RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000555574.1

TMX1-202, Transcript of thioredoxin related transmembrane protein 1, humanhuman

TSL 2

Gene TMX1, Length 943 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMX1-202ENST00000555574 FOXN1O15353 648 aa22.11■■□□□ 1.13
TMX1-202ENST00000555574 DUSP27Q5VZP5 1158 aa22.11■■□□□ 1.13
TMX1-202ENST00000555574 ANKRD13DQ6ZTN6 518 aa22.11■■□□□ 1.13
TMX1-202ENST00000555574 MPNDQ8N594 471 aa22.11■■□□□ 1.13
TMX1-202ENST00000555574 PRKRIP1Q9H875 184 aaPredicted RBP22.11■■□□□ 1.13
TMX1-202ENST00000555574 MBIPQ9NS73 344 aa22.11■■□□□ 1.13
TMX1-202ENST00000555574 ZNRF3Q9ULT6 936 aa22.11■■□□□ 1.13
TMX1-202ENST00000555574 COL4A1P02462 1669 aa22.11■■□□□ 1.13
TMX1-202ENST00000555574 RASSF10A6NK89 507 aa22.1■■□□□ 1.13
TMX1-202ENST00000555574 ATP5J2-PTCD1G3V325 749 aa22.1■■□□□ 1.13
TMX1-202ENST00000555574 CXCL9Q07325 125 aa22.1■■□□□ 1.13
TMX1-202ENST00000555574 USP50Q70EL3 339 aaPredicted RBP22.1■■□□□ 1.13
TMX1-202ENST00000555574 GPRC5DQ9NZD1 345 aa22.1■■□□□ 1.13
TMX1-202ENST00000555574 ABT1Q9ULW3 272 aaKnown RBP22.1■■□□□ 1.13
TMX1-202ENST00000555574 FMR1Q06787 632 aaKnown RBP eCLIP22.09■■□□□ 1.13
TMX1-202ENST00000555574 KIAA2012Q0VF49 1180 aa22.09■■□□□ 1.13
TMX1-202ENST00000555574 FAM89AQ96GI7 184 aa22.09■■□□□ 1.13
TMX1-202ENST00000555574 ISCA1Q9BUE6 129 aa22.09■■□□□ 1.13
TMX1-202ENST00000555574 GMPSP49915 693 aaPredicted RBP22.08■■□□□ 1.13
TMX1-202ENST00000555574 DEFB115Q30KQ5 88 aa22.08■■□□□ 1.13
TMX1-202ENST00000555574 HYPKQ9NX55 129 aa22.08■■□□□ 1.13
TMX1-202ENST00000555574 RTL5Q5HYW3 569 aaPredicted RBP22.07■■□□□ 1.12
TMX1-202ENST00000555574 AIDAQ96BJ3 306 aa22.07■■□□□ 1.12
TMX1-202ENST00000555574 ADARB2Q9NS39 739 aaKnown RBP22.07■■□□□ 1.12
TMX1-202ENST00000555574 THSD7BQ9C0I4 1608 aa22.06■■□□□ 1.12
TMX1-202ENST00000555574 TRAF5O00463 557 aa22.06■■□□□ 1.12
TMX1-202ENST00000555574 APAF1O14727 1248 aa22.06■■□□□ 1.12
TMX1-202ENST00000555574 CIAPIN1Q6FI81 312 aa22.06■■□□□ 1.12
TMX1-202ENST00000555574 TMC4Q7Z404 712 aa22.06■■□□□ 1.12
TMX1-202ENST00000555574 RAD17O75943 681 aa22.05■■□□□ 1.12
TMX1-202ENST00000555574 ZNF853P0CG23 659 aa22.05■■□□□ 1.12
TMX1-202ENST00000555574 CELF1Q92879 486 aaKnown RBP22.05■■□□□ 1.12
TMX1-202ENST00000555574 YDJCA8MPS7 323 aa22.04■■□□□ 1.12
TMX1-202ENST00000555574 SF3B3Q15393 1217 aaKnown RBP22.04■■□□□ 1.12
TMX1-202ENST00000555574 IFT57Q9NWB7 429 aa22.04■■□□□ 1.12
TMX1-202ENST00000555574 WBP1LQ9NX94 342 aa22.04■■□□□ 1.12
TMX1-202ENST00000555574 CDHR2Q9BYE9 1310 aa22.04■■□□□ 1.12
TMX1-202ENST00000555574 WDR33Q9C0J8 1336 aaKnown RBP22.04■■□□□ 1.12
TMX1-202ENST00000555574 CTCFP49711 727 aaPredicted RBP22.03■■□□□ 1.12
TMX1-202ENST00000555574 BCL2L13Q9BXK5 485 aa22.03■■□□□ 1.12
TMX1-202ENST00000555574 ELL2O00472 640 aaPredicted RBP22.02■■□□□ 1.12
TMX1-202ENST00000555574 GNAI1P63096 354 aa22.02■■□□□ 1.12
TMX1-202ENST00000555574 GOLGA2Q08379 1002 aa22.02■■□□□ 1.12
TMX1-202ENST00000555574 TNIP1Q15025 636 aa22.02■■□□□ 1.12
TMX1-202ENST00000555574 CST9Q5W186 159 aa22.02■■□□□ 1.12
TMX1-202ENST00000555574 RIC3Q7Z5B4 369 aa22.02■■□□□ 1.12
TMX1-202ENST00000555574 PHAXQ9H814 394 aaKnown RBP22.02■■□□□ 1.12
TMX1-202ENST00000555574 IRS4O14654 1257 aaPredicted RBP22.01■■□□□ 1.11
TMX1-202ENST00000555574 CALD1Q05682 793 aaKnown RBP22.01■■□□□ 1.11
TMX1-202ENST00000555574 TRIM28Q13263 835 aaKnown RBP22.01■■□□□ 1.11
TMX1-202ENST00000555574 PAXIP1Q6ZW49 1069 aaPredicted RBP22.01■■□□□ 1.11
TMX1-202ENST00000555574 PRDM10Q9NQV6 1147 aa22.01■■□□□ 1.11
TMX1-202ENST00000555574 NSFL1CQ9UNZ2 370 aaKnown RBP22.01■■□□□ 1.11
TMX1-202ENST00000555574 SHTN1A0MZ66 631 aa22■■□□□ 1.11
TMX1-202ENST00000555574 TRPM4Q8TD43 1214 aa22■■□□□ 1.11
TMX1-202ENST00000555574 CAPNS2Q96L46 248 aa22■■□□□ 1.11
TMX1-202ENST00000555574 GPSM2P81274 684 aa21.99■■□□□ 1.11
TMX1-202ENST00000555574 GRM1Q13255 1194 aa21.99■■□□□ 1.11
TMX1-202ENST00000555574 WASHC4Q2M389 1173 aa21.99■■□□□ 1.11
TMX1-202ENST00000555574 MYD88Q99836 296 aa21.99■■□□□ 1.11
TMX1-202ENST00000555574 GLIS2Q9BZE0 524 aaPredicted RBP21.99■■□□□ 1.11
TMX1-202ENST00000555574 DBNDD1Q9H9R9 158 aa21.99■■□□□ 1.11
TMX1-202ENST00000555574 RIMBP2O15034 1052 aa21.98■■□□□ 1.11
TMX1-202ENST00000555574 LBX1P52954 281 aa21.98■■□□□ 1.11
TMX1-202ENST00000555574 HIRAP54198 1017 aaPredicted RBP21.98■■□□□ 1.11
TMX1-202ENST00000555574 MAP2K1Q02750 393 aaPredicted RBP21.98■■□□□ 1.11
TMX1-202ENST00000555574 CYP4F22Q6NT55 531 aa21.98■■□□□ 1.11
TMX1-202ENST00000555574 MICALL2Q8IY33 904 aa21.98■■□□□ 1.11
TMX1-202ENST00000555574 ZBTB38Q8NAP3 1195 aaPredicted RBP21.98■■□□□ 1.11
TMX1-202ENST00000555574 C8orf58Q8NAV2 365 aa21.98■■□□□ 1.11
TMX1-202ENST00000555574 POLLQ9UGP5 575 aa21.98■■□□□ 1.11
TMX1-202ENST00000555574 CNOT7Q9UIV1 285 aaKnown RBP21.98■■□□□ 1.11
TMX1-202ENST00000555574 TLL2Q9Y6L7 1015 aa21.98■■□□□ 1.11
TMX1-202ENST00000555574 C6orf229H3BNL8 230 aa21.97■■□□□ 1.11
TMX1-202ENST00000555574 PSMD14O00487 310 aa21.97■■□□□ 1.11
TMX1-202ENST00000555574 ECE1P42892 770 aa21.97■■□□□ 1.11
TMX1-202ENST00000555574 ZBTB12Q9Y330 459 aaPredicted RBP21.97■■□□□ 1.11
TMX1-202ENST00000555574 SCN9AQ15858 1988 aa21.97■■□□□ 1.11
TMX1-202ENST00000555574 CELF2O95319 508 aaKnown RBP21.96■■□□□ 1.11
TMX1-202ENST00000555574 HSPA8P11142 646 aaKnown RBP21.96■■□□□ 1.11
TMX1-202ENST00000555574 RPS8P62241 208 aaKnown RBP21.96■■□□□ 1.11
TMX1-202ENST00000555574 GPR101Q96P66 508 aaPredicted RBP21.96■■□□□ 1.11
TMX1-202ENST00000555574 SEC31BQ9NQW1 1179 aa21.96■■□□□ 1.11
TMX1-202ENST00000555574 PGAP2Q9UHJ9 254 aa21.96■■□□□ 1.11
TMX1-202ENST00000555574 H7C1D1 291 aa21.95■■□□□ 1.1
TMX1-202ENST00000555574 ECE2O60344 883 aa21.95■■□□□ 1.1
TMX1-202ENST00000555574 ZC3H15Q8WU90 426 aaKnown RBP21.95■■□□□ 1.1
TMX1-202ENST00000555574 DOK7Q18PE1 504 aa21.94■■□□□ 1.1
TMX1-202ENST00000555574 SAPCD2Q86UD0 394 aa21.94■■□□□ 1.1
TMX1-202ENST00000555574 TBC1D16Q8TBP0 767 aa21.94■■□□□ 1.1
TMX1-202ENST00000555574 EYA3Q99504 573 aa21.94■■□□□ 1.1
TMX1-202ENST00000555574 ZNF408Q9H9D4 720 aa21.94■■□□□ 1.1
TMX1-202ENST00000555574 RTL9Q8NET4 1388 aa21.94■■□□□ 1.1
TMX1-202ENST00000555574 PCCAP05165 728 aaPredicted RBP21.93■■□□□ 1.1
TMX1-202ENST00000555574 MYH3P11055 1940 aa21.93■■□□□ 1.1
TMX1-202ENST00000555574 HSP90B1P14625 803 aaKnown RBP21.93■■□□□ 1.1
TMX1-202ENST00000555574 TSPYL6Q8N831 410 aa21.93■■□□□ 1.1
TMX1-202ENST00000555574 CCDC191Q8NCU4 936 aa21.93■■□□□ 1.1
TMX1-202ENST00000555574 JARID2Q92833 1246 aaPredicted RBP21.93■■□□□ 1.1
TMX1-202ENST00000555574 SPEF2Q9C093 1822 aa21.93■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 120.7 ms