RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000537484.1

PUS1-206, Transcript of pseudouridylate synthase 1, humanhuman

TSL 3

Gene PUS1, Length 642 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PUS1-206ENST00000537484 PDE8AO60658 829 aa25.21■■□□□ 1.63
PUS1-206ENST00000537484 ZNF277Q9NRM2 450 aaPredicted RBP25.21■■□□□ 1.63
PUS1-206ENST00000537484 BEND3Q5T5X7 828 aa25.2■■□□□ 1.62
PUS1-206ENST00000537484 UBE3BQ7Z3V4 1068 aa25.2■■□□□ 1.62
PUS1-206ENST00000537484 PSMD1Q99460 953 aa25.2■■□□□ 1.62
PUS1-206ENST00000537484 BCL2L13Q9BXK5 485 aa25.2■■□□□ 1.62
PUS1-206ENST00000537484 CT47B1P0C2W7 299 aaPredicted RBP25.19■■□□□ 1.62
PUS1-206ENST00000537484 GRIPAP1Q4V328 841 aa25.19■■□□□ 1.62
PUS1-206ENST00000537484 CELF1Q92879 486 aaKnown RBP25.19■■□□□ 1.62
PUS1-206ENST00000537484 TIAM2Q8IVF5 1701 aa25.19■■□□□ 1.62
PUS1-206ENST00000537484 TAF1P21675 1872 aa25.19■■□□□ 1.62
PUS1-206ENST00000537484 COL4A1P02462 1669 aa25.18■■□□□ 1.62
PUS1-206ENST00000537484 ALDH1L2Q3SY69 923 aa25.18■■□□□ 1.62
PUS1-206ENST00000537484 SP8Q8IXZ3 490 aa25.18■■□□□ 1.62
PUS1-206ENST00000537484 TMX4Q9H1E5 349 aaPredicted RBP25.18■■□□□ 1.62
PUS1-206ENST00000537484 CASP7P55210 303 aa25.17■■□□□ 1.62
PUS1-206ENST00000537484 CTSWP56202 376 aa25.17■■□□□ 1.62
PUS1-206ENST00000537484 CCDC152Q4G0S7 254 aa25.17■■□□□ 1.62
PUS1-206ENST00000537484 CCDC85AQ96PX6 553 aaPredicted RBP25.17■■□□□ 1.62
PUS1-206ENST00000537484 SEC31BQ9NQW1 1179 aa25.17■■□□□ 1.62
PUS1-206ENST00000537484 DICER1Q9UPY3 1922 aaKnown RBP25.17■■□□□ 1.62
PUS1-206ENST00000537484 IARSP41252 1262 aaKnown RBP25.16■■□□□ 1.62
PUS1-206ENST00000537484 SLC4A10Q6U841 1118 aa25.16■■□□□ 1.62
PUS1-206ENST00000537484 TMC4Q7Z404 712 aa25.16■■□□□ 1.62
PUS1-206ENST00000537484 SMC4Q9NTJ3 1288 aa25.16■■□□□ 1.62
PUS1-206ENST00000537484 PTPRCP08575 1304 aa25.15■■□□□ 1.62
PUS1-206ENST00000537484 KDM2BQ8NHM5 1336 aa25.15■■□□□ 1.62
PUS1-206ENST00000537484 NMRK2Q9NPI5 230 aa25.15■■□□□ 1.62
PUS1-206ENST00000537484 GLTPD2A6NH11 291 aa25.14■■□□□ 1.62
PUS1-206ENST00000537484 RPS8P62241 208 aaKnown RBP25.14■■□□□ 1.62
PUS1-206ENST00000537484 TTLL11Q8NHH1 800 aa25.14■■□□□ 1.62
PUS1-206ENST00000537484 KIF3CO14782 793 aa25.13■■□□□ 1.61
PUS1-206ENST00000537484 PLA2G12BQ9BX93 195 aa25.13■■□□□ 1.61
PUS1-206ENST00000537484 ALDH1L1O75891 902 aa25.12■■□□□ 1.61
PUS1-206ENST00000537484 DPP8Q6V1X1 898 aaPredicted RBP25.12■■□□□ 1.61
PUS1-206ENST00000537484 MPNDQ8N594 471 aa25.12■■□□□ 1.61
PUS1-206ENST00000537484 RTFDC1Q9BY42 306 aaPredicted RBP25.12■■□□□ 1.61
PUS1-206ENST00000537484 SRCIN1Q9C0H9 1055 aa25.12■■□□□ 1.61
PUS1-206ENST00000537484 LRRC37AA6NMS7 1700 aa25.11■■□□□ 1.61
PUS1-206ENST00000537484 ZBED9Q6R2W3 1325 aa25.11■■□□□ 1.61
PUS1-206ENST00000537484 RARSP54136 660 aaKnown RBP25.1■■□□□ 1.61
PUS1-206ENST00000537484 DPY19L2Q6NUT2 758 aa25.1■■□□□ 1.61
PUS1-206ENST00000537484 GREM2Q9H772 168 aa25.1■■□□□ 1.61
PUS1-206ENST00000537484 COL4A5P29400 1685 aa25.1■■□□□ 1.61
PUS1-206ENST00000537484 RTL9Q8NET4 1388 aa25.09■■□□□ 1.61
PUS1-206ENST00000537484 GRM8O00222 908 aa25.09■■□□□ 1.61
PUS1-206ENST00000537484 SUPT20HQ8NEM7 779 aa25.09■■□□□ 1.61
PUS1-206ENST00000537484 RRAGCQ9HB90 399 aa25.09■■□□□ 1.61
PUS1-206ENST00000537484 MYH3P11055 1940 aa25.08■■□□□ 1.61
PUS1-206ENST00000537484 BRPF1P55201 1214 aaPredicted RBP25.08■■□□□ 1.61
PUS1-206ENST00000537484 LARGE2Q8N3Y3 721 aa25.08■■□□□ 1.61
PUS1-206ENST00000537484 C9orf78Q9NZ63 289 aaPredicted RBP25.08■■□□□ 1.61
PUS1-206ENST00000537484 FZD9O00144 591 aa25.07■■□□□ 1.6
PUS1-206ENST00000537484 PPIP5K2O43314 1243 aa25.07■■□□□ 1.6
PUS1-206ENST00000537484 CSF1RP07333 972 aa25.07■■□□□ 1.6
PUS1-206ENST00000537484 C1QTNF8P60827 252 aa25.07■■□□□ 1.6
PUS1-206ENST00000537484 GPSM2P81274 684 aa25.07■■□□□ 1.6
PUS1-206ENST00000537484 AOC3Q16853 763 aa25.07■■□□□ 1.6
PUS1-206ENST00000537484 ANKRD18AQ8IVF6 992 aa25.07■■□□□ 1.6
PUS1-206ENST00000537484 JDP2Q8WYK2 163 aa25.07■■□□□ 1.6
PUS1-206ENST00000537484 CDC5LQ99459 802 aaKnown RBP25.07■■□□□ 1.6
PUS1-206ENST00000537484 NOB1Q9ULX3 412 aaKnown RBP25.07■■□□□ 1.6
PUS1-206ENST00000537484 ZNF541Q9H0D2 1346 aa25.07■■□□□ 1.6
PUS1-206ENST00000537484 DUOX1Q9NRD9 1551 aa25.06■■□□□ 1.6
PUS1-206ENST00000537484 DDNO94850 711 aaPredicted RBP25.06■■□□□ 1.6
PUS1-206ENST00000537484 VPS33BQ9H267 617 aa25.06■■□□□ 1.6
PUS1-206ENST00000537484 NSFL1CQ9UNZ2 370 aaKnown RBP25.06■■□□□ 1.6
PUS1-206ENST00000537484 FOXO4P98177 505 aa25.05■■□□□ 1.6
PUS1-206ENST00000537484 FAM161AQ3B820 660 aa25.05■■□□□ 1.6
PUS1-206ENST00000537484 EPHA10Q5JZY3 1008 aa25.04■■□□□ 1.6
PUS1-206ENST00000537484 POTECB2RU33 542 aa25.03■■□□□ 1.6
PUS1-206ENST00000537484 ITGA6P23229 1130 aa25.03■■□□□ 1.6
PUS1-206ENST00000537484 KIAA2012Q0VF49 1180 aa25.03■■□□□ 1.6
PUS1-206ENST00000537484 NIM1KQ8IY84 436 aa25.03■■□□□ 1.6
PUS1-206ENST00000537484 POLLQ9UGP5 575 aa25.03■■□□□ 1.6
PUS1-206ENST00000537484 WDR90Q96KV7 1748 aa25.03■■□□□ 1.6
PUS1-206ENST00000537484 NBPF7P0C2Y1 421 aaPredicted RBP25.02■■□□□ 1.6
PUS1-206ENST00000537484 VEGFAP15692 232 aaPredicted RBP25.02■■□□□ 1.6
PUS1-206ENST00000537484 BSDC1Q9NW68 430 aaPredicted RBP25.02■■□□□ 1.6
PUS1-206ENST00000537484 PODXL2Q9NZ53 605 aa25.02■■□□□ 1.6
PUS1-206ENST00000537484 LTBP1Q14766 1721 aa25.02■■□□□ 1.6
PUS1-206ENST00000537484 UTYO14607 1347 aa25.02■■□□□ 1.6
PUS1-206ENST00000537484 TBC1D16Q8TBP0 767 aa25.01■■□□□ 1.59
PUS1-206ENST00000537484 SUCLG2Q96I99 432 aa25.01■■□□□ 1.59
PUS1-206ENST00000537484 API5Q9BZZ5 524 aaKnown RBP25.01■■□□□ 1.59
PUS1-206ENST00000537484 ANKIB1Q9P2G1 1089 aa25.01■■□□□ 1.59
PUS1-206ENST00000537484 C6orf229H3BNL8 230 aa25■■□□□ 1.59
PUS1-206ENST00000537484 TOMM70O94826 608 aa25■■□□□ 1.59
PUS1-206ENST00000537484 EIF6P56537 245 aaKnown RBP25■■□□□ 1.59
PUS1-206ENST00000537484 LMBR1LQ6UX01 489 aa25■■□□□ 1.59
PUS1-206ENST00000537484 KIF16BQ96L93 1317 aa25■■□□□ 1.59
PUS1-206ENST00000537484 BCAR3O75815 825 aa24.99■■□□□ 1.59
PUS1-206ENST00000537484 IGHMBP2P38935 993 aaKnown RBP24.99■■□□□ 1.59
PUS1-206ENST00000537484 WASHC4Q2M389 1173 aa24.99■■□□□ 1.59
PUS1-206ENST00000537484 IFFO2Q5TF58 517 aa24.99■■□□□ 1.59
PUS1-206ENST00000537484 C16orf71Q8IYS4 520 aaPredicted RBP24.99■■□□□ 1.59
PUS1-206ENST00000537484 KAZALD1Q96I82 304 aa24.99■■□□□ 1.59
PUS1-206ENST00000537484 L3MBTL3Q96JM7 780 aaPredicted RBP24.99■■□□□ 1.59
PUS1-206ENST00000537484 GPR101Q96P66 508 aaPredicted RBP24.99■■□□□ 1.59
PUS1-206ENST00000537484 MINPP1Q9UNW1 487 aa24.99■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 69.5 ms