RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000495292.1

FAM107B-227, Transcript of family with sequence similarity 107 member B, human

TSL 4

Gene FAM107B, Length 542 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

Download Table

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
FAM107B-227	ENST00000495292	ZNF524	Q96C55	264 aa		5.73	□□□□□ -1.49
FAM107B-227	ENST00000495292	MAEL	Q96JY0	434 aa	Known RBP	5.73	□□□□□ -1.49
FAM107B-227	ENST00000495292	TEX37	Q96LM6	180 aa		5.73	□□□□□ -1.49
FAM107B-227	ENST00000495292	SMR3A	Q99954	134 aa		5.73	□□□□□ -1.49
FAM107B-227	ENST00000495292	TRIM2	Q9C040	744 aa		5.73	□□□□□ -1.49
FAM107B-227	ENST00000495292	SLC38A1	Q9H2H9	487 aa		5.73	□□□□□ -1.49
FAM107B-227	ENST00000495292	RAD21L1	Q9H4I0	556 aa		5.73	□□□□□ -1.49
FAM107B-227	ENST00000495292	PNPO	Q9NVS9	261 aa		5.73	□□□□□ -1.49
FAM107B-227	ENST00000495292	ASB6	Q9NWX5	421 aa		5.73	□□□□□ -1.49
FAM107B-227	ENST00000495292	ZIM2	Q9NZV7	527 aa		5.73	□□□□□ -1.49
FAM107B-227	ENST00000495292	PRSS50	Q9UI38	385 aa		5.73	□□□□□ -1.49
FAM107B-227	ENST00000495292	DCTN4	Q9UJW0	460 aa		5.73	□□□□□ -1.49
FAM107B-227	ENST00000495292	MAGED1	Q9Y5V3	778 aa	Predicted RBP	5.73	□□□□□ -1.49
FAM107B-227	ENST00000495292	GPR45	Q9Y5Y3	372 aa		5.73	□□□□□ -1.49
FAM107B-227	ENST00000495292	ABCA2	Q9BZC7	2435 aa		5.73	□□□□□ -1.49
FAM107B-227	ENST00000495292	DSPP	Q9NZW4	1301 aa		5.73	□□□□□ -1.49
FAM107B-227	ENST00000495292	USF3	Q68DE3	2245 aa		5.72	□□□□□ -1.49
FAM107B-227	ENST00000495292	HIVEP2	P31629	2446 aa		5.72	□□□□□ -1.49
FAM107B-227	ENST00000495292	TMED7-TICAM2	A0A0A6YYA0	188 aa		5.72	□□□□□ -1.49
FAM107B-227	ENST00000495292	CIB4	A0PJX0	185 aa		5.72	□□□□□ -1.49
FAM107B-227	ENST00000495292	PRAMEF27	A3QJZ7	478 aa		5.72	□□□□□ -1.49
FAM107B-227	ENST00000495292	CDHR4	A6H8M9	788 aa		5.72	□□□□□ -1.49
FAM107B-227	ENST00000495292	TRIM64	A6NGJ6	449 aa		5.72	□□□□□ -1.49
FAM107B-227	ENST00000495292	TRIM64B	A6NI03	449 aa		5.72	□□□□□ -1.49
FAM107B-227	ENST00000495292	OR6C65	A6NJZ3	312 aa		5.72	□□□□□ -1.49
FAM107B-227	ENST00000495292	CCT8L1P	A6NM43	557 aa		5.72	□□□□□ -1.49
FAM107B-227	ENST00000495292	ABCD4	O14678	606 aa		5.72	□□□□□ -1.49
FAM107B-227	ENST00000495292	PAX4	O43316	350 aa		5.72	□□□□□ -1.49
FAM107B-227	ENST00000495292	RAD51D	O75771	328 aa		5.72	□□□□□ -1.49
FAM107B-227	ENST00000495292	LY6G6D	O95868	133 aa		5.72	□□□□□ -1.49
FAM107B-227	ENST00000495292	GPI	P06744	558 aa		5.72	□□□□□ -1.49
FAM107B-227	ENST00000495292	CHRM4	P08173	479 aa		5.72	□□□□□ -1.49
FAM107B-227	ENST00000495292	EPHA3	P29320	983 aa		5.72	□□□□□ -1.49
FAM107B-227	ENST00000495292	TACR3	P29371	465 aa		5.72	□□□□□ -1.49
FAM107B-227	ENST00000495292	IL12A	P29459	219 aa		5.72	□□□□□ -1.49
FAM107B-227	ENST00000495292	CDKN2C	P42773	168 aa		5.72	□□□□□ -1.49
FAM107B-227	ENST00000495292	CDH11	P55287	796 aa		5.72	□□□□□ -1.49
FAM107B-227	ENST00000495292	NME5	P56597	212 aa		5.72	□□□□□ -1.49
FAM107B-227	ENST00000495292	OR2B6	P58173	313 aa		5.72	□□□□□ -1.49
FAM107B-227	ENST00000495292	COPZ1	P61923	177 aa		5.72	□□□□□ -1.49
FAM107B-227	ENST00000495292	IRX1	P78414	480 aa	Predicted RBP	5.72	□□□□□ -1.49
FAM107B-227	ENST00000495292	EPS8	Q12929	822 aa		5.72	□□□□□ -1.49
FAM107B-227	ENST00000495292	VEZF1	Q14119	521 aa		5.72	□□□□□ -1.49
FAM107B-227	ENST00000495292	MPP2	Q14168	576 aa		5.72	□□□□□ -1.49
FAM107B-227	ENST00000495292	LARS2	Q15031	903 aa	Known RBP	5.72	□□□□□ -1.49
FAM107B-227	ENST00000495292	TSC22D1	Q15714	1073 aa		5.72	□□□□□ -1.49
FAM107B-227	ENST00000495292	SYPL1	Q16563	259 aa		5.72	□□□□□ -1.49
FAM107B-227	ENST00000495292	CLEC12B	Q2HXU8	276 aa		5.72	□□□□□ -1.49
FAM107B-227	ENST00000495292	AGAP6	Q5VW22	663 aa		5.72	□□□□□ -1.49
FAM107B-227	ENST00000495292	PRAMEF8	Q5VWM4	474 aa		5.72	□□□□□ -1.49
FAM107B-227	ENST00000495292	PRAMEF7	Q5VXH5	474 aa		5.72	□□□□□ -1.49
FAM107B-227	ENST00000495292	NXN	Q6DKJ4	435 aa		5.72	□□□□□ -1.49
FAM107B-227	ENST00000495292	CASP12	Q6UXS9	341 aa		5.72	□□□□□ -1.49
FAM107B-227	ENST00000495292	ABHD12B	Q7Z5M8	362 aa	Predicted RBP	5.72	□□□□□ -1.49
FAM107B-227	ENST00000495292	DTX2	Q86UW9	622 aa		5.72	□□□□□ -1.49
FAM107B-227	ENST00000495292	ADGRG3	Q86Y34	549 aa		5.72	□□□□□ -1.49
FAM107B-227	ENST00000495292	CIART	Q8N365	385 aa	Predicted RBP	5.72	□□□□□ -1.49
FAM107B-227	ENST00000495292	ZNF433	Q8N7K0	673 aa	Predicted RBP	5.72	□□□□□ -1.49
FAM107B-227	ENST00000495292	ANKFN1	Q8N957	763 aa		5.72	□□□□□ -1.49
FAM107B-227	ENST00000495292	KBTBD8	Q8NFY9	601 aa		5.72	□□□□□ -1.49
FAM107B-227	ENST00000495292	LILRB1	Q8NHL6	650 aa	Predicted RBP	5.72	□□□□□ -1.49
FAM107B-227	ENST00000495292	FBLIM1	Q8WUP2	373 aa		5.72	□□□□□ -1.49
FAM107B-227	ENST00000495292	SLC35B4	Q969S0	331 aa		5.72	□□□□□ -1.49
FAM107B-227	ENST00000495292	TMEM45B	Q96B21	275 aa		5.72	□□□□□ -1.49
FAM107B-227	ENST00000495292	ITCH	Q96J02	903 aa		5.72	□□□□□ -1.49
FAM107B-227	ENST00000495292	ARL5B	Q96KC2	179 aa		5.72	□□□□□ -1.49
FAM107B-227	ENST00000495292	SF3B5	Q9BWJ5	86 aa	Known RBP	5.72	□□□□□ -1.49
FAM107B-227	ENST00000495292	AMBRA1	Q9C0C7	1298 aa		5.72	□□□□□ -1.49
FAM107B-227	ENST00000495292	MANSC1	Q9H8J5	431 aa		5.72	□□□□□ -1.49
FAM107B-227	ENST00000495292	LIN7B	Q9HAP6	207 aa		5.72	□□□□□ -1.49
FAM107B-227	ENST00000495292	MOV10	Q9HCE1	1003 aa	Known RBP	5.72	□□□□□ -1.49
FAM107B-227	ENST00000495292	SDR39U1	Q9NRG7	319 aa	Predicted RBP	5.72	□□□□□ -1.49
FAM107B-227	ENST00000495292	CISD1	Q9NZ45	108 aa	Known RBP	5.72	□□□□□ -1.49
FAM107B-227	ENST00000495292	OSGIN1	Q9UJX0	560 aa		5.72	□□□□□ -1.49
FAM107B-227	ENST00000495292	AMDHD2	Q9Y303	409 aa		5.72	□□□□□ -1.49
FAM107B-227	ENST00000495292	TMED7	Q9Y3B3	224 aa		5.72	□□□□□ -1.49
FAM107B-227	ENST00000495292	TLN2	Q9Y4G6	2542 aa		5.72	□□□□□ -1.49
FAM107B-227	ENST00000495292	FN1	P02751	2386 aa	Known RBP	5.71	□□□□□ -1.5
FAM107B-227	ENST00000495292		A0A0G2JPF8	293 aa		5.71	□□□□□ -1.5
FAM107B-227	ENST00000495292	TMEM72	A0PK05	275 aa		5.71	□□□□□ -1.5
FAM107B-227	ENST00000495292	DPRX	A6NFQ7	191 aa		5.71	□□□□□ -1.5
FAM107B-227	ENST00000495292	CLDN24	A6NM45	220 aa		5.71	□□□□□ -1.5
FAM107B-227	ENST00000495292		A8MVM7	634 aa		5.71	□□□□□ -1.5
FAM107B-227	ENST00000495292	HNRNPCL2	B2RXH8	293 aa		5.71	□□□□□ -1.5
FAM107B-227	ENST00000495292	SHISA9	B4DS77	424 aa		5.71	□□□□□ -1.5
FAM107B-227	ENST00000495292	HNRNPCL3	B7ZW38	293 aa		5.71	□□□□□ -1.5
FAM107B-227	ENST00000495292	AP3D1	O14617	1153 aa		5.71	□□□□□ -1.5
FAM107B-227	ENST00000495292	SMAD7	O15105	426 aa	Known RBP	5.71	□□□□□ -1.5
FAM107B-227	ENST00000495292	UBD	O15205	165 aa		5.71	□□□□□ -1.5
FAM107B-227	ENST00000495292	HNRNPCL1	O60812	293 aa	Known RBP	5.71	□□□□□ -1.5
FAM107B-227	ENST00000495292	BCAS1	O75363	584 aa	Predicted RBP	5.71	□□□□□ -1.5
FAM107B-227	ENST00000495292	VAMP5	O95183	116 aa		5.71	□□□□□ -1.5
FAM107B-227	ENST00000495292	BCHE	P06276	602 aa		5.71	□□□□□ -1.5
FAM107B-227	ENST00000495292	SOD3	P08294	240 aa		5.71	□□□□□ -1.5
FAM107B-227	ENST00000495292	HNRNPCL4	P0DMR1	293 aa		5.71	□□□□□ -1.5
FAM107B-227	ENST00000495292	KIT	P10721	976 aa		5.71	□□□□□ -1.5
FAM107B-227	ENST00000495292	CXCR1	P25024	350 aa		5.71	□□□□□ -1.5
FAM107B-227	ENST00000495292	MPG	P29372	298 aa		5.71	□□□□□ -1.5
FAM107B-227	ENST00000495292	ADM	P35318	185 aa		5.71	□□□□□ -1.5
FAM107B-227	ENST00000495292	CRAT	P43155	626 aa		5.71	□□□□□ -1.5

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 24.9 ms