RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000496246.5

TTLL3-231, Transcript of tubulin tyrosine ligase like 3, human

TSL 4

Gene TTLL3, Length 507 nt, Biotype nonsense mediated decay.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TTLL3-231	ENST00000496246	TMEM171	Q8WVE6	324 aa		10.05	□□□□□ -0.8
TTLL3-231	ENST00000496246	LZIC	Q8WZA0	190 aa		10.05	□□□□□ -0.8
TTLL3-231	ENST00000496246	C3orf49	Q96BT1	292 aa		10.05	□□□□□ -0.8
TTLL3-231	ENST00000496246	MBD6	Q96DN6	1003 aa		10.05	□□□□□ -0.8
TTLL3-231	ENST00000496246	PLPPR2	Q96GM1	343 aa		10.05	□□□□□ -0.8
TTLL3-231	ENST00000496246	RADIL	Q96JH8	1075 aa		10.05	□□□□□ -0.8
TTLL3-231	ENST00000496246	CXorf56	Q9H5V9	222 aa		10.05	□□□□□ -0.8
TTLL3-231	ENST00000496246	ZNF385D	Q9H6B1	395 aa		10.05	□□□□□ -0.8
TTLL3-231	ENST00000496246	MOV10	Q9HCE1	1003 aa	Known RBP	10.05	□□□□□ -0.8
TTLL3-231	ENST00000496246	ZNF446	Q9NWS9	450 aa		10.05	□□□□□ -0.8
TTLL3-231	ENST00000496246	BAG5	Q9UL15	447 aa		10.05	□□□□□ -0.8
TTLL3-231	ENST00000496246	TRAV36DV7	A0A075B6V5	113 aa		10.04	□□□□□ -0.8
TTLL3-231	ENST00000496246	LOC100653049	A0A140TA62	436 aa		10.04	□□□□□ -0.8
TTLL3-231	ENST00000496246	MBD3L2B	A0A1B0GVZ6	204 aa	Predicted RBP	10.04	□□□□□ -0.8
TTLL3-231	ENST00000496246	AQP7P3	A6NL99	342 aa		10.04	□□□□□ -0.8
TTLL3-231	ENST00000496246	ZNF587B	E7ETH6	402 aa		10.04	□□□□□ -0.8
TTLL3-231	ENST00000496246		M0QX08	132 aa		10.04	□□□□□ -0.8
TTLL3-231	ENST00000496246	CLOCK	O15516	846 aa		10.04	□□□□□ -0.8
TTLL3-231	ENST00000496246	FRS3	O43559	492 aa		10.04	□□□□□ -0.8
TTLL3-231	ENST00000496246	FMO6P	O60774	539 aa		10.04	□□□□□ -0.8
TTLL3-231	ENST00000496246	TMCC2	O75069	709 aa		10.04	□□□□□ -0.8
TTLL3-231	ENST00000496246	GCM2	O75603	506 aa	Predicted RBP	10.04	□□□□□ -0.8
TTLL3-231	ENST00000496246	KRT34	O76011	436 aa		10.04	□□□□□ -0.8
TTLL3-231	ENST00000496246	AKR7A3	O95154	331 aa		10.04	□□□□□ -0.8
TTLL3-231	ENST00000496246	WNT11	O96014	354 aa		10.04	□□□□□ -0.8
TTLL3-231	ENST00000496246	HIST1H2AB	P04908	130 aa		10.04	□□□□□ -0.8
TTLL3-231	ENST00000496246	IMPDH2	P12268	514 aa		10.04	□□□□□ -0.8
TTLL3-231	ENST00000496246	HOXB9	P17482	250 aa	Predicted RBP	10.04	□□□□□ -0.8
TTLL3-231	ENST00000496246	CD247	P20963	164 aa		10.04	□□□□□ -0.8
TTLL3-231	ENST00000496246	CCKAR	P32238	428 aa		10.04	□□□□□ -0.8
TTLL3-231	ENST00000496246	RPS5	P46782	204 aa	Known RBP	10.04	□□□□□ -0.8
TTLL3-231	ENST00000496246	H3F3A	P84243	136 aa		10.04	□□□□□ -0.8
TTLL3-231	ENST00000496246	SF3A3	Q12874	501 aa	Known RBP eCLIP	10.04	□□□□□ -0.8	3e-23	■■■■■ 78.6
TTLL3-231	ENST00000496246	FAP	Q12884	760 aa		10.04	□□□□□ -0.8
TTLL3-231	ENST00000496246	BNIP2	Q12982	314 aa		10.04	□□□□□ -0.8
TTLL3-231	ENST00000496246	OR1Q1	Q15612	314 aa		10.04	□□□□□ -0.8
TTLL3-231	ENST00000496246	DEFB113	Q30KQ7	82 aa		10.04	□□□□□ -0.8
TTLL3-231	ENST00000496246	FAM69A	Q5T7M9	428 aa		10.04	□□□□□ -0.8
TTLL3-231	ENST00000496246	REP15	Q6BDI9	236 aa		10.04	□□□□□ -0.8
TTLL3-231	ENST00000496246	ZNF704	Q6ZNC4	412 aa	Predicted RBP	10.04	□□□□□ -0.8
TTLL3-231	ENST00000496246	HIST3H2A	Q7L7L0	130 aa		10.04	□□□□□ -0.8
TTLL3-231	ENST00000496246	ATG4D	Q86TL0	474 aa	Predicted RBP	10.04	□□□□□ -0.8
TTLL3-231	ENST00000496246	SMYD1	Q8NB12	490 aa		10.04	□□□□□ -0.8
TTLL3-231	ENST00000496246	OR9K2	Q8NGE7	335 aa		10.04	□□□□□ -0.8
TTLL3-231	ENST00000496246	NRGN	Q92686	78 aa		10.04	□□□□□ -0.8
TTLL3-231	ENST00000496246	HIST1H2AC	Q93077	130 aa		10.04	□□□□□ -0.8
TTLL3-231	ENST00000496246	TMEM45B	Q96B21	275 aa		10.04	□□□□□ -0.8
TTLL3-231	ENST00000496246	CMTM5	Q96DZ9	223 aa		10.04	□□□□□ -0.8
TTLL3-231	ENST00000496246	MCHR1	Q99705	422 aa		10.04	□□□□□ -0.8
TTLL3-231	ENST00000496246	KCNS3	Q9BQ31	491 aa		10.04	□□□□□ -0.8
TTLL3-231	ENST00000496246	SLCO5A1	Q9H2Y9	848 aa		10.04	□□□□□ -0.8
TTLL3-231	ENST00000496246	ALG2	Q9H553	416 aa		10.04	□□□□□ -0.8
TTLL3-231	ENST00000496246	KAT8	Q9H7Z6	458 aa	Known RBP	10.04	□□□□□ -0.8
TTLL3-231	ENST00000496246	PLEKHF2	Q9H8W4	249 aa		10.04	□□□□□ -0.8
TTLL3-231	ENST00000496246	EFCAB1	Q9HAE3	211 aa		10.04	□□□□□ -0.8
TTLL3-231	ENST00000496246	SLC52A3	Q9NQ40	469 aa		10.04	□□□□□ -0.8
TTLL3-231	ENST00000496246	SAR1A	Q9NR31	198 aa		10.04	□□□□□ -0.8
TTLL3-231	ENST00000496246	PRSS50	Q9UI38	385 aa		10.04	□□□□□ -0.8
TTLL3-231	ENST00000496246	POU2F3	Q9UKI9	436 aa		10.04	□□□□□ -0.8
TTLL3-231	ENST00000496246	MGAT4B	Q9UQ53	548 aa		10.04	□□□□□ -0.8
TTLL3-231	ENST00000496246	B3GALT5	Q9Y2C3	310 aa		10.04	□□□□□ -0.8
TTLL3-231	ENST00000496246	RNF115	Q9Y4L5	304 aa		10.04	□□□□□ -0.8
TTLL3-231	ENST00000496246	CORIN	Q9Y5Q5	1042 aa		10.04	□□□□□ -0.8
TTLL3-231	ENST00000496246	FLVCR1	Q9Y5Y0	555 aa		10.04	□□□□□ -0.8
TTLL3-231	ENST00000496246		A0A1B0GWA3	101 aa		10.03	□□□□□ -0.8
TTLL3-231	ENST00000496246	ZC3H12D	A2A288	527 aa	Known RBP	10.03	□□□□□ -0.8
TTLL3-231	ENST00000496246	ZNF716	A6NP11	495 aa		10.03	□□□□□ -0.8
TTLL3-231	ENST00000496246	DEFB108A	A8MXU0	73 aa		10.03	□□□□□ -0.8
TTLL3-231	ENST00000496246	GSTA4	O15217	222 aa		10.03	□□□□□ -0.8
TTLL3-231	ENST00000496246	ADAM11	O75078	769 aa		10.03	□□□□□ -0.8
TTLL3-231	ENST00000496246	RAD51D	O75771	328 aa		10.03	□□□□□ -0.8
TTLL3-231	ENST00000496246	MFN2	O95140	757 aa		10.03	□□□□□ -0.8
TTLL3-231	ENST00000496246	IGHV3-9	P01782	118 aa		10.03	□□□□□ -0.8
TTLL3-231	ENST00000496246	PRG2	P13727	222 aa		10.03	□□□□□ -0.8
TTLL3-231	ENST00000496246	HOXC5	Q00444	222 aa		10.03	□□□□□ -0.8
TTLL3-231	ENST00000496246	VEZF1	Q14119	521 aa		10.03	□□□□□ -0.8
TTLL3-231	ENST00000496246	VMAC	Q2NL98	169 aa		10.03	□□□□□ -0.8
TTLL3-231	ENST00000496246	SHE	Q5VZ18	495 aa		10.03	□□□□□ -0.8
TTLL3-231	ENST00000496246	NANOGP8	Q6NSW7	305 aa		10.03	□□□□□ -0.8
TTLL3-231	ENST00000496246	HMBOX1	Q6NT76	420 aa		10.03	□□□□□ -0.8
TTLL3-231	ENST00000496246	ZNF613	Q6PF04	617 aa		10.03	□□□□□ -0.8
TTLL3-231	ENST00000496246	TTC33	Q6PID6	262 aa	Predicted RBP	10.03	□□□□□ -0.8
TTLL3-231	ENST00000496246	C6orf89	Q6UWU4	347 aa		10.03	□□□□□ -0.8
TTLL3-231	ENST00000496246	TMEM108	Q6UXF1	575 aa		10.03	□□□□□ -0.8
TTLL3-231	ENST00000496246	C17orf78	Q8N4C9	275 aa		10.03	□□□□□ -0.8
TTLL3-231	ENST00000496246	TMEM99	Q8N816	258 aa		10.03	□□□□□ -0.8
TTLL3-231	ENST00000496246	C1orf162	Q8NEQ5	155 aa	Predicted RBP	10.03	□□□□□ -0.8
TTLL3-231	ENST00000496246	ZNF524	Q96C55	264 aa		10.03	□□□□□ -0.8
TTLL3-231	ENST00000496246	OXGR1	Q96P68	337 aa		10.03	□□□□□ -0.8
TTLL3-231	ENST00000496246	PIP5K1A	Q99755	562 aa		10.03	□□□□□ -0.8
TTLL3-231	ENST00000496246	IKZF5	Q9H5V7	419 aa		10.03	□□□□□ -0.8
TTLL3-231	ENST00000496246	NANOG	Q9H9S0	305 aa		10.03	□□□□□ -0.8
TTLL3-231	ENST00000496246	B3GAT2	Q9NPZ5	323 aa		10.03	□□□□□ -0.8
TTLL3-231	ENST00000496246	AMDHD2	Q9Y303	409 aa		10.03	□□□□□ -0.8
TTLL3-231	ENST00000496246	ZNF814	B7Z6K7	855 aa		10.02	□□□□□ -0.81
TTLL3-231	ENST00000496246	SLC43A1	O75387	559 aa		10.02	□□□□□ -0.81
TTLL3-231	ENST00000496246	ATE1	O95260	518 aa		10.02	□□□□□ -0.81
TTLL3-231	ENST00000496246	LGI1	O95970	557 aa		10.02	□□□□□ -0.81
TTLL3-231	ENST00000496246	MT-ATP6	P00846	226 aa		10.02	□□□□□ -0.81
TTLL3-231	ENST00000496246	BMP4	P12644	408 aa		10.02	□□□□□ -0.81

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