RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000489424.5

HDAC10-216, Transcript of histone deacetylase 10, human

TSL 5

Gene HDAC10, Length 759 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
HDAC10-216	ENST00000489424	SLC15A3	Q8IY34	581 aa		15.34	■□□□□ 0.05
HDAC10-216	ENST00000489424	MICU2	Q8IYU8	434 aa		15.34	■□□□□ 0.05
HDAC10-216	ENST00000489424	CLIP4	Q8N3C7	705 aa		15.34	■□□□□ 0.05
HDAC10-216	ENST00000489424	FITM2	Q8N6M3	262 aa		15.34	■□□□□ 0.05
HDAC10-216	ENST00000489424	ATP6V1C2	Q8NEY4	427 aa		15.34	■□□□□ 0.05
HDAC10-216	ENST00000489424	OR5B2	Q96R09	309 aa		15.34	■□□□□ 0.05
HDAC10-216	ENST00000489424	ACTR6	Q9GZN1	396 aa		15.34	■□□□□ 0.05
HDAC10-216	ENST00000489424	MFN2	O95140	757 aa		15.33	■□□□□ 0.04
HDAC10-216	ENST00000489424	CXCR1	P25024	350 aa		15.33	■□□□□ 0.04
HDAC10-216	ENST00000489424	GZMM	P51124	257 aa		15.33	■□□□□ 0.04
HDAC10-216	ENST00000489424	PCBP3	P57721	371 aa	Known RBP	15.33	■□□□□ 0.04
HDAC10-216	ENST00000489424	H3F3A	P84243	136 aa		15.33	■□□□□ 0.04
HDAC10-216	ENST00000489424	ABLIM2	Q6H8Q1	611 aa		15.33	■□□□□ 0.04
HDAC10-216	ENST00000489424	C22orf34	Q6ZV56	151 aa		15.33	■□□□□ 0.04
HDAC10-216	ENST00000489424	NUFIP2	Q7Z417	695 aa	Known RBP	15.33	■□□□□ 0.04
HDAC10-216	ENST00000489424	RANBP3L	Q86VV4	465 aa	Predicted RBP	15.33	■□□□□ 0.04
HDAC10-216	ENST00000489424	CADM2	Q8N3J6	435 aa		15.33	■□□□□ 0.04
HDAC10-216	ENST00000489424	PIGX	Q8TBF5	258 aa		15.33	■□□□□ 0.04
HDAC10-216	ENST00000489424	LZIC	Q8WZA0	190 aa		15.33	■□□□□ 0.04
HDAC10-216	ENST00000489424	PROX1	Q92786	737 aa		15.33	■□□□□ 0.04
HDAC10-216	ENST00000489424	DDIT4L	Q96D03	193 aa		15.33	■□□□□ 0.04
HDAC10-216	ENST00000489424	KCTD14	Q9BQ13	255 aa	Predicted RBP	15.33	■□□□□ 0.04
HDAC10-216	ENST00000489424	ADAM19	Q9H013	955 aa		15.33	■□□□□ 0.04
HDAC10-216	ENST00000489424	ALG2	Q9H553	416 aa		15.33	■□□□□ 0.04
HDAC10-216	ENST00000489424	ARL8B	Q9NVJ2	186 aa		15.33	■□□□□ 0.04
HDAC10-216	ENST00000489424	CMTM6	Q9NX76	183 aa		15.33	■□□□□ 0.04
HDAC10-216	ENST00000489424	BAG5	Q9UL15	447 aa		15.33	■□□□□ 0.04
HDAC10-216	ENST00000489424	SETD2	Q9BYW2	2564 aa	Predicted RBP	15.33	■□□□□ 0.04
HDAC10-216	ENST00000489424		A0A1W2PNR3	127 aa		15.32	■□□□□ 0.04
HDAC10-216	ENST00000489424	CCT8L1P	A6NM43	557 aa		15.32	■□□□□ 0.04
HDAC10-216	ENST00000489424	GKN3P	P0CG01	181 aa		15.32	■□□□□ 0.04
HDAC10-216	ENST00000489424	TFPI	P10646	304 aa		15.32	■□□□□ 0.04
HDAC10-216	ENST00000489424	CALB2	P22676	271 aa		15.32	■□□□□ 0.04
HDAC10-216	ENST00000489424	RGS8	P57771	180 aa	Predicted RBP	15.32	■□□□□ 0.04
HDAC10-216	ENST00000489424	POU4F3	Q15319	338 aa		15.32	■□□□□ 0.04
HDAC10-216	ENST00000489424	PGAM4	Q8N0Y7	254 aa		15.32	■□□□□ 0.04
HDAC10-216	ENST00000489424	ZNF611	Q8N823	705 aa		15.32	■□□□□ 0.04
HDAC10-216	ENST00000489424	IGFBPL1	Q8WX77	278 aa		15.32	■□□□□ 0.04
HDAC10-216	ENST00000489424	POTEKP	Q9BYX7	375 aa		15.32	■□□□□ 0.04
HDAC10-216	ENST00000489424	TRIM2	Q9C040	744 aa		15.32	■□□□□ 0.04
HDAC10-216	ENST00000489424	C12orf49	Q9H741	205 aa		15.32	■□□□□ 0.04
HDAC10-216	ENST00000489424	TMEM27	Q9HBJ8	222 aa		15.32	■□□□□ 0.04
HDAC10-216	ENST00000489424	CTPS2	Q9NRF8	586 aa		15.32	■□□□□ 0.04
HDAC10-216	ENST00000489424	ADPRHL2	Q9NX46	363 aa		15.32	■□□□□ 0.04
HDAC10-216	ENST00000489424	TMEM181	Q9P2C4	612 aa		15.32	■□□□□ 0.04
HDAC10-216	ENST00000489424	SLC9A8	Q9Y2E8	581 aa		15.32	■□□□□ 0.04
HDAC10-216	ENST00000489424	ZNF469	Q96JG9	3925 aa	Predicted RBP	15.31	■□□□□ 0.04
HDAC10-216	ENST00000489424	ACAN	P16112	2415 aa		15.31	■□□□□ 0.04
HDAC10-216	ENST00000489424	MBD3L2B	A0A1B0GVZ6	204 aa	Predicted RBP	15.31	■□□□□ 0.04
HDAC10-216	ENST00000489424	AP3D1	O14617	1153 aa		15.31	■□□□□ 0.04
HDAC10-216	ENST00000489424	SMPD2	O60906	423 aa		15.31	■□□□□ 0.04
HDAC10-216	ENST00000489424	BCAS1	O75363	584 aa	Predicted RBP	15.31	■□□□□ 0.04
HDAC10-216	ENST00000489424	ACAA2	P42765	397 aa	Known RBP	15.31	■□□□□ 0.04
HDAC10-216	ENST00000489424	NKX6-1	P78426	367 aa	Predicted RBP	15.31	■□□□□ 0.04
HDAC10-216	ENST00000489424	PLAUR	Q03405	335 aa		15.31	■□□□□ 0.04
HDAC10-216	ENST00000489424	KRTAP21-3	Q3LHN1	58 aa		15.31	■□□□□ 0.04
HDAC10-216	ENST00000489424	SPATS1	Q496A3	300 aa		15.31	■□□□□ 0.04
HDAC10-216	ENST00000489424	SAMD4B	Q5PRF9	694 aa	Known RBP	15.31	■□□□□ 0.04
HDAC10-216	ENST00000489424	ANKRD34A	Q69YU3	496 aa		15.31	■□□□□ 0.04
HDAC10-216	ENST00000489424	C8orf82	Q6P1X6	216 aa	Predicted RBP	15.31	■□□□□ 0.04
HDAC10-216	ENST00000489424	TRPM8	Q7Z2W7	1104 aa		15.31	■□□□□ 0.04
HDAC10-216	ENST00000489424	SMYD1	Q8NB12	490 aa		15.31	■□□□□ 0.04
HDAC10-216	ENST00000489424	OR52E4	Q8NGH9	312 aa		15.31	■□□□□ 0.04
HDAC10-216	ENST00000489424	KISS1R	Q969F8	398 aa	Predicted RBP	15.31	■□□□□ 0.04
HDAC10-216	ENST00000489424	GSX2	Q9BZM3	304 aa		15.31	■□□□□ 0.04
HDAC10-216	ENST00000489424	PARPBP	Q9NWS1	579 aa		15.31	■□□□□ 0.04
HDAC10-216	ENST00000489424	TES	Q9UGI8	421 aa	Known RBP	15.31	■□□□□ 0.04
HDAC10-216	ENST00000489424	ZFHX3	Q15911	3703 aa		15.3	■□□□□ 0.04
HDAC10-216	ENST00000489424	TMED7-TICAM2	A0A0A6YYA0	188 aa		15.3	■□□□□ 0.04
HDAC10-216	ENST00000489424	ZNF716	A6NP11	495 aa		15.3	■□□□□ 0.04
HDAC10-216	ENST00000489424	FAM171A2	A8MVW0	826 aa		15.3	■□□□□ 0.04
HDAC10-216	ENST00000489424		B2RBV5	119 aa		15.3	■□□□□ 0.04
HDAC10-216	ENST00000489424	ZNF814	B7Z6K7	855 aa		15.3	■□□□□ 0.04
HDAC10-216	ENST00000489424	NME4	O00746	187 aa		15.3	■□□□□ 0.04
HDAC10-216	ENST00000489424	LGI1	O95970	557 aa		15.3	■□□□□ 0.04
HDAC10-216	ENST00000489424	FES	P07332	822 aa		15.3	■□□□□ 0.04
HDAC10-216	ENST00000489424	COX5A	P20674	150 aa		15.3	■□□□□ 0.04
HDAC10-216	ENST00000489424	IL32	P24001	234 aa		15.3	■□□□□ 0.04
HDAC10-216	ENST00000489424	TACR3	P29371	465 aa		15.3	■□□□□ 0.04
HDAC10-216	ENST00000489424	KDELR2	P33947	212 aa		15.3	■□□□□ 0.04
HDAC10-216	ENST00000489424	SLC35A1	P78382	337 aa		15.3	■□□□□ 0.04
HDAC10-216	ENST00000489424	DMTN	Q08495	405 aa		15.3	■□□□□ 0.04
HDAC10-216	ENST00000489424	FOXD4	Q12950	439 aa	Predicted RBP	15.3	■□□□□ 0.04
HDAC10-216	ENST00000489424	LRRC23	Q53EV4	343 aa	Predicted RBP	15.3	■□□□□ 0.04
HDAC10-216	ENST00000489424	TIMM23B	Q5SRD1	257 aa		15.3	■□□□□ 0.04
HDAC10-216	ENST00000489424	ZNF704	Q6ZNC4	412 aa	Predicted RBP	15.3	■□□□□ 0.04
HDAC10-216	ENST00000489424	DNAJA4	Q8WW22	397 aa	Predicted RBP	15.3	■□□□□ 0.04
HDAC10-216	ENST00000489424	ZC3HAV1L	Q96H79	300 aa	Known RBP	15.3	■□□□□ 0.04
HDAC10-216	ENST00000489424	NAA11	Q9BSU3	229 aa	Predicted RBP	15.3	■□□□□ 0.04
HDAC10-216	ENST00000489424	ESRP2	Q9H6T0	727 aa	Known RBP	15.3	■□□□□ 0.04
HDAC10-216	ENST00000489424	ABCD2	Q9UBJ2	740 aa		15.3	■□□□□ 0.04
HDAC10-216	ENST00000489424	OSGIN1	Q9UJX0	560 aa		15.3	■□□□□ 0.04
HDAC10-216	ENST00000489424	TMED7	Q9Y3B3	224 aa		15.3	■□□□□ 0.04
HDAC10-216	ENST00000489424	CXCR6	O00574	342 aa		15.29	■□□□□ 0.04
HDAC10-216	ENST00000489424	TPST1	O60507	370 aa		15.29	■□□□□ 0.04
HDAC10-216	ENST00000489424	ADAM11	O75078	769 aa		15.29	■□□□□ 0.04
HDAC10-216	ENST00000489424	ADA	P00813	363 aa		15.29	■□□□□ 0.04
HDAC10-216	ENST00000489424	OPN1SW	P03999	348 aa		15.29	■□□□□ 0.04
HDAC10-216	ENST00000489424	IFNA8	P32881	189 aa		15.29	■□□□□ 0.04
HDAC10-216	ENST00000489424	GSK3B	P49841	420 aa		15.29	■□□□□ 0.04

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