RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000551525.5

PTPRB-210, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type B, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRB, Length 5,291 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRB-210ENST00000551525 TRIM21P19474 475 aaKnown RBP7.3□□□□□ -1.24
PTPRB-210ENST00000551525 MORC4Q8TE76 937 aa7.3□□□□□ -1.24
PTPRB-210ENST00000551525 SLC16A10Q8TF71 515 aa7.3□□□□□ -1.24
PTPRB-210ENST00000551525 RBM17Q96I25 401 aaKnown RBP7.3□□□□□ -1.24
PTPRB-210ENST00000551525 NAP1L4Q99733 375 aaKnown RBP7.3□□□□□ -1.24
PTPRB-210ENST00000551525 UBA5Q9GZZ9 404 aa7.3□□□□□ -1.24
PTPRB-210ENST00000551525 CTNNA3Q9UI47 895 aa7.3□□□□□ -1.24
PTPRB-210ENST00000551525 SPATA31D1Q6ZQQ2 1576 aa7.3□□□□□ -1.24
PTPRB-210ENST00000551525 KCNQ2O43526 872 aa7.3□□□□□ -1.24
PTPRB-210ENST00000551525 EZRP15311 586 aaKnown RBP7.3□□□□□ -1.24
PTPRB-210ENST00000551525 IRX5P78411 483 aaPredicted RBP7.3□□□□□ -1.24
PTPRB-210ENST00000551525 SF3A1Q15459 793 aaKnown RBP7.3□□□□□ -1.24
PTPRB-210ENST00000551525 CRACR2AQ9BSW2 395 aa7.3□□□□□ -1.24
PTPRB-210ENST00000551525 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP7.3□□□□□ -1.24
PTPRB-210ENST00000551525 GOLGA6L7A0A1B0GV03 622 aa7.3□□□□□ -1.24
PTPRB-210ENST00000551525 SMARCA5O60264 1052 aaPredicted RBP7.3□□□□□ -1.24
PTPRB-210ENST00000551525 ZBTB17Q13105 803 aa7.3□□□□□ -1.24
PTPRB-210ENST00000551525 IFIT5Q13325 482 aaKnown RBP7.3□□□□□ -1.24
PTPRB-210ENST00000551525 RRS1Q15050 365 aaKnown RBP7.3□□□□□ -1.24
PTPRB-210ENST00000551525 CCNL1Q9UK58 526 aaPredicted RBP7.3□□□□□ -1.24
PTPRB-210ENST00000551525 ZBED9Q6R2W3 1325 aa7.3□□□□□ -1.24
PTPRB-210ENST00000551525 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP7.3□□□□□ -1.24
PTPRB-210ENST00000551525 GOLGA6CA6NDK9 693 aa7.29□□□□□ -1.24
PTPRB-210ENST00000551525 GOLGA6BA6NDN3 693 aa7.29□□□□□ -1.24
PTPRB-210ENST00000551525 SMC2O95347 1197 aa7.29□□□□□ -1.24
PTPRB-210ENST00000551525 GCP02774 474 aa7.29□□□□□ -1.24
PTPRB-210ENST00000551525 GOLGA6DP0CG33 693 aa7.29□□□□□ -1.24
PTPRB-210ENST00000551525 PARP10Q53GL7 1025 aa7.29□□□□□ -1.24
PTPRB-210ENST00000551525 CRACR2BQ8N4Y2 399 aaPredicted RBP7.29□□□□□ -1.24
PTPRB-210ENST00000551525 RILPL2Q969X0 211 aa7.29□□□□□ -1.24
PTPRB-210ENST00000551525 GOLGA6AQ9NYA3 693 aa7.29□□□□□ -1.24
PTPRB-210ENST00000551525 SATB2Q9UPW6 733 aa7.29□□□□□ -1.24
PTPRB-210ENST00000551525 ATF5Q9Y2D1 282 aaPredicted RBP7.29□□□□□ -1.24
PTPRB-210ENST00000551525 H3BQV1 296 aa7.29□□□□□ -1.24
PTPRB-210ENST00000551525 PTCD1O75127 700 aaKnown RBP7.29□□□□□ -1.24
PTPRB-210ENST00000551525 HLA-DOAP06340 250 aa7.29□□□□□ -1.24
PTPRB-210ENST00000551525 TNIP1Q15025 636 aa7.29□□□□□ -1.24
PTPRB-210ENST00000551525 IFFO2Q5TF58 517 aa7.29□□□□□ -1.24
PTPRB-210ENST00000551525 NME9Q86XW9 330 aa7.29□□□□□ -1.24
PTPRB-210ENST00000551525 CCDC112Q8NEF3 446 aa7.29□□□□□ -1.24
PTPRB-210ENST00000551525 IP6K1Q92551 441 aa7.29□□□□□ -1.24
PTPRB-210ENST00000551525 ANKRD2Q9GZV1 360 aa7.29□□□□□ -1.24
PTPRB-210ENST00000551525 C6orf229H3BNL8 230 aa7.29□□□□□ -1.24
PTPRB-210ENST00000551525 BAG3O95817 575 aa7.29□□□□□ -1.24
PTPRB-210ENST00000551525 GCKP35557 465 aa7.29□□□□□ -1.24
PTPRB-210ENST00000551525 SLC20A2Q08357 652 aa7.29□□□□□ -1.24
PTPRB-210ENST00000551525 CCDC174Q6PII3 467 aa7.29□□□□□ -1.24
PTPRB-210ENST00000551525 MPP4Q96JB8 637 aa7.29□□□□□ -1.24
PTPRB-210ENST00000551525 TACO1Q9BSH4 297 aaKnown RBP7.29□□□□□ -1.24
PTPRB-210ENST00000551525 CARD10Q9BWT7 1032 aa7.29□□□□□ -1.24
PTPRB-210ENST00000551525 BABAM1Q9NWV8 329 aa7.29□□□□□ -1.24
PTPRB-210ENST00000551525 ABCD1P33897 745 aa7.29□□□□□ -1.24
PTPRB-210ENST00000551525 FAM161AQ3B820 660 aa7.29□□□□□ -1.24
PTPRB-210ENST00000551525 CCDC178Q5BJE1 867 aa7.29□□□□□ -1.24
PTPRB-210ENST00000551525 SLTMQ9NWH9 1034 aaKnown RBP eCLIP7.29□□□□□ -1.24
PTPRB-210ENST00000551525 MYL6BP14649 208 aa7.29□□□□□ -1.24
PTPRB-210ENST00000551525 BMS1Q14692 1282 aaKnown RBP7.29□□□□□ -1.24
PTPRB-210ENST00000551525 CHRNA2Q15822 529 aa7.29□□□□□ -1.24
PTPRB-210ENST00000551525 RSRC1Q96IZ7 334 aaKnown RBP7.29□□□□□ -1.24
PTPRB-210ENST00000551525 METTL14Q9HCE5 456 aaKnown RBP7.29□□□□□ -1.24
PTPRB-210ENST00000551525 CABP5Q9NP86 173 aa7.29□□□□□ -1.24
PTPRB-210ENST00000551525 DONSONQ9NYP3 566 aa7.29□□□□□ -1.24
PTPRB-210ENST00000551525 SEPT6Q14141 434 aa7.28□□□□□ -1.24
PTPRB-210ENST00000551525 SEPT7Q16181 437 aaKnown RBP7.28□□□□□ -1.24
PTPRB-210ENST00000551525 CENPQQ7L2Z9 268 aaPredicted RBP7.28□□□□□ -1.24
PTPRB-210ENST00000551525 IKBKGQ9Y6K9 419 aa7.28□□□□□ -1.24
PTPRB-210ENST00000551525 PZPP20742 1482 aa7.28□□□□□ -1.24
PTPRB-210ENST00000551525 FYB1O15117 783 aa7.28□□□□□ -1.24
PTPRB-210ENST00000551525 RLBP1P12271 317 aa7.28□□□□□ -1.24
PTPRB-210ENST00000551525 TMX1Q9H3N1 280 aa7.28□□□□□ -1.24
PTPRB-210ENST00000551525 RMI1Q9H9A7 625 aa7.28□□□□□ -1.24
PTPRB-210ENST00000551525 NR2E3Q9Y5X4 410 aa7.28□□□□□ -1.24
PTPRB-210ENST00000551525 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa7.28□□□□□ -1.24
PTPRB-210ENST00000551525 SHTN1A0MZ66 631 aa7.28□□□□□ -1.24
PTPRB-210ENST00000551525 POLR3GO15318 223 aaPredicted RBP7.28□□□□□ -1.24
PTPRB-210ENST00000551525 ERLIN1O75477 346 aa7.28□□□□□ -1.24
PTPRB-210ENST00000551525 METTL24Q5JXM2 366 aa7.28□□□□□ -1.24
PTPRB-210ENST00000551525 ANKRD45Q5TZF3 282 aa7.28□□□□□ -1.24
PTPRB-210ENST00000551525 SMC1BQ8NDV3 1235 aa7.28□□□□□ -1.24
PTPRB-210ENST00000551525 CLUAP1Q96AJ1 413 aa7.28□□□□□ -1.24
PTPRB-210ENST00000551525 CWC25Q9NXE8 425 aaPredicted RBP7.28□□□□□ -1.24
PTPRB-210ENST00000551525 KLHL10Q6JEL2 608 aa7.28□□□□□ -1.24
PTPRB-210ENST00000551525 ZNF804AQ7Z570 1209 aa7.28□□□□□ -1.24
PTPRB-210ENST00000551525 MAST3O60307 1309 aa7.28□□□□□ -1.24
PTPRB-210ENST00000551525 SLC4A2P04920 1241 aa7.27□□□□□ -1.25
PTPRB-210ENST00000551525 TTF1Q15361 905 aaPredicted RBP7.27□□□□□ -1.25
PTPRB-210ENST00000551525 SYCP1Q15431 976 aa7.27□□□□□ -1.25
PTPRB-210ENST00000551525 INTS3Q68E01 1043 aaKnown RBP7.27□□□□□ -1.25
PTPRB-210ENST00000551525 RALGAPBQ86X10 1494 aa7.27□□□□□ -1.25
PTPRB-210ENST00000551525 FSD1Q9BTV5 496 aa7.27□□□□□ -1.25
PTPRB-210ENST00000551525 GLI2P10070 1586 aa7.27□□□□□ -1.25
PTPRB-210ENST00000551525 H0YIN7 160 aa7.27□□□□□ -1.25
PTPRB-210ENST00000551525 SLC4A3P48751 1232 aa7.27□□□□□ -1.25
PTPRB-210ENST00000551525 MMP14P50281 582 aa7.27□□□□□ -1.25
PTPRB-210ENST00000551525 TSPOAP1O95153 1857 aa7.27□□□□□ -1.25
PTPRB-210ENST00000551525 SURF6O75683 361 aaKnown RBP7.27□□□□□ -1.25
PTPRB-210ENST00000551525 UQCRFS1P1P0C7P4 283 aa7.27□□□□□ -1.25
PTPRB-210ENST00000551525 PLCG2P16885 1265 aa7.27□□□□□ -1.25
PTPRB-210ENST00000551525 HS1BP3Q53T59 392 aa7.27□□□□□ -1.25
PTPRB-210ENST00000551525 GET4Q7L5D6 327 aaPredicted RBP7.27□□□□□ -1.25
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