RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000332175.12

PTPRM-201, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type M, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRM, Length 6,095 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRM-201ENST00000332175 SLC38A5Q8WUX1 472 aa20.79■□□□□ 0.92
PTPRM-201ENST00000332175 TFAP2CQ92754 450 aa20.79■□□□□ 0.92
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PTPRM-201ENST00000332175 HSFX1Q9UBD0 423 aa20.79■□□□□ 0.92
PTPRM-201ENST00000332175 A0A1W2PPV4 95 aa20.79■□□□□ 0.92
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PTPRM-201ENST00000332175 TSPAN11A1L157 253 aa20.77■□□□□ 0.92
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PTPRM-201ENST00000332175 MPEG1Q2M385 716 aa20.77■□□□□ 0.92
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PTPRM-201ENST00000332175 PAN3Q58A45 887 aaKnown RBP20.76■□□□□ 0.91
PTPRM-201ENST00000332175 COX20Q5RI15 118 aa20.76■□□□□ 0.91
PTPRM-201ENST00000332175 PARM1Q6UWI2 310 aa20.76■□□□□ 0.91
PTPRM-201ENST00000332175 NMNAT3Q96T66 252 aa20.76■□□□□ 0.91
PTPRM-201ENST00000332175 SYT11Q9BT88 431 aa20.76■□□□□ 0.91
PTPRM-201ENST00000332175 SDHAF2Q9NX18 166 aa20.76■□□□□ 0.91
PTPRM-201ENST00000332175 CNOT2Q9NZN8 540 aaKnown RBP20.76■□□□□ 0.91
PTPRM-201ENST00000332175 MYH15Q9Y2K3 1946 aa20.76■□□□□ 0.91
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