RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000562311.5

KIFC3-209, Transcript of kinesin family member C3, human

TSL 5

Gene KIFC3, Length 777 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
KIFC3-209	ENST00000562311	CELF1	Q92879	486 aa	Known RBP	32.84	■■■□□ 2.85
KIFC3-209	ENST00000562311	TSR2	Q969E8	191 aa	Known RBP	32.84	■■■□□ 2.85
KIFC3-209	ENST00000562311	BBOX1	O75936	387 aa		32.83	■■■□□ 2.85
KIFC3-209	ENST00000562311	FMR1	Q06787	632 aa	Known RBP eCLIP	32.83	■■■□□ 2.85	1e-6	■■■■□ 23.7
KIFC3-209	ENST00000562311	GRIPAP1	Q4V328	841 aa		32.83	■■■□□ 2.85
KIFC3-209	ENST00000562311	COL13A1	Q5TAT6	717 aa	Predicted RBP	32.83	■■■□□ 2.85
KIFC3-209	ENST00000562311	DDX46	Q7L014	1031 aa	Known RBP	32.83	■■■□□ 2.85
KIFC3-209	ENST00000562311	CLEC11A	Q9Y240	323 aa		32.83	■■■□□ 2.85
KIFC3-209	ENST00000562311	DPP8	Q6V1X1	898 aa	Predicted RBP	32.82	■■■□□ 2.84
KIFC3-209	ENST00000562311	JARID2	Q92833	1246 aa	Predicted RBP	32.81	■■■□□ 2.84
KIFC3-209	ENST00000562311	CXCL9	Q07325	125 aa		32.8	■■■□□ 2.84
KIFC3-209	ENST00000562311	MPND	Q8N594	471 aa		32.8	■■■□□ 2.84
KIFC3-209	ENST00000562311	HSPA1A	P0DMV8	641 aa	Known RBP	32.79	■■■□□ 2.84
KIFC3-209	ENST00000562311	HSPA1B	P0DMV9	641 aa	Known RBP	32.79	■■■□□ 2.84
KIFC3-209	ENST00000562311	SF3B3	Q15393	1217 aa	Known RBP	32.79	■■■□□ 2.84
KIFC3-209	ENST00000562311	TRIM28	Q13263	835 aa	Known RBP	32.78	■■■□□ 2.84
KIFC3-209	ENST00000562311	RIC3	Q7Z5B4	369 aa		32.78	■■■□□ 2.84
KIFC3-209	ENST00000562311	CNTROB	Q8N137	903 aa		32.78	■■■□□ 2.84
KIFC3-209	ENST00000562311	MYD88	Q99836	296 aa		32.78	■■■□□ 2.84
KIFC3-209	ENST00000562311	YDJC	A8MPS7	323 aa		32.77	■■■□□ 2.84
KIFC3-209	ENST00000562311	IRS4	O14654	1257 aa	Predicted RBP	32.77	■■■□□ 2.84
KIFC3-209	ENST00000562311	KIAA2012	Q0VF49	1180 aa		32.77	■■■□□ 2.84
KIFC3-209	ENST00000562311	PNMA8A	Q86V59	439 aa	Predicted RBP	32.77	■■■□□ 2.84
KIFC3-209	ENST00000562311	CNTNAP1	P78357	1384 aa		32.77	■■■□□ 2.84
KIFC3-209	ENST00000562311	CALD1	Q05682	793 aa	Known RBP	32.76	■■■□□ 2.83
KIFC3-209	ENST00000562311	GOLGA2	Q08379	1002 aa		32.76	■■■□□ 2.83
KIFC3-209	ENST00000562311	ZNRF3	Q9ULT6	936 aa		32.76	■■■□□ 2.83
KIFC3-209	ENST00000562311	SHTN1	A0MZ66	631 aa		32.75	■■■□□ 2.83
KIFC3-209	ENST00000562311	GPR101	Q96P66	508 aa	Predicted RBP	32.75	■■■□□ 2.83
KIFC3-209	ENST00000562311	RAD17	O75943	681 aa		32.74	■■■□□ 2.83
KIFC3-209	ENST00000562311	WWC1	Q8IX03	1113 aa		32.74	■■■□□ 2.83
KIFC3-209	ENST00000562311	SEC31B	Q9NQW1	1179 aa		32.74	■■■□□ 2.83
KIFC3-209	ENST00000562311	LMOD1	P29536	600 aa	Predicted RBP	32.73	■■■□□ 2.83
KIFC3-209	ENST00000562311	GMPS	P49915	693 aa	Predicted RBP	32.73	■■■□□ 2.83
KIFC3-209	ENST00000562311	SUPT20H	Q8NEM7	779 aa		32.73	■■■□□ 2.83
KIFC3-209	ENST00000562311	GPRC5D	Q9NZD1	345 aa		32.73	■■■□□ 2.83
KIFC3-209	ENST00000562311	TMEM88B	A6NKF7	163 aa		32.72	■■■□□ 2.83
KIFC3-209	ENST00000562311	GPSM2	P81274	684 aa		32.72	■■■□□ 2.83
KIFC3-209	ENST00000562311	TMX4	Q9H1E5	349 aa	Predicted RBP	32.72	■■■□□ 2.83
KIFC3-209	ENST00000562311	VPS33B	Q9H267	617 aa		32.72	■■■□□ 2.83
KIFC3-209	ENST00000562311	TRAF5	O00463	557 aa		32.71	■■■□□ 2.83
KIFC3-209	ENST00000562311	ZBTB38	Q8NAP3	1195 aa	Predicted RBP	32.71	■■■□□ 2.83
KIFC3-209	ENST00000562311	POLL	Q9UGP5	575 aa		32.71	■■■□□ 2.83
KIFC3-209	ENST00000562311	VEGFB	P49765	207 aa		32.69	■■■□□ 2.82
KIFC3-209	ENST00000562311	G2E3	Q7L622	706 aa		32.69	■■■□□ 2.82
KIFC3-209	ENST00000562311	CCDC85A	Q96PX6	553 aa	Predicted RBP	32.69	■■■□□ 2.82
KIFC3-209	ENST00000562311	METTL22	Q9BUU2	404 aa	Predicted RBP	32.69	■■■□□ 2.82
KIFC3-209	ENST00000562311	CCDC27	Q2M243	656 aa		32.68	■■■□□ 2.82
KIFC3-209	ENST00000562311	MRS2	Q9HD23	443 aa		32.68	■■■□□ 2.82
KIFC3-209	ENST00000562311	NSFL1C	Q9UNZ2	370 aa	Known RBP	32.68	■■■□□ 2.82
KIFC3-209	ENST00000562311	MAP3K2	Q9Y2U5	619 aa		32.68	■■■□□ 2.82
KIFC3-209	ENST00000562311	IGKV5-2	P06315	115 aa		32.67	■■■□□ 2.82
KIFC3-209	ENST00000562311	CCDC30	Q5VVM6	783 aa		32.67	■■■□□ 2.82
KIFC3-209	ENST00000562311	CIAPIN1	Q6FI81	312 aa		32.67	■■■□□ 2.82
KIFC3-209	ENST00000562311	KCNQ5	Q9NR82	932 aa		32.67	■■■□□ 2.82
KIFC3-209	ENST00000562311	ZNF316	A6NFI3	1004 aa	Predicted RBP	32.66	■■■□□ 2.82
KIFC3-209	ENST00000562311	RIMBP2	O15034	1052 aa		32.66	■■■□□ 2.82
KIFC3-209	ENST00000562311	HIRA	P54198	1017 aa	Predicted RBP	32.66	■■■□□ 2.82
KIFC3-209	ENST00000562311	TMC4	Q7Z404	712 aa		32.66	■■■□□ 2.82
KIFC3-209	ENST00000562311	TRPM4	Q8TD43	1214 aa		32.66	■■■□□ 2.82
KIFC3-209	ENST00000562311	DBNDD1	Q9H9R9	158 aa		32.66	■■■□□ 2.82
KIFC3-209	ENST00000562311	PCCA	P05165	728 aa	Predicted RBP	32.65	■■■□□ 2.82
KIFC3-209	ENST00000562311	USP50	Q70EL3	339 aa	Predicted RBP	32.65	■■■□□ 2.82
KIFC3-209	ENST00000562311	CCDC191	Q8NCU4	936 aa		32.65	■■■□□ 2.82
KIFC3-209	ENST00000562311	RPS8	P62241	208 aa	Known RBP	32.64	■■■□□ 2.82
KIFC3-209	ENST00000562311	SCN9A	Q15858	1988 aa		32.64	■■■□□ 2.82
KIFC3-209	ENST00000562311	ADARB2	Q9NS39	739 aa	Known RBP	32.64	■■■□□ 2.82
KIFC3-209	ENST00000562311	CWC25	Q9NXE8	425 aa	Predicted RBP	32.64	■■■□□ 2.82
KIFC3-209	ENST00000562311	ZBTB12	Q9Y330	459 aa	Predicted RBP	32.64	■■■□□ 2.82
KIFC3-209	ENST00000562311	RTL9	Q8NET4	1388 aa		32.63	■■■□□ 2.81
KIFC3-209	ENST00000562311	PI4KAP2	A4QPH2	592 aa		32.63	■■■□□ 2.81
KIFC3-209	ENST00000562311	PI4KAP1	Q8N8J0	262 aa		32.63	■■■□□ 2.81
KIFC3-209	ENST00000562311	SALL2	Q9Y467	1007 aa	Predicted RBP	32.63	■■■□□ 2.81
KIFC3-209	ENST00000562311	DOK7	Q18PE1	504 aa		32.62	■■■□□ 2.81
KIFC3-209	ENST00000562311	TWISTNB	Q3B726	338 aa	Predicted RBP	32.62	■■■□□ 2.81
KIFC3-209	ENST00000562311	CST9	Q5W186	159 aa		32.62	■■■□□ 2.81
KIFC3-209	ENST00000562311	TBC1D16	Q8TBP0	767 aa		32.62	■■■□□ 2.81
KIFC3-209	ENST00000562311	FANCI	Q9NVI1	1328 aa		32.61	■■■□□ 2.81
KIFC3-209	ENST00000562311	RASSF10	A6NK89	507 aa		32.61	■■■□□ 2.81
KIFC3-209	ENST00000562311	C6orf229	H3BNL8	230 aa		32.61	■■■□□ 2.81
KIFC3-209	ENST00000562311	WASHC4	Q2M389	1173 aa		32.61	■■■□□ 2.81
KIFC3-209	ENST00000562311	CWF19L2	Q2TBE0	894 aa	Known RBP	32.61	■■■□□ 2.81
KIFC3-209	ENST00000562311	WTIP	A6NIX2	430 aa	Predicted RBP	32.6	■■■□□ 2.81
KIFC3-209	ENST00000562311	PSMD14	O00487	310 aa		32.6	■■■□□ 2.81
KIFC3-209	ENST00000562311	KSR2	Q6VAB6	950 aa		32.6	■■■□□ 2.81
KIFC3-209	ENST00000562311	FOXN1	O15353	648 aa		32.59	■■■□□ 2.81
KIFC3-209	ENST00000562311	EGFR	P00533	1210 aa		32.59	■■■□□ 2.81
KIFC3-209	ENST00000562311	DLK2	Q6UY11	383 aa		32.59	■■■□□ 2.81
KIFC3-209	ENST00000562311	GLIS2	Q9BZE0	524 aa	Predicted RBP	32.59	■■■□□ 2.81
KIFC3-209	ENST00000562311	SPINK5	Q9NQ38	1064 aa	Predicted RBP	32.59	■■■□□ 2.81
KIFC3-209	ENST00000562311	TRPM7	Q96QT4	1865 aa		32.59	■■■□□ 2.81
KIFC3-209	ENST00000562311	PDE8A	O60658	829 aa		32.58	■■■□□ 2.81
KIFC3-209	ENST00000562311	DDX58	O95786	925 aa	Known RBP	32.58	■■■□□ 2.81
KIFC3-209	ENST00000562311	BCL2L13	Q9BXK5	485 aa		32.58	■■■□□ 2.81
KIFC3-209	ENST00000562311	SPEF2	Q9C093	1822 aa		32.57	■■■□□ 2.8
KIFC3-209	ENST00000562311	ECE2	O60344	883 aa		32.57	■■■□□ 2.8
KIFC3-209	ENST00000562311	MICALL2	Q8IY33	904 aa		32.57	■■■□□ 2.8
KIFC3-209	ENST00000562311	ABT1	Q9ULW3	272 aa	Known RBP	32.57	■■■□□ 2.8
KIFC3-209	ENST00000562311	IL16	Q14005	1332 aa		32.56	■■■□□ 2.8
KIFC3-209	ENST00000562311	TNIP1	Q15025	636 aa		32.56	■■■□□ 2.8

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