ENST00000528787 GGNQ86UU5 652 aa7.12□□□□□ -1.27
SSBP3-211ENST00000528787 CD163Q86VB7 1156 aa7.12□□□□□ -1.27
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SSBP3-211ENST00000528787 OR10G2Q8NGC3 310 aa7.12□□□□□ -1.27
SSBP3-211ENST00000528787 OR4D11Q8NGI4 311 aa7.12□□□□□ -1.27
SSBP3-211ENST00000528787 OR52J3Q8NH60 311 aa7.12□□□□□ -1.27
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SSBP3-211ENST00000528787 EME1Q96AY2 570 aa7.12□□□□□ -1.27
SSBP3-211ENST00000528787 INTS12Q96CB8 462 aaKnown RBP7.12□□□□□ -1.27
SSBP3-211ENST00000528787 SLC25A36Q96CQ1 311 aa7.12□□□□□ -1.27
SSBP3-211ENST00000528787 RDH12Q96NR8 316 aa7.12□□□□□ -1.27
SSBP3-211ENST00000528787 OXGR1Q96P68 337 aa7.12□□□□□ -1.27
SSBP3-211ENST00000528787 PRSS27Q9BQR3 290 aa7.12□□□□□ -1.27
SSBP3-211ENST00000528787 DGCR6LQ9BY27 220 aa7.12□□□□□ -1.27
SSBP3-211ENST00000528787 TSPAN10Q9H1Z9 355 aaPredicted RBP7.12□□□□□ -1.27
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SSBP3-211ENST00000528787 CHST11Q9NPF2 352 aa7.12□□□□□ -1.27
SSBP3-211ENST00000528787 B3GAT2Q9NPZ5 323 aa7.12□□□□□ -1.27
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SSBP3-211ENST00000528787 ITPR1Q14643 2758 aa7.11□□□□□ -1.27
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SSBP3-211ENST00000528787 TRGV8A0A0C4DH27 118 aa7.11□□□□□ -1.27
SSBP3-211ENST00000528787 A0A0J9YW62 118 aa7.11□□□□□ -1.27
SSBP3-211ENST00000528787 A0A1W2PNV4 684 aa7.11□□□□□ -1.27
SSBP3-211ENST00000528787 MBD3L4A6NDZ8 208 aaPredicted RBP7.11□□□□□ -1.27
SSBP3-211ENST00000528787 MBD3L3A6NE82 208 aaPredicted RBP7.11□□□□□ -1.27
SSBP3-211ENST00000528787 A6NIZ1 184 aa7.11□□□□□ -1.27
SSBP3-211ENST00000528787 MBD3L5A6NJ08 208 aaPredicted RBP7.11□□□□□ -1.27
SSBP3-211ENST00000528787 ENO4A6NNW6 628 aa7.11□□□□□ -1.27
SSBP3-211ENST00000528787 CLCA1A8K7I4 914 aa7.11□□□□□ -1.27
SSBP3-211ENST00000528787 J3KTA2 159 aa7.11□□□□□ -1.27
SSBP3-211ENST00000528787 FFAR1O14842 300 aa7.11□□□□□ -1.27
SSBP3-211ENST00000528787 AHCYL1O43865 530 aa7.11□□□□□ -1.27
SSBP3-211ENST00000528787 CXCL13O43927 109 aa7.11□□□□□ -1.27
SSBP3-211ENST00000528787 CYTIPO60759 359 aa7.11□□□□□ -1.27
SSBP3-211ENST00000528787 TIPRLO75663 272 aa7.11□□□□□ -1.27
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