RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000492485.5

TRIOBP-211, Transcript of TRIO and F-actin binding protein, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene TRIOBP, Length 3,948 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIOBP-211ENST00000492485 KCNN3Q9UGI6 736 aa11.44□□□□□ -0.58
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TRIOBP-211ENST00000492485 NOTCH3Q9UM47 2321 aa11.44□□□□□ -0.58
TRIOBP-211ENST00000492485 C5orf42Q9H799 3197 aa11.44□□□□□ -0.58
TRIOBP-211ENST00000492485 TSPAN11A1L157 253 aa11.44□□□□□ -0.58
TRIOBP-211ENST00000492485 METTL21EPA6NDL7 271 aa11.44□□□□□ -0.58
TRIOBP-211ENST00000492485 F5H5P2 479 aa11.44□□□□□ -0.58
TRIOBP-211ENST00000492485 TMEM189-UBE2V1I3L0A0 370 aa11.44□□□□□ -0.58
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TRIOBP-211ENST00000492485 ARHGEF15O94989 841 aa11.44□□□□□ -0.58
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TRIOBP-211ENST00000492485 OR1D4P47884 311 aa11.44□□□□□ -0.58
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TRIOBP-211ENST00000492485 IRF4Q15306 451 aa11.44□□□□□ -0.58
TRIOBP-211ENST00000492485 RNASE10Q5GAN6 216 aaKnown RBP11.44□□□□□ -0.58
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TRIOBP-211ENST00000492485 SLC16A7O60669 478 aa11.43□□□□□ -0.58
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TRIOBP-211ENST00000492485 ST6GALNAC5Q9BVH7 336 aa11.43□□□□□ -0.58
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TRIOBP-211ENST00000492485 GTPBP8Q8N3Z3 284 aaPredicted RBP11.43□□□□□ -0.58
TRIOBP-211ENST00000492485 MED30Q96HR3 178 aa11.43□□□□□ -0.58
TRIOBP-211ENST00000492485 GABARAPL1Q9H0R8 117 aa11.43□□□□□ -0.58
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TRIOBP-211ENST00000492485 OR5T2Q8NGG2 359 aa11.43□□□□□ -0.58
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TRIOBP-211ENST00000492485 OR2M4Q96R27 311 aa11.43□□□□□ -0.58
TRIOBP-211ENST00000492485 WDR77Q9BQA1 342 aaPredicted RBP11.43□□□□□ -0.58
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TRIOBP-211ENST00000492485 POU3F2P20265 443 aaPredicted RBP11.42□□□□□ -0.58
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TRIOBP-211ENST00000492485 DLSTP36957 453 aa11.42□□□□□ -0.58
TRIOBP-211ENST00000492485 SNRPGP62308 76 aaKnown RBP11.42□□□□□ -0.58
TRIOBP-211ENST00000492485 METTL11BQ5VVY1 283 aa11.42□□□□□ -0.58
TRIOBP-211ENST00000492485 CNKSR3Q6P9H4 555 aa11.42□□□□□ -0.58
TRIOBP-211ENST00000492485 NLRC3Q7RTR2 1065 aa11.42□□□□□ -0.58
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