RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000568721.1

KCTD13-208, Transcript of potassium channel tetramerization domain containing 13, human

TSL 2

Gene KCTD13, Length 589 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
KCTD13-208	ENST00000568721	GRAPL	Q8TC17	118 aa	Predicted RBP	28.16	■■■□□ 2.1
KCTD13-208	ENST00000568721	ATP6V0A2	Q9Y487	856 aa		28.16	■■■□□ 2.1
KCTD13-208	ENST00000568721	PDE8A	O60658	829 aa		28.15	■■■□□ 2.1
KCTD13-208	ENST00000568721	HNRNPU	Q00839	825 aa	Known RBP eCLIP	28.15	■■■□□ 2.1
KCTD13-208	ENST00000568721	ZC3H4	Q9UPT8	1303 aa	Known RBP	28.15	■■■□□ 2.1
KCTD13-208	ENST00000568721	LRRC37A	A6NMS7	1700 aa		28.15	■■■□□ 2.1
KCTD13-208	ENST00000568721	CASP7	P55210	303 aa		28.14	■■■□□ 2.1
KCTD13-208	ENST00000568721	CELF1	Q92879	486 aa	Known RBP	28.14	■■■□□ 2.1
KCTD13-208	ENST00000568721	PSMD1	Q99460	953 aa		28.14	■■■□□ 2.1
KCTD13-208	ENST00000568721	GPBP1L1	Q9HC44	474 aa	Predicted RBP	28.14	■■■□□ 2.1
KCTD13-208	ENST00000568721	ALDH1L2	Q3SY69	923 aa		28.13	■■■□□ 2.09
KCTD13-208	ENST00000568721	SP8	Q8IXZ3	490 aa		28.13	■■■□□ 2.09
KCTD13-208	ENST00000568721	CT47B1	P0C2W7	299 aa	Predicted RBP	28.12	■■■□□ 2.09
KCTD13-208	ENST00000568721	ZNF277	Q9NRM2	450 aa	Predicted RBP	28.12	■■■□□ 2.09
KCTD13-208	ENST00000568721	HSP90B1	P14625	803 aa	Known RBP	28.11	■■■□□ 2.09
KCTD13-208	ENST00000568721	GRIPAP1	Q4V328	841 aa		28.11	■■■□□ 2.09
KCTD13-208	ENST00000568721	SEC31B	Q9NQW1	1179 aa		28.11	■■■□□ 2.09
KCTD13-208	ENST00000568721	UBE3B	Q7Z3V4	1068 aa		28.1	■■■□□ 2.09
KCTD13-208	ENST00000568721	BCL2L13	Q9BXK5	485 aa		28.1	■■■□□ 2.09
KCTD13-208	ENST00000568721	COL4A5	P29400	1685 aa		28.08	■■■□□ 2.09
KCTD13-208	ENST00000568721	KIF3C	O14782	793 aa		28.08	■■■□□ 2.09
KCTD13-208	ENST00000568721	TTLL11	Q8NHH1	800 aa		28.08	■■■□□ 2.09
KCTD13-208	ENST00000568721	PLA2G12B	Q9BX93	195 aa		28.08	■■■□□ 2.09
KCTD13-208	ENST00000568721	GLTPD2	A6NH11	291 aa		28.07	■■■□□ 2.08
KCTD13-208	ENST00000568721	IARS	P41252	1262 aa	Known RBP	28.07	■■■□□ 2.08
KCTD13-208	ENST00000568721	CTSW	P56202	376 aa		28.07	■■■□□ 2.08
KCTD13-208	ENST00000568721	CCDC152	Q4G0S7	254 aa		28.07	■■■□□ 2.08
KCTD13-208	ENST00000568721	TMC4	Q7Z404	712 aa		28.07	■■■□□ 2.08
KCTD13-208	ENST00000568721	NMRK2	Q9NPI5	230 aa		28.07	■■■□□ 2.08
KCTD13-208	ENST00000568721	PTPRC	P08575	1304 aa		28.07	■■■□□ 2.08
KCTD13-208	ENST00000568721	LTBP1	Q14766	1721 aa		28.06	■■■□□ 2.08
KCTD13-208	ENST00000568721	BRPF1	P55201	1214 aa	Predicted RBP	28.06	■■■□□ 2.08
KCTD13-208	ENST00000568721	RPS8	P62241	208 aa	Known RBP	28.06	■■■□□ 2.08
KCTD13-208	ENST00000568721	CCDC85A	Q96PX6	553 aa	Predicted RBP	28.06	■■■□□ 2.08
KCTD13-208	ENST00000568721	RTFDC1	Q9BY42	306 aa	Predicted RBP	28.06	■■■□□ 2.08
KCTD13-208	ENST00000568721	SPEF2	Q9C093	1822 aa		28.06	■■■□□ 2.08
KCTD13-208	ENST00000568721	SLC4A10	Q6U841	1118 aa		28.05	■■■□□ 2.08
KCTD13-208	ENST00000568721	DUOX1	Q9NRD9	1551 aa		28.05	■■■□□ 2.08
KCTD13-208	ENST00000568721	ALDH1L1	O75891	902 aa		28.04	■■■□□ 2.08
KCTD13-208	ENST00000568721	SMC4	Q9NTJ3	1288 aa		28.04	■■■□□ 2.08
KCTD13-208	ENST00000568721	WDR90	Q96KV7	1748 aa		28.04	■■■□□ 2.08
KCTD13-208	ENST00000568721	KDM2B	Q8NHM5	1336 aa		28.03	■■■□□ 2.08
KCTD13-208	ENST00000568721	CSF1R	P07333	972 aa		28.03	■■■□□ 2.08
KCTD13-208	ENST00000568721	RARS	P54136	660 aa	Known RBP	28.03	■■■□□ 2.08
KCTD13-208	ENST00000568721	MPND	Q8N594	471 aa		28.03	■■■□□ 2.08
KCTD13-208	ENST00000568721	RTL9	Q8NET4	1388 aa		28.02	■■■□□ 2.08
KCTD13-208	ENST00000568721	ZBED9	Q6R2W3	1325 aa		28.02	■■■□□ 2.08
KCTD13-208	ENST00000568721	SRCIN1	Q9C0H9	1055 aa		28.02	■■■□□ 2.08
KCTD13-208	ENST00000568721	TMX4	Q9H1E5	349 aa	Predicted RBP	28.02	■■■□□ 2.08
KCTD13-208	ENST00000568721	GREM2	Q9H772	168 aa		28.02	■■■□□ 2.08
KCTD13-208	ENST00000568721	POTEC	B2RU33	542 aa		28.01	■■■□□ 2.07
KCTD13-208	ENST00000568721	FZD9	O00144	591 aa		28.01	■■■□□ 2.07
KCTD13-208	ENST00000568721	GRM8	O00222	908 aa		28.01	■■■□□ 2.07
KCTD13-208	ENST00000568721	RRAGC	Q9HB90	399 aa		28.01	■■■□□ 2.07
KCTD13-208	ENST00000568721	FOXO4	P98177	505 aa		28	■■■□□ 2.07
KCTD13-208	ENST00000568721	DPP8	Q6V1X1	898 aa	Predicted RBP	28	■■■□□ 2.07
KCTD13-208	ENST00000568721	DPY19L2	Q6NUT2	758 aa		27.99	■■■□□ 2.07
KCTD13-208	ENST00000568721	VPS33B	Q9H267	617 aa		27.99	■■■□□ 2.07
KCTD13-208	ENST00000568721	DDN	O94850	711 aa	Predicted RBP	27.98	■■■□□ 2.07
KCTD13-208	ENST00000568721	C1QTNF8	P60827	252 aa		27.98	■■■□□ 2.07
KCTD13-208	ENST00000568721	GPSM2	P81274	684 aa		27.98	■■■□□ 2.07
KCTD13-208	ENST00000568721	EPHA10	Q5JZY3	1008 aa		27.98	■■■□□ 2.07
KCTD13-208	ENST00000568721	NOB1	Q9ULX3	412 aa	Known RBP	27.98	■■■□□ 2.07
KCTD13-208	ENST00000568721	UTY	O14607	1347 aa		27.97	■■■□□ 2.07
KCTD13-208	ENST00000568721	AOC3	Q16853	763 aa		27.97	■■■□□ 2.07
KCTD13-208	ENST00000568721	SUPT20H	Q8NEM7	779 aa		27.97	■■■□□ 2.07
KCTD13-208	ENST00000568721	ZNF541	Q9H0D2	1346 aa		27.96	■■■□□ 2.07
KCTD13-208	ENST00000568721	ANKRD18A	Q8IVF6	992 aa		27.96	■■■□□ 2.07
KCTD13-208	ENST00000568721	LARGE2	Q8N3Y3	721 aa		27.96	■■■□□ 2.07
KCTD13-208	ENST00000568721	KAZALD1	Q96I82	304 aa		27.96	■■■□□ 2.07
KCTD13-208	ENST00000568721	C9orf78	Q9NZ63	289 aa	Predicted RBP	27.96	■■■□□ 2.07
KCTD13-208	ENST00000568721	POLL	Q9UGP5	575 aa		27.96	■■■□□ 2.07
KCTD13-208	ENST00000568721	NSFL1C	Q9UNZ2	370 aa	Known RBP	27.96	■■■□□ 2.07
KCTD13-208	ENST00000568721	PPIP5K2	O43314	1243 aa		27.95	■■■□□ 2.06
KCTD13-208	ENST00000568721	NBPF7	P0C2Y1	421 aa	Predicted RBP	27.95	■■■□□ 2.06
KCTD13-208	ENST00000568721	JDP2	Q8WYK2	163 aa		27.95	■■■□□ 2.06
KCTD13-208	ENST00000568721	CDC5L	Q99459	802 aa	Known RBP	27.95	■■■□□ 2.06
KCTD13-208	ENST00000568721	PODXL2	Q9NZ53	605 aa		27.95	■■■□□ 2.06
KCTD13-208	ENST00000568721	ITGA6	P23229	1130 aa		27.94	■■■□□ 2.06
KCTD13-208	ENST00000568721	KIAA2012	Q0VF49	1180 aa		27.94	■■■□□ 2.06
KCTD13-208	ENST00000568721	FAM161A	Q3B820	660 aa		27.94	■■■□□ 2.06
KCTD13-208	ENST00000568721	SCN4A	P35499	1836 aa		27.94	■■■□□ 2.06
KCTD13-208	ENST00000568721	BSDC1	Q9NW68	430 aa	Predicted RBP	27.93	■■■□□ 2.06
KCTD13-208	ENST00000568721	BCAR3	O75815	825 aa		27.92	■■■□□ 2.06
KCTD13-208	ENST00000568721	VEGFA	P15692	232 aa	Predicted RBP	27.92	■■■□□ 2.06
KCTD13-208	ENST00000568721	SUCLG2	Q96I99	432 aa		27.92	■■■□□ 2.06
KCTD13-208	ENST00000568721	USP44	Q9H0E7	712 aa		27.92	■■■□□ 2.06
KCTD13-208	ENST00000568721	LMBR1L	Q6UX01	489 aa		27.91	■■■□□ 2.06
KCTD13-208	ENST00000568721	TBC1D16	Q8TBP0	767 aa		27.91	■■■□□ 2.06
KCTD13-208	ENST00000568721	ARHGAP45	Q92619	1136 aa		27.91	■■■□□ 2.06
KCTD13-208	ENST00000568721	TOMM70	O94826	608 aa		27.9	■■■□□ 2.06
KCTD13-208	ENST00000568721	L3MBTL3	Q96JM7	780 aa	Predicted RBP	27.9	■■■□□ 2.06
KCTD13-208	ENST00000568721	MINPP1	Q9UNW1	487 aa		27.9	■■■□□ 2.06
KCTD13-208	ENST00000568721		A0A1B0GUL6	1792 aa		27.9	■■■□□ 2.06
KCTD13-208	ENST00000568721	NIM1K	Q8IY84	436 aa		27.89	■■■□□ 2.06
KCTD13-208	ENST00000568721	API5	Q9BZZ5	524 aa	Known RBP	27.89	■■■□□ 2.06
KCTD13-208	ENST00000568721	C6orf229	H3BNL8	230 aa		27.88	■■■□□ 2.05
KCTD13-208	ENST00000568721	WASHC4	Q2M389	1173 aa		27.88	■■■□□ 2.05
KCTD13-208	ENST00000568721	GPR101	Q96P66	508 aa	Predicted RBP	27.88	■■■□□ 2.05
KCTD13-208	ENST00000568721	WTIP	A6NIX2	430 aa	Predicted RBP	27.87	■■■□□ 2.05

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