RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000450873.6

RABGEF1-205, Transcript of RAB guanine nucleotide exchange factor 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 2 BASIC

Gene RABGEF1, Length 2,281 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGEF1-205ENST00000450873 TNFRSF1BP20333 461 aa9.51□□□□□ -0.89
RABGEF1-205ENST00000450873 SHC1P29353 583 aa9.51□□□□□ -0.89
RABGEF1-205ENST00000450873 EIF1AXP47813 144 aaKnown RBP9.51□□□□□ -0.89
RABGEF1-205ENST00000450873 OR1E2P47887 323 aa9.51□□□□□ -0.89
RABGEF1-205ENST00000450873 TPD52P55327 224 aaPredicted RBP9.51□□□□□ -0.89
RABGEF1-205ENST00000450873 TRAP1Q12931 704 aaKnown RBP9.51□□□□□ -0.89
RABGEF1-205ENST00000450873 NDUFA5Q16718 116 aa9.51□□□□□ -0.89
RABGEF1-205ENST00000450873 LRRC36Q1X8D7 754 aa9.51□□□□□ -0.89
RABGEF1-205ENST00000450873 ELOA3BQ3SY89 546 aa9.51□□□□□ -0.89
RABGEF1-205ENST00000450873 ALG10BQ5I7T1 473 aa9.51□□□□□ -0.89
RABGEF1-205ENST00000450873 ENTPD8Q5MY95 495 aa9.51□□□□□ -0.89
RABGEF1-205ENST00000450873 ADGRE4PQ86SQ3 457 aa9.51□□□□□ -0.89
RABGEF1-205ENST00000450873 PQLC1Q8N2U9 271 aa9.51□□□□□ -0.89
RABGEF1-205ENST00000450873 ELOA3Q8NG57 546 aa9.51□□□□□ -0.89
RABGEF1-205ENST00000450873 OR10D3Q8NH80 312 aa9.51□□□□□ -0.89
RABGEF1-205ENST00000450873 ITLN2Q8WWU7 325 aaPredicted RBP9.51□□□□□ -0.89
RABGEF1-205ENST00000450873 OSTF1Q92882 214 aa9.51□□□□□ -0.89
RABGEF1-205ENST00000450873 WNT2BQ93097 391 aa9.51□□□□□ -0.89
RABGEF1-205ENST00000450873 SLC38A4Q969I6 547 aa9.51□□□□□ -0.89
RABGEF1-205ENST00000450873 PYURFQ96I23 114 aa9.51□□□□□ -0.89
RABGEF1-205ENST00000450873 OR5B2Q96R09 309 aa9.51□□□□□ -0.89
RABGEF1-205ENST00000450873 TRIB1Q96RU8 372 aa9.51□□□□□ -0.89
RABGEF1-205ENST00000450873 TTYH2Q9BSA4 534 aa9.51□□□□□ -0.89
RABGEF1-205ENST00000450873 POTEKPQ9BYX7 375 aa9.51□□□□□ -0.89
RABGEF1-205ENST00000450873 POMPQ9Y244 141 aa9.51□□□□□ -0.89
RABGEF1-205ENST00000450873 HDGFL3Q9Y3E1 203 aa9.51□□□□□ -0.89
RABGEF1-205ENST00000450873 ZNF175Q9Y473 711 aa9.51□□□□□ -0.89
RABGEF1-205ENST00000450873 FAM215AQ9Y5M1 114 aa9.51□□□□□ -0.89
RABGEF1-205ENST00000450873 MYO9AB2RTY4 2548 aa9.51□□□□□ -0.89
RABGEF1-205ENST00000450873 CCDC160A6NGH7 325 aa9.51□□□□□ -0.89
RABGEF1-205ENST00000450873 CPSF4LA6NMK7 179 aaKnown RBP9.51□□□□□ -0.89
RABGEF1-205ENST00000450873 A8MVM7 634 aa9.51□□□□□ -0.89
RABGEF1-205ENST00000450873 PRKD3O94806 890 aa9.51□□□□□ -0.89
RABGEF1-205ENST00000450873 GLI4P10075 376 aa9.51□□□□□ -0.89
RABGEF1-205ENST00000450873 IFNA8P32881 189 aa9.51□□□□□ -0.89
RABGEF1-205ENST00000450873 LCN8Q6JVE9 175 aa9.51□□□□□ -0.89
RABGEF1-205ENST00000450873 ZFP1Q6P2D0 407 aa9.51□□□□□ -0.89
RABGEF1-205ENST00000450873 RPTNQ6XPR3 784 aa9.51□□□□□ -0.89
RABGEF1-205ENST00000450873 DEF8Q6ZN54 512 aa9.51□□□□□ -0.89
RABGEF1-205ENST00000450873 TMPPEQ6ZT21 453 aa9.51□□□□□ -0.89
RABGEF1-205ENST00000450873 STK35Q8TDR2 534 aa9.51□□□□□ -0.89
RABGEF1-205ENST00000450873 GRIP2Q9C0E4 1043 aa9.51□□□□□ -0.89
RABGEF1-205ENST00000450873 PLGRKTQ9HBL7 147 aa9.51□□□□□ -0.89
RABGEF1-205ENST00000450873 CLCF1Q9UBD9 225 aa9.51□□□□□ -0.89
RABGEF1-205ENST00000450873 ITPR2Q14571 2701 aa9.5□□□□□ -0.89
RABGEF1-205ENST00000450873 CXCL13O43927 109 aa9.5□□□□□ -0.89
RABGEF1-205ENST00000450873 OR5F1O95221 314 aa9.5□□□□□ -0.89
RABGEF1-205ENST00000450873 SYNGR4O95473 234 aa9.5□□□□□ -0.89
RABGEF1-205ENST00000450873 CDH2P19022 906 aaPredicted RBP9.5□□□□□ -0.89
RABGEF1-205ENST00000450873 TIMP3P35625 211 aa9.5□□□□□ -0.89
RABGEF1-205ENST00000450873 CDH12P55289 794 aa9.5□□□□□ -0.89
RABGEF1-205ENST00000450873 TAS2R41P59536 307 aa9.5□□□□□ -0.89
RABGEF1-205ENST00000450873 RAC3P60763 192 aa9.5□□□□□ -0.89
RABGEF1-205ENST00000450873 CSNK2A1P68400 391 aaPredicted RBP9.5□□□□□ -0.89
RABGEF1-205ENST00000450873 MS4A2Q01362 244 aa9.5□□□□□ -0.89
RABGEF1-205ENST00000450873 PMPCAQ10713 525 aa9.5□□□□□ -0.89
RABGEF1-205ENST00000450873 RIPPLY2Q5TAB7 128 aa9.5□□□□□ -0.89
RABGEF1-205ENST00000450873 C5orf46Q6UWT4 87 aa9.5□□□□□ -0.89
RABGEF1-205ENST00000450873 ZNF808Q8N4W9 903 aaPredicted RBP9.5□□□□□ -0.89
RABGEF1-205ENST00000450873 ADAMTS16Q8TE57 1224 aa9.5□□□□□ -0.89
RABGEF1-205ENST00000450873 RND1Q92730 232 aa9.5□□□□□ -0.89
RABGEF1-205ENST00000450873 CPNE4Q96A23 557 aaPredicted RBP9.5□□□□□ -0.89
RABGEF1-205ENST00000450873 CCDC124Q96CT7 223 aaKnown RBP9.5□□□□□ -0.89
RABGEF1-205ENST00000450873 CCDC120Q96HB5 630 aa9.5□□□□□ -0.89
RABGEF1-205ENST00000450873 LRGUKQ96M69 825 aa9.5□□□□□ -0.89
RABGEF1-205ENST00000450873 TM9SF2Q99805 663 aa9.5□□□□□ -0.89
RABGEF1-205ENST00000450873 TRIM15Q9C019 465 aa9.5□□□□□ -0.89
RABGEF1-205ENST00000450873 AMBRA1Q9C0C7 1298 aa9.5□□□□□ -0.89
RABGEF1-205ENST00000450873 UBAP1Q9NZ09 502 aa9.5□□□□□ -0.89
RABGEF1-205ENST00000450873 MCTS1Q9ULC4 181 aaKnown RBP9.5□□□□□ -0.89
RABGEF1-205ENST00000450873 TRAPPC4Q9Y296 219 aa9.5□□□□□ -0.89
RABGEF1-205ENST00000450873 CEPT1Q9Y6K0 416 aa9.5□□□□□ -0.89
RABGEF1-205ENST00000450873 A0A087WUJ7 227 aa9.49□□□□□ -0.89
RABGEF1-205ENST00000450873 A0A1W2PNR3 127 aa9.49□□□□□ -0.89
RABGEF1-205ENST00000450873 MBD3L4A6NDZ8 208 aaPredicted RBP9.49□□□□□ -0.89
RABGEF1-205ENST00000450873 MBD3L3A6NE82 208 aaPredicted RBP9.49□□□□□ -0.89
RABGEF1-205ENST00000450873 MBD3L5A6NJ08 208 aaPredicted RBP9.49□□□□□ -0.89
RABGEF1-205ENST00000450873 SLC22A20A6NK97 555 aa9.49□□□□□ -0.89
RABGEF1-205ENST00000450873 SULT2B1O00204 365 aa9.49□□□□□ -0.89
RABGEF1-205ENST00000450873 CHP2O43745 196 aa9.49□□□□□ -0.89
RABGEF1-205ENST00000450873 PMS2P2O95744 297 aa9.49□□□□□ -0.89
RABGEF1-205ENST00000450873 GSTT2P0CG29 244 aa9.49□□□□□ -0.89
RABGEF1-205ENST00000450873 GSTT2BP0CG30 244 aa9.49□□□□□ -0.89
RABGEF1-205ENST00000450873 THRBP10828 461 aa9.49□□□□□ -0.89
RABGEF1-205ENST00000450873 PRF1P14222 555 aa9.49□□□□□ -0.89
RABGEF1-205ENST00000450873 NUP107P57740 925 aa9.49□□□□□ -0.89
RABGEF1-205ENST00000450873 MYBPC1Q00872 1141 aa9.49□□□□□ -0.89
RABGEF1-205ENST00000450873 MYBPHQ13203 477 aa9.49□□□□□ -0.89
RABGEF1-205ENST00000450873 CYP2R1Q6VVX0 501 aa9.49□□□□□ -0.89
RABGEF1-205ENST00000450873 P4HA3Q7Z4N8 544 aa9.49□□□□□ -0.89
RABGEF1-205ENST00000450873 RPRMLQ8N4K4 120 aa9.49□□□□□ -0.89
RABGEF1-205ENST00000450873 MBD3L2Q8NHZ7 208 aaPredicted RBP9.49□□□□□ -0.89
RABGEF1-205ENST00000450873 SLC41A3Q96GZ6 507 aa9.49□□□□□ -0.89
RABGEF1-205ENST00000450873 ZNF845Q96IR2 970 aaPredicted RBP9.49□□□□□ -0.89
RABGEF1-205ENST00000450873 PRRG4Q9BZD6 226 aa9.49□□□□□ -0.89
RABGEF1-205ENST00000450873 OR11A1Q9GZK7 315 aa9.49□□□□□ -0.89
RABGEF1-205ENST00000450873 COQ10BQ9H8M1 238 aa9.49□□□□□ -0.89
RABGEF1-205ENST00000450873 RSL24D1Q9UHA3 163 aaKnown RBP9.49□□□□□ -0.89
RABGEF1-205ENST00000450873 RIMS3Q9UJD0 308 aa9.49□□□□□ -0.89
RABGEF1-205ENST00000450873 BOLA2-SMG1P6H3BVE0 249 aa9.49□□□□□ -0.89
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 32.4 ms