RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000494570.1

KDM4C-211, Transcript of lysine demethylase 4C, humanhuman

TSL 2

Gene KDM4C, Length 647 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDM4C-211ENST00000494570 ZIC4Q8N9L1 334 aa7.28□□□□□ -1.24
KDM4C-211ENST00000494570 SMYD1Q8NB12 490 aa7.28□□□□□ -1.24
KDM4C-211ENST00000494570 C11orf65Q8NCR3 313 aa7.28□□□□□ -1.24
KDM4C-211ENST00000494570 ZNF417Q8TAU3 575 aa7.28□□□□□ -1.24
KDM4C-211ENST00000494570 TAMM41Q96BW9 452 aa7.28□□□□□ -1.24
KDM4C-211ENST00000494570 CITED4Q96RK1 184 aa7.28□□□□□ -1.24
KDM4C-211ENST00000494570 ZNF587Q96SQ5 575 aaPredicted RBP7.28□□□□□ -1.24
KDM4C-211ENST00000494570 ARHGDIGQ99819 225 aa7.28□□□□□ -1.24
KDM4C-211ENST00000494570 ELAC2Q9BQ52 826 aaKnown RBP7.28□□□□□ -1.24
KDM4C-211ENST00000494570 LIME1Q9H400 295 aa7.28□□□□□ -1.24
KDM4C-211ENST00000494570 C12orf49Q9H741 205 aa7.28□□□□□ -1.24
KDM4C-211ENST00000494570 CMTM6Q9NX76 183 aa7.28□□□□□ -1.24
KDM4C-211ENST00000494570 FAM53CQ9NYF3 392 aa7.28□□□□□ -1.24
KDM4C-211ENST00000494570 TMEM181Q9P2C4 612 aa7.28□□□□□ -1.24
KDM4C-211ENST00000494570 EMC9Q9Y3B6 208 aa7.28□□□□□ -1.24
KDM4C-211ENST00000494570 CAPN7Q9Y6W3 813 aa7.28□□□□□ -1.24
KDM4C-211ENST00000494570 MAP1AP78559 2803 aaPredicted RBP7.28□□□□□ -1.24
KDM4C-211ENST00000494570 HIVEP1P15822 2718 aa7.27□□□□□ -1.25
KDM4C-211ENST00000494570 SH3D21A4FU49 640 aa7.27□□□□□ -1.25
KDM4C-211ENST00000494570 CCT8L1PA6NM43 557 aa7.27□□□□□ -1.25
KDM4C-211ENST00000494570 BBIP1A8MTZ0 92 aa7.27□□□□□ -1.25
KDM4C-211ENST00000494570 C16orf97H3BN30 126 aa7.27□□□□□ -1.25
KDM4C-211ENST00000494570 PLGP00747 810 aaPredicted RBP7.27□□□□□ -1.25
KDM4C-211ENST00000494570 NPPAP01160 153 aa7.27□□□□□ -1.25
KDM4C-211ENST00000494570 OPN1SWP03999 348 aa7.27□□□□□ -1.25
KDM4C-211ENST00000494570 COX4I1P13073 169 aa7.27□□□□□ -1.25
KDM4C-211ENST00000494570 POU2F1P14859 743 aa7.27□□□□□ -1.25
KDM4C-211ENST00000494570 FPR1P21462 350 aa7.27□□□□□ -1.25
KDM4C-211ENST00000494570 OR3A2P47893 321 aa7.27□□□□□ -1.25
KDM4C-211ENST00000494570 CTBP2P56545 445 aa7.27□□□□□ -1.25
KDM4C-211ENST00000494570 OR2B6P58173 313 aa7.27□□□□□ -1.25
KDM4C-211ENST00000494570 CSNK2A1P68400 391 aaPredicted RBP7.27□□□□□ -1.25
KDM4C-211ENST00000494570 CEACAM7Q14002 265 aa7.27□□□□□ -1.25
KDM4C-211ENST00000494570 DOC2BQ14184 412 aa7.27□□□□□ -1.25
KDM4C-211ENST00000494570 SLC17A1Q14916 467 aa7.27□□□□□ -1.25
KDM4C-211ENST00000494570 TESK1Q15569 626 aa7.27□□□□□ -1.25
KDM4C-211ENST00000494570 TSC22D1Q15714 1073 aa7.27□□□□□ -1.25
KDM4C-211ENST00000494570 NRF1Q16656 503 aa7.27□□□□□ -1.25
KDM4C-211ENST00000494570 CYP51A1Q16850 503 aa7.27□□□□□ -1.25
KDM4C-211ENST00000494570 EXOC3L2Q2M3D2 409 aa7.27□□□□□ -1.25
KDM4C-211ENST00000494570 ANKRD34AQ69YU3 496 aa7.27□□□□□ -1.25
KDM4C-211ENST00000494570 GTF2IRD2BQ6EKJ0 949 aa7.27□□□□□ -1.25
KDM4C-211ENST00000494570 SEZ6L2Q6UXD5 910 aa7.27□□□□□ -1.25
KDM4C-211ENST00000494570 NHLRC1Q6VVB1 395 aa7.27□□□□□ -1.25
KDM4C-211ENST00000494570 ZC3HAV1Q7Z2W4 902 aaKnown RBP7.27□□□□□ -1.25
KDM4C-211ENST00000494570 PIGWQ7Z7B1 504 aa7.27□□□□□ -1.25
KDM4C-211ENST00000494570 GTF2IRD2Q86UP8 949 aa7.27□□□□□ -1.25
KDM4C-211ENST00000494570 ARMC8Q8IUR7 673 aa7.27□□□□□ -1.25
KDM4C-211ENST00000494570 SLC15A3Q8IY34 581 aa7.27□□□□□ -1.25
KDM4C-211ENST00000494570 TMEM99Q8N816 258 aa7.27□□□□□ -1.25
KDM4C-211ENST00000494570 OR6T1Q8NGN1 323 aa7.27□□□□□ -1.25
KDM4C-211ENST00000494570 RP9Q8TA86 221 aaKnown RBP7.27□□□□□ -1.25
KDM4C-211ENST00000494570 RCN3Q96D15 328 aa7.27□□□□□ -1.25
KDM4C-211ENST00000494570 KTI12Q96EK9 354 aaPredicted RBP7.27□□□□□ -1.25
KDM4C-211ENST00000494570 LRRC46Q96FV0 321 aa7.27□□□□□ -1.25
KDM4C-211ENST00000494570 DMRTB1Q96MA1 342 aa7.27□□□□□ -1.25
KDM4C-211ENST00000494570 PLEKHF2Q9H8W4 249 aa7.27□□□□□ -1.25
KDM4C-211ENST00000494570 MRGBPQ9NV56 204 aa7.27□□□□□ -1.25
KDM4C-211ENST00000494570 KLHL28Q9NXS3 571 aa7.27□□□□□ -1.25
KDM4C-211ENST00000494570 KLHL9Q9P2J3 617 aa7.27□□□□□ -1.25
KDM4C-211ENST00000494570 PRSS50Q9UI38 385 aa7.27□□□□□ -1.25
KDM4C-211ENST00000494570 ANGPT4Q9Y264 503 aa7.27□□□□□ -1.25
KDM4C-211ENST00000494570 SPIN1Q9Y657 262 aaPredicted RBP7.27□□□□□ -1.25
KDM4C-211ENST00000494570 MPDZO75970 2070 aa7.27□□□□□ -1.25
KDM4C-211ENST00000494570 PRR14LQ5THK1 2151 aa7.27□□□□□ -1.25
KDM4C-211ENST00000494570 ROS1P08922 2347 aa7.26□□□□□ -1.25
KDM4C-211ENST00000494570 A0A0B4J2E0 115 aa7.26□□□□□ -1.25
KDM4C-211ENST00000494570 A0A1B0GX12 115 aa7.26□□□□□ -1.25
KDM4C-211ENST00000494570 GMNCA6NCL1 334 aa7.26□□□□□ -1.25
KDM4C-211ENST00000494570 AQP7P3A6NL99 342 aa7.26□□□□□ -1.25
KDM4C-211ENST00000494570 A8MVM7 634 aa7.26□□□□□ -1.25
KDM4C-211ENST00000494570 M0R3H8 397 aa7.26□□□□□ -1.25
KDM4C-211ENST00000494570 PDLIM1O00151 329 aa7.26□□□□□ -1.25
KDM4C-211ENST00000494570 KLF4O43474 513 aa7.26□□□□□ -1.25
KDM4C-211ENST00000494570 CCDC22O60826 627 aa7.26□□□□□ -1.25
KDM4C-211ENST00000494570 SERPINB7O75635 380 aa7.26□□□□□ -1.25
KDM4C-211ENST00000494570 AKR7A3O95154 331 aa7.26□□□□□ -1.25
KDM4C-211ENST00000494570 C8BP07358 591 aa7.26□□□□□ -1.25
KDM4C-211ENST00000494570 UQCRBP14927 111 aa7.26□□□□□ -1.25
KDM4C-211ENST00000494570 PSMB1P20618 241 aaKnown RBP7.26□□□□□ -1.25
KDM4C-211ENST00000494570 FUT4P22083 530 aa7.26□□□□□ -1.25
KDM4C-211ENST00000494570 CRYGSP22914 178 aa7.26□□□□□ -1.25
KDM4C-211ENST00000494570 CXCR1P25024 350 aa7.26□□□□□ -1.25
KDM4C-211ENST00000494570 FOXG1P55316 489 aaPredicted RBP7.26□□□□□ -1.25
KDM4C-211ENST00000494570 COPZ1P61923 177 aa7.26□□□□□ -1.25
KDM4C-211ENST00000494570 SLC35A1P78382 337 aa7.26□□□□□ -1.25
KDM4C-211ENST00000494570 LTBQ06643 244 aa7.26□□□□□ -1.25
KDM4C-211ENST00000494570 MAPRE2Q15555 327 aa7.26□□□□□ -1.25
KDM4C-211ENST00000494570 OR1Q1Q15612 314 aa7.26□□□□□ -1.25
KDM4C-211ENST00000494570 OR7A5Q15622 319 aa7.26□□□□□ -1.25
KDM4C-211ENST00000494570 TMEM201Q5SNT2 666 aa7.26□□□□□ -1.25
KDM4C-211ENST00000494570 C1orf140Q5VVS0 124 aa7.26□□□□□ -1.25
KDM4C-211ENST00000494570 PAQR6Q6TCH4 344 aa7.26□□□□□ -1.25
KDM4C-211ENST00000494570 WDR88Q6ZMY6 472 aa7.26□□□□□ -1.25
KDM4C-211ENST00000494570 BEND4Q6ZU67 534 aa7.26□□□□□ -1.25
KDM4C-211ENST00000494570 CXorf67Q86X51 503 aaPredicted RBP7.26□□□□□ -1.25
KDM4C-211ENST00000494570 CDC20BQ86Y33 519 aa7.26□□□□□ -1.25
KDM4C-211ENST00000494570 KRT73Q86Y46 540 aa7.26□□□□□ -1.25
KDM4C-211ENST00000494570 P3H2Q8IVL5 708 aa7.26□□□□□ -1.25
KDM4C-211ENST00000494570 ALDH16A1Q8IZ83 802 aa7.26□□□□□ -1.25
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 31.8 ms