RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000317868.8

ATG4C-201, Transcript of autophagy related 4C cysteine peptidase, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene ATG4C, Length 2,938 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG4C-201ENST00000317868 PRPS1P60891 318 aa12.6□□□□□ -0.39
ATG4C-201ENST00000317868 OVCH1Q7RTY7 1134 aa12.6□□□□□ -0.39
ATG4C-201ENST00000317868 OR5H6Q8NGV6 325 aa12.6□□□□□ -0.39
ATG4C-201ENST00000317868 HSD17B8Q92506 261 aa12.6□□□□□ -0.39
ATG4C-201ENST00000317868 PHYHIPQ92561 330 aa12.6□□□□□ -0.39
ATG4C-201ENST00000317868 CMTM3Q96MX0 182 aa12.6□□□□□ -0.39
ATG4C-201ENST00000317868 LMF1Q96S06 567 aa12.6□□□□□ -0.39
ATG4C-201ENST00000317868 RAB33BQ9H082 229 aa12.6□□□□□ -0.39
ATG4C-201ENST00000317868 ANKRD10Q9NXR5 420 aa12.6□□□□□ -0.39
ATG4C-201ENST00000317868 NCDNQ9UBB6 729 aa12.6□□□□□ -0.39
ATG4C-201ENST00000317868 PRODH2Q9UF12 536 aa12.6□□□□□ -0.39
ATG4C-201ENST00000317868 IGHV1OR15-9A0A0B4J2B8 117 aa12.6□□□□□ -0.39
ATG4C-201ENST00000317868 LOC105378220A0A1B0GUY1 285 aaPredicted RBP12.6□□□□□ -0.39
ATG4C-201ENST00000317868 A0A1W2PRG6 482 aa12.6□□□□□ -0.39
ATG4C-201ENST00000317868 IMPA2O14732 288 aa12.6□□□□□ -0.39
ATG4C-201ENST00000317868 FZD7O75084 574 aa12.6□□□□□ -0.39
ATG4C-201ENST00000317868 SERTAD2Q14140 314 aa12.6□□□□□ -0.39
ATG4C-201ENST00000317868 CD226Q15762 336 aa12.6□□□□□ -0.39
ATG4C-201ENST00000317868 NNATQ16517 81 aa12.6□□□□□ -0.39
ATG4C-201ENST00000317868 Q5BKY6 102 aa12.6□□□□□ -0.39
ATG4C-201ENST00000317868 ASCC1Q8N9N2 400 aaKnown RBP12.6□□□□□ -0.39
ATG4C-201ENST00000317868 OR51Q1Q8NH59 317 aa12.6□□□□□ -0.39
ATG4C-201ENST00000317868 PTPMT1Q8WUK0 201 aaPredicted RBP12.6□□□□□ -0.39
ATG4C-201ENST00000317868 NMNAT3Q96T66 252 aa12.6□□□□□ -0.39
ATG4C-201ENST00000317868 MAGEB4O15481 346 aaPredicted RBP12.59□□□□□ -0.39
ATG4C-201ENST00000317868 ORC5O43913 435 aa12.59□□□□□ -0.39
ATG4C-201ENST00000317868 IL33O95760 270 aa12.59□□□□□ -0.39
ATG4C-201ENST00000317868 TXNDC12O95881 172 aa12.59□□□□□ -0.39
ATG4C-201ENST00000317868 ASAH2BP0C7U1 165 aa12.59□□□□□ -0.39
ATG4C-201ENST00000317868 S100A1P23297 94 aa12.59□□□□□ -0.39
ATG4C-201ENST00000317868 UQCRC1P31930 480 aa12.59□□□□□ -0.39
ATG4C-201ENST00000317868 TALDO1P37837 337 aa12.59□□□□□ -0.39
ATG4C-201ENST00000317868 MMP15P51511 669 aa12.59□□□□□ -0.39
ATG4C-201ENST00000317868 GBX2P52951 348 aaPredicted RBP12.59□□□□□ -0.39
ATG4C-201ENST00000317868 SLC25A1P53007 311 aa12.59□□□□□ -0.39
ATG4C-201ENST00000317868 SLC37A1P57057 533 aa12.59□□□□□ -0.39
ATG4C-201ENST00000317868 RRAS2P62070 204 aaPredicted RBP12.59□□□□□ -0.39
ATG4C-201ENST00000317868 EGR4Q05215 589 aa12.59□□□□□ -0.39
ATG4C-201ENST00000317868 TNK1Q13470 666 aa12.59□□□□□ -0.39
ATG4C-201ENST00000317868 EFR3AQ14156 821 aa12.59□□□□□ -0.39
ATG4C-201ENST00000317868 ZNF74Q16587 644 aa12.59□□□□□ -0.39
ATG4C-201ENST00000317868 WBP2NLQ6ICG8 309 aa12.59□□□□□ -0.39
ATG4C-201ENST00000317868 ZNF524Q96C55 264 aa12.59□□□□□ -0.39
ATG4C-201ENST00000317868 CCDC86Q9H6F5 360 aaKnown RBP12.59□□□□□ -0.39
ATG4C-201ENST00000317868 ACOXLQ9NUZ1 547 aa12.59□□□□□ -0.39
ATG4C-201ENST00000317868 PCNX3Q9H6A9 2034 aa12.59□□□□□ -0.39
ATG4C-201ENST00000317868 PRR32B1ATL7 298 aa12.59□□□□□ -0.39
ATG4C-201ENST00000317868 OIP5O43482 229 aa12.59□□□□□ -0.39
ATG4C-201ENST00000317868 SELENOFO60613 162 aa12.59□□□□□ -0.39
ATG4C-201ENST00000317868 GLCEO94923 617 aa12.59□□□□□ -0.39
ATG4C-201ENST00000317868 LGALS3BPQ08380 585 aa12.59□□□□□ -0.39
ATG4C-201ENST00000317868 PON3Q15166 354 aa12.59□□□□□ -0.39
ATG4C-201ENST00000317868 ELOCQ15369 112 aa12.59□□□□□ -0.39
ATG4C-201ENST00000317868 TCTE1Q5JU00 501 aa12.59□□□□□ -0.39
ATG4C-201ENST00000317868 YIPF7Q8N8F6 280 aa12.59□□□□□ -0.39
ATG4C-201ENST00000317868 UBASH3BQ8TF42 649 aa12.59□□□□□ -0.39
ATG4C-201ENST00000317868 YIPF5Q969M3 257 aa12.59□□□□□ -0.39
ATG4C-201ENST00000317868 RASD2Q96D21 266 aa12.59□□□□□ -0.39
ATG4C-201ENST00000317868 GFI1Q99684 422 aa12.59□□□□□ -0.39
ATG4C-201ENST00000317868 SLA2Q9H6Q3 261 aa12.59□□□□□ -0.39
ATG4C-201ENST00000317868 NIPAL2Q9H841 368 aa12.59□□□□□ -0.39
ATG4C-201ENST00000317868 PLSCR3Q9NRY6 295 aa12.59□□□□□ -0.39
ATG4C-201ENST00000317868 IGKV3D-11A0A0A0MRZ8 115 aa12.58□□□□□ -0.39
ATG4C-201ENST00000317868 IGHV5-51A0A0C4DH38 117 aa12.58□□□□□ -0.39
ATG4C-201ENST00000317868 TLCD2A6NGC4 264 aa12.58□□□□□ -0.39
ATG4C-201ENST00000317868 GNB5O14775 395 aa12.58□□□□□ -0.39
ATG4C-201ENST00000317868 CTDSPLO15194 276 aa12.58□□□□□ -0.39
ATG4C-201ENST00000317868 GPRIN2O60269 458 aa12.58□□□□□ -0.39
ATG4C-201ENST00000317868 ARL6IP5O75915 188 aa12.58□□□□□ -0.39
ATG4C-201ENST00000317868 UBL3O95164 117 aa12.58□□□□□ -0.39
ATG4C-201ENST00000317868 C1QBP02746 253 aa12.58□□□□□ -0.39
ATG4C-201ENST00000317868 PNMTP11086 282 aa12.58□□□□□ -0.39
ATG4C-201ENST00000317868 NAA10P41227 235 aaPredicted RBP12.58□□□□□ -0.39
ATG4C-201ENST00000317868 CD83Q01151 205 aa12.58□□□□□ -0.39
ATG4C-201ENST00000317868 BMPERQ8N8U9 685 aa12.58□□□□□ -0.39
ATG4C-201ENST00000317868 OR51L1Q8NGJ5 315 aa12.58□□□□□ -0.39
ATG4C-201ENST00000317868 MOSPD2Q8NHP6 518 aa12.58□□□□□ -0.39
ATG4C-201ENST00000317868 MMABQ96EY8 250 aaPredicted RBP12.58□□□□□ -0.39
ATG4C-201ENST00000317868 C12orf10Q9HB07 376 aa12.58□□□□□ -0.39
ATG4C-201ENST00000317868 PAQR5Q9NXK6 330 aaPredicted RBP12.58□□□□□ -0.39
ATG4C-201ENST00000317868 PCDHGA9Q9Y5G4 932 aaKnown RBP12.58□□□□□ -0.39
ATG4C-201ENST00000317868 CACNG2Q9Y698 323 aa12.58□□□□□ -0.39
ATG4C-201ENST00000317868 C7orf66A4D0T2 115 aa12.58□□□□□ -0.4
ATG4C-201ENST00000317868 SYNDIG1LA6NDD5 238 aa12.58□□□□□ -0.4
ATG4C-201ENST00000317868 GSTZ1O43708 216 aaPredicted RBP12.58□□□□□ -0.4
ATG4C-201ENST00000317868 TMEM127O75204 238 aa12.58□□□□□ -0.4
ATG4C-201ENST00000317868 IGKV3-11P04433 115 aa12.58□□□□□ -0.4
ATG4C-201ENST00000317868 CD1CP29017 333 aa12.58□□□□□ -0.4
ATG4C-201ENST00000317868 PGDP52209 483 aa12.58□□□□□ -0.4
ATG4C-201ENST00000317868 ZNF57Q68EA5 555 aaPredicted RBP12.58□□□□□ -0.4
ATG4C-201ENST00000317868 APOOLQ6UXV4 268 aa12.58□□□□□ -0.4
ATG4C-201ENST00000317868 OR4D9Q8NGE8 314 aa12.58□□□□□ -0.4
ATG4C-201ENST00000317868 LDHAL6BQ9BYZ2 381 aaPredicted RBP12.58□□□□□ -0.4
ATG4C-201ENST00000317868 MMP25Q9NPA2 562 aa12.58□□□□□ -0.4
ATG4C-201ENST00000317868 UBQLN4Q9NRR5 601 aa12.58□□□□□ -0.4
ATG4C-201ENST00000317868 EPHA6Q9UF33 1036 aa12.58□□□□□ -0.4
ATG4C-201ENST00000317868 SPATA2Q9UM82 520 aa12.58□□□□□ -0.4
ATG4C-201ENST00000317868 SLC6A5Q9Y345 797 aa12.58□□□□□ -0.4
ATG4C-201ENST00000317868 OR10H1Q9Y4A9 318 aa12.58□□□□□ -0.4
ATG4C-201ENST00000317868 CEP290O15078 2479 aa12.58□□□□□ -0.4
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 37.4 ms