RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000325599.12

SHQ1-201, Transcript of SHQ1, H/ACA ribonucleoprotein assembly factor, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SHQ1, Length 2,879 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHQ1-201ENST00000325599 LINC00518Q8N0U6 118 aa15.02□□□□□ -0.01
SHQ1-201ENST00000325599 LMF1Q96S06 567 aa15.02□□□□□ -0.01
SHQ1-201ENST00000325599 ABHD1Q96SE0 405 aa15.02□□□□□ -0.01
SHQ1-201ENST00000325599 CLDN20P56880 219 aa15.01□□□□□ -0.01
SHQ1-201ENST00000325599 GPR176Q14439 515 aa15.01□□□□□ -0.01
SHQ1-201ENST00000325599 PXKQ7Z7A4 578 aa15.01□□□□□ -0.01
SHQ1-201ENST00000325599 LRRC28Q86X40 367 aaPredicted RBP15.01□□□□□ -0.01
SHQ1-201ENST00000325599 C19orf47Q8N9M1 422 aaKnown RBP15.01□□□□□ -0.01
SHQ1-201ENST00000325599 ZPLD1Q8TCW7 415 aa15.01□□□□□ -0.01
SHQ1-201ENST00000325599 ZDHHC1Q8WTX9 485 aa15.01□□□□□ -0.01
SHQ1-201ENST00000325599 UBL7Q96S82 380 aaPredicted RBP15.01□□□□□ -0.01
SHQ1-201ENST00000325599 THAP7Q9BT49 309 aaPredicted RBP15.01□□□□□ -0.01
SHQ1-201ENST00000325599 ST6GALNAC2Q9UJ37 374 aa15.01□□□□□ -0.01
SHQ1-201ENST00000325599 CLDN16Q9Y5I7 305 aa15.01□□□□□ -0.01
SHQ1-201ENST00000325599 C4orf47A7E2U8 309 aa15.01□□□□□ -0.01
SHQ1-201ENST00000325599 ZNF254O75437 659 aa15.01□□□□□ -0.01
SHQ1-201ENST00000325599 CT45A8P0DMV1 189 aa15.01□□□□□ -0.01
SHQ1-201ENST00000325599 CT45A9P0DMV2 189 aa15.01□□□□□ -0.01
SHQ1-201ENST00000325599 FGFBP1Q14512 234 aa15.01□□□□□ -0.01
SHQ1-201ENST00000325599 MFSD13AQ14CX5 517 aa15.01□□□□□ -0.01
SHQ1-201ENST00000325599 CT45A2Q5DJT8 189 aa15.01□□□□□ -0.01
SHQ1-201ENST00000325599 ARHGAP11AQ6P4F7 1023 aa15.01□□□□□ -0.01
SHQ1-201ENST00000325599 ULK3Q6PHR2 472 aa15.01□□□□□ -0.01
SHQ1-201ENST00000325599 Q6ZS52 159 aa15.01□□□□□ -0.01
SHQ1-201ENST00000325599 PARGQ86W56 976 aa15.01□□□□□ -0.01
SHQ1-201ENST00000325599 OR8H3Q8N146 312 aa15.01□□□□□ -0.01
SHQ1-201ENST00000325599 BMPERQ8N8U9 685 aa15.01□□□□□ -0.01
SHQ1-201ENST00000325599 GATSQ8NAP1 163 aa15.01□□□□□ -0.01
SHQ1-201ENST00000325599 TRMT10AQ8TBZ6 339 aaKnown RBP15.01□□□□□ -0.01
SHQ1-201ENST00000325599 PMM1Q92871 262 aa15.01□□□□□ -0.01
SHQ1-201ENST00000325599 GALNT9Q9HCQ5 603 aa15.01□□□□□ -0.01
SHQ1-201ENST00000325599 HAO2Q9NYQ3 351 aa15.01□□□□□ -0.01
SHQ1-201ENST00000325599 WSB2Q9NYS7 404 aaPredicted RBP15.01□□□□□ -0.01
SHQ1-201ENST00000325599 ERVK-19Q9WJR5 959 aa15.01□□□□□ -0.01
SHQ1-201ENST00000325599 SEC16AO15027 2179 aa15.01□□□□□ -0.01
SHQ1-201ENST00000325599 THADAQ6YHU6 1953 aa15□□□□□ -0.01
SHQ1-201ENST00000325599 NUPL2O15504 423 aaKnown RBP15□□□□□ -0.01
SHQ1-201ENST00000325599 EEF1E1O43324 174 aaKnown RBP15□□□□□ -0.01
SHQ1-201ENST00000325599 LTBRP36941 435 aa15□□□□□ -0.01
SHQ1-201ENST00000325599 SRP9P49458 86 aaKnown RBP15□□□□□ -0.01
SHQ1-201ENST00000325599 RNASE12Q5GAN4 147 aaKnown RBP15□□□□□ -0.01
SHQ1-201ENST00000325599 FAM160A2Q8N612 972 aaPredicted RBP15□□□□□ -0.01
SHQ1-201ENST00000325599 OR4D9Q8NGE8 314 aa15□□□□□ -0.01
SHQ1-201ENST00000325599 PELI1Q96FA3 418 aa15□□□□□ -0.01
SHQ1-201ENST00000325599 NMNAT3Q96T66 252 aa15□□□□□ -0.01
SHQ1-201ENST00000325599 MAP3K3Q99759 626 aa15□□□□□ -0.01
SHQ1-201ENST00000325599 MARVELD1Q9BSK0 173 aa15□□□□□ -0.01
SHQ1-201ENST00000325599 GPR174Q9BXC1 333 aa15□□□□□ -0.01
SHQ1-201ENST00000325599 C2orf42Q9NWW7 574 aa15□□□□□ -0.01
SHQ1-201ENST00000325599 MRPL39Q9NYK5 338 aaKnown RBP15□□□□□ -0.01
SHQ1-201ENST00000325599 RPS6KB2Q9UBS0 482 aa15□□□□□ -0.01
SHQ1-201ENST00000325599 SERTAD3Q9UJW9 196 aa15□□□□□ -0.01
SHQ1-201ENST00000325599 MMP17Q9ULZ9 603 aa15□□□□□ -0.01
SHQ1-201ENST00000325599 SHISA7A6NL88 538 aa15□□□□□ -0.01
SHQ1-201ENST00000325599 IFNGP01579 166 aa15□□□□□ -0.01
SHQ1-201ENST00000325599 RPL4P36578 427 aaKnown RBP15□□□□□ -0.01
SHQ1-201ENST00000325599 RBM34P42696 430 aaKnown RBP15□□□□□ -0.01
SHQ1-201ENST00000325599 BTN1A1Q13410 526 aa15□□□□□ -0.01
SHQ1-201ENST00000325599 GRM7Q14831 915 aa15□□□□□ -0.01
SHQ1-201ENST00000325599 DNAJC5GQ8N7S2 189 aa15□□□□□ -0.01
SHQ1-201ENST00000325599 C16orf52Q8NHV5 167 aa15□□□□□ -0.01
SHQ1-201ENST00000325599 ORAI1Q96D31 301 aa15□□□□□ -0.01
SHQ1-201ENST00000325599 ST6GALNAC1Q9NSC7 600 aaPredicted RBP15□□□□□ -0.01
SHQ1-201ENST00000325599 BAIAP2Q9UQB8 552 aa15□□□□□ -0.01
SHQ1-201ENST00000325599 OR5K4A6NMS3 321 aa14.99□□□□□ -0.01
SHQ1-201ENST00000325599 NPIPB9F8W1W9 429 aa14.99□□□□□ -0.01
SHQ1-201ENST00000325599 PSMD9O00233 223 aa14.99□□□□□ -0.01
SHQ1-201ENST00000325599 NDUFB2O95178 105 aa14.99□□□□□ -0.01
SHQ1-201ENST00000325599 RNH1P13489 461 aaKnown RBP14.99□□□□□ -0.01
SHQ1-201ENST00000325599 SDHBP21912 280 aa14.99□□□□□ -0.01
SHQ1-201ENST00000325599 ERP29P30040 261 aaKnown RBP14.99□□□□□ -0.01
SHQ1-201ENST00000325599 PITPNBP48739 271 aa14.99□□□□□ -0.01
SHQ1-201ENST00000325599 NRG3P56975 720 aa14.99□□□□□ -0.01
SHQ1-201ENST00000325599 PRTGQ2VWP7 1150 aa14.99□□□□□ -0.01
SHQ1-201ENST00000325599 ZNF767PQ75MW2 155 aa14.99□□□□□ -0.01
SHQ1-201ENST00000325599 RLN3Q8WXF3 142 aa14.99□□□□□ -0.01
SHQ1-201ENST00000325599 MRPS7Q9Y2R9 242 aaKnown RBP14.99□□□□□ -0.01
SHQ1-201ENST00000325599 TMEM184BQ9Y519 407 aaPredicted RBP14.99□□□□□ -0.01
SHQ1-201ENST00000325599 COL4A2P08572 1712 aa14.99□□□□□ -0.01
SHQ1-201ENST00000325599 FAM171A2A8MVW0 826 aa14.99□□□□□ -0.01
SHQ1-201ENST00000325599 CTNSO60931 367 aa14.99□□□□□ -0.01
SHQ1-201ENST00000325599 CSTAP01040 98 aa14.99□□□□□ -0.01
SHQ1-201ENST00000325599 ARSBP15848 533 aa14.99□□□□□ -0.01
SHQ1-201ENST00000325599 NPR2P20594 1047 aa14.99□□□□□ -0.01
SHQ1-201ENST00000325599 PSMB10P40306 273 aa14.99□□□□□ -0.01
SHQ1-201ENST00000325599 ZNF141Q15928 474 aa14.99□□□□□ -0.01
SHQ1-201ENST00000325599 ESPNLQ6ZVH7 1005 aa14.99□□□□□ -0.01
SHQ1-201ENST00000325599 BCORP1Q8N888 145 aa14.99□□□□□ -0.01
SHQ1-201ENST00000325599 THAP4Q8WY91 577 aa14.99□□□□□ -0.01
SHQ1-201ENST00000325599 RFT1Q96AA3 541 aa14.99□□□□□ -0.01
SHQ1-201ENST00000325599 SGTBQ96EQ0 304 aa14.99□□□□□ -0.01
SHQ1-201ENST00000325599 PDCD1LG2Q9BQ51 273 aa14.99□□□□□ -0.01
SHQ1-201ENST00000325599 PRTFDC1Q9NRG1 225 aa14.99□□□□□ -0.01
SHQ1-201ENST00000325599 MCUBQ9NWR8 336 aa14.99□□□□□ -0.01
SHQ1-201ENST00000325599 ZNF346Q9UL40 294 aaKnown RBP14.99□□□□□ -0.01
SHQ1-201ENST00000325599 COPS3Q9UNS2 423 aa14.99□□□□□ -0.01
SHQ1-201ENST00000325599 OR10H1Q9Y4A9 318 aa14.99□□□□□ -0.01
SHQ1-201ENST00000325599 HSFX4A0A1B0GTS1 333 aaPredicted RBP14.99□□□□□ -0.01
SHQ1-201ENST00000325599 HSFX3A0A1B0GWH4 333 aaPredicted RBP14.99□□□□□ -0.01
SHQ1-201ENST00000325599 INMT-MINDY4F8WBC2 141 aa14.99□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 34.2 ms