RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000597718.5

FCHO1-222, Transcript of FCH domain only 1, human

TSL 5

Gene FCHO1, Length 884 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
FCHO1-222	ENST00000597718	LMOD1	P29536	600 aa	Predicted RBP	18.25	■□□□□ 0.51
FCHO1-222	ENST00000597718	SCNN1D	P51172	638 aa		18.25	■□□□□ 0.51
FCHO1-222	ENST00000597718	MAP1S	Q66K74	1059 aa	Predicted RBP	18.25	■□□□□ 0.51
FCHO1-222	ENST00000597718	PNMA8A	Q86V59	439 aa	Predicted RBP	18.25	■□□□□ 0.51
FCHO1-222	ENST00000597718	SP8	Q8IXZ3	490 aa		18.25	■□□□□ 0.51
FCHO1-222	ENST00000597718	ANP32C	O43423	234 aa		18.24	■□□□□ 0.51
FCHO1-222	ENST00000597718	GOLGA2	Q08379	1002 aa		18.24	■□□□□ 0.51
FCHO1-222	ENST00000597718	MPND	Q8N594	471 aa		18.24	■□□□□ 0.51
FCHO1-222	ENST00000597718	C8orf58	Q8NAV2	365 aa		18.24	■□□□□ 0.51
FCHO1-222	ENST00000597718	RTFDC1	Q9BY42	306 aa	Predicted RBP	18.24	■□□□□ 0.51
FCHO1-222	ENST00000597718	COL4A1	P02462	1669 aa		18.24	■□□□□ 0.51
FCHO1-222	ENST00000597718	DUOX1	Q9NRD9	1551 aa		18.23	■□□□□ 0.51
FCHO1-222	ENST00000597718	HSPA1A	P0DMV8	641 aa	Known RBP	18.23	■□□□□ 0.51
FCHO1-222	ENST00000597718	HSPA1B	P0DMV9	641 aa	Known RBP	18.23	■□□□□ 0.51
FCHO1-222	ENST00000597718	EPS15	P42566	896 aa		18.23	■□□□□ 0.51
FCHO1-222	ENST00000597718	RIC3	Q7Z5B4	369 aa		18.23	■□□□□ 0.51
FCHO1-222	ENST00000597718	SUPT20H	Q8NEM7	779 aa		18.23	■□□□□ 0.51
FCHO1-222	ENST00000597718	COL13A1	Q5TAT6	717 aa	Predicted RBP	18.22	■□□□□ 0.51
FCHO1-222	ENST00000597718	CNTROB	Q8N137	903 aa		18.22	■□□□□ 0.51
FCHO1-222	ENST00000597718	CELF1	Q92879	486 aa	Known RBP	18.22	■□□□□ 0.51
FCHO1-222	ENST00000597718	LRRC37A	A6NMS7	1700 aa		18.22	■□□□□ 0.51
FCHO1-222	ENST00000597718	IRS4	O14654	1257 aa	Predicted RBP	18.21	■□□□□ 0.51
FCHO1-222	ENST00000597718	CENPB	P07199	599 aa	Predicted RBP	18.21	■□□□□ 0.51
FCHO1-222	ENST00000597718	TSR2	Q969E8	191 aa	Known RBP	18.21	■□□□□ 0.51
FCHO1-222	ENST00000597718	MYD88	Q99836	296 aa		18.21	■□□□□ 0.51
FCHO1-222	ENST00000597718	ZNRF3	Q9ULT6	936 aa		18.21	■□□□□ 0.51
FCHO1-222	ENST00000597718	CNTNAP1	P78357	1384 aa		18.2	■□□□□ 0.5
FCHO1-222	ENST00000597718	TMEM88B	A6NKF7	163 aa		18.2	■□□□□ 0.5
FCHO1-222	ENST00000597718	CXCL9	Q07325	125 aa		18.2	■□□□□ 0.5
FCHO1-222	ENST00000597718	KIAA2012	Q0VF49	1180 aa		18.2	■□□□□ 0.5
FCHO1-222	ENST00000597718	SF3B3	Q15393	1217 aa	Known RBP	18.2	■□□□□ 0.5
FCHO1-222	ENST00000597718	TSPYL6	Q8N831	410 aa		18.2	■□□□□ 0.5
FCHO1-222	ENST00000597718	VPS33B	Q9H267	617 aa		18.2	■□□□□ 0.5
FCHO1-222	ENST00000597718	CCER2	I3L3R5	266 aa		18.19	■□□□□ 0.5
FCHO1-222	ENST00000597718	TRIM28	Q13263	835 aa	Known RBP	18.19	■□□□□ 0.5
FCHO1-222	ENST00000597718	TMC4	Q7Z404	712 aa		18.19	■□□□□ 0.5
FCHO1-222	ENST00000597718	RAD17	O75943	681 aa		18.18	■□□□□ 0.5
FCHO1-222	ENST00000597718	GMPS	P49915	693 aa	Predicted RBP	18.18	■□□□□ 0.5
FCHO1-222	ENST00000597718	FMR1	Q06787	632 aa	Known RBP eCLIP	18.18	■□□□□ 0.5
FCHO1-222	ENST00000597718	CCDC30	Q5VVM6	783 aa		18.18	■□□□□ 0.5
FCHO1-222	ENST00000597718	JARID2	Q92833	1246 aa	Predicted RBP	18.18	■□□□□ 0.5
FCHO1-222	ENST00000597718	GPRC5D	Q9NZD1	345 aa		18.18	■□□□□ 0.5
FCHO1-222	ENST00000597718	CIAPIN1	Q6FI81	312 aa		18.17	■□□□□ 0.5
FCHO1-222	ENST00000597718	USP50	Q70EL3	339 aa	Predicted RBP	18.17	■□□□□ 0.5
FCHO1-222	ENST00000597718	ZBTB38	Q8NAP3	1195 aa	Predicted RBP	18.17	■□□□□ 0.5
FCHO1-222	ENST00000597718	NSFL1C	Q9UNZ2	370 aa	Known RBP	18.17	■□□□□ 0.5
FCHO1-222	ENST00000597718	YDJC	A8MPS7	323 aa		18.16	■□□□□ 0.5
FCHO1-222	ENST00000597718	GPSM2	P81274	684 aa		18.16	■□□□□ 0.5
FCHO1-222	ENST00000597718	WWC1	Q8IX03	1113 aa		18.16	■□□□□ 0.5
FCHO1-222	ENST00000597718	MRS2	Q9HD23	443 aa		18.16	■□□□□ 0.5
FCHO1-222	ENST00000597718	SEC31B	Q9NQW1	1179 aa		18.16	■□□□□ 0.5
FCHO1-222	ENST00000597718	RIMBP2	O15034	1052 aa		18.15	■□□□□ 0.5
FCHO1-222	ENST00000597718	VEGFB	P49765	207 aa		18.15	■□□□□ 0.5
FCHO1-222	ENST00000597718	CCDC191	Q8NCU4	936 aa		18.15	■□□□□ 0.5
FCHO1-222	ENST00000597718	GPR101	Q96P66	508 aa	Predicted RBP	18.15	■□□□□ 0.5
FCHO1-222	ENST00000597718	CCDC85A	Q96PX6	553 aa	Predicted RBP	18.15	■□□□□ 0.5
FCHO1-222	ENST00000597718	METTL22	Q9BUU2	404 aa	Predicted RBP	18.15	■□□□□ 0.5
FCHO1-222	ENST00000597718	BCL2L13	Q9BXK5	485 aa		18.15	■□□□□ 0.5
FCHO1-222	ENST00000597718	ADARB2	Q9NS39	739 aa	Known RBP	18.15	■□□□□ 0.5
FCHO1-222	ENST00000597718	CWC25	Q9NXE8	425 aa	Predicted RBP	18.15	■□□□□ 0.5
FCHO1-222	ENST00000597718	MAP3K2	Q9Y2U5	619 aa		18.15	■□□□□ 0.5
FCHO1-222	ENST00000597718	C6orf229	H3BNL8	230 aa		18.14	■□□□□ 0.49
FCHO1-222	ENST00000597718	TRAF5	O00463	557 aa		18.14	■□□□□ 0.49
FCHO1-222	ENST00000597718	DDX58	O95786	925 aa	Known RBP	18.14	■□□□□ 0.49
FCHO1-222	ENST00000597718	PCCA	P05165	728 aa	Predicted RBP	18.14	■□□□□ 0.49
FCHO1-222	ENST00000597718	TNIP1	Q15025	636 aa		18.14	■□□□□ 0.49
FCHO1-222	ENST00000597718	CCDC27	Q2M243	656 aa		18.14	■□□□□ 0.49
FCHO1-222	ENST00000597718	WASHC4	Q2M389	1173 aa		18.14	■□□□□ 0.49
FCHO1-222	ENST00000597718	DBNDD1	Q9H9R9	158 aa		18.14	■□□□□ 0.49
FCHO1-222	ENST00000597718	POLL	Q9UGP5	575 aa		18.14	■□□□□ 0.49
FCHO1-222	ENST00000597718	ABT1	Q9ULW3	272 aa	Known RBP	18.14	■□□□□ 0.49
FCHO1-222	ENST00000597718	SHTN1	A0MZ66	631 aa		18.13	■□□□□ 0.49
FCHO1-222	ENST00000597718	RPS8	P62241	208 aa	Known RBP	18.13	■□□□□ 0.49
FCHO1-222	ENST00000597718	PI4KAP2	A4QPH2	592 aa		18.12	■□□□□ 0.49
FCHO1-222	ENST00000597718	RASSF10	A6NK89	507 aa		18.12	■□□□□ 0.49
FCHO1-222	ENST00000597718	DOK7	Q18PE1	504 aa		18.12	■□□□□ 0.49
FCHO1-222	ENST00000597718	TWISTNB	Q3B726	338 aa	Predicted RBP	18.12	■□□□□ 0.49
FCHO1-222	ENST00000597718	TNS4	Q8IZW8	715 aa		18.12	■□□□□ 0.49
FCHO1-222	ENST00000597718	PI4KAP1	Q8N8J0	262 aa		18.12	■□□□□ 0.49
FCHO1-222	ENST00000597718	STK31	Q9BXU1	1019 aa		18.12	■□□□□ 0.49
FCHO1-222	ENST00000597718	CHMP4A	Q9BY43	222 aa		18.12	■□□□□ 0.49
FCHO1-222	ENST00000597718	ZBTB12	Q9Y330	459 aa	Predicted RBP	18.12	■□□□□ 0.49
FCHO1-222	ENST00000597718	SALL2	Q9Y467	1007 aa	Predicted RBP	18.12	■□□□□ 0.49
FCHO1-222	ENST00000597718	PDE8A	O60658	829 aa		18.11	■□□□□ 0.49
FCHO1-222	ENST00000597718	IGKV5-2	P06315	115 aa		18.11	■□□□□ 0.49
FCHO1-222	ENST00000597718	HSP90B1	P14625	803 aa	Known RBP	18.11	■□□□□ 0.49
FCHO1-222	ENST00000597718	DEFB115	Q30KQ5	88 aa		18.11	■□□□□ 0.49
FCHO1-222	ENST00000597718	CCDC152	Q4G0S7	254 aa		18.11	■□□□□ 0.49
FCHO1-222	ENST00000597718	KSR2	Q6VAB6	950 aa		18.11	■□□□□ 0.49
FCHO1-222	ENST00000597718	G2E3	Q7L622	706 aa		18.11	■□□□□ 0.49
FCHO1-222	ENST00000597718	TBC1D16	Q8TBP0	767 aa		18.11	■□□□□ 0.49
FCHO1-222	ENST00000597718	TRPM4	Q8TD43	1214 aa		18.11	■□□□□ 0.49
FCHO1-222	ENST00000597718	CDHR2	Q9BYE9	1310 aa		18.11	■□□□□ 0.49
FCHO1-222	ENST00000597718	PSMD14	O00487	310 aa		18.1	■□□□□ 0.49
FCHO1-222	ENST00000597718	FOXN1	O15353	648 aa		18.1	■□□□□ 0.49
FCHO1-222	ENST00000597718	ECE2	O60344	883 aa		18.1	■□□□□ 0.49
FCHO1-222	ENST00000597718	HIRA	P54198	1017 aa	Predicted RBP	18.1	■□□□□ 0.49
FCHO1-222	ENST00000597718	GLIS2	Q9BZE0	524 aa	Predicted RBP	18.1	■□□□□ 0.49
FCHO1-222	ENST00000597718	KCNQ5	Q9NR82	932 aa		18.1	■□□□□ 0.49
FCHO1-222	ENST00000597718	CNOT7	Q9UIV1	285 aa	Known RBP	18.1	■□□□□ 0.49

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